TCONS_00066699 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00066699
Unique Name	TCONS_00066699
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2851

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_458:38287..71544-

transcript sequence

>TCONS_00066699 ID=TCONS_00066699|Name=TCONS_00066699|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2851bp
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GCTTTGACGATTTGAATGTTTATCGGTACAATTACTTCAATTAATCGACC
AATTCGCTATCGAACCGCGAAAACGAAGTTAGACCAGAAAGAAAAGGGAG
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CTATATACTTGCTAAATATAGACATGGCTTGATATTAGGGAGATAACAGT
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AAGTCGACGAAGAAGGCAAGCACCAGtgggCTATGAAACATTTCAAGACG
CAAGCTTTTTGTAATATTTGTCATGGAGTGTTAGCAGGGTTCGGACGAAA
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AAACGGAAAGTTACGGAAATGGACCATCATTGGGTAGAAGGGAATTGTCC
GGGAAAATGCACGAAGTGTAATAAAACCATTAAAAACAATTGTTTAACTG
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ACCAATTTGTATAACCCCTGCATCAAAGGAGAAGGCAGAAAAAGTGGTGA
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CCACAAAATATTATGAATAATTATTTCTCTATCGGTGTTGATGCGGCAAT
CGCATTGAAATTTCATTTACAGAGGGAGAAAAACCCTGAAAAGTTCAACA
GCAGGTTTAAGAATAAACTTCGATATTTTCAAGCTGGTACGTCAGAGCAA
CTGGCTGCAACATGTACAAAACTAAGCAACTTCTTAGAAATTATTTGCGA
TGGCAAGAAACTTGAACTACCCAGTTTAGAGGGTATTGCAATATTGAACA
TCCCAAGTATCTACGGAGGAGCGAATATTTGGGGTGAACCGGagaagaaa
aggaaaaggaGGAAGAAGAGTAGTGGCTCTTCTGGTGATGAACCTGAATC
ACTCGGAAGTGTCAGCCAAGATATAAGTGACCGCAAACTAGAAGTCGTTG
GTTTGGAAAATAGTTTATATGTTGGTCAAATCATCGCTGGTGTCAGACAA
CATGGTTTAAGATTAGCACAATGCTCGACTGTTGTTATTAAaatCATGAA
GACAATGCCAATGCAAATCGACGGTGAACCTTGGATGCAGGCACCTGCTC
A

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_458:38287..71544-

Legend: exon

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>TCONS_00066699 ID=TCONS_00066699|Name=TCONS_00066699|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=33258bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_458:38287..71544- (Clytia hemisphaerica)
AGGTGTTTCATATAAAACATGCCGAAAAATAAACAAGAAATGAATATATC
GCTTTGACGATTTGAATGTTTATCGGTACAATTACTTCAATTAATCGACC
AATTCGCTATCGAACCGCGAAAACGAAGTTAGACCAGAAAGAAAAGGGAG
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CGTCGAGTTGAAAATATAGATGTTGCTTCTAAATACCATCAAGTTTTATG
AATAAGAATGGCTGCTGCAGGGATCTGGGACAGGCTACATCCTGACGAAT
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GTGTAAACTAAAAACCTTGAAGACTCTTTGCGCTTTGGTAGGATCAATGA
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ACCAGACGATCTCAATCGAACGGAATCGACGATCTAACCAGTCAAACCAA
ATCGAACGCAATCAACCGGTTGAAATTCGATTGTCGAACGCAATCGAATC
TCAATCGAACGTCAAAATTCTGGGTAATATTCGATTGGTTCGATTATCGT
TCGATTGAGATCGTCTGGCTTTATTCTTGCAGCTTCCCAACATCCGAGCT
CTCAAACATCACAAGCCGAATGAAATTACTTTCGATTTTACGTAGAAATT
ATTCTATGAACAAGGAAACAATGAATCGACGATCGAACGCAATCGAACGC
AATCGAACATCAATCGAACGCAATCGAATATCAATCGAATCTGAAAATTG
CGGTAATATTCGATTGAGATTCGATTGCGTTCGACAATCGAATTTCAATC
GGTCGATTGCGTTCGATTTGGTTCGACTGGTTCGATCGTCGATTTCTTTC
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CTAGAAAATGTTCCTCCAAATCTTTTGCATTTTGTAACATTTTTTCTTTT
TTTCTGAAGAATCTCCAAGCATCTTCTAGTCAATATTTCTAACTTGAAAC
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TAAAGATGGTTTTGTGTGGTGCTAATACTTTAGGCGTACAAACTTTCGCG
AGCAGAAACTTTCGTGAATTTTGGCCTTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTT
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TCTATAAAACCTTGAAATCGTAATAAATATCAAATTCTCTGCATATTATT
ATCCTTTAAAGCTGTTTTAAAGTCAAAGAGCAACCAACTTTAGCGGATTT
AAGGAATATCTTTTACTTTTAAGGCAACTTTTATTTGAAAGTTCTCATTT
TTATCCTAGGATTCGCAAAAGTTTATGCTTGCGAAAATCATTTTTTCCTC
AAATTTGCAAAAGTAAATGTCGTGAATTTCGCAATTTTTCAACCAATAAC
TACTATGACTTTGTATAATGCTGACATACATTGTCTAATTCCCTCATAGC
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GCTGTTTAAAAATCACTCTAACTACTCGTAAACGTAAACTATCGTATATT
GGTCTAATGTCAACATCCCCCTCCTAATCTCAACACCCTTAACTCTAGAG
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AATACCCCTTTTAATAAAAACTAGAGATTCCAATCTGAATCTAGCAGTAC
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TTTCAATTTTTGAATCAGTATAATTATCTTTGAGGCAATGATACTTCAAC
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TTTATTTGGCTACTTGCAAGAAATTTGTTATCTAAAAAATATAGATTTCC
CAAAGTATTTCATTGCTATTTTTTTGTTTTGTTTATTTGAAGAGGAAGTG
ATAAGCCACCCAGTGCTTGTTTCAATTTTGATGTAATTACAATGATTAAT
GTCTGTAATTAACAACTCAGGAGGTTGATCTTTTTCATAGTAGAATAAAG
AGCATTCAAAATCCATTTAAACCTGTTTTACAACTGGCCTAAGATGTTTT
ATTGTAACTGTTATTTAAATATTTAGAAATCAAATGTTATAAATGAAATT
AAATCTTTATTTCATCATTAACTTCCTTAATTGATATCAAGACTTCCTAA
TTACAAACTTATCATGCTTTTCATTGATAACAAGCTCACTTCCTTTACAT
ATGATGTAATGATCCATTGCAGATCCCTGACTGTAAACAAACATCTTTAC
TATTTTTGGAGTGTTTTGGATTGTTTCAATTTCATTTAGAGTGTTTTTTC
AATTTATATATTTTCAATTTTATTCTTCTATGCGGAAACATCAGTATTCT
CAAAAGTTCTGAGTAAGTAACTTTCCAGGGGCTTTCTTCTGTTTGCTTTT
TAGCTAAAATTTCAAGGTGAGAAGATTTTTGAAAAGTTTCCAATATTATT
AAGATGTTTAAATATAATGAATGATTTATGNATCTTTTTTCTATCAGACT
TTTGTCTGTCGAATACCCCTTTTAATAAAAACTAGAGATTCCAATCTGAA
TCTAGCAGTACCTGGCAACACATGTTTGAGGAAATTATATAAATTCGAAT
GAGATTCTTTTTTTCAATTTTTGAATCAGTATAATTATCTTTGAGGCAAT
GATACTTCAACCTTCGTTTTGATCATGAAACAAAAGAGTCTGACAGAGTA
AAGCAACAAAACAAAAGTTTTTGGTGTTAATCCTTAGTTGTAATGGTAGG
CTAGTGGTATTTTTATTTGGCTACTTGCAAGAAATTTGTTATCTAAAAAA
TATAGATTTCCCAAAGTATTTCATTGCTATTTTTTTGTTTTGTTTATTTG
AAGAGGAAGTGATAAGCCACCCAGTGCTTGTTTCAATTTTGATGTAATTA
CAATGATTAATGTCTGTAATTAACAACTCAGGAGGTTGATCTTTTTCATA
GTAGAATAAAGAGCATTCAAAATCCATTTAAACCTGTTTTACAACTGGCC
TAAGATGTTTTATTGTAACTGTTATTTAAATATTTAGAAATCAAATGTTA
TAAATGAAATTAAATCTTTATTTCATCATTAACTTCCTTAATTGATATCA
AGACTTCCTAATTACAAACTTATCATGCTTTTCATTGATAACAAGCTCAC
TTCCTTTACATATGATGTAATGATCCATTGCAGATCCCTGACTGTAAACA
AACATCTTTACTATTTTTGGAGTGTTTTGGATTGTTTCAATTTCATTTAG
AGTGTCTTTTCAATTTATATATTTTCAATTTTATTCTTCTATGGGGAAAC
ATCAGTATTCTCAAAAGTTCTGAGTAAGTAACTTTCCAGGGGCTTTCATC
TTTTTGCTTTTTAGCTAAAATTTCATGGTGAGAAGATTTTTGAAAAGTTT
CCAATATTATTAAGATGTTTAAATATAATGAATGATTTATTTTTTTTAAA
CATTTTTTTCATGGAATAAACATTTTCTTTCTTTCTCATAACAAGTTTTT
TTTTGCTCTGTGTAGCATAGATTAAGAGCTTTTCCCCCTGATTATATTTG
AAAATCTTTTTCAAAAAGAATTTTCATTGAGCTTAAACCTCAGATGAGTT
TCTCCAAAAAATAAGTCGAGTTTCATCTATTGATTTTTTAAAATGATATT
CATTTCCATCCCATCAAAGGTATATCATCAATGTTTTTCTTTTTAAAGAG
AACACAAACTATTAATTTATTCTCTTATTTGAAATTGTGCTAACAGTTTT
CCAAAAAGTCAACCCATACAAAGTATTTAAACGCAATATGTTAATCTGAT
CAATTAATATAAGCATTGTGTACACATTAATTCGTTGTAATCAAAATGCA
TCCTTAAGCTAGAGAAGAAATCGATTTTGTATAAACAGTTTTTCATAATT
CAACTGATCCTAGATATATGAAATACCGAGATCAAGCAATAGAACCTTGC
TGTGTTTTGTCTTTTAGCTGTGTGAAAATACCTTCTCATTAAATGTACAT
CAATGCTCTTTAATAACTATCATTCAGTTCACTGTTATGCTTTTTAAATA
ACAAGCAATACCAAAGCTTTAAAATAAGCTTTAGTTAATTAAAATCAAGG
CTTGCATCCACAATCTTTAATAAATAATAATCACAGCAATATTGGTCTAG
CAACCAAATTTTGAAAAGTAAAAAAATATGAAATTTATAATTGCAATTTA
ATCTCCTAGAATATGTTTTAAATATTTACATCTAGGTTATAAGTATTTTA
CACCTTTTCTACCGTAATCGCGCTGTCAGACGCGTGTCACTTTATTATTT
AATTATCCCCCTAAACTTGATCCAATCCTTTCTTACACCTTTTTCTATTG
TCAATAGGTGCAAAAAAAGACTGGGACGGTTTTAGGGTGGTAAAACGGAC
AAAAATAAGCCTGTGCAGCAATTGGCAGCTACGGTTGAAAAGGTGTATTG
TCAGGATGTATGACTCTTTCCTATCAGATTCAAAGAGAGACAGTCATAGC
AGGTTAAGCCAGGTCAATACTTGGTAGAGTAACTATTACCAGGAAACAGT
TTAAGCTTTATCGAATTTGTATTTACTTTTTTTGCTCAATTTTTTAAATT
GAAATTTCAAGAAACTGCCAGAAATACACTGTATTATAATTATAATTTTG
AAAATTTAGTTTCTATGGATTTTGGTTTTTTAAATACCTTGTATTTGTCA
TGAGAAGAAATCAGTAGAACTTCTTTTAACAAAACATTTTTTTGGAATAT
TTTTCCTTTCCATATTTTTTCTTTCTTTTAAATGTAAATTAAATCGATTT
GATATCAAATGGTAAATTCCTTCTCTTTTTTTTTAAAAGTTGATTTTTAA
AGAAAAGATGGCGTTTTTTATATAAATTTTAACCTCTTTCCTTCTTTCTT
CTTCAATTTTTGTCTTTATGAATAAAAAAATATTCTCTGAGATTGAGCTT
TTATGGCATCTTTTTAAAGTAAGAAATTTTGACAATTAAAAATATCATCC
CTTACAATTTTTGGCAATTTGCATATTTAAATTGAAGAAATTTAAAAGTT
TTATAAGAATGTCCACGTATGCTGTTACAGTTAAAAAAAATTCAAATTTG
CTTTTGCAAGGTTTCCTTAGGGAATATTAAAGATCTTCTGCAAAGTATTT
TTTGGTGTATCTGCTATTTAGTCCACAAAGTAAAATTGTTTGTCTAGCTC
ATATAGTTAAGCTATTTGGTCAAGACAATATGATAAGATATCCTATGGCT
TTCATTTACCATGGAGTTTTCTGTATTTTTGGAAATCGGAAGGCTTTAAA
AATTTCATATCAAAGACTGAATGTCTTTTATTGAAAGCGATTGTTTCTCT
CAGACGTCTCATTTTATACACCAACATTCTTTTTAAAAACATTTTCAAAC
TTCTACAAACTGTTTTATGTGTGGGTGTTTTCCTTTTATTTTTTATGATT
ATTCTAAATAATGAGGAAAAAGTTGAATTATTGATGAAATTCACAAAGTT
TCTCTAATTTCTCAAAATTATGGTTAAACACTATAAAAACACTAAATTTC
TAATAAATTAAGACAAGAAATAGGAGTTTAAAACACATTCTTTAAAGTTC
AACCTGGTTCAACAGTTTATAACTAAGCGGATTTTTCATCCACTCATTCG
AAACCCTTTGTCTCACTTTATACTAAATCAAAAAATGAAAGTCTTTATTA
AACCCAAATCAACTTGGTGATTTGTCTGACAAAATGTTAGCTCATTAAAA
TTCTCATTTAATATTTTAATAATCAGTGTCCAAGGAGTAGACAAAACTTA
TACAAAGCAAGTCTTTTTCAGTTTCAATTTTTTGCAAATAATTAGCCTAA
AACCAAACCAAAGAAAAAAACAGTTTATGAGTGCCTCTTTTGTAGCCAAT
TTAATTATTGTTCGCTTATCTGGATGTTTAATTGCACAGGGGAAAGTTTT
TGAAGATAATAGGTTATTATATTCAGATCACACATCCTATCTTTAGAGAA
GAAAGGGCCATTAAATTCCATCATAAAAAAGGTTCCTCTGTTAATCAAGA
TGTTAAAGTAAATTGCCAAAAGCCAAACGCCAAACGCCTTTATTGATCAA
GAGAAGTAAATTGCTCAATAATATATTCTTTATAAAACAGATTTCGTTCA
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TCCAGATAATTGTCTAACTCTAAGTATTTTTAATTAATTAAAGGCTAAAT
ACTAAATTGGTTGGGGGTCAAACATTTTGGTGACACCCACCCTTATGAAA
AATGACTTGCATTACTCCAATGGTCATCTTCACCTTAACAAAATCTAGAA
AAGCCAAAAAGTCAGAAAAATAATTCAAATTTCCCAAATCATGTAGTCAG
GGAATTTGAAATCAGGAATATTAAAAGATGACATTTGGCACATTTTGATA
CGAAGGAATGAAGTTATAACTGAACAGATTAAAAATAGAAAGATAGTTTG
AACCATAGGGGATGATTTTAATATAACATGGTGTTGACATCTCCACGTAT
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GTGAAGTACTTTTGGGCATTGTTTCAAGTGTTTTTTTATATTCTAATATT
ATCCACTTTGGTTTCTAGACTCGAAGAGAAGATTAAAAGATGTACTGCAG
GAATTTCGAGAAGGTTATCATGAAGGTTACGACCCTGAACAGGTAAGCTC
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TTTCCATTTGTAGGTAAATTTAAAGGGACATTAAAGTACTGACGAAATTT
GTAAACAAACCGTATGCAGCGGGATACAAAATCAAAACAAATGTCACATG
TCAAAATAAAAAAATAAAAACAAATAATGGCTGATTTTGATTGTTTCAAT
TCTTTTACAAGTTTGTTTTGGACACGTGATTTTAATTGTTCAATGTTTAC
GTTTTACTACTTTCACTTTTATGTCCATTTAAAGTGATTCTCTTCCCGAG
ACTAACATTTTGCCGATTCAGCATTATTATACTATTTTCAGTTGCCTTAT
TCCTTGACATCAATTGATTTTTTTTGTTGACAAACCATGCTCGCAGGTAA
CGGCTCCGTTCGCTCTGAAACGAAATCAAGCCGTTCTANAAATAATTCAA
ATTTCCCAAATCATGTAGTCAGGGAATTTGAAATCAGGAATATTAAAAGA
TGACATTTGGCACATTTTGATACGAAGGAATAAAGTTATAACTGAACAGA
TTAAAAATAGAAAGATAGTTTGAACCATAGGGGATGATTTTAATATAACA
TGGTGTTGACATCCCCCCCACGTATTAAACTGCTTTTTTTGATGTTGAAA
TTTGAGTACAATTAGTAGCTTTTCAAGGTTACTGAGTAAAGGGTAAGAGG
GTCTAACTTTCAAGTTTCAAAAATTTCAAGTTATGAAGTCAAGTATTAAG
TCAAGTGAAGTCACTTAAAGTCAAGCGTAAAACTCGACTCTTAGTAAGGC
CTAAAAGCCTGGAGCTGTATATTATGAAGACTAAGTTGTGAAGTACTTTT
GGGCATTGTTTCAAGTGTTTTTTTATATTCTAATATTATCCACTTTGGTT
TCTAGACTCGAAGAGAAGATTAAAAGATGTACTGCAGGAATTTCGAGAAG
GTTATCATGAAGGTTACGACCCTGAACAGGTAAGCTCACTTTTGAACTGT
TAGNTTTGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTT
CGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTACCAGCTTTTCTCGAGATTGGCTCTT
TAGTCTTTTCTGATTTTTTGCACAAAGATGCATAACTATAAACCCTCGAA
TGTGACGGAGCCCGATTTTCGAAAAAAAAAATTTTTAGGCAAATTTGGGC
CAAAAAACGGCTATAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGTGAAAAATTGGATC
ATTAATTTTTTCTGATTTTTTGTATGATAGTAGGGTACCATCATAGGTAA
AAGATGGCTCAAGCAGATTTTCGCAAAAAAATTTTGTTGGCTTAAAAAAC
GCATGTTTAACTATAAGAATCAATATTAATAAGCATACACTAATGTTCTT
AGTCAAATTACTACATTTTTTTATGAGATAGATGTTTTTTTTCTCATGAG
GGCTTACTTTTAAAGAATATATGTGTTTAGACATGAACCTTTGGTTACTT
GGCGTATGTTTGTAGAAAAACTGGCCAAATTCGATATTTTTTTATAAACA
CATTATCAATTACTTAGGTATTAGCTTTTCTCGAGATTGCCTGTTTCATT
CTTTATTATTTTTTGCACAAAGATGCGTAACTATAAACCCTTGAATGTGA
CTGAGCCCAATTTTCGAAAAAAAATGTTTTTGGGCAAATTTGGGCCAAAA
AACGGCTAAAAAACGGGTTTTTTGGACTTTGAAAAATTGGATCATTAATT
TTTTCTAATTTTTTTGAATGAAAATAGGTAAAAGATGGCTCAAGCTGATT
TTTGTAAAAAACGAATTTTTCAGCTCAAAAAACGCATCTTTATCTATAAG
AATCACTATTAATAAGCATACATCAATGTTCTTAGCCAAATTACTCAATA
TTTTGATGAGATCGATGTTTTTTTTGCTCACGAAGTCTCGAATATGAAAG
AATATTTATAGAGCATGAAATTTTGGTTTCTAAACGGTTTTTTATAACAA
ACAAACGACTAATTTTAATAGATCGGCACTATTAGTGTTCTGAATGATTG
TTTAATTGTCACGCTCACGTAGATATCAATTATATATGTGTTATATGCAT
AACCAGGTAGGTCCATAAAAGTATCACTTGTTTCAATTCAAAAGAAAAGT
GTTTCAAATTTTATCAGATCTATTATACAATTAAAAAGTCATTAAAAACT
TTCGGTTATTTTAACCCTTAGTTGATTGTATTGAACCCTACCAGTAAAAC
ATCTCCCCTCCATCATTAAGTTGTTATTTTTCAGGATAAATGGCTTTATG
GTTCTGACCTAAGTCAAGACTCCCTTGAGAAGAACCCACAGATTTTTGTG
AAGTCTGAAGATGTCGTGCTTTTTAAGCTCTTCCAAGCAAAAAAAAGGGA
CTATCGCAAAAAATAATGCTGCTATTGTTTTCGAAAATCCGTGAAGCTTC
TTATTGGTCAAGCGCTGAAATTCTATTGTAATGTCACGTGACATCGGCAC
AAATTTCAGCCGAAGCACGACTTCTAGCCCTTTGGGCTTTATAAATCTAT
GGAAGAATCCCTCTTTTAGGTTGTAATTCTTTTCTTCTTTTAGCCTATGG
GTTACGATGGATTCAAACTATTCATGTCAGTCTATTTGGGACAAAGTGTG
AGCGAAGAATTGATGCAGACTTTATTTTGGACTTTCCATAAGAAAGTTCC
CAGAGGAGATGCAAAGTCACCAGATCTTCCCAACACAATATTACGAAAAA
TCTTAGTAGAAAATGGAAATGTTTCGCAAGAGAGCTTAGACCAGCTGAAT
GGTAACTATATAGCTTAACTCCAGAAAAAAACATTGTTTTTTCCCTAAAA
ATGTAAAGTTTTAAATTATGATAAAAATTCTAAAATTCTAAAATTTAAAA
AACTTTAAAAGTCGTTTTAATTAATCATACGTGTAATGTTCATTCAAAAC
ACATACACTAGCGGTTTCATATTATAGGATTTAAGTCTATTCTCATTTGA
GCACTCTTTTAGGAATAACTAGATTATGTTAATTTATAGGATGCATTGTA
AAGGCTGCTTGAATTTACTCTCACTGTTTTTAATACACTTTATTTTTGCA
AAAACTCTAATCACTTTTTTTCACTTAATTATGTAAGAAAGCACTCATCA
TATTTCTATTCCAGAAAGTTCATTGTCAAGGATCGCAAAAGGTGCACGGC
GAGCGACGGTTGTTGCCACAGCAACAGTTGTAGCAGGTATTAAACAGAAC
GGTGAAACTACAGAACTCGAGAGTATCAAAGAAGACAAAGAAAATTCTCG
ATTATCTTCTTCCCTTAATATAACATCCACTCGTACTAAATGTTGTAATG
ACACACTTACACCAGGTTAGCTAATCATTCCATGCAACACTTTGCATACT
ACTTTACGCTTGCATGTACATTCAACACGACAAAGTCATAGAAGTCTAGT
TTTCACTTACCGCACAGTCAATAAAACTACATATTGAGCTATTTTATTGG
CTGATAACACGAATGAAATACACTTTTTTATAAGAACATCCAAAATCTTT
GAAGCCTTCGGATGTTCTTGACTTTTTGAGTTTTAAGCCAAAAAATGTTT
TTAACATATATGTTCTTATTTTCGTCATTTTATGGGCATTTTTGCCTTTT
TTCCTAAGAAATCGGGTGTTTTAGAGTCCACGAAGCCTTAAAAAAATGTT
CTTAACTTGTTAACCGTTGAAACCTTATGTTCTTTTATATAGTTTGTTCT
TATAAAAAACGTGTACTAGTATTATTCATTCAGACAATCCCTACCCATTC
CTTTATAAACTGCTGTTTATACTTAAATTCCTAGGACCGCTGCACTAACG
CTTGTTACAGAAATTTGACATAACATAATTACGCAACGACACTGTCAAAA
ATCACTAACATCTTATTAATTAAGCATACATTAACCTAAAACTAATTATT
AACATATACTTCAAGAGAAATTACAGCGGGGAGTTTCCATAACTCATATA
CGCGCGCTGAACGCAAAATTTGCGGTCGGTATTATATCTTATCGGTAGAA
AATTCGTCGGCTATAAAAATTCGTCTGTAAATATTTTGTCCCCAAGAGAT
TTTCTCGTCTACCGATAGTGACATGATTGTTAAATTGTTGTACTTGTTGG
AGTCAAGGAGACACTCGCAAGCTCGGTCGTTACTTGACTTTGGGCAACAT
TTCTCAGAATAGCGTCAACTAACCGGTCATTATTGTATTAGTGTAGTAGG
CCCGTCGTCATGCTAAAAGAACCAATTGTATTGCTCAAAAAGCCGTGTAG
CCTACTTCGAGAAAGTTACCGGTTAACAACAGGTTTCGGGTATGGAGTAT
GGAGACTCAAGCCACTGTAATTTCAAATCGAATTTATTTTATTCAGATGA
CATACATACACAATATACGTTCTAACAATTTTTTTTTTCTTTATGAGGTT
GTGTAAATGCCTCTTAGTCCCCGAAGATCCCATTTTTTGCTGTTTTACTT
TTTCGAGAAACTACATGACAATATTTGTCTTTCAATCCTTCTTGTCAATG
ATTACATCTCCTTCTCACAGATCCGGTAGGATTTTTTCACCCAGTTGGGA
TAGAAATAACGGACTGAAAGTCTAGTGAGAGCTACAATGTTCTTCATGTG
CACAGACTTGTTAAAAGCAAACTAACTTTTTTAAATGATCAATTAGGTCT
ATAAGATCACAAAAACGAGTGGTGAGAAAAATTTTGACCATTTTGCTGGT
CCCCATGTGACGTCATCACTTTTTCTGGGGCTTGAAAATGAAAATGGAAG
TGAAAATTTGAAGCTCATCAATATTTGAGAAGCTATAAAGAAAAATAGCT
CAAAAAATGACGTCATCGATGACGTCATCGGCAATTAAAAAATCGTCGAA
ATCGAAAATTTTTTGTTTCATTTGAAAGGTCCTCTTTTTTCCCAATGCTT
GAGAACAAAAAAAATTCAGTGGGGATGGTAAAAAAAGCATCACATTTTGT
AGTGAGGATTGGTTTATTTGATTATTATCAGTGGAACAAAAATTGGAAGA
TATATTTGTGCTGGGAACGATATTTTGGACAATTTTTTAAGTGGGAGGGC
TCCCAGTTGGTCTGTGAGATTGGGGTGTATGATTTGAGGACTTTTTGAAA
ATATCTGTAAAAATAAAATTGATTTGTATTATATTGATATTTAGTCCTAT
TTATTTGTTTTAGGTGATATTCCAAGGAGAGCAATTTCAGAAGCAGAGTT
ATCACGCATAGACAAAACTAATGATGAAATGCTAACACCTATAACAAAGA
GACGATTATTTTTAGATACAATGACACATCTACCTATGATTGAAATCAAA
GAAATTGCTTGTTATTTATCACTACTAGAAGGTGGAGATGTCAAAGATAA
ATTAGAATGTAAGTGAACGCTGCCCTTACAGAAGGAAGCAATTTCTAGAA
ATTCTAGAAATTCCATAAACTTCTTCTACCGGGTGTCCCAGAAAAAAACT
AATTCTGTAAACTGTTAAAGAATCGATCCTTTTGTATTGAAAAGAGAAAG
AATAAACTTAAAGATTCTACCCTGATTTTTCGCCTTTTTTCTATGATGAT
TTTTCAGTATTTAAACCATAACTTTTGATCTAGTTAATCAAATTTGACAA
ATGACCCCTCAAAATTTAAGTTTATCTTACTTTTTTCTTTTCAATGCAAA
AGGATTGATTCTTTCAAAGTTCAAAGAACTCAAGAAAATTCACTTCAAAG
AGGGGGACTTTTTTCTGGGACACCCGCTACAAACTTTTAGATTTAAGACC
TTTATTTTTAAATAACGTAAAACTACAGATTCCCCCGATACGTTTTTTCT
TGAAACGACTGAGGAATTTTCATGGCTTTTAATTAAGCAAGATTTAGGCG
TATGAGTCAATAGTCCTGCCCACACGACCAATGCCATACTTAAAGAATCT
AACTACATACGTACTTTTCTCCACGTGGTACCAACAAGATAAAGCAATAT
CTCNTTTCAGTATTTAAACCATAACTTTTGATCTAGTTAATCAAATTTGA
CAAATGACCCCTCAAAATTTAAGTTTATCTTACTTTTTTCTTTTCAATGC
AAAAGGATTGATTCTTTCAAAGTTCAAAGAACTCGAGAAAATTCACTTCA
AAGAGGGGGACTTTTTTCTGGGACACCCGGTACAAACTTTTAGATTTAAG
ACCTTTACTTTTAAATAACGCAACTACAGATTCCCCGATACGTTTTGTTC
TTGAAACGACTGAGGAATTTTCATGGCTTTTAATTAAGCAAGATTTAGGC
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GCTGCAACATGTACAAAACTAAGCAACTTCTTAGAAATTATTGTAAGTAA
AAAATGTTCTTTTTTATATCGACAAGAATTTTTATATAATATTATCATTC
TTGCTTTCTTCTCGAATATTTGGGATAAGAATGTCTAATTGAAAGACACT
CTATATCCACTTCTGTTTTCTTTTCCGGATTTGGTAATCGGAATTTCACT
ATACCGGGTATTAGTATGTAATCTTGTATGATGTTATTCTATATGGATGA
AAAATCCAGATAGTTAATCTGACCTTGAATTCAAGAATGGAATTTTCATT
ATTTTGCCCTTTCCCTCTGGCGAGTGAGTTTTATAAAAGAGTGCAATATT
CAATAATTTCTCGCCTTTTTTTTAGTGCGATGGCAAGAAACTTGAACTAC
CCAGTTTAGAGGGTATTGCAATATTGAACATCCCAAGTATCTACGGAGGA
GCGAATATTTGGGGTGAACCGGAGAAGAAAAGGAAAAGGAGGAAGAAGAG
TAGTGGCTCTTCTGGTGATGAACCTGAATCACTCGGAAGTGTCAGCCAAG
GTTTGTTTCCGTATTTTTTATCACCGTTTTAAGGGTTCAATCGTGGCATG
CGTTTCATGTTTGCATTTACCGGTCTAAATACTCAGATTCAAAATTTGCC
AGTTTGGCAGAAGAAGGATGGGCTCTCCTCAATTTCAAACTTTGTTTTGC
TTTTATTTCCTTCTGAATCGCATTAATATTCTGTTCAAAACTCATTATGG
GGTTTCAAAGCGGCCAATACCGTTACTGGCTGTTTCTGGATAACGCCTAC
TTTGAAAACGAGAAATTTAAACCGTTCAAAGCTTCTAAATTATACTTTCC
CCGAGGTAGGCATTCACGAAATTCATAAATTTTGTTCGCATTCTATTTTA
GATATAAGTGACCGCAAACTAGAAGTCGTTGGTTTGGAAAATAGTTTATA
TGTTGGTCAAATCATCGCTGGTGTCAGACAACATGGTTTAAGATTAGCAC
AATGCTCGACTGTTGTTATTAAGTATGTTTCTTTTTGTTGAAGTAGACCC
TTCCTGCTTTTGAAACTTACTCAAACATCTTTTTCCAAACATCTTTTCTT
CTGAAATGAGAAAAATCAGAAAGTAGCCATGTTATTTAAACATTGTGTTA
CAGCCAACCATTTTATTGACAGCTTACCAATGCCTAGGCTGCACGCATCC
CCTCTGATATGATTTGATATAACAAAATAAATTCTGGGGATGCGCGCAGC
CTAACCAACGCCATATTAACGTCTATAATTTTCATTTTCATTTTTTAGAA
TCATGAAGACAATGCCAATGCAAATCGACGGTGAACCTTGGATGCAGGCA
CCTGCTCA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_041707	XLOC_041707	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_458	supercontig	scaffold_458:38287..71544 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0.35022	1.53185e-07	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00066699 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: DGKB (Diacylglycerol kinase beta OS=Homo sapiens GN=DGKB PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 672.929 bits (1735), Expect = 0.000e+0
Identity = 383/801 (47.82%), Postives = 509/801 (63.55%), Query Frame = 3

Query:  576 WDRLHPDEFTKLQEYTKYSKRRLKDVLQEFR-EGYHEGYDPE-------QPMGYDGFKLFMSVYLGQSVSEELMQTLFWTFHKKVPRGDAKSPDLPNTILRKILVENGNVSQESLDQLNGDIPRRAISEAELSRIDKTNDEMLTPITKRRLFLDTMTHLPMIEIKEIACYLSLLEGGDVKDKLEFVFRVYDSDNNDYLDGEELESIVSQMLRVAEYLGWDTTALKPILTDMLADMDYDSDGQISLEEWVKGGMNNIPFLVLMGMEIKVDEEGKHQWAMKHFKTQAFCNICHGVLAGFGRKQGLQCIFCRFTCHERCVQRSPNSCISTYTQNKTKRKVTEMDHHWVEGNCPGXXXXXXXXXX-XXXXXGLHCVWCSAQVHNRCVTNMPVMCSLGPHKVHILPPICITPA-----------------SXXXXXXXXXXXXNSVI-----------SYDGIPMQITPLPDTKPLIAFINPKSGGRQGARLLNKFRYLLNPRQVFNLAEGGPFPGLKFFAQVPDFRVLCCGGDGTAGWILATIDRLTSLKQRPPMAILPLGTGNDLARCLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXMMDRWQIDCDNFEKTSIEGDIMPQNIMNNYFSIGVDAAIALKFHLQREKNPEKFNSRFKNKLRYFQAGTSEQLAATCTKLSNFLEIICDGKKLEL--PSLEGIAILNIPSIYGGANIWGEPEXXXXXXX-----XXXXXXXDEPESLGSVSQDISDRKLEVVGLENSLYVGQIIAGVRQHGLRLAQCSTVVIKIMKTMPMQIDGEPWMQAP 2846
            W  L P EF++LQ+Y +YS ++LKDVL+EF   G    Y+PE       Q + ++GFKLFM  +L   + ++    LF +F  K P         P  +   + +  G ++           P R  S A     +                        +I +K+I CYLSLLE G  +DKLEF+FR+YD+D N +LD  ELE+I+SQM+ VAEYL WD T L PIL +M+ ++DYD DG +SLEEW++GGM  IP LVL+G+E  V ++G+H W +KHF   A+CN+C  +L G G KQGL C FC++T HERCV R+P SCI TY   K+KR    M H+WVEGNCP KC KC+KT+K    LTGLHCVWC   +HN+C +++   C  GP K HILPP  I P                  S  K EK    + N VI           + DG  +Q+TP+P T PL+ F+NPKSGG+QG R+  KF+YLLNPRQV++L+  GP PGL FF  VPDFRVL CGGDGT GW+L  I++  ++ + PP+AILPLGTGNDLARCL WGGGYEG +L K+L+ +  S+ +M+DRW+ +    +K   +GD +P +I+NNYFSIGVDA+IA +FH+ REK+PEKFNSR KNK  YF+ GTSE  +ATC KL   +EI CDG +++L   SLEGIAILNIPS++GG+N+WGE +K+R  R+         ++  + + L   SQD+SD+ LEVVGLE ++ +GQI  G++  G RLAQCS VVI+  K++PMQIDGEPWMQ P
Sbjct:    7 WAHLSPSEFSQLQKYAEYSTKKLKDVLEEFHGNGVLAKYNPEGKQDILNQTIDFEGFKLFMKTFLEAELPDDFTAHLFMSFSNKFPHSSPMVKSKPALLSGGLRMNKGAIT-----------PPRTTSPANTCSPE------------------------VIHLKDIVCYLSLLERGRPEDKLEFMFRLYDTDGNGFLDSSELENIISQMMHVAEYLEWDVTELNPILHEMMEEIDYDHDGTVSLEEWIQGGMTTIPLLVLLGLENNVKDDGQHVWRLKHFNKPAYCNLCLNMLIGVG-KQGLCCSFCKYTVHERCVARAPPSCIKTYV--KSKRNTDVMHHYWVEGNCPTKCDKCHKTVKCYQGLTGLHCVWCQITLHNKCASHLKPECDCGPLKDHILPPTTICPVVLQTLPTSGVSVPEERQSTVKKEKSGSQQPNKVIDKNKMQRANSVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPKSGGKQGERIYRKFQYLLNPRQVYSLSGNGPMPGLNFFRDVPDFRVLACGGDGTVGWVLDCIEK-ANVGKHPPVAILPLGTGNDLARCLRWGGGYEGENLMKILKDIENSTEIMLDRWKFEVIPNDKDE-KGDPVPYSIINNYFSIGVDASIAHRFHIMREKHPEKFNSRMKNKFWYFEFGTSETFSATCKKLHESVEIECDGVQIDLINISLEGIAILNIPSMHGGSNLWGESKKRRSHRRIEKKGSDKRTTVTDAKELKFASQDLSDQLLEVVGLEGAMEMGQIYTGLKSAGRRLAQCSCVVIRTSKSLPMQIDGEPWMQTP 767

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00066699 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00066699 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
DGKB	0.000e+0	47.82	Diacylglycerol kinase beta OS=Homo sapiens GN=DGKB...	[more]

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TCONS_00066699 (transcript) - C. hemisphaerica