TCONS_00066838 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00066838
Unique NameTCONS_00066838
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length274

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00066838 ID=TCONS_00066838|Name=TCONS_00066838|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=274bp
CAGATACCGATAGGTTGGGACGATATGTAAACAACTCAAAAAACTTCAAC
TGTTTTACAAAAGTAATTGCTGACCCAATGTCTACTAAGTTACACCTCGG
CATTTTTGCTGCTAAACACATTGCAATTGGAGAGGAACTTCGTTATGATT
ACACAGACACCAATTTATTTTGGAGAAGAAAGGACGAATTCAAAAATTAC
AGAGATCCGCTTAGAAAAGATCAGCTATCTGCATTCAGGAAGAGTGGCGA
AGAAGCGAAAACAAAAAGTGATCT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_460:41210..52675-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00066838 ID=TCONS_00066838|Name=TCONS_00066838|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11466bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_460:41210..52675- (Clytia hemisphaerica)
CAGATACCGATAGGTTGGGACGATATGTAAACAACTCAAAAAACTTCAAC
TGTTTTACAAAAGTAATTGCTGACCCAATGTCTACTAAGTTACACCTCGG
CATTTTTGCTGCTAAACACATTGCAATTGGAGAGGAACTTCGTTATGATT
ACACAGACACCAATTTATTTTGGAGAAGAAAGGTATATATGCTAAACGAC
ATATGAATAAAAGCCACTTCGACTGCTTTTGTAGTATTTTGCTAAAGTTG
TATTTTCTGATTACTTCTATTTTGCATGACAATAAGAACCGTTTAGATGA
TATTATGATATAGTGGGAAGGGAGGGAGTGAACAGTAAATTCGGGCACAT
AAAGAAACTGCAGGGTGTCTGGTGAGAATAACAATGATCTGGGAGCTTAA
TTTTCGACGTATCAAGCAGCGGGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATAGTGGGAAGGGAGGGAGT
GAACAGTAAATTCGGGCACATAAAGAAACTGCAGGGTGTCTGGTGAGAAT
AACAATGATCTGGGAGCTTAATTTTCGACGTATCAAGTAGCGGGAAGATG
TCGCATAAGTGGCAAGAGTATTTTATTTCTTAATTCGCTAATTAATGTTT
AAATTTAGCTATTTCTAAAACTTTATTAATGATAAAAATTCTACCCTTCT
CTGAACTAAAAAGCAAATTGACTGAAATGAATTTTAACTGCATTGTTTGA
TTAAATTTCAAAATAACTTGCATTTTTAAAGGACGAATTCAAAAATTACA
GAGATCCGCTTAGAAAAGATCAGCTATCTGCATTCAGGAAGGTAATTTGT
AACTTCTCATCTCATTATTATTTTCAGTTCATGAAATGACGCTCAATGTC
CATAACAAAGGGGTTTGGCTTTTTTATGAGTAGAGAATTGATTAAAAGCC
TAAGGAATGGTATTTTGTGTTTTCCTTTTTTCTTCATGTGAATTATATTC
TATATTAATCATTTTTTTAATTGTTCAGTGTGACGAAGAAGCGAAAAAGA
AAAGTGATTCATTTTGTCAAAAGACTGAAAAGGTAATAGTTTGTTCTTTT
GTCTCAGTAAATTTAGTGCCCATTATGGTGTAAAATCATTCTTTAATTAA
TATTCATCGTGAAATGAATCCCATTGATTCGTCCATGGCTGTGGTTCCAA
TAATGCTACTCATATACGGGTGAAGAATGGACCAAAGGGGAAAAAATGNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCTTCCGATCTGGTCCTAATA
ATGGCACTTTGTTATGAGTAGATAATGGACTAAAAGTAAAGGAAATGCGT
TTTGTCTCTTTCCTTTCTATTTTTGTTAGTAATTTTTTTTCCATTACACA
CAGATTGTAACCTTTTATTACTTTTATGTTAAATATTCAGAGTGACGAAA
GATTGAAGACCGAAAGTAGTTCATTTGTTGAAAGAAATGAAAAGGTATTA
GTTTGATATTTTTGTCTCAACAATTAATCTGGTCCCAATAAAGATATCCG
GGTCGTTATTTGATCACTATTCATCGTAAAATAAGTCTCATTGATTCGCC
CATGGCAAACGGTTGTGGTCCCAATAATGGCATTGTTCATTCTCATTCCA
TAAAGAAAAGAACAGTGCTTTGTCTCTTTACTTTCTTTTTGCATGAGTAA
CCTTTTTCCTTTCACAGAGATTGAGACATAATTATTTATTAAAATATTTT
TCTAAAATATTCAGGTTGACGAAGGTGCGAAAAGGGAAAGTGATTCATCT
CGTCAAAGGACTGAAATGGTAATAGTTTGTGCTATTCGTCTAGATTAATT
TGGTCCAAATAAAGATATTCTTTGAATGATTGATTAATTTTCGTCATATA
ACGGAACTCCTTGGTCAGTCTATGACGAAAGTTTGTGGTCCTAATAATGG
CACTTTGTTATGAGTAGATAATGGACTAAAAGTAAAGGAAATGCGTTTTG
TCTCTTTCATTTCTATTTTTATTAGTAATTTTTTTCCATTACACACAGAT
TGTAATCATTTATTACTTTTATGTTGAATATTCAGAGTGACGAAAGATTG
AAGACCGAAAGTAGTTCATCTGTTGAAAGAAATGAAAAGGTATTAGTTTG
TTCTTTTTGTCTCAACAATTAATTTGGTCCCAATAAAGATACCCTGGTCG
TTATTTGATCACTATCCATCGTGAAATAAGTCTTGGTCCCAATAAAGATA
TCCTGGTCGTTATTTGATCACTATTCATCGTGAAATAAGTCTCATTGATT
CGCCCATGGCAAAAGGTTGTGGTCCCAATAATGACATTGTTTATTCTCAT
TCTGTAAGAGAAATGAACTGTGCTTTGTTTCTTTACTTTCTTTTTCTATG
AGTAACCTTTTTCCTTTCACAGAGATTGAGAAATAATTATTTATTAAAAT
ATTTTTCTAAAATATTCAGGTTGACGAAGATGTGAATAATAAAAGTGATT
CATCTCGTCAAAGGACTGAAATGGTGATAGTTTGTGTTTTTCGTCTAGAT
TAATTTGGTCCCAATAAAGATATTCTTTGAATGATTGATTAATTTTCGTC
ATGTAACGGATCTCCTTGGTCAGTNGTGCTTTTCGTCTAGATTAATTTGG
TCCCAATAAAGATATTCTTTGAATGATTGATTAATTTTCGTCATATAACG
GAACTCTTTGGTCAGTCTATGACGAAAGTTTGTGGTCCTAATAATGGCAC
TTTGTTATGAGTAGATAATGGACTAAAAGTAAAGGAAATGCGTTTTGTNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTATTAAAATATTTTTCTAAAAT
ATTCAGGTTGACGAAGGTGTGAATAGGGAAAGTGATTCATCTCGTCAAAG
GACCGAAATGGTAATAATTTGTGCTTTCCGTATAGATTAATTTGGTCCTA
ATAAAGATATTCTTTGAATGATTGATTAATTTTCGTCATGTAACGGATCT
CCTTGGTCAGTCTATGACGAAAGTTTGTGGTCCTANNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATTTTATTACTTTTATGTTG
AATATTCAGAGTGACGAAAGATTGAAGACCGAAAGTAGTTCATCTGTTGA
AAGAAATGAAAAGGTATTAGTTTGTTCTTTTCGTCTCAACAATTAATTTG
GTCCCAATAAAGATATCCTGGTCGTTATTTGATCACTATTCATCATGAAA
TAAGTCTCATTGATTCGCCCATGGCAAAAGGTTATGGTCCAAATAATGAC
ATTGTTTATTCTTATTTTGTAAAATAAATGAACAGTGCTTTGTCTCTTTA
CTTTCTTTTTTTATGAGTAACCTTTTTCCTTTCACAGAGATTGAGAAATA
ATTATTTATTAAAATATTTTTCAAAAATATTCAGGTTGACGAAGGTGTGA
ATAGGGAAAGTGATTCATCTCGTCAAAGGACCGAAATGGTAATAGTTTGC
GCTTTTCGTCTAGANAGGACTGAAATGGTAATAGTTTGTGCTTTTCGTCT
AGATTAATTTGGTCCTAATAAAGATATTCTTTGAATGATTGATTAATTTT
CGTCATTTAACGGAACACCTTGGTCAGTCTATGACGAAAGTTTGTGGTCC
TAATAATAGCACTTTGTTATGAGTAGATAATGGACTAAAAGTAAAGGAAA
TGCGTTTTGTCTCTTTCCTTTCTATTTTTGTTAGTAATTTTTTTTCCATT
ACAAACAGATTGTAACCTTTTATTACTTTTATGTTAAATATTCAGAGTGA
CGAAAGATTGAAGACCGAAAGTAGTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTATGTTAAATATTCAGAGTGACGA
AAGATTGAAGACCGAAAGTAGTTCATCTGTTGAAAGAAATGAAAAGGTAT
TAGTTTGTTCTTTTTGTCTCAACAATCAATTTGGTCCCAATAAAGATATC
CTGGTCGTTATTTGATCACTATTCATCGTGAAATAAGTCTCATTGATTCG
CCCATGGCAAAAGGTTGTGGTCCCAATAATGACATTGTTTATTCTCATTC
TGTAAATGAAATGAACAGTGCTTTGTCTCTTTACTTTCTTTTTCTATGAG
TAACCTTTTTCCTTTCACACAGATTGAGAAATAATTATTTGTTAAAATAT
TTTTCTAAAATATTCAGGTTGACGAAGGTGTGAATAGGGAAAGTGATTCA
TCTCGTCAAAGGACCGAAATGGTAATAGTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
TTGAAGACCGAAAGTAGTTCATCTGTTGAAAGAAATGAAAAGGTATTAGT
TTGTTCTTTTTGTCTCAACAATTAATTTGGTCCCAATAAACATATTCTTT
GAATGATTGATTAATTTTCTATTGATCAGAAATGAATATCCTTGACAAAT
CCATGACAAAGGGCTGTGGTCCCAATAAATGGCACTTTGTTATGAGTAGA
TAATGGACCCAAACTAAAGGAAAAGAAAGTTGTCTCCTTCCTTTCTATTT
CTATCAATTATTTTTTGCCTTAAACACAGACTGTGTTCAAGTGTGACGAA
GAAATGAAAACGACAAGAGGTTTAGCTTGCCAAAGAACTAAAAAGGTAAA
ACATTTCGTCTCGATTGAATTGGTTGCAATAAAGATTGTTTTTAATTTTT
AAGATTGCTAACGATTTAATAGATTTTTTTCATTTGTGAGGTAAGTTNAT
TTTTAAGATTGCTAACGATTTAATAGATTTTTTTCAACTGTGAGCTGTGA
GGTAAGTTAAATCCATGATATTTAAAATGCCACATGCTAGAAACTAATTA
GACCATTACATGAAGCAAATTCATATAAATTAATTCTGTTTTTCACATAG
ATTATTAAATAAGTTTTTTTTCTGATATATTCAGAGTGGCGAAGAAGCGA
AAACAAAAAGTGATCT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_041798XLOC_041798Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1575043694:52494..52675TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1575043694:52494..52675Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1575043694:51835..51894TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1575043694:51835..51894Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1575043694:41210..41241TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1575043694:41210..41241Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1510915933:52494..52675TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1510915933:52494..52675Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1510915933:51835..51894TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1510915933:51835..51894Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1510915933:41210..41241TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1510915933:41210..41241Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1491911889:52494..52675TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1491911889:52494..52675Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1491911889:51835..51894TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1491911889:51835..51894Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1491911889:41210..41241TCONS_00066838-exon-scaffold_460-1491911889:41210..41241Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_460supercontigscaffold_460:41210..52675 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	3.03583	0.200151	1.0841	1.14275	0.544875	0.610186	0	0.588914	0.524991	0	1.99446	1.1289	0	0	2.90246	1.1326	1.3747	1.5024	0	0.659841	2.98212	0.0837355	0	0	0	0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00066838 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top