TCONS_00068764 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00068764
Unique Name	TCONS_00068764
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3287

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_49:201977..216498+

transcript sequence

>TCONS_00068764 ID=TCONS_00068764|Name=TCONS_00068764|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3287bp
gaagATGTAAAATTACTATTAATCCCATGAGTAAAAAGAGACACAGTGGT
TCCTTCCTAAACTCATCCTGGTAACAAAAATGCTTATTGAAGTTTTATCA
CAGCTGCTCTCtgataaaaacaatgaaaggaAGAGTGCTTCATCAAAACT
TGAATTGATGCTGAAGGATAATGAGATTGTCATTGCCCTTGATAAGTCAT
CTGGAAGAAAGAAGTCGGAAATCACTTGGGATGTTGTAGTGCAAAGGATT
GCAAAATTTGTTacattggaaattgaaaaagctAGTTCATCGGAAGTTTT
GGAAAAGAGGGCTAAGGAAATTGCTAACCTTTACAAGACAGCAATAAGGA
CCGCTGAAAGAAATAACACTATCCTAAAACCTGGACCAGTGTTCAACCAT
ATTGGATATGTTATTGAACGAGTGGAAAAAGGGTCCTTCCTTGAAATCTA
TTCCAATATCTTGGTCAAGCTGCTGCTGCCAAAACGAAAACATTCTAATG
AGCTTGGACCAAAGCGATGGAAATtttttgtGGAACTATTTTGCCAGTTG
TTGGAAGCGAATCAATCACACCAGTCAGCTTTTGTTTACGCAAGTGCACT
TCATAAACTGATGGAGATTGTATGTAATGTACCAGACGTGGACACCGGAA
AATTGTCTACCTTCTTCAAAGACATTTTCTCTACAAAGAGgtCAAAAGAG
AATGTTTCCTTTTTGGAAACAATGATATCAAGTATGAATTTATTTTGTAA
AGCCTTTGTTTTGGAATGTCAAGCAGAAATTTGTGCTCTTGGTGATGATA
TCTTTCATTTTCTGCTCAATATTTGGAAATCCCAATCTGCTTCATTGAAG
AATCAACTTCTAACCTTCTTTGATGTCCAGTTGAAAACGCACTCAATAAA
TTCTTCCGAGACTGATTTGGATCTTTACCCATGGTTTCATGATGCTTGGA
AAGCCAATATGAAAGAACTATTTGAAGTTTTATACAAAGAAATGGcacaa
atatcaaaatcaaaaaaatcctATCAAAAGAAGTTGATTTCCTTGATGAC
ACAGTTGGTGGGTCAGTTAACCTTCCTCAATGTAGAAGTAAACCCAAACA
TTGAGAATACATTTGAAAGTGGTGAAAACCGGAGAAAAAGACAACGACTT
TCAGATGAAAAACCGTTGACAGCACTTCTGATGGGCATTGATTTTGTGGT
TCGCCCTTCTCAGTCTTGTCTTATATTGAAAGTAATATCCAGCTTGATGG
ATGATCAATCATTTGTCATCAATGATACGACaacaaaagatattttaaat
aagATTGCAAACAATGCCAGTCTACCAGGTATTGACGTCGAACACAAAAA
CAATGTTTTGTTACATTCAATTGCTGTTGCATCTCACTGTTGCGTTCAAA
CCAAAGGAGAATCGAATGATTGTAATTTGGAATTACTGAAGATTTTTTAT
GTTTGTCACAAAAGCATGAAGAGTATAGCTGACCAAGAAAAATTTATCCC
TTTCATCAGAACCTTGATTCAATTCAAGGTGTTGAGGATAAATCAGGTTT
TCAAGAGAGATGATCCCCTTGATCAATGGCATTGTTCAAGgGAATTGTTG
ATTCTGTTTTTGGAGATGGCGGCAAGAAATTACTTTCCAGACAACGAGCA
CaatgaagaaagggagaaaaCACTCTTGAATGGCTTTCCACAGAGAAACA
TGCTTTACAACTGGCTCATCCCACCCTCAAATCCCTATCAAAACATGGCC
AGTTCAAACATCGAAGCCCTTGCACATTTGGTTGTAATGTTGACATGTAA
AAGTCCAGCACTTTTCTCTGGTCAAAGTGTAAATGTACCCAGAAAAAGTG
GCAAGGTAGATGAGGAAAGTACTGGATCAGTCTACGATATTGTACAAAAA
CCAGCACCAGTAAATATGGAAAAACCTATCAAGCGACAAAATATGATTGA
GGCAGGCTGTGGTTTCCTTATCGAATTGTTTACAAGGTTTTGGAAAGTTA
TGGACACAGTTGAAGAAAAGGATAACCTGGAAATCCACACAACCTCTTTA
TGTTTATGCTTGAAAGTTATGGTTCTGCTGAAGAAACATATCATAGATAC
CGATGCTAATAAACATTTGAGCAAGTTTATAAGGAAGTGTTCGGAACATT
TATCGGTGATGCTCCCGAAGCTTCTGAAGCAACAatcagaagaagaaaga
aaagctCTGGTTGAAGGACTCTCTCTCTTTGATACATttttAGAAGATGC
AAGTGTATGTTCCATTTTCTTTGCGTTGGGCTGGAATCTTGTGGAAGATG
TTCTCTATTCCATTCTcagcaaaaagGATAGTGTGAGTGGAAAATTGAGT
TGTGGCGCCTCTTCGTCTACAGACGACATGATGATGGAATTTGATGATTC
TCCCAACAGTGATGACACGAATAACAATAATCAAGACAATCCATTGACAT
CTGCGAACGTGGGTGAAGAACTTCAAATGGTCGCATGTTCGATCGTTTGC
AAAGTTGTCTTCACCATTGTCAATGAGGAGAAATTGAAAGAACTTTTTTT
AACTGACTTGGAACAGgCTCAAGACAATTGTAAAGGGCTTAAAATGtTGC
TTCAATTGAACAAATGCTTGTCATCAAACCAAAATGTACTACCATCCAAA
GAATTGCTCATTTTGGTCAATGTTACAAGGAGATACCTGCAAACATTCCA
CAACGACCAGGTGGTCTGTGAAAAGTTATTGGAAGGCATTCAACTTTACA
TCAGAATGTCTGGCACAATTCCCAACGATGCTACGATGGAAGAAGCTCGA
TTAACGCTCATCAAAATGATTGAAATCTTTCTgtcagTTGGGTCGACAAA
GTATTCGCCACGCGTTCGCTCGAAGATAGTGCAAACTTTATTCGTCATAC
CAAAGAGCACAACAGAAGAAGAGACGTGGAAGATTGAATTTGAGTTGGGT
GAAGAAAACGGGAAACATTTGGTTTGTGCGTTCGATATCATTCTCACCTT
GTTAATGACTGATCCAAGTTATTTGGTTCAACATTACATTTGTCAAAACA
TGCACAAACTGCTCACTAAACTCAAAGCGGAACAAGTCAAAAAGTTACAG
AATCTCCTCAAAGAAATGACCAAACATGACATGgAAATGGAGAAAGAGAA
GAATCAAATATCCATCCAACTGTTCGTGGTGAAAAACATTATAATTTTCT
GCCCCATACTGGAGAAACAATCTCTCTTGACTCTGATCGAGTCTGCAAGG
AATGGCTCCATCCAACACAATGCTATTTTAAAGGTGa

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_49:201977..216498+

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00068764 ID=TCONS_00068764|Name=TCONS_00068764|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14522bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:201977..216498+ (Clytia hemisphaerica)
gaagATGTAAAATTACTATTAATCCCATGAGTAAAAAGAGGTATTATGTC
TAGTCTAGGAAAAGTGAATAGAATCTCGCAAGTTAATATGTGCAAATTAA
TTTAGAAAACGCTAGAAAAACGCctactgaaaattgaaactatgaaatta
ttgaaatatttcactaatcAAGCATCAATCCTTTAGTTTTTGTTAAGTAT
TATAAATTCATTGGtttcattttctatttcaagccaacatcttagcaaag
aggtgcttgcccatagttaccGTAGAgtgaattttaaataaaaattataa
atattttcaaatgtatGTGTACACAAGAACGCAAACAAAGTGTTCAACAA
AAGCAGAGTTATTACTACTACCTTCTTCAAGAAACACAAAGGGTTAACTA
GGGGAATTCTTTTTTTAGACACAGTGGTTCCTTCCTAAACTCATCCTGGT
AACAAAAATGCTTATTGAAGTTTTATCACAGCTGCTCTCtgataaaaaca
atgaaaggaAGGTTTGTCAATTTTTTCATGTGCATCATTTAATAATATTA
GGTATAATATTAAAGCAATTTAATGAGAGTAGTGAAAACTTTGAACATTC
CGGACCTCCTCATACCAACAAAGTCTAGACTGAGCTTAGAAAAATATCTC
ATTCTTTGGAGTAAATGCCTTGATACTAGCTGTACTAGAAAATGTAAGAG
TACTTAAAAAATCCCTTGAAAAATTGCCCttttcaaaatcaatcaaattC
AATCAGAAATATCTGCTCCTATTTGTTCCTATTAAGCATCATATAAGTTG
ACACAATATCTATAGATATACATATATGTTTTAAACTCAGAGTTTTATGG
TGCTCAGGCACCAATCATCAGTGAAAGGAGATacgttagaaaataaaata
caatatattgtcttcaaaaaatgttatgaTGTCATCAGGTGGTTCAAAGA
tatcaagctgaaattttcgtCTGTGTCTACATTTGGCAATAATTTCTGAT
CTCTTATTCAGTAAGTTCTTTCCTGGGTAGTTTGCAATCTCGAATTTCTT
GGCAAGACACAATAATTACAACGTTTGGTTTCTGGAGTGAAGGTTTTGGA
GTTGTAGATGGTTCGCCACGATACGGTTTGTTGGCCGTTCAGGTCTTTGA
TACGCCATACTTCAATTAAAAAAGTATCAATTGGACCCTAATGATGATAG
TGTTTTATATTTAGAGTGCTTCATCAAAACTTGAATTGATGCTGAAGGAT
AATGAGATTGTCATTGCCCTTGATAAGTCATCTGGAAGAAAGAAGTCGGA
AATCACTTGGGATGTTGTAGTGCAAAGGATTGCAAAATTTGTTacattgg
aaattgaaaaagctAGTTCATCGGAAGTTTTGGAAAAGAGGGCTAAGgta
aatttattttgcaatgcTCTGAGGATATATACAGCAAAGACAAAGGAATT
GAATATCATTTTTTGACTAAAGCTGTCagcttcaaattttcacaaaagat
gtAAATAAGcaaaaggaaataaaaaatggaaaaatattttgaaaaattgc
ttgCGTCAGCAGAAATATatactattttgaaaaaactgaaaaagggtGCC
TTACTTTCGTCAAGTACAAAGAAAATCAATGGACCAAGCAAAACTGATAT
ATAATTTTGGTGGTATTTCTGCTTAAAAAGAATTATCATAactgagaaaa
atataaatgttttttttgttattcttaTTTCGGAAAAAAACTTATGAAAA
CTGGCTATATCTGTTGGCACTcaaaaaaacaatggaaaaccTGGGAAAGA
AAATGATAATTGctatttttacattttgaatACAATGTCAAAACAAAAGG
TCTCCTGGATGGGAAGTCAAATATGATGCATTTCAGTAGTTTTAAATGAT
GAACTGTATACAACGTTAACATTCAAATGACTAGAATGCCAAGATGAAAC
AaagaatctttctttttttggagAGTTAATGTCTATAGAGACAAAAATCC
TTGTATTCTCTCAAGGGACCAgtttttattcaaattagttttcgagGCTG
GCATGggtcaaatcaaaattttcttttaaagttACTTTCATTAAGCACTA
GTTCGTTTTTAGAAGTTTTTAGGCATATTCATTTGTTTGCGAGTCAAGCA
AATGATAAAGCGCTTTTGTAGcattaaaaatatctttgatacacattttg
gtGCGACACTAGTGTTGCTAAGTGATGAAGGTCCAGGTTGGAGAggtttt
ttataaaagatgATTTAGGTAATCATTACAGTACCAACAAATTTGCTTAA
GGagacaattttccaattttctcattttcagaatttctttTGTCTTAAAA
CTCAATAGTCTGGCAATGAGTTTTATTTGTGAATAAATAGGCTCAAAACA
TTAACATAGTTTTATATTGATATGTATTTTACAACATATATCTTTTTAGG
AAATTGCTAACCTTTACAAGACAGCAATAAGGACCGCTGAAAGAAGTAAG
aatattatttttcataatttttaaatgctATCAAAGACCTGAAATGTAAA
CCTCTGATTTTAATTTCTAGTAACTTGTCTAGCTACCCTCTCTTTCGATA
TTGTGAATAGCACAATCAGGCACAAGCACAATTTGCGTGACACAAATAGA
GAGTTTTTTtattatcgaccgccggaggcggtttctttcatagtggtacg
ctaatctcgttttgcctttggctcattactttgtctaccatttactttcg
gttttgttaactagattacccaggtgtttctcttttttttccctggatgt
cttttattcgaaattgaataatcgagacatgaaaaatgactacattgtaa
tctgttttcaattagtaatctaaaatgtactggagaagacatgtaggcgt
taataatgtgcgtgCGCTCtctcgcgagcgtgatgcgtgatggaaggtgg
tcgtttcagtgtggtttacatccacactttGACCTAGTTATTTGATCTGT
CTTTTATAGATAACACTATCCTAAAACCTGGACCAGTGTTCAACCATATT
GGATATGTTATTGAACGAGTGGAAAAAGGGTCCTTCCTTGAAATCTATTC
CAATATCTTGGTCAAGCTGCTGCTGCCAAAACGAAAACATTCTAATGAGC
TTGGACCAAAGCGATGGAAATGTAAGAACTATTAAGAGCTACTTATTTAT
GATTCATTCTTTCACAAATACTAACTAATAAATAAAGAATACtcaaattt
tactttagtttttgtGGAACTATTTTGCCAGTTGTTGGAAGCGAATCAAT
CACACCAGTCAGCTTTTGTTTACGCAAGTGCACTTCATAAACTGATGGAG
ATTGTATGTAATGTACCAGACGTGGACACCGGAAAATTGTCTACCTTCTT
CAAAGACATTTTCTCTACAAAGAGGTATTACTTCTGGAATAATCAAGAAT
AATcaggtttaaaattttaagtTGTGTTAAtctcaataaaaaaattattt
tacagatcaaATATGATGAGTATTTGGTTGAAAGTGCACTTATAAAGCAA
TCcctaatattttcttttcttttaggtCAAAAGAGAATGTTTCCTTTTTG
GAAACAATGATATCAAGTATGAATTTATTTTGTAAAGCCTTTGTTTTGGA
ATGTCAAGCAGAAATTTGTGCTCTTGGTGATGATATCTTTCATTTTCTGC
TCAATATTTGGAAATCCCAATCTGCTTCATTGAAGGTAATATCAACTGGC
CTATTAacattttttgctcaaattttgtgagGCAACTCCACATGACATGT
ATTTTTGGGACAGAGGGTCAATTTTTTGCCACCTTTTGGTatggtgtatt
ttacagaccggcccAGAATTGCCCTTTTTTGCCTAAACAGCCCCTAGGAT
ACCATATCTCATGATTGAAAAATGCTATTGAAATTGTGACAAGTATTAGG
TATTAATGTTACAAGCTTGTAGCCAAAATTTTAGACAAATCGGACGAGGG
GGTTGTGCTGAAGGTgagcattttaggtaaaaaCAGACTGGTCTTTCAAA
TACCAACTGATCACGtgactaaattgaaattttgcacactgtcttagatg
gtcaatatctatcattggtgaagatttcaagtcaaaagcgCTGGCATTAG
TTCCAGAGTTTTGGCAGGTGGTCAacatgtattttacagacaaaAAGTAC
CAAATACTCGAATgtgaacgaattttttctgttaCTAGTCTNgtgtattt
tacagacaaaAAGTACCGAATACTCATgtgaacgaattttttctgttact
agtctcttttatttgacaaatcagcCTTCAGAAACAAATTCGGTCAAATC
AAACGAGGCAATCAGTCAATACAGGATTTTGGTCaagtttacattctggt
ctgtaaaataccaaccagataggtcaaaatttcaaagtcatagtacttgt
caatcttgagatGCTTTCCCTAgtaaaaaaataggaagatgctcgaaggg
ttaaaaAGTCTCAACAATCGAAACTATTATAATATTTTGAAGACTTGTTT
TTATATATGAGCATTATCTAtagattattttttcttcaacttttatTGTA
GAATCAACTTCTAACCTTCTTTGATGTCCAGTTGAAAACGCACTCAATAA
ATTCTTCCGAGACTGATTTGGATCTTTACCCATGGTTTCATGATGCTTGG
AAAGTATGTTTTAAAACCATTTACTTTCATCATTTTCTAAATACCTCCTA
AGAAAATAATCATTTAGGTTAGGTACTATCTATGCAACTTTTAGTAATAA
ATCTTTCTTCGTTTAGGCCAATATGAAAGAACTATTTGAAGTTTTATACA
AAGAAATGGcacaaatatcaaaatcaaagtaaGTGTCGACGTAATCTCAG
GTTCTTTTCTATGACATATGGTTTCTGCTTACCAATATTAGTAAATAGGA
CGTCAAAAATATGTTGCCaattaaaaataacttttgggCTTGTACAGGAC
TCATTCGCATGcataaattttaagtttgttGAGTACTATTTTTGATGAAT
GCAAGTTTTAATGTGTAAGAGAGATAATTATGTAAAAGAGACTTTTTCTT
TGGGTTAGCCACTctgaaaatcggaaaaaaaacACAACTGGTCATTTTAA
TTAAATAGaattacttttgtttttttagaaaatcctATCAAAAGAAGTTG
ATTTCCTTGATGACACAGTTGGTGGGTCAGgtaaacattttgttttctta
tcttttttaCTTTGATATTATTGGTAGATCAGACAGGATCAGGTAACGTG
TTTTGCTGTCTTATATTCTAACTTTGATCTATCAGTATTGCTGTTTTTTA
GTTAACCTTCCTCAATGTAGAAGTAAACCCAAACATTGAGAATACATTTG
AAAGTGGTGAAAACCGGAGAAAAAGACAACGACTTTCAGATGAAAAACCG
TTGACAGCACTTCTGATGGGCATTGATTTTGTGGTTCGCCCTTCTCAGTC
TTGTCTTATGTATGTATTCtcctttttgatcattttttccagcagtcttt
tttctttatatttgctttatttttaagtCGATGCATGtcttttcttcatt
attttaaaagaaaacaagaACAATTCATTGTTAAAGAAGGACTTTAAAGG
GGAAGTTAAGTAATTTCTAGGGTACCCGTTTTTTGCTGCTATCATCATTA
TATGAGAATATCATGTGCCTCAGGTTACTTTTTATTCGTTCGAAACACTT
TTTTCTACGAGATATAGCTCCCtcttttttgcaataaaagtgAGTTTTNT
CTTTACTTCTcctagaatttagaaaaatatatattatttaaCCCAGTTGC
TTTCAGACTTCAATTTCCCACTGGAGATAGCTAGCCTTTAGAAAAACCTA
CTGGTAAAAACAAGTTCTAGACTTTAGATATAGGGCGCACAACGTACGTT
AGCATTAACTCACTAAGTAACGTTGACTTGTCATGAAATAGGAATTATTT
AACATTAACAACATATTTCTCTTTAAAGAGCGAGGAATGGtctaaataca
atttttatatcTCTTGTCTTTCGTGTTTCATAACTATAACTTTACTTACG
GCCTCTTNgtttcttttaaacaaaatctgtACTGATAAACAGTGTTTTGT
AAAGAGATTCTGCTAGACATCTAAtcgttttttaaaagatttcttcacGT
TTCTTCGAtcctatacacgtttttttttattagaacctagtttataagaa
cattgaggctgaaattcgtcgaaaaattaagaacatcgtaagaacatgcc
caNacacgttttttttttataaggaacacgtttataaggaactcgaggct
gaaagaagtccaaaaaataaggaattgttaaggaactgctcaggctaaga
ataagaaaacaagttctaAGGAACAGTAAAAGTAAGAGTTTTCACTTGAA
ctagctatgtaaataaggaactcaaaaggaactttgaggctgaaattttc
tataaaaataaggaactcaaggctcagagcaaagttaaggttcctttata
taaaaaaaacgtgtaagttcAAAACTTACTAAGCTTACTGGACCTTACTG
AAAACACAAAGATTCTTTCACATACCTAGATATTGTGGCTACCATTGAAT
TTCTATTGANtgtgctctttattttgcatgatattgtcgatttagaggag
tctggaaaattaagaacgcatttaagaacattttaggctgaaaattgcta
aaacaataagcacatccaggctcagccaaattttaggtgttctagtaaaa
aaaaaaagtacttTCTCATCCTTTCTAGCTACAAGATTAGTAAGTCCTTG
ACCTTCTGTgataattttagtttgatgaaGCAACTGTAAATGCTAGATTT
GTAGATGCGTAAAAAACTTCGGCTCTCCAGAGGAAAATGTGTCCACGAAT
AGTCCTCATCCTGATTGGGTAAATCGCTAATTCCACTTGAATTTTGTGGC
TGAAAATCNTATTGAAGTTGAGATTTTCGTGAATTCTATGATGTTGGTTT
TCAGGGGAAAAACATATACCTTAAAAATCACTTAACTTCCCCTTTAAAGA
TCTTGTTAATAAAGAAAGGACTTAAAAGCTGTTGATAAAGTCTTTTGACT
TATTAAATATTACGTTTAAGATTGAAAGTAATATCCAGCTTGATGGATGA
TCAATCATTTGTCATCAATGATACGACaacaaaagatattttaaataagA
TTGCAAACAATGCCAGTCTACCAGGTATTGAGTAAGTGTTGTTTTTATGT
TTCGTATCATCATCCATTCGATGTTTCGTTGATtgtatttaaaagttttt
ttgtgagAACATCCATAACTTTTTAAGCCTTAGGGtatttttaacccttt
gagttTCAGGCCTACAAATGTTCTTAATGtgcttttattttcaccatttt
atgagcatttttgtccattttcttaggAAATGGGCCATTTCAGAGTGCAA
AAGCCTtattaagatgttcttaacttgttcttaacattttggccattgaa
gccatatgttcttatatagtttgttcttatattaaaaaaacaaaatttaa
aatctcaCTGAATTCTTTTCCAGCGTCGAACACAAAAACAATGTTTTGTT
ACATTCAATTGCTGTTGCATCTCACTGTTGCGTTCAAACCAAAGGAGAAT
CGAATGATTGTAATTTGGAATTACTGAAGATTTTTTATGTTTGTCACAAA
AGCATGAAGAGTATAGCTGACCAAGAAAAATTTATCCCTTTCATCAGAAC
CTTGATTCAAGTAAAATGCCTTATTTGTCTCTAttatttaataatttatt
ttgacCCTTAAAACTATATGTATTTTGTCCACTGTCAAAACCAACTATGT
AAACTTGGTACTCCTGTTTACTAACTAAAACTAACACCAACTAAAAAATT
TCCTGTTCCCCCATATCTCAATGTCTCTACAGTGTCTCAAAGTTTTTTGA
TAGTTGTCTAGGCTATAATTCTTATTAAAATAATTATGCCcacaatatat
ttttaaatttcccCTGCTTCTTTtcatttgcaatattccaaccaTGATAA
TTTCTTTTCAGTTCAAGGTGTTGAGGATAAATCAGGTTTTCAAGAGAGAT
GATCCCCTTGATCAATGGCATTGTTCAAGGTATGAGATAAATTATCAGTA
ACAAGAACTCTTCAAGCAAACTTTTTGCACATTTGTTGCAAGATGATCTT
GTAATGCAATTGACTTATTCTTGGACTACTTCAAGACcaaataaaatgtt
aaaatcGACCTCTCTCAAATAAGAGGAATTATGAAAACCAGAttgtgttc
ttatttttctaggGAATTGTTGATTCTGTTTTTGGAGATGGCGGCAAGAA
ATTACTTTCCAGACAACGAGCACaatgaagaaagggagaaaaCACTCTTG
AATGGCTTTCCACAGAGAAACATGCTTTACAACTGGCTCATCCCACCCTC
AAATCCCTATCAAAACATGGCCAGGTAACTTGTCATAATACTCTTTATTT
ACACTTAGCAGGATGGATGTAATCTCTGTTGTACTGAGTGTTCTATACCA
GAAAGCCAGTAGAGCTCATTAGATTCATACATTTATTTGTCAACAACTCA
AAAAATTACATAACTGTCATTTTCACCTACTTAGTTTTGACAaataaatg
tataattttatttaaatttatcaaaaacccTTTGTTAAAAGCCTTTTCAA
CATGGTTCAACGACTATTTTGAAGACTGTCTCATTTTGCTTGTTCATGTT
TTTCATACTTTCAGTTCAAACATCGAAGCCCTTGCACATTTGGTTGTAAT
GTTGACATGTAAAAGTCCAGCACTTTTCTCTGGTCAAAGTGTAAATGTAC
CCAGGTAACATTAAGCTTCATttaatgattttaaatttttactcTATGCA
TTTAAATAATTAAGAAATAAATTTACATACTCATTTAAATATCTTTAAAC
ACAGAAAAAGTGGCAAGGTAGATGAGGAAAGTACTGGATCAGTCTACGAT
ATTGTACAAAAAGTGAGTCGAATTAATATACTTattgtttgtaaacatag
actCTATATATATTGTTGATGAGCAAGCTCTTCTTCTCCGTTCACAACAA
GCGATTATGCGAAGCTCAAAACTTGATGTTTTGAGCACTCTGGGGCAGTC
TATACTCGCTTACCATTGAACTGATGAAgagtcctgggaaggacgaaaca
TGTGTCTACGGATAGATGTATTTGTAAAAGTaaatcttttgtttaaaaaa
atggctctttattatttgtaattttttttttcattttcggtTACAGCCAG
CACCAGTAAATATGGAAAAACCTATCAAGTAAGTTTTCTTAAAGTAGCAT
AATTTTTGATGTATGAAATGAGAATGAACCATGTGAAATTTGTTATCCTT
GTCATAAAAAGCGAATGCagtatttctttcttttcatgACAGGCGACAAA
ATATGATTGAGGCAGGCTGTGGTTTCCTTATCGAATTGTTTACAAGGTTT
TGGAAAGTTATGGTAAGGATTTTCTTTGTTGTCTTTCCCACGTGAAAATG
CATTACCATCTGTGTCCTATATCCATCTCTTCACCTCGTGACGGTCtctt
ttctttatcaaattcTAGGACACAGTTGAAGAAAAGGATAACCTGGAAAT
CCACACAACCTCTTTATGTTTATGCTTGAAAGTTATGGTTCTGCTGAAGA
AACATATCATAGATACCGATGCTAATAAACATTTGAGCAAGTTTATAAGG
AAGTGTTCGGAACATTTATCGGTGATGCTCCCGAAGCTTCTGAAGCAACA
atcagaagaagaaagaaaagctCTGGTTGAAGGACTCTCTCTCTTTGATA
CATttgtaagtatttctttttttcgtgATCATTTGATGGTCTAATATATC
AACTATGGACGTTTTTCCTTCTGGCTTGAGATACTTTAATGTATGAATga
tttggatgaaattttgcggattttgcggatttgggtgtcatccgcgaaat
taagtccccatAGAAATTTGGAAAGGTCTAATCcgtgaaatttttttgag
aaaaactctgaaaatgttaggcaattacttttaaaatgttaactggcatc
aaagaagcgctaacaATGTGTATTTCGACAACCAGTACGTGTAACTTTTA
TTATTCCGTTAAAGTAGTCAATAAATACatgtttatattattttcagttA
GAAGATGCAAGTGTATGTTCCATTTTCTTTGCGTTGGGCTGGAATCTTGT
GGAAGATGTTCTCTATTCCATTCTcagcaaaaaggtaaaaaagctAGTTT
GTAGCTAGGAaaactttaaagtttgaaatttgTAGTTTACTTAAAATCTT
GAATTTGAAGTATTAATGTAACAAGAAAAGAAGTTTTCTAAAGGGTCTGC
TGACAactaaatgggcttttccataAATTTTTCGTACCcgacctgttgag
gatattcttttttcgagttCCACagccccctggatatccaggtaCTTTTA
GTCCTGTACCTCCCTGGATATCATCTCCCTCTTTTAAGGTCCTTATAAGG
GCCCTGGATATCCAGATAGTattgaaccccctggatatccgatatcctca
acaagggggggggcacggactatttctcgATAAGCCCAATTATTTCTTTG
AACTCATTTCAGGATAGTGTGAGTGGAAAATTGAGTTGTGGCGCCTCTTC
GTCTACAGACGACATGATGATGGAATTTGATGATTCTCCCAACAGTGATG
ACACGAATAACAATAATCAAGGTATTAACAGATTAGGTCAACACTTCTTA
CCCGATGGGAAATATAGGTTGCTTGAAGTTCTAAATAAGTTTGAgtttat
cgacccagtgatattcatattggaagtttatcgtggcttggatcacgaga
tttacgtttggcttcGTTTCATTTACTTGAAGTTACTGGCAATTTATATA
TAACAATGAAGTGTAAAAAAAACGATATTCTTCTtattatcaatatttta
aaagtttatattccattaaaaactaaaaagaaCATCCTTCTTTCCAGACA
ATCCATTGACATCTGCGAACGTGGGTGAAGAACTTCAAATGGTCGCATGT
TCGATCGTTTGCAAAGTTGTCTTCACCATTGTCAATGAGGAGAAATTGAA
AGAACTTTTTTTAACTGACTTGGAACAGGTAAAATTTGACTGTGATTATG
ATATCCACACTTTCTAATATATAGTAACATGGAGAACCGTTAGATAACCT
AGCTTTATTGCACACTAAAAGTTTATaataaaattatacaattttAAATC
TAAGAGTCAAAAATTATATACTAAAGATNAATATCCACATTTTCTAATAT
ATAGTCACATGGAGAACCGTTAGATAACCTAGCTTTATTGCACACTAAAA
GTTTATaataaaattatacaattttAAATCTAAGAGTCAAAAATTATATA
CTAAAGATTTGTTtcaagtttacaaaaatatactgtgCACTGTCAATTCT
TCgtcaaaataattgacgtcatttcagtCTTTGGTGTCGTGGAGTTGGAG
GTTGAACTTATTTACATGCCGACATTTCAAAATCAGTTCATTCCTTGAAT
TTAACAGTTTCTTGGGTTGGTCGAATGTGGCAATTGCTAATTTATCATCA
AGGCAGAGTGAACATTTCATAAAATTACATTATACCAatgtcaatttctt
tttcacaggCTCAAGACAATTGTAAAGGGCTTAAAATGGTATGTGCTTTT
CATCTCTCAGCAAgttattttattttccttttgcAGTTAATAGATGTCAA
TCCTGTTTAATCCCGTGAATTTTTCTATCTGGGAAAGTCTCAAGAATAAA
CTCAACCAAGACATCCTAAATGTAGAAAAATAATATCCCGAAAGCGCTGG
AATACTTATATAACAAGGATCTGTATTAACACACAACTCGTTGAAATGTC
TTTAAGTGTTCTGTgtaaagggctacttagactacacaatatattgacga
acaatattcgacaatatggtttgcggaccgtaatgtacgaagtaaacaac
tggtactctattataaaaaggaattttctttctgtaaacaaccccccttt
attgttggaatattgcaaatgagctgacaatatattgcctgacaatatgt
ttgtgtagtgtatgtagcccttaagatttcattcaatttcttctttcttt
tttatcagtTGCTTCAATTGAACAAATGCTTGTCATCAAACCAAAATGTA
CTACCATCCAAAGAATTGCTCATTTTGGTCAATGTTACAAGGTTGGTTAT
CCTTTGAGTATCATGCCAATCCTTTTATTATTTATAATTAGAGacagtga
aagaaaaaaaccatttcaaCTATGAAATCCGCATTGAACTTGACTTGCAT
AACGTTCTCTCTAAAATTACGATCCTTTTTCGATCCAGGAGATACCTGCA
AACATTCCACAACGACCAGGTGGTCTGTGAAAAGTTATTGGAAGGCATTC
AACTTTACATCAGAATGTCTGGCACAATTCCCAACGATGCTACGATGGAA
GAAGCTCGATTAACGCTCATCAAAATGATTGAAATCTTTCTGTAAGTCAA
GGCCTCAAGTCCATATTGTAATcactttatttatttgaataatTGACTGC
CTTATTGCACGAcgaaatacatttttttttcaggtcagTTGGGTCGACAA
AGTATTCGCCACGCGTTCGCTCGAAGATAGTGCAAACTTTATTCGTCATA
CCAAAGGTACTATATCTATCAACAAAAAGGAAAACCTCCTGTTGTATACA
TTaaagcttttaacaatgttgtATCACCTACTCAATATGAATGATAATCT
ATATGTTATTTTAGCAGATTCTATCAGGGTTTTAATGAGCATTTAGGATT
TGACTATTGTTTTGAATACTTTTAGAGCACAACAGAAGAAGAGACGTGGA
AGATTGAATTTGAGTTGGGTGAAGAAAACGGTATTTACCTTTCTCCTATC
TTTCGCCAAAAAGGCGTAGCGAATTCGTGATCCTTGCCTTTCATGAAAAA
GATGTGTGTTCCTTTCCCATTATGATACTAAAGTGAACCATGTACCTTCC
TCCGGGTAAACCCATACCCTTGTGAGGGGAGTAGGttaccataactctga
tacaagagtgtggttGCGATATGCCGGACATTGTGGCGTGTGTTGCCATT
TATCCTACTTGCGACAAACTATAAGCTCTCCTGTTTACCTCGAGTGTCAT
TAAGGATCATGGTATCTGTGTCTTGCATGCACAGAACCAACGGAGCCTGG
AATGCACTAAGCGCTTCTTCTTGAAAAAGAAGGAATTCCTACTTGGTAAA
TAGTTGAACTTGTTCCCGGATAGAGAGGGCTCATATAATCATAAAAATTT
AATATGGgggggggagtggaggatatagCAATTTTCAgcgatttaccccc
cggacaaggcacattttgatgatttttcgctacccccggacaatatatcc
tccaacattttctggaagagcccgtTCGGATAGAGAGGGctcataaaatc
aaaaaaatttaatatgggggggggagtggaggatatagcaattttcagtg
atttgcCCCCCCGGACAAAATGACTTTTAGCCCCCGGAGCatttttaccc
cccggacaaggcaaattttgatgatttttcgctaccccccggacaatata
tcctccaacattttctggaagagcccgtTCGGATAGAGAGGGCTAATATC
ATCATATCTTGCATCATTCAGTACTTTCACAATGGAACATTtgtaattca
aatcttttcTTCCATTTCAGGGAAACATTTGGTTTGTGCGTTCGATATCA
TTCTCACCTTGTTAATGACTGATCCAAGTTATTTGGTTCAACATTACATT
TGTCAAAACATGCACAAACTGCTCACTAAACTCAAAGCGGAACAAGTCAA
AAAGTTACAGAATCTCCTCAAAGAAATGACCAAACATGACATGGTATACA
GTTTGAAATGAGTCAAACCTTTATAAATCCGAACCTATAAAGTTGTACAC
TATTTTTTATACCTATACCGATCCATAAACTTGAAAACGGTGTACTAATT
ATCTTTAGTACTTGATTGATAGACAAAGAATTAATGCAAGTACGTCAATT
TTATGTTCGATCCAAAGTACTATTAGTAGTATGTATTTGTAACGGGGGTT
ATGGAAATGACGTTTGATGAAGACAATGCATTATTTTGACGCCGATCAAT
ACTTTACGGTATTGCCTTCATAAACGGCTGGTACATGATTgatgtttgct
ttgttttttttttaccaggAAATGGAGAAAGAGAAGAATCAAATATCCAT
CCAACTGTTCGTGGTGAAAAACATTATAATTTTCTGCCCCATACTGGAGA
AACAATCTCTCTTGACTCTGATCGAGTCTGCAAGGAATGGCTCCATCCAA
CACAATGCTATTTTAAAGGTGa

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_042882	XLOC_042882	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_49	supercontig	scaffold_49:201977..216498 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	1.96892e-09	1.46134	0.979478	6.52422e-05	1.98013	0.808161	4.14585	9.27151e-09	2.66161	5.03197	0.0846891	2.94186	0.245735	0.43253	0.954014	0.992619	1.36066	1.95013	1.94711	6.14547e-06	4.258	1.72281	5.86987e-05	6.30798	5.08271	0.00406904	1.82106	0.00237124	0.599728

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00068764 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ATM (Serine-protein kinase ATM OS=Homo sapiens GN=ATM PE=1 SV=4)

HSP 1 Score: 106.301 bits (264), Expect = 6.314e-23
Identity = 87/327 (26.61%), Postives = 157/327 (48.01%), Query Frame = 2

Query:   68 LVTKMLIEVLSQLLSDKNNERKSASSKLELMLKDNEIVIALDKSSGRKKSE-ITWDVVVQRIAKFVTLEIE---------KASSSEVLEKRAKEIANLYKTAIRTAERNNTILKPGPVFNHIGYVIERVEKGSFLEIY----SNILVKLLLPKRKHSNELGPKRW-KFFVELFCQLLEANQSHQSAFVYASALHKLMEIVCNVPDVDTGKLSTFFKDIFSTKRSKENVSFLETMISSMNLFCKAFVLECQAEICALGDDIFHFLLNIWKSQ--SASLKNQLLTFFDVQLKTHSINSSETDLDLYPWFHDAWKANMKELFEVLYKEMA 997
            LV   L+    QL  D+  ERK    K + +++D E +  LD+ S  K+ + + WD V + + K++  E E          AS+    +K+ +EI++L K  I+ A R    LK   + N   Y+++ V+  S   IY    SNIL+K +L  RK+  E+  ++W + F   F   L+ +Q      V A  +H + +  C+  D    K   FF       R +++ S L  +++++ +F K   +  +  +C LGD+I   LL IW     + SLK  ++  F +Q+  H    ++T  +   +    W++ +  L+++L  E++
Sbjct:    3 LVLNDLLICCRQLEHDRATERKKEVEKFKRLIRDPETIKHLDRHSDSKQGKYLNWDAVFRFLQKYIQKETECLRIAKPNVSASTQASRQKKMQEISSLVKYFIKCANRRAPRLKCQELLN---YIMDTVKDSSNGAIYGADCSNILLKDILSVRKYWCEISQQQWLELFSVYFRLYLKPSQDVHRVLV-ARIIHAVTKGCCSQTDGLNSKFLDFFSKAIQCARQEKSSSGLNHILAALTIFLKTLAVNFRIRVCELGDEILPTLLYIWTQHRLNDSLKEVIIELFQLQIYIHHPKGAKTQ-EKGAYESTKWRSILYNLYDLLVNEIS 324

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00068764 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00068764 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
ATM	6.314e-23	26.61	Serine-protein kinase ATM OS=Homo sapiens GN=ATM P...	[more]

You are here

TCONS_00068764 (transcript) - C. hemisphaerica