TCONS_00069574 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00069574
Unique Name	TCONS_00069574
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2669

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at scaffold_502:101278..106888-
coding sequence from alignment at scaffold_502:101278..106888-

transcript sequence

>TCONS_00069574 ID=TCONS_00069574|Name=TCONS_00069574|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2669bp
tacaATGCAAGTTATATCACTTTATTCCCAATGTCTGGACACTCTTGTCA
AGTGCTTTTACTCCAAAGAAGATTGCAAGATTGTTTTGGAAACACTTAGT
GCATCAGGAATTGTTCAAGTGTTTACAAGCAGATTTATTGGACATCTCAT
AGAATGGGATTCTTTGTTAGTTACTGATCAAGTTGTCGATACTGTTTCAA
GTTCTGGTTTACGCAGTTTTGGCCTCAATGGATGCACAAAGGTTACTGCA
GAATGTGTTTCAAAGCTTTTGAACAGATGCCAAAACATTTACAACCTTGA
CATCTCAAATTGTGATCAATTGCTTGAGCCAGAGTTCTTTGACTGTCTCT
ttattcagaatttgaagaaattgaaaatcaatGGATGCAATAGACTAAAT
GGTTCTATGTTTGAGaaaatcatcAGTCAATGTCCTACTCTGGAGAATCT
CTCACTAGACGAATGTTGTAACTTGGGTGGCTTTTCTTCAACGTGTTTAC
GATTTCAAACTTTTGGCTCTTCCCTGACCTCTATTTCCATGTCCGGATGT
AAATCGGTTGATAATAAATTCGTCAGGAACTTGTGTAGTGTTACTAGGTC
AAATTTAAAATGGCTGGACATTTCGTATACCTCAGCTGATTGCCTCGCAT
TAATCTACCTTGCAGGGTTTACTTTGAAAATGGCTTGCCAAATTACTAAT
CTTAAAGAATTAGGAGGTACCATTCTTAGAGATGTTGAGCTCAACGAAGA
ACTAAATGATTTATTTGAGTACGATCAAAATATGAAGTGTGCTAGTCCTG
AAATAAAATGTAAAGATTGTCTTGAAAGACAAAGAGAAGCAACATTACTT
GAGGACTATTATAAAATAGGGAATATTATTCCATGTAATTCTAAAACTAA
TTATGAAGATTGGGATGTCATTTCTTTATCACaagaagaaaatcttttgt
caTGCACCTGTAAGGACCTTCAGCAGAACAAGATGACAACAATACCTATT
GATCCAGGTTTAGAAAAGGGGCAGCTGTTTGAACCGAAATTGATATACTT
GGATATAAACAATCTTGAATTTTATTACAATGAATTTGGGCGCAAGTGCC
TGGAATTGTTTATGGACTCCAATAAATGTCTTGAACATTTCTTCATTTCT
TGGAATAATCTTGATAATGAAATGTTAAAATGTATTTCGAAGAATGATAT
TAACCTAAAAACATTTCATCTGGATAATTGTAGTGGCTTGATAGGTTTGA
ACTGGGATGGGTTTGGTCAATATTGTCATTCATTGGTTGATTTGAATTTG
ACTGGTGCCTCATTTTTAACAGATCGTGCAATCATCCAGTTgattcaaaa
caatcaaaatataAGGAAACTTGGACTTTCAGAAGCATCGATATCAGATG
AAGTTGTTCATTTTATTACTGATTTATTAAGCGAAAAGCTCGAATTGATA
GATTTGTCTTGGTGTGAAAACATAACCAATGCTGCTACTATCAATCTGAT
TACAAAATGTACTAAATTGGATTGTGTGAACTTGCGACAGGGTCAAGTTT
CTTCATCTACGGTTGAAGCTATTGGAAAATATCAAACAAATCTTTCTTCC
ATTGGACTAAGTGGTTTGAAAGGACTCCATCAAGACTTGGCTTCTCAGAA
CCCTTCTTTATTACACCTTACATCTCTTCAAAAATTGACATCAATAGATC
TTAGTTGGAATTGTATGGTTTCAGATGACACAATTATAGCCCTCTTCGGT
AACATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTTAAAATGTCTTAG
TTCCAACCCATTCCTACCAATGATCTATAATTACAAAGAATGGTACAGAT
TGAAAACAGACATAACGAAGAAGATATTGGCTGAAAAATCTGACTTGGAA
GAAAGTGAGAAAAAATTGCTCAggaaaaatatacataaacACCAGTTCAT
CGAAGCAGATTTTCATGTACCTTTCCGATCCAAAGTGTATCAGCCAAGAC
TAAAGAACCTTTCTTTAAGCTACTGCGACAAAGTAGACGATGACCAGCTA
TCTGACATTGTCTCGGTATGTAGAGGAACCTTGGTTATAACAGGCTATTT
TGGAGAAGCTATCGAGCCAAAATGGAGGTATGATCAATATGTTGAGACCT
TTATTGTTAATTAACCATAATATTAGCACAAGCTTTTTTATCTTCCCTGC
TGATTTTAACTCAACCAACTCACATATGCATCGTATTGGTTGAAATTCAC
ACCTGGTTCACAAGGTATTTTAACTATTTTTAAATAAACTTTatactttt
taaagttttaattaTATCACAGCACTCAAAAAGGGAAGCAGAGACACTTT
CCCCCTAGCATGACTTTCTGATTTGTGCTTTCATGCTTTTAGAACAAATC
ACACCTAAAAAGCGTAAATGGTCCAGTATTATTTATAATGAGTGAGCATG
AGTGAGATCTGAGCGATGTTTATTTCATCAAATTGATAATTGAACTttgc
ttaaccctttaagtgccaatgtcgagtTTATtggacatgggctatatagg
agggcgtcctgtaatgcccagtttgagttagaaatcgtcattttttgtcG
AACTCGTAGAATTGGATTGTGTTTAATGGTTAAGCGAACAAAAGTgtgtc
tttccagcgagattttgag

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00069574-protein

>TCONS_00069574-protein ID=TCONS_00069574-protein|Name=TCONS_00069574-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=720bp
TMQVISLYSQCLDTLVKCFYSKEDCKIVLETLSASGIVQVFTSRFIGHLI
EWDSLLVTDQVVDTVSSSGLRSFGLNGCTKVTAECVSKLLNRCQNIYNLD
ISNCDQLLEPEFFDCLFIQNLKKLKINGCNRLNGSMFEKIISQCPTLENL
SLDECCNLGGFSSTCLRFQTFGSSLTSISMSGCKSVDNKFVRNLCSVTRS
NLKWLDISYTSADCLALIYLAGFTLKMACQITNLKELGGTILRDVELNEE
LNDLFEYDQNMKCASPEIKCKDCLERQREATLLEDYYKIGNIIPCNSKTN
YEDWDVISLSQEENLLSCTCKDLQQNKMTTIPIDPGLEKGQLFEPKLIYL
DINNLEFYYNEFGRKCLELFMDSNKCLEHFFISWNNLDNEMLKCISKNDI
NLKTFHLDNCSGLIGLNWDGFGQYCHSLVDLNLTGASFLTDRAIIQLIQN
NQNIRKLGLSEASISDEVVHFITDLLSEKLELIDLSWCENITNAATINLI
TKCTKLDCVNLRQGQVSSSTVEAIGKYQTNLSSIGLSGLKGLHQDLASQN
PSLLHLTSLQKLTSIDLSWNCMVSDDTIIALFGNMPVLEEAVLIGLKCLS
SNPFLPMIYNYKEWYRLKTDITKKILAEKSDLEESEKKLLRKNIHKHQFI
EADFHVPFRSKVYQPRLKNLSLSYCDKVDDDQLSDIVSVCRGTLVITGYF
GEAIEPKWRYDQYVETFIVN

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_502:101278..106888-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00069574 ID=TCONS_00069574|Name=TCONS_00069574|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5611bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_502:101278..106888- (Clytia hemisphaerica)
TACAATGCAAGTTATATCACTTTATTCCCAATGTCTGGACACTCTTGTCA
AGTGCTTTTACTCCAAAGAAGATTGCAAGATTGTTTTGGAAACACTTAGT
GCATCAGGAATTGTTCAAGTGTTTACAAGCAGATTTATTGGACATCTCAT
AGAATGGGATTCTTTGTTAGTTACTGATCAAGTTGTCGATACTGTTTCAA
GTTCTGGTTTACGCAGTTTTGGCCTCAATGGATGCACAAAGGTTACTGCA
GAATGTGTTTCAAAGCTTTTGAACAGGTGAATATGTTCATTATTTATAAA
ATTTCTTGATTTATCTAATTTGATTGACACCTTGTATTTTCCTTCTTTAT
AAAAACTTAATAAGGACCTGAAAAAATCATTGAGACTAATACAGTAGGCA
ATATTTTGTGTTTCAATTATGCTGATTACACGGGGCATTTGAAATTAATT
TAACGTCAAGTTGTTTTGATTCTAACAAAAATAGCACTTTGGTTCTTATT
CTCACTCTTTTCTTTTCAGATGCCAAAACATTTACAACCTTGACATCTCA
AATTGTGATCAATTGCTTGAGCCAGAGTTCTTTGACTGTCTCTTTATTCA
GAATTTGAAGAAATTGAAAATCAATGGATGCAATAGACTAAATGGTTCTA
TGTTTGAGGTGAGAAATTTGGATAAATTTCCTATAGAGGTTTGCATTTAT
ATCCCAATTAAGGTGTATTATATACGTAAATAAGTTTATGCTAATTGTTT
TTTTCCTTGAAGTATTTCACTTTCCTTTTTTAGAAAATCATCAGTCAATG
TCCTACTCTGGAGAATCTCTCACTAGACGAATGTTGTAACTTGGGTGGCT
TTTCTTCAACGTGTTTACGATTTCAAACTTTTGGCTCTTCCCTGACCTCT
ATTTCCATGTCCGGATGTAAATCGGTTGATAATAAATTCGTCAGGAACTT
GTGTAGTGTTACTAGGTCAAATTTAAAATGGCTGGACATTTCGTATACCT
CAGCTGATTGCCTCGCATTAATCTACCTTGCAGGGTTTACTTTGAAAATG
GCTTGCCAAATTACTAATCTTAAAGAATTAGGAGGTACCATTCTTAGAGA
TGTTGAGCTCAACGAAGAACTAAATGATTTATTTGAGTACGATCAAAATA
TGAAGTGTGCTAGTCCTGAAATAAAATGTAAAGATTGTCTTGAAAGACAA
AGAGAAGCAACATTACTTGAGGACTATTATAAAATAGGGAATATTATTCC
ATGTAATTCTAAAACTAATTATGAAGATTGGGATGTCATTTCTTTATCAC
AAGAAGAAAATCTTTTGTCATGCACCTGTAAGGACCTTCAGCAGAACAAG
ATGACAACAATACCTATTGATCCAGGTTTAGAAAAGGGGCAGCTGTTTGA
ACCGAAATTGATATACTTGGATATAAACAATCTTGAATTTTATTACAATG
AATTTGGGCGCAAGTGCCTGGAATTGTTTATGGACTCCAATAAATGTCTT
GAACATTTCTTCATTTCTTGGAATAATCTTGATAATGAAATGTTAAAATG
TATTTCGAAGAATGATATTAACCTAAAAACATTTCATCTGGTAAGTAATA
ACTCACTTATTTGAGATATATTTTCGGGTGCTAGTTTAGCAAGATGGAAG
GGTATGTCAGAGCCAAAGCTCCAAAATTGACCCATAGAGAGACTGAATTT
TGGAAATCTTGTCAAATTTTGGACGCTTTCGCAAACATTAAAAAATTTCC
AATTAACTTTGTTTATTGTAGGATAATTGTAGTGGCTTGATAGGTTTGAA
CTGGGATGGGTTTGGTCAATATTGTCATTCATTGGTTGATTTGAATTTGA
CTGGTGCCTCATTTTTAACAGATCGTGCAATCATCCAGTTGATTCAAAAC
AATCAAAATATAAGGAAACTTGGACTTTCAGAAGCATCGATATCAGATGA
AGTTGTTCATTTTATTACTGATTTATTAAGCGAAAAGGTACTTCCATTTG
ACGAGCTTCCTCATCTTTTAGATCTCTCAAGATTGGGATGCTGAATGTTT
GAGTTTCCCATAAATTTCAAACATTGTTGTCGCTGCTAATTTCTATTGTG
AACTTATATAAAACAGCAAACTTCAGCGATTATAGCGAAGTCCCTAATTA
GCTACCTGTTTGATTTTAGCTCGAATTGATAGATTTGTCTTGGTGTGAAA
ACATAACCAATGCTGCTACTATCAATCTGATTACAAAATGTACTAAATTG
GATTGTGTGAACTTGCGACAGGGTCAAGTTTCTTCATCTACGGTTGAAGC
TATTGGAAAATATCAAACAAATCTTTCTTCCATTGGACTAAGTGGTTTGA
AAGGTATGCTTAGATTTAAAATAGATTAAGAGCATAGAATGCACCCCCCT
GAGCTTAGGGGGGGGGGCTAAACCATTTTTGCTTGATTGGGGCTGTATTT
TTCAAAAAATACTGGGGGCTAGCTTGCTAGGGGGGGCTGAGTGTTGTGTA
ATAGAACTGGGGGCAGAGCTGATAGATTGAAGATATTTCAAATTATGTTA
AAAATCTCTGCTGTGGGAAAGGGGAAAAATCTGTGGGAAAAAATCTATCG
AGAATTTGCATGCAAAATTTCTTTGATATTTTGCTTTGTGAAGGTGGGGG
CTATGTTTCTAGAATTTAGCCGGGGGCTATTATTCTTAGCTCCCCCTGAA
AAATGCTGTGGGCTGGACCCCTCTGCACACTATGAAGAGAAAAATTGCCG
AATTTTGACACGCATCCCTCTGATATTATTTGGTTATGGGATGTTCATCG
TTTATAAAATTCCCGTCGGATTTTTCTTTCTAAACCTTTTTAAGAAAACT
GAAACAGGTTAGTCCATTTGGGTAACTCTCTGACGGGGACCTTATACACG
ATTAGCATCCCCTAAGTCAAAACATTCAGAGGGGATGCTTGCACTCTGTT
AGTCGTTCTCAGATTTATCTCTAGTAGGGGGCCAATCCTTAGGATCCGTG
ACATCTTTTATGCGACACAACCGCGTGTAGTTAGTTCGAAAGTTAGGAAG
TTTTTTAAGACTTTTTTGAGAGGGGGGCGGCGAATAAGGCCCGACAAAAG
CTTTTATGACTAAAAAGCTGACGTTTACAGGCCTTCCTACTTTCGAACTA
ACCACATGCGGTTGCGTCGCTTAAAAGGTGTCACGGATCCTAAGGATTGG
TCCCCTACTACTCATCTTGCCAATGAAGTTTAATTTAAATACAGGAATAG
TTGAATCTATTATTTCTATCTTCTGTACAGGACTCCATCAAGACTTGGCT
TCTCAGAACCCTTCTTTATTACACCTTACATCTCTTCAAAAATTGACATC
AATAGATCTTAGTTGGAATTGTATGGTTTCAGATGACACAATTATAGCCC
TCTTCGGTAACATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTTAAAA
TGTCTTAGTTCCAACCCATTCCTACCAATGATCTATAATTACAAAGAATG
GTACAGATTGAAAACAGACATAACGAAGAAGATATTGGCTGAAAAATCTG
ACTTGGAAGAAAGTGAGAAAAAATTGCTCAGGAAAAATATACATAAACAC
CAGGTTAGTAAATAAGTAGGATTATTGTCACAAGGTTGTTCTTAAAAAAA
TGTTCTCAAACCTCGAGCTTCTCTTTACCATTTTATACTAGCAGGGGAGG
TGAGGTGAACCTGAGGTACTTGACATCTTTTCTCTCTCTCTTTTCTTTCT
CTACCTGTAGATGTACTCAATTACTCTATAAGAAATACGAGAATTTTTAA
AGTCCGAAATTTCAAAATACGATTGACGTCGACAATGATAAATAAGAATA
GTTACTAAAGTGTATCCAGATATAATTTGCAGTGGAAACAAGAATGCCTG
TAACTTTTGATAGTCCGATATAATTTTTTTGCTTCTTTTAGAGAATCAAA
AGCGCTATTTTTGAATTTATTTTTTGTTGAAAAATACGTGATTTTTAGCG
GTTAAATTTGCGATTGCAAAAATTGAGCTTTTTTTCTATTTTCGCTACAA
CGTTCATTTTACACTAGTGGTAGTTCAACCTTAGGTTAAGAAAATTGTCA
AATTTCAAGGCAAACGGAAAAGTCCTTCGGAAGATATGGGACCCGAAATA
CCCCTTGGTAGCACTTTTCTGTGAAACATCAAATCTCCAAATTTTTAATA
AAAACGGGGGATTATGATGGGATGATAAAACAGTTTTTCAATCATATATT
ATAACATATTTTACGATCTTTTTACAATAATGACCTCATAGCCAAACTGT
GCTTTAATGTTTTGGGAATTAGCAAAGTTCTTTTATTACTTAAAAATAAC
AAAGGCAATATCAGTTCAATATGCTTATCGTTTCAATAAAGACAATCAAA
TTGTGTATTCACTTTGTTTCGAAATGATCAATGATACCAATAACACCAAT
GCAACAAATAACACTTTCCAACTTTTAATTGCACTGTTCAAAAAAGATAA
CCCCCGTTTTTAGTAAAAATTTGGAGATTTGATATTTCACAGAAAAGTGC
TACCAAGGGGTACTTTGGGTCCCATATCTTCCGAAGGACTTTTCCGTTTG
CCTTGAAATTTAACAACCTTCTTTACCTAAGGTTGAACTACCACTAGTGT
AAAAATGAACGTTATAGCATAAAAAGAAAAAAAGCTCAATTTTTGAAATC
GCAAATTTAATCGCTAAAAATCGCGAATTTTTCAACAAAAAAGACATTCA
AATATAGCGCTTTTGATTCTCTAACATAAACAAAAAAAAATTTTGGAATT
ATATTTGACTATTAAAAGTTACAGGCATTCTTGTTTCCGCTGCCAATTAT
ATCTGGATAGACTTTAATATAATACCTCTCTTTTTAGTTCATCGAAGCAG
ATTTTCATGTACCTTTCCGATCCAAAGTGTATCAGCCAAGACTAAAGAAC
CTTTCTTTAAGCTACTGCGACAAAGTAGACGATGACCAGCTATCTGACAT
TGTCTCGGTATGTAGAGGAACCTTGGTTATAACAGGCTATTTTGGAGAAG
CTATCGAGCCAAAATGGAGGTATGATCAATATGTTGAGACCTTTATTGTT
AATTAACCATAATATTAGCACAAGCTTTTTTATCTTCCCTGCTGATTTTA
ACTCAACCAACTCACATATGCATCGTATTGGTTGAAATTCACACCTGGTT
CACAAGGTATTTTAACTATTTTTAAATAAACTTTATACTTTTTAAAGTTT
TAATTATATCACAGCACTCAAAAAGGGAAGCAGAGACACTTTCCCCCTAG
CATGACTTTCTGATTTGTGCTTTCATGCTTTTAGAACAAATCACACCTAA
AAAGCGTAAATGGTCCAGTATTATTTATAATGAGTGAGCATGAGTGAGAT
CTGAGCGATGTTTATTTCATCAAATTGATAATTGAACTTTGCTTAACCCT
TTAAGTGCCAATGTCGAGTTTATTGGACATGGGCTATATAGGAGGGCGTC
CTGTAATGCCCAGTTTGAGTTAGAAATCGTCATTTTTTGTCGAACTCGTA
GAATTGGATTGTGTTTAATGGTTAAGCGAACAAAAGTGTGTCTTTCCAGC
GAGATTTTGAG

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_502:101278..106888-

>TCONS_00069574 ID=TCONS_00069574|Name=TCONS_00069574|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=15141bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_502:101278..106888- (Clytia hemisphaerica)
TTCATCGAAGCAGATTTTCATGTACCTTTCCGATCCAAAGTGTATCAGCC
AAGACTAAAGAACCTTTCTTTAAGCTACTGCGACAAAGTAGACGATGACC
AGCTATCTGACATTGTCTCGGTATGTAGAGGAACCTTGGTTATAACAGGC
TATTTTGGAGAAGCTATCGAGCCAAAATGGAGGTATGATCAATATGTTGA
GACCTTTATTGTTAATTAAGACTCCATCAAGACTTGGCTTCTCAGAACCC
TTCTTTATTACACCTTACATCTCTTCAAAAATTGACATCAATAGATCTTA
GTTGGAATTGTATGGTTTCAGATGACACAATTATAGCCCTCTTCGGTAAC
ATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTTAAAATGTCTTAGTTC
CAACCCATTCCTACCAATGATCTATAATTACAAAGAATGGTACAGATTGA
AAACAGACATAACGAAGAAGATATTGGCTGAAAAATCTGACTTGGAAGAA
AGTGAGAAAAAATTGCTCAGGAAAAATATACATAAACACCAGCTCGAATT
GATAGATTTGTCTTGGTGTGAAAACATAACCAATGCTGCTACTATCAATC
TGATTACAAAATGTACTAAATTGGATTGTGTGAACTTGCGACAGGGTCAA
GTTTCTTCATCTACGGTTGAAGCTATTGGAAAATATCAAACAAATCTTTC
TTCCATTGGACTAAGTGGTTTGAAAGGATAATTGTAGTGGCTTGATAGGT
TTGAACTGGGATGGGTTTGGTCAATATTGTCATTCATTGGTTGATTTGAA
TTTGACTGGTGCCTCATTTTTAACAGATCGTGCAATCATCCAGTTGATTC
AAAACAATCAAAATATAAGGAAACTTGGACTTTCAGAAGCATCGATATCA
GATGAAGTTGTTCATTTTATTACTGATTTATTAAGCGAAAAGAAAATCAT
CAGTCAATGTCCTACTCTGGAGAATCTCTCACTAGACGAATGTTGTAACT
TGGGTGGCTTTTCTTCAACGTGTTTACGATTTCAAACTTTTGGCTCTTCC
CTGACCTCTATTTCCATGTCCGGATGTAAATCGGTTGATAATAAATTCGT
CAGGAACTTGTGTAGTGTTACTAGGTCAAATTTAAAATGGCTGGACATTT
CGTATACCTCAGCTGATTGCCTCGCATTAATCTACCTTGCAGGGTTTACT
TTGAAAATGGCTTGCCAAATTACTAATCTTAAAGAATTAGGAGGTACCAT
TCTTAGAGATGTTGAGCTCAACGAAGAACTAAATGATTTATTTGAGTACG
ATCAAAATATGAAGTGTGCTAGTCCTGAAATAAAATGTAAAGATTGTCTT
GAAAGACAAAGAGAAGCAACATTACTTGAGGACTATTATAAAATAGGGAA
TATTATTCCATGTAATTCTAAAACTAATTATGAAGATTGGGATGTCATTT
CTTTATCACAAGAAGAAAATCTTTTGTCATGCACCTGTAAGGACCTTCAG
CAGAACAAGATGACAACAATACCTATTGATCCAGGTTTAGAAAAGGGGCA
GCTGTTTGAACCGAAATTGATATACTTGGATATAAACAATCTTGAATTTT
ATTACAATGAATTTGGGCGCAAGTGCCTGGAATTGTTTATGGACTCCAAT
AAATGTCTTGAACATTTCTTCATTTCTTGGAATAATCTTGATAATGAAAT
GTTAAAATGTATTTCGAAGAATGATATTAACCTAAAAACATTTCATCTGA
TGCCAAAACATTTACAACCTTGACATCTCAAATTGTGATCAATTGCTTGA
GCCAGAGTTCTTTGACTGTCTCTTTATTCAGAATTTGAAGAAATTGAAAA
TCAATGGATGCAATAGACTAAATGGTTCTATGTTTGAGACAATGCAAGTT
ATATCACTTTATTCCCAATGTCTGGACACTCTTGTCAAGTGCTTTTACTC
CAAAGAAGATTGCAAGATTGTTTTGGAAACACTTAGTGCATCAGGAATTG
TTCAAGTGTTTACAAGCAGATTTATTGGACATCTCATAGAATGGGATTCT
TTGTTAGTTACTGATCAAGTTGTCGATACTGTTTCAAGTTCTGGTTTACG
CAGTTTTGGCCTCAATGGATGCACAAAGGTTACTGCAGAATGTGTTTCAA
AGCTTTTGAACAGTTCATCGAAGCAGATTTTCATGTACCTTTCCGATCCA
AAGTGTATCAGCCAAGACTAAAGAACCTTTCTTTAAGCTACTGCGACAAA
GTAGACGATGACCAGCTATCTGACATTGTCTCGGTATGTAGAGGAACCTT
GGTTATAACAGGCTATTTTGGAGAAGCTATCGAGCCAAAATGGAGGTATG
ATCAATATGTTGAGACCTTTATTGTTAATTAAGACTCCATCAAGACTTGG
CTTCTCAGAACCCTTCTTTATTACACCTTACATCTCTTCAAAAATTGACA
TCAATAGATCTTAGTTGGAATTGTATGGTTTCAGATGACACAATTATAGC
CCTCTTCGGTAACATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTTAA
AATGTCTTAGTTCCAACCCATTCCTACCAATGATCTATAATTACAAAGAA
TGGTACAGATTGAAAACAGACATAACGAAGAAGATATTGGCTGAAAAATC
TGACTTGGAAGAAAGTGAGAAAAAATTGCTCAGGAAAAATATACATAAAC
ACCAGCTCGAATTGATAGATTTGTCTTGGTGTGAAAACATAACCAATGCT
GCTACTATCAATCTGATTACAAAATGTACTAAATTGGATTGTGTGAACTT
GCGACAGGGTCAAGTTTCTTCATCTACGGTTGAAGCTATTGGAAAATATC
AAACAAATCTTTCTTCCATTGGACTAAGTGGTTTGAAAGGATAATTGTAG
TGGCTTGATAGGTTTGAACTGGGATGGGTTTGGTCAATATTGTCATTCAT
TGGTTGATTTGAATTTGACTGGTGCCTCATTTTTAACAGATCGTGCAATC
ATCCAGTTGATTCAAAACAATCAAAATATAAGGAAACTTGGACTTTCAGA
AGCATCGATATCAGATGAAGTTGTTCATTTTATTACTGATTTATTAAGCG
AAAAGAAAATCATCAGTCAATGTCCTACTCTGGAGAATCTCTCACTAGAC
GAATGTTGTAACTTGGGTGGCTTTTCTTCAACGTGTTTACGATTTCAAAC
TTTTGGCTCTTCCCTGACCTCTATTTCCATGTCCGGATGTAAATCGGTTG
ATAATAAATTCGTCAGGAACTTGTGTAGTGTTACTAGGTCAAATTTAAAA
TGGCTGGACATTTCGTATACCTCAGCTGATTGCCTCGCATTAATCTACCT
TGCAGGGTTTACTTTGAAAATGGCTTGCCAAATTACTAATCTTAAAGAAT
TAGGAGGTACCATTCTTAGAGATGTTGAGCTCAACGAAGAACTAAATGAT
TTATTTGAGTACGATCAAAATATGAAGTGTGCTAGTCCTGAAATAAAATG
TAAAGATTGTCTTGAAAGACAAAGAGAAGCAACATTACTTGAGGACTATT
ATAAAATAGGGAATATTATTCCATGTAATTCTAAAACTAATTATGAAGAT
TGGGATGTCATTTCTTTATCACAAGAAGAAAATCTTTTGTCATGCACCTG
TAAGGACCTTCAGCAGAACAAGATGACAACAATACCTATTGATCCAGGTT
TAGAAAAGGGGCAGCTGTTTGAACCGAAATTGATATACTTGGATATAAAC
AATCTTGAATTTTATTACAATGAATTTGGGCGCAAGTGCCTGGAATTGTT
TATGGACTCCAATAAATGTCTTGAACATTTCTTCATTTCTTGGAATAATC
TTGATAATGAAATGTTAAAATGTATTTCGAAGAATGATATTAACCTAAAA
ACATTTCATCTGATGCCAAAACATTTACAACCTTGACATCTCAAATTGTG
ATCAATTGCTTGAGCCAGAGTTCTTTGACTGTCTCTTTATTCAGAATTTG
AAGAAATTGAAAATCAATGGATGCAATAGACTAAATGGTTCTATGTTTGA
GACAATGCAAGTTATATCACTTTATTCCCAATGTCTGGACACTCTTGTCA
AGTGCTTTTACTCCAAAGAAGATTGCAAGATTGTTTTGGAAACACTTAGT
GCATCAGGAATTGTTCAAGTGTTTACAAGCAGATTTATTGGACATCTCAT
AGAATGGGATTCTTTGTTAGTTACTGATCAAGTTGTCGATACTGTTTCAA
GTTCTGGTTTACGCAGTTTTGGCCTCAATGGATGCACAAAGGTTACTGCA
GAATGTGTTTCAAAGCTTTTGAACAGTTCATCGAAGCAGATTTTCATGTA
CCTTTCCGATCCAAAGTGTATCAGCCAAGACTAAAGAACCTTTCTTTAAG
CTACTGCGACAAAGTAGACGATGACCAGCTATCTGACATTGTCTCGGTAT
GTAGAGGAACCTTGGTTATAACAGGCTATTTTGGAGAAGCTATCGAGCCA
AAATGGAGGTATGATCAATATGTTGAGACCTTTATTGTTAATTAAGACTC
CATCAAGACTTGGCTTCTCAGAACCCTTCTTTATTACACCTTACATCTCT
TCAAAAATTGACATCAATAGATCTTAGTTGGAATTGTATGGTTTCAGATG
ACACAATTATAGCCCTCTTCGGTAACATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTT
CTGATCGGCTTAAAATGTCTTAGTTCCAACCCATTCCTACCAATGATCTA
TAATTACAAAGAATGGTACAGATTGAAAACAGACATAACGAAGAAGATAT
TGGCTGAAAAATCTGACTTGGAAGAAAGTGAGAAAAAATTGCTCAGGAAA
AATATACATAAACACCAGCTCGAATTGATAGATTTGTCTTGGTGTGAAAA
CATAACCAATGCTGCTACTATCAATCTGATTACAAAATGTACTAAATTGG
ATTGTGTGAACTTGCGACAGGGTCAAGTTTCTTCATCTACGGTTGAAGCT
ATTGGAAAATATCAAACAAATCTTTCTTCCATTGGACTAAGTGGTTTGAA
AGGATAATTGTAGTGGCTTGATAGGTTTGAACTGGGATGGGTTTGGTCAA
TATTGTCATTCATTGGTTGATTTGAATTTGACTGGTGCCTCATTTTTAAC
AGATCGTGCAATCATCCAGTTGATTCAAAACAATCAAAATATAAGGAAAC
TTGGACTTTCAGAAGCATCGATATCAGATGAAGTTGTTCATTTTATTACT
GATTTATTAAGCGAAAAGAAAATCATCAGTCAATGTCCTACTCTGGAGAA
TCTCTCACTAGACGAATGTTGTAACTTGGGTGGCTTTTCTTCAACGTGTT
TACGATTTCAAACTTTTGGCTCTTCCCTGACCTCTATTTCCATGTCCGGA
TGTAAATCGGTTGATAATAAATTCGTCAGGAACTTGTGTAGTGTTACTAG
GTCAAATTTAAAATGGCTGGACATTTCGTATACCTCAGCTGATTGCCTCG
CATTAATCTACCTTGCAGGGTTTACTTTGAAAATGGCTTGCCAAATTACT
AATCTTAAAGAATTAGGAGGTACCATTCTTAGAGATGTTGAGCTCAACGA
AGAACTAAATGATTTATTTGAGTACGATCAAAATATGAAGTGTGCTAGTC
CTGAAATAAAATGTAAAGATTGTCTTGAAAGACAAAGAGAAGCAACATTA
CTTGAGGACTATTATAAAATAGGGAATATTATTCCATGTAATTCTAAAAC
TAATTATGAAGATTGGGATGTCATTTCTTTATCACAAGAAGAAAATCTTT
TGTCATGCACCTGTAAGGACCTTCAGCAGAACAAGATGACAACAATACCT
ATTGATCCAGGTTTAGAAAAGGGGCAGCTGTTTGAACCGAAATTGATATA
CTTGGATATAAACAATCTTGAATTTTATTACAATGAATTTGGGCGCAAGT
GCCTGGAATTGTTTATGGACTCCAATAAATGTCTTGAACATTTCTTCATT
TCTTGGAATAATCTTGATAATGAAATGTTAAAATGTATTTCGAAGAATGA
TATTAACCTAAAAACATTTCATCTGATGCCAAAACATTTACAACCTTGAC
ATCTCAAATTGTGATCAATTGCTTGAGCCAGAGTTCTTTGACTGTCTCTT
TATTCAGAATTTGAAGAAATTGAAAATCAATGGATGCAATAGACTAAATG
GTTCTATGTTTGAGACAATGCAAGTTATATCACTTTATTCCCAATGTCTG
GACACTCTTGTCAAGTGCTTTTACTCCAAAGAAGATTGCAAGATTGTTTT
GGAAACACTTAGTGCATCAGGAATTGTTCAAGTGTTTACAAGCAGATTTA
TTGGACATCTCATAGAATGGGATTCTTTGTTAGTTACTGATCAAGTTGTC
GATACTGTTTCAAGTTCTGGTTTACGCAGTTTTGGCCTCAATGGATGCAC
AAAGGTTACTGCAGAATGTGTTTCAAAGCTTTTGAACAGTTCATCGAAGC
AGATTTTCATGTACCTTTCCGATCCAAAGTGTATCAGCCAAGACTAAAGA
ACCTTTCTTTAAGCTACTGCGACAAAGTAGACGATGACCAGCTATCTGAC
ATTGTCTCGGTATGTAGAGGAACCTTGGTTATAACAGGCTATTTTGGAGA
AGCTATCGAGCCAAAATGGAGGTATGATCAATATGTTGAGACCTTTATTG
TTAATTAAGACTCCATCAAGACTTGGCTTCTCAGAACCCTTCTTTATTAC
ACCTTACATCTCTTCAAAAATTGACATCAATAGATCTTAGTTGGAATTGT
ATGGTTTCAGATGACACAATTATAGCCCTCTTCGGTAACATGCCAGTACT
TGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTTAAAATGTCTTAGTTCCAACCCATTCC
TACCAATGATCTATAATTACAAAGAATGGTACAGATTGAAAACAGACATA
ACGAAGAAGATATTGGCTGAAAAATCTGACTTGGAAGAAAGTGAGAAAAA
ATTGCTCAGGAAAAATATACATAAACACCAGCTCGAATTGATAGATTTGT
CTTGGTGTGAAAACATAACCAATGCTGCTACTATCAATCTGATTACAAAA
TGTACTAAATTGGATTGTGTGAACTTGCGACAGGGTCAAGTTTCTTCATC
TACGGTTGAAGCTATTGGAAAATATCAAACAAATCTTTCTTCCATTGGAC
TAAGTGGTTTGAAAGGATAATTGTAGTGGCTTGATAGGTTTGAACTGGGA
TGGGTTTGGTCAATATTGTCATTCATTGGTTGATTTGAATTTGACTGGTG
CCTCATTTTTAACAGATCGTGCAATCATCCAGTTGATTCAAAACAATCAA
AATATAAGGAAACTTGGACTTTCAGAAGCATCGATATCAGATGAAGTTGT
TCATTTTATTACTGATTTATTAAGCGAAAAGAAAATCATCAGTCAATGTC
CTACTCTGGAGAATCTCTCACTAGACGAATGTTGTAACTTGGGTGGCTTT
TCTTCAACGTGTTTACGATTTCAAACTTTTGGCTCTTCCCTGACCTCTAT
TTCCATGTCCGGATGTAAATCGGTTGATAATAAATTCGTCAGGAACTTGT
GTAGTGTTACTAGGTCAAATTTAAAATGGCTGGACATTTCGTATACCTCA
GCTGATTGCCTCGCATTAATCTACCTTGCAGGGTTTACTTTGAAAATGGC
TTGCCAAATTACTAATCTTAAAGAATTAGGAGGTACCATTCTTAGAGATG
TTGAGCTCAACGAAGAACTAAATGATTTATTTGAGTACGATCAAAATATG
AAGTGTGCTAGTCCTGAAATAAAATGTAAAGATTGTCTTGAAAGACAAAG
AGAAGCAACATTACTTGAGGACTATTATAAAATAGGGAATATTATTCCAT
GTAATTCTAAAACTAATTATGAAGATTGGGATGTCATTTCTTTATCACAA
GAAGAAAATCTTTTGTCATGCACCTGTAAGGACCTTCAGCAGAACAAGAT
GACAACAATACCTATTGATCCAGGTTTAGAAAAGGGGCAGCTGTTTGAAC
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TTGACTGTCTCTTTATTCAGAATTTGAAGAAATTGAAAATCAATGGATGC
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GCAAGATTGTTTTGGAAACACTTAGTGCATCAGGAATTGTTCAAGTGTTT
ACAAGCAGATTTATTGGACATCTCATAGAATGGGATTCTTTGTTAGTTAC
TGATCAAGTTGTCGATACTGTTTCAAGTTCTGGTTTACGCAGTTTTGGCC
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AGTTCATCGAAGCAGATTTTCATGTACCTTTCCGATCCAAAGTGTATCAG
CCAAGACTAAAGAACCTTTCTTTAAGCTACTGCGACAAAGTAGACGATGA
CCAGCTATCTGACATTGTCTCGGTATGTAGAGGAACCTTGGTTATAACAG
GCTATTTTGGAGAAGCTATCGAGCCAAAATGGAGGTATGATCAATATGTT
GAGACCTTTATTGTTAATTAAGACTCCATCAAGACTTGGCTTCTCAGAAC
CCTTCTTTATTACACCTTACATCTCTTCAAAAATTGACATCAATAGATCT
TAGTTGGAATTGTATGGTTTCAGATGACACAATTATAGCCCTCTTCGGTA
ACATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTTAAAATGTCTTAGT
TCCAACCCATTCCTACCAATGATCTATAATTACAAAGAATGGTACAGATT
GAAAACAGACATAACGAAGAAGATATTGGCTGAAAAATCTGACTTGGAAG
AAAGTGAGAAAAAATTGCTCAGGAAAAATATACATAAACACCAGCTCGAA
TTGATAGATTTGTCTTGGTGTGAAAACATAACCAATGCTGCTACTATCAA
TCTGATTACAAAATGTACTAAATTGGATTGTGTGAACTTGCGACAGGGTC
AAGTTTCTTCATCTACGGTTGAAGCTATTGGAAAATATCAAACAAATCTT
TCTTCCATTGGACTAAGTGGTTTGAAAGGATAATTGTAGTGGCTTGATAG
GTTTGAACTGGGATGGGTTTGGTCAATATTGTCATTCATTGGTTGATTTG
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CAGATGAAGTTGTTCATTTTATTACTGATTTATTAAGCGAAAAGAAAATC
ATCAGTCAATGTCCTACTCTGGAGAATCTCTCACTAGACGAATGTTGTAA
CTTGGGTGGCTTTTCTTCAACGTGTTTACGATTTCAAACTTTTGGCTCTT
CCCTGACCTCTATTTCCATGTCCGGATGTAAATCGGTTGATAATAAATTC
GTCAGGAACTTGTGTAGTGTTACTAGGTCAAATTTAAAATGGCTGGACAT
TTCGTATACCTCAGCTGATTGCCTCGCATTAATCTACCTTGCAGGGTTTA
CTTTGAAAATGGCTTGCCAAATTACTAATCTTAAAGAATTAGGAGGTACC
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CGATCAAAATATGAAGTGTGCTAGTCCTGAAATAAAATGTAAAGATTGTC
TTGAAAGACAAAGAGAAGCAACATTACTTGAGGACTATTATAAAATAGGG
AATATTATTCCATGTAATTCTAAAACTAATTATGAAGATTGGGATGTCAT
TTCTTTATCACAAGAAGAAAATCTTTTGTCATGCACCTGTAAGGACCTTC
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CAGCTGTTTGAACCGAAATTGATATACTTGGATATAAACAATCTTGAATT
TTATTACAATGAATTTGGGCGCAAGTGCCTGGAATTGTTTATGGACTCCA
ATAAATGTCTTGAACATTTCTTCATTTCTTGGAATAATCTTGATAATGAA
ATGTTAAAATGTATTTCGAAGAATGATATTAACCTAAAAACATTTCATCT
GATGCCAAAACATTTACAACCTTGACATCTCAAATTGTGATCAATTGCTT
GAGCCAGAGTTCTTTGACTGTCTCTTTATTCAGAATTTGAAGAAATTGAA
AATCAATGGATGCAATAGACTAAATGGTTCTATGTTTGAGACAATGCAAG
TTATATCACTTTATTCCCAATGTCTGGACACTCTTGTCAAGTGCTTTTAC
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TGTTCAAGTGTTTACAAGCAGATTTATTGGACATCTCATAGAATGGGATT
CTTTGTTAGTTACTGATCAAGTTGTCGATACTGTTTCAAGTTCTGGTTTA
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AAGTAGACGATGACCAGCTATCTGACATTGTCTCGGTATGTAGAGGAACC
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GGCTTCTCAGAACCCTTCTTTATTACACCTTACATCTCTTCAAAAATTGA
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GCCCTCTTCGGTAACATGCCAGTACTTGAAGAAGCAGTTCTGATCGGCTT
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TCTGACTTGGAAGAAAGTGAGAAAAAATTGCTCAGGAAAAATATACATAA
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CTGCTACTATCAATCTGATTACAAAATGTACTAAATTGGATTGTGTGAAC
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TCAAACAAATCTTTCTTCCATTGGACTAAGTGGTTTGAAAGGATAATTGT
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ATTGGTTGATTTGAATTTGACTGGTGCCTCATTTTTAACAGATCGTGCAA
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ACAATCTTGAATTTTATTACAATGAATTTGGGCGCAAGTGCCTGGAATTG
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CTAATCTTAAAGAATTAGGAGGTACCATTCTTAGAGATGTTGAGCTCAAC
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GATATTAACCTAAAAACATTTCATCTGATGCCAAAACATTTACAACCTTG
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ACAAAGGTTACTGCAGAATGTGTTTCAAAGCTTTTGAACAG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_043340	XLOC_043340	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00069574-protein	TCONS_00069574-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_502	supercontig	scaffold_502:101278..106888 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR006553	Leu-rich_rpt_Cys-con_subtyp
IPR032675	L_dom-like

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00069574 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00069574 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00069574 (transcript) - C. hemisphaerica