TCONS_00070244 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00070244
Unique NameTCONS_00070244
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1713

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00070244 ID=TCONS_00070244|Name=TCONS_00070244|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1713bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_516:302255..347284-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00070244 ID=TCONS_00070244|Name=TCONS_00070244|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=45030bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_516:302255..347284- (Clytia hemisphaerica)
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TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:303791..303859TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:303791..303859Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:303436..303570TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:303436..303570Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:302972..303144TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:302972..303144Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:302255..302929TCONS_00070244-exon-scaffold_516-1491911889:302255..302929Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_516supercontigscaffold_516:302255..347284 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0.258962 0 5.47289 2.70078 8.90258 7.62526 2.74304 1.06355 5.45358 4.56851 8.07687 5.89851 7.08679 15.0194 5.61763 9.55682 0 0 3.27909 2.56916 3.98636 3.2843 7.9501 2.42826 1.81376 0.383154 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00070244 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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