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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072175 ID=TCONS_00072175|Name=TCONS_00072175|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2891bp GCAATCCGTACCATGACATCCATCCACAGAACTACACTACACTGCACAGA TGCACCCATGGAAGGAGCGTTTGGCTGTTTGATCAAAATACATTCAAGTA TACAAATTGAGACAAGTGGAAGATAGCAAAGTAACGTCAGCTTGGTCAAC TCTAACCAACTCAAGAACAACAAATCTAAAAGTCTTGAGAATAAATCTTC TATTGCAAGCTGGATGCATTTTTTAAGGAGATGTTTGTACATTTGATTTC ATGACGTTGGATAGGTTGTTTACTGCCAGTGAAAATGAAGTAAAACTATC TATCGCCCACACTgaagaaaattcacaaaaacaTATCAACAACTAgtaag caAACTATAAGAGAGGGTCTTCGATTCTCAGAAATGAGTCAACATTCAAT GATTACTGAACAAGCAATCAACCCTTACCTTTCATCGCGTGGAACTTCAA ATCATATGATTCAGTCTATGGCCCTTGGTAACCATCTGACTGACAATAAT AATTCAAGCAATAATAATTACTTCAGTGAAATACAAATGGATGACGGGAA ATGGACCCGACATCAAACACAGATCTTAATTGACACCTGGAAAGAGCATA AAGATATCTTATTAAGTACTGGATCAAGCTCAGCTGAACATTTTCGTGTC TGGAAACTCATTGCGACTGAAGTTAACAAATTCGCACCACCCAAGAGTCT CCAGCAATGCAAGAAGAAGTTCCGTAATATACGATACATTTGTAAAATGG CCATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAGAAACATTATCCAATGTTT TATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGG TGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAG ATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGC CAATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAGACGA ACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGTAACGTTAATAACAGTGAAG GTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAG TATCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAACGAA CGTCACAAACGAGCGAAGGGAAACCGCCACTGAAAGCCATCATCATTCCT TACAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTA TCAAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATTCGAC CAGCTCTNCGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGAAGAAGTTTCG TAATATACGATACATTTGTAAAATGGCCATGAATAATAACAAACAAGAGG GCGGTAAGAAACATTATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATT TCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGT CGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGAT ATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCC GAATTAAACACACGTCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCA ATCGGGCAACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTC CTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAAT CATCAACCGACCGTATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAGC CGTCACTGAGAGCCATCATCATTCCTTACAAAACGGGGATCTCGAGAACG GCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTATCAAATTATTACTCACACCACGAT TCTATGTATCCGCCCATTTATTCGACCAGCTCTGAACATTACATGCGTaa gcataaaaatattgacGTCAGTATAATGGGGCGTGGGTACCCCAGTGCAA AGCGTGTTAAACGCGCCATGGATATTTACTCATCACCTGCCCCTGCGCCC TACAAATACGCAAGCCGACACCATCATAGAGGATATCCGCCCACGATGGC CACAATCGCCAGTAATTCTTACCCATATCACATTAACAACCACTATTCGA CAACACCGCCGCTTATTCGACCCGTATCTACACCAAAAGATACATCCCCG TCTCCCCGTAATACTGTTTCTAGTACCAATAACGTAGCACCGAGTCTGTC CAATGATTCGTCTTATATGAAAGCAGAGCATACGCATATTAATGACGCAC CGCCTGCGCTGAAATCGTCTCCTGGGTACAAGAATAGAGAGATGCACGCA CCTAAAGACTTAACATTAAGTGAAACTTTGAACTTTTACAATCAACGATT CTTAGATATGCAAGAGAGACAAACTGAATTATTTAGTGAAATGATTTGTC GGCATGAACAATTTCTTTCCAGACTTTTAGAACAACAACGAACGGCTGCT GAAGATGCTCAAAAAAGAGACAAAGAATTCATGTTAAAATTGATAGAAAT GTTCGTTAAGCAATAGTTTCAAACGTTCTCAactttttagtttttacaat tttttcttctgattttcaatttcttctgatagaatttttctttcgttttt ttttttcttttaaaattttctgctCCAGGTTTTTGAGCAGATTTGTAAAT ATATTTATCTAAATGCGATCTTTAAATTGGGTAATTCTTAATTTTTACAG TTGACTTGCCTGGTTTTTGATACATTCTTAAAACTGTCAGATCGTTGTGT ACGACAGGGGTTTTATTCAAATCTCCCTTGTCAACAAAAATTCTTTAAGA ATTCATCTTTGAACCCTTAAATGAGGCCGTTGGAAAATTAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_71:426415..510805- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072175 ID=TCONS_00072175|Name=TCONS_00072175|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=84391bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:426415..510805- (Clytia hemisphaerica) GCAATCCGTACCATGACATCCATCCACAGAACTACACTACACTGCACAGG
TTTGTATTTCATTCTTTGATCACAAAAAAATTTTCTTAACTATTTATTCT
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TCTACGGAAATACCCCGGTTTTAGCCAGTAGTGGAACATTTAAACTAGAC
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TATACAGTCGACTCTCGCTAATTCGAACTTGAACGGTGAATCTTATTTGT
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TTCACAGCATGTTTATTCATGCTCGGTGAGGTATTATCAGTATGTAACTG
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AAAAATAGACAAAAGACGGATGACCTAGCGTCTAGACATGTCTGAAACGT
CTGAAACTTCATCATTACACATGCTTTTACACTATAAAACTGATTTAAAG
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AAAAAATTGTAGCCTCTGAAGCCTCCCCGCTTCCGCCGGGCCTGAGCTCT
CGACATGGAAAGGAAGGTTTACCAACCAATATAAATCAAAGTTTGAATCC
TCGATGGAAACTTGTAAACTGGAGGTATATTCATATACCCCCCATCAATT
GTTCTTAAAATCACTTCCTTACAATGCAGCAAATCTTACCCTTGTGTCAC
AGACCCCACTGGGATATTGGACAAAATTTTGTCCAAGTGGGAAAAATACC
CTACAGTTTCAGCCCCACTAGGAAAGTGACTTTTATTCCATTACCATTCG
AAATTAAATGGAAAAACTACGCGCTAAATCATCTCTACTGGATTTTATAA
GACGGGAATAATAGAAAAATTTCTATCCCAATGAGATTTTCATCATGATC
GTTCTTATAGAGTATATTCCTATAAAATTAAAAAGTATTTGGACACTAGA
TTTATTTACTCTTTCCTGGAGGATATTCAAGCTGCAGCATCATCAGAGGA
GATTGCAAAATTGACTGAAATTTACGAAAATGACACATCTTCCAGGAGAT
ATTCGAGGCCCTCCCTTCAGAGCCTGTTTCTTAGATCTTTCACGACAAAG
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AAAATGAAGTAATTTCTATCTTTCGGAAAAGCTTATAATATTAGGGGGCT
GGAACATTTTCTCTTATCACTGATCTAATATTTAGATACTATATATAATT
TTCTCTTCAAATCTTAATACCAACTTCAACTGTAGAGAGCTTTATCTCTT
TCCTTTAAAGGTTAAGTGGGTGGAGCAGTTGAGAAATTAATTTTTAACAG
GTGCTTCAAAAGGAATACTGTAAATTCGTTTAAAAAACTTTATTAAAAAT
ATTATTATTTTAGCAGGTCAAATTCTTTTCCTTTTTTGATTAAAGGGTAT
GTTCAAGCCTTCATTTTTTTCTACACATGGTACTACCCACTTACATTTTA
GGGGATGATTTTAAAACTCGTTATTTGATTTGGATCTCACACGTTTGATC
GTATCCATCTACCTAAAAGATATAAAGATAGACAATCAAGCCTTAACAAA
ATAGTCCTCAAAATTTAAAATTAAACTGATATTGGCATTTAGATTAGGTC
TTTTAATAGGTTTGGTCAAACTTAACATATACAGTTGACTCTCGCTCATT
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GCATTTTTTGCAGAAAACCTTAGGAAAATGAAAGAAATTAGGTGAAAAAT
TTGCTAATTCGCGAATTTTTTTCCACGCAAAAATTAATCCACTTAAGGTA
CGCTCTTCTAGAAATGCATAAAGTCATTGTCAATCTCGTTTTCAAAATAT
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TTCATAGTGATGGGGGTCCCATCTACATGAAAAGGGGTCAATCTCAAAAT
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GAGATTGGCAGAGATTGGATCTTTTGCCTTGATGACAGCGAGATCTTAAA
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GAGAGCTTATACTAAGGACTTGTTCGGGTTCAAAGTTATTTCTCACAGGA
AGAAGTTGGGCACATCTGAAACTTAACGAAACATATTTTTGAGGTTTCCC
TAAATTTAAGTTTCTATGTTAAGAAGTTTCTGTCAACTATCAGTTATTTT
TATCTTGAATAATTGCAGAACTTAGTCTTGCTTTAACCAATTTTCAATAA
TTTAAAAAGCTGTCAAAGTTTCAAAGAAGACTTTCATTGGTTGAGAATAA
CGAAAAGAAAAAAAAACACTTAAAGTTGCAATTACCAGTCAAGACTTGAA
CTCAAAGTCTCCGATATCCTTTGAAACTTAGTTGCTAATTTGCCAAATCC
AACTACGAGAGTGCGGTCTGTAGCTGCAAATTGAACTTAAGATGAACTTA
TGAGAGCTTATAAGATCAATGTTAAAGAATTACTGGCAGGAAACGAGGAT
AATTATTTTGTCAAGGAATCAAGCAGCTTGTTAATCACCTGCAATTTAGC
ACAGCCCTGGCGAGTAAAGAAAATTGATTTCTTATGTTTTCATGACATAG
TGGACGTGACTTTTGATTGGATCTCAAAAGTCTTCTAAGCTGACTTGGTT
GTATGTATATCGTTTTTGTAAAATGTTTCTCTTGTGTTGCATGCATTCTT
TGTCAGGTTGATTGTAATGGTAAATAATTTTCGACAATTTAGCCGGTAGT
GTCAAATGGATTAAGTCGGTTGATGTTTGTCTGCAGGTGTGTTTTCATGA
TAAGTATCCATGGTAATTCATTGTTGCCAAAAATTGAGTGACCGGGTTTA
AAAAGAAATTGAAAGTTCTGCTGATTTGTTTGGGTGGGATATAATTGTCT
TGAAACCTCAACTTTTTGCTTATCTTCTTCAAAGTTGGATGTATATTTTG
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TGATTTTTTAAGGAAAGGGTTTTTGAAATTTTTGGTCGGCACCTACAGGA
GATTTTTACTGTGTGATTAAATATTAGTCTACTTAAAATCCAGTTTTCAA
TATCTGAAATAAATCATTTTCGAACATGACTAACACCCTTCTGCATGTGC
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_71 | supercontig | scaffold_71:426415..510805 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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