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transcript sequence >TCONS_00072176 ID=TCONS_00072176|Name=TCONS_00072176|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2763bp CGACAGCATGCAATCCGTACCATGACATCCATCCACAGAACTACACTACA CTGCACAGgctTGATCTCTATATATTCCAAAATAATGCAAGCgagatcaa ttttattttggttgaaAATGCGAGACAGATATTCTCAAGATGCACCCATG GAAGGAGCGTTTGGCTGTTTGATCAAAATACATTCAAGTATACAAATTGA GACAAGTGGAAGATAGCAAAGgcaAACTATAAGAGAGGGTCTTCGATTCT CAGAAATGAGTCAACATTCAATGATTACTGAACAAGCAATCAACCCTTAC CTTTCATCGCGTGGAACTTCAAATCATATGATTCAGTCTATGGCCCTTGG TAACCATCTGACTGACAATAATAATTCAAGCAATAATAATTACTTCAGTG AAATACAAATGGATGACGGGAAATGGACCCGACATCAAACACAGATCTTA ATTGACACCTGGAAAGAGCATAAAGATATCTTATTAAGTACTGGATCAAG CTCAGCTGAACATTTTCGTGTCTGGAAACTCATTGCGACTGAAGTTAACA AATTCGCACCACCCAAGAGTCTCCAGCAATGCAAGAAGAAGTTCCGTAAT ATACGATACATTTGTAAAATGGCCATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGG TAAGAAACATTATCCAATGTTTTATTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCG AGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTGTCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAG GTTTTGAACGATTCAAGCAAAGATGGCGACCTGTACGGGACTGGATATCA GAATCCGTCACCACAAGACAGCCAATACGACGAACGATCGTCATCCGAAT TAAACACACGTCGCGAAGACGAACTAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCG GGTAACGTTAATAACAGTGAAGGTTCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCA ATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTATCAAACAACGACGTCACCAAATCATC AACCGACCGTATCCGAAACGAACGTCACAAACGAGCGAAGGGAAACCGCC ACTGAAAGCCATCATCATTCCTTACAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCA TAGTAGAATCAACGAACGCTTATCAAATTATTACTCACACCACGATTCTA TGTATCCGCCCATTTATTCGACCAGCTCTNCGCACCACCCAAGAGTCTCC AGCAATGCAAGAAGAAGTTTCGTAATATACGATACATTTGTAAAATGGCC ATGAATAATAACAAACAAGAGGGCGGTAAGAAACATTATCCAATGTTTTA TTCAGATTTCCTTGAAATCATTTCCGAGAGTGAGCGCATCAAAGAAGGTG TCAAAATAGAATCACCCAATGTCGAGGTTTTGAACGATTCAAGCAAAGAT GGCGACCTGTACGGGACTGGATATCAGAATCCGTCACCACAAGACAGCCA ATACGACGAACGATCGTCATCCGAATTAAACACACGTCGCGAAGACGAAC TAGACGAGCGACGTACTCAGCAATCGGGCAACGTTAATAACAGTGAAGGT TCTGGAAGCTTTAACGGAAGTCCTCAATCCAGAGAGTGTGAGAACGAGTA TCAAACAACGACGTCACCAAATCATCAACCGACCGTATCCGAAACGAACG TCACAAACGAGCGAAGGGAAGCCGTCACTGAGAGCCATCATCATTCCTTA CAAAACGGGGATCTCGAGAACGGCCATAGTAGAATCAACGAACGCTTATC AAATTATTACTCACACCACGATTCTATGTATCCGCCCATTTATTCGACCA GCTCTGAACATTACATGCGTaagcataaaaatattgacGTCAGTATAATG GGGCGTGGGTACCCCAGTGCAAAGCGTGTTAAACGCGCCATGGATATTTA CTCATCACCTGCCCCTGCGCCCTACAAATACGCAAGCCGACACCATCATA GAGGATATCCGCCCACGATGGCCACAATCGCCAGTAATTCTTACCCATAT CACATTAACAACCACTATTCGACAACACCGCCGCTTATTCGACCCGTATC TACACCAAAAGATACATCCCCGTCTCCCCGTAATACTGTTTCTAGTACCA ATAACGTAGCACCGAGTCTGTCCAATGATTCGTCTTATATGAAAGCAGAG CATACGCATATTAATGACGCACCGCCTGCGCTGAAATCGTCTCCTGGGTA CAAGAATAGAGAGATGCACGCACCTAAAGACTTAACATTAAGTGAAACTT TGAACTTTTACAATCAACGATTCTTAGATATGCAAGAGAGACAAACTGAA TTATTTAGTGAAATGATTTGTCGGCATGAACAATTTCTTTCCAGACTTTT AGAACAACAACGAACGGCTGCTGAAGATGCTCAAAAAAGAGACAAAGAAT TCATGTTAAAATTGATAGAAATGTTCGTTAAGCAATAGTTTCAAACGTTC TCAactttttagtttttacaattttttcttctgattttcaatttcttctg atagaatttttctttcgtttttttttttcttttaaaattttctgctCCAG GTTTTTGAGCAGATTTGTAAATATATTTATCTAAATGCGATCTTTAAATT GGGTAATTCTTAATTTTTACAGTTGACTTGCCTGGTTTTTGATACATTCT TAAAACTGTCAGATCGTTGTGTACGACAGGGGTTTTATTCAAATCTCCCT TGTCAACAAAAATTCTTTAAGAATTCATCTTTGAACCCTTAAATGAGGCC GTTGGAAAATTAG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_71:426415..510814- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072176 ID=TCONS_00072176|Name=TCONS_00072176|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=84400bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_71:426415..510814- (Clytia hemisphaerica) CGACAGCATGCAATCCGTACCATGACATCCATCCACAGAACTACACTACA
CTGCACAGGTTTGTATTTCATTCTTTGATCACAAAAAAATTTTCTTAACT
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TTCCGTAGAAAACTTTACGTCATGAATATCATGAATTTGTACTTGTACGG
CACGTTAGCGCGAGAAAATTGCTCTTTCTTTTGTTTAAAACTGCTGATTG
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CTTATTTGTTCGAATTATAGGGAGATTCGAACTATAGACATTTTAAGAGG
GTTTCTCATTGGCGGGGACTGGAAACAAGTTCGAATTATAGGAAGATTCG
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AATTCGACGTTCTACTATTCGATACGCTCCATTATTCGATAATATTGAAA
GTCATCGTCAACAAGAAAACCACATAAACGACGCTCTACTATTTGATACA
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CTACTTTTATTCACAGCATGTTTATTCATGCTCGGTGAGGTATTATCAGT
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CTGAAACGTCTGAAACTTCATCATTACACATGCTTTTACACTATAAAACT
GATTTAAAGTAATTATAAAATTGAAACTAGCTCCAGGCCCGGCGGAACAA
CCATAAAAGTGGGGAGGCTGACGGCTCAAAATGAGCTAAAATTCGCTAAG
TATTTGAGAAAAAAATTGTAGCCTCTGAAGCCTCCCCGCTTCCGCCGGGC
CTGAGCTCTCGACATGGAAAGGAAGGTTTACCAACCAATATAAATCAAAG
TTTGAATCCTCGATGGAAACTTGTAAACTGGAGGTATATTCATATACCCC
CCATCAATTGTTCTTAAAATCACTTCCTTACAATGCAGCAAATCTTACCC
TTGTGTCACAGACCCCACTGGGATATTGGACAAAATTTTGTCCAAGTGGG
AAAAATACCCTACAGTTTCAGCCCCACTAGGAAAGTGACTTTTATTCCAT
TACCATTCGAAATTAAATGGAAAAACTACGCGCTAAATCATCTCTACTGG
ATTTTATAAGACGGGAATAATAGAAAAATTTCTATCCCAATGAGATTTTC
ATCATGATCGTTCTTATAGAGTATATTCCTATAAAATTAAAAAGTATTTG
GACACTAGATTTATTTACTCTTTCCTGGAGGATATTCAAGCTGCAGCATC
ATCAGAGGAGATTGCAAAATTGACTGAAATTTACGAAAATGACACATCTT
CCAGGAGATATTCGAGGCCCTCCCTTCAGAGCCTGTTTCTTAGATCTTTC
ACGACAAAGATCTTTCACAATATGAAACTCATTTTAAAAATATTACAAAA
TCTTTCTAAATTTTTGTGAAAAACTTCAAAAATGTATGATATCTTTATAG
AAGAATGAAAAAATGAAGTAATTTCTATCTTTCGGAAAAGCTTATAATAT
TAGGGGGCTGGAACATTTTCTCTTATCACTGATCTAATATTTAGATACTA
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TTATCTCTTTCCTTTAAAGGTTAAGTGGGTGGAGCAGTTGAGAAATTAAT
TTTTAACAGGTGCTTCAAAAGGAATACTGTAAATTCGTTTAAAAAACTTT
ATTAAAAATATTATTATTTTAGCAGGTCAAATTCTTTTCCTTTTTTGATT
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CGTTTGATCGTATCCATCTACCTAAAAGATATAAAGATAGACAATCAAGC
CTTAACAAAATAGTCCTCAAAATTTAAAATTAAACTGATATTGGCATTTA
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TCGCTCATTCAAACTTGAACGGGGATTCATATTTTTCTGAATTACAGAAA
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AGCTAAAAAGCTTTTTTGTCCTACTTATGGGTAGAAAATTTGTCGGTAAA
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GTTTTCGAAAACCCCAAGTGGATTAAATTTCTGACTGATTAATTTGGCCA
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TCAAAATATGTGTTGCCAGGATTCATCCAGAGAAGTGTAAAGAGATGGAA
AACAGCTTTTTGAAAACAATGGAAATACGGCTCGTCATTTACCAGGTCCT
TTGCCCTTAAGGGAGTTTGTTTCGGTTAATGGATATTTTTTGTTATTGAT
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AGAATAAAAGTAAGTGTGTATAAACTTTATTGTTCAAAAGGTTTCATATA
AATGGTTTTGACTGTCCCAGAAAAACTATTTTCTGTTTCATTTTCTGTAT
CATCATTTCTTAAAGTCAAAGCCAGCGGTTCGCGTGTTGGCGTGATTTGA
ATTTTTATGGCGTGTTCAGCTGGAGAGGGGGCCTGAATTAGGCAAAACTA
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TCGGTATAGTACTAAATTGATTTCAATACTCAAATTTAAGATCTTATACC
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TAATCATATTCATTACGTAATGTTTCCTGTGGAAACACTCAAGTTTTTGC
CGATAATGGCAAATTTTGAACATTTCTCTTTTATATAGCTGAAATTTGTC
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AAGTGCCCTCTCTGAGGTCTGCAAAATATTAGAGAGCTCCATTATAATAT
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GGAATCGGTTCATGATTTCCTGACCCTTGATCACTTTAGCTTGTCACGTA
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TGGGAATCTGGCGATTTTTTAATCACGATGATTAATTAATTTGCTTTGGT
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ATATTGTTATTTCTTCTTATTTCCAAGACGCGTGGTATTAATTCTTTAAG
GACTTTATCAATTTCAGTTCGATAATGTGTCTATACCGCATCCTGGTTGG
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ACCAAAGCTGAGTTACTGAACAGTAATCCAGGACTAGCCCTCAAACCACG
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TACATTGTTTTTCCTTGTGGCACAATGAAAAAATCGAGTTTTCGAATCAA
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AAAACTGATTTTTTTAATGAACTCTCTCGTATCTCATTCATTTGGGTACA
CCGTCACCGCTTTGAGAGGCGGTGGTTGTTTTGGTTTGGTGGTTTGTGAG
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CTTGAGATGACGTGATTTCATATGTATTTTTCAAAAATCAAAATGTGGTA
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ACAGTGTGGATAATCTTAAAATTGAATTCTCGCATGGCGGTTTTAAGGTA
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TTCATTGATAGTTAGATTATCTTTATTACTGGACTTTGAAAATTATGTAT
CTTCAATTTGAGCTTGACTCTCGGTATTTTATTTCATTGACAGTGGGAAA
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TTATCATCGGTGGAAAATAATTCATTATTTATTACCCGTCTAGTAAAGTC
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AATGACCTGTCTAGTCATTAAATCAAAACAAAAATGGTAGAGTAGATATG
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ATAACTAAATCGGAAGACACTTGGCTCTTTAGGAAACTTCACATATGGAC
TTTAGAAAATCCCGAATAATAGAGCACTCATCATGCTTGACGCCAAATTA
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TTTGAGAATTTGAGAACAAGGCCACCTATTGTTAAGATGCTGTGCTATAG
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GAACCTACGGCTAAGCGGTTCTTGAGCACTGAATTTTGGCAATCTTCTGG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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TCONS_00072176-exon-scaffold_71-1491911889:510757..510814 | TCONS_00072176-exon-scaffold_71-1491911889:510757..510814 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00072176-exon-scaffold_71-1491911889:504431..504512 | TCONS_00072176-exon-scaffold_71-1491911889:504431..504512 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_71 | supercontig | scaffold_71:426415..510814 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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