TCONS_00073049 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00073049
Unique Name	TCONS_00073049
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2637

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_86:992051..1005477-

transcript sequence

>TCONS_00073049 ID=TCONS_00073049|Name=TCONS_00073049|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2637bp
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TCTGTtagaaaaaacataaataaaatcgaCAACAACAAGAACAATAGTAA
CAACAACAGACAACTTCATGTACAACACTATGAATACCATGGTCGTGCAA
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ACTATGGGTACCACGGCACCAAGCGCCGGCTCAGGCAGCGGTGGAGCCCC
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GGTCACCTAATGGTTCGTCAACAGGCGCCACGATGGCGGATTCAAACGCA
AACACAACATATCGCCCAACTTCAACAGAATATATGACTTCTAAGAGCTA
TTACATTAATGGTGGACAGTACAGCCCTCTCCCTGCAGCAAACGCCACTC
AAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGATACCCTTCACCTCATGAT
GAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACAGAGTAATTCAGATGCAGC
AACCACCGGCTCCATTTTAATGCCAAAAAGCGTAAATGGAAGCGCAGAGG
AACACAGCCCGTCACCACCAACTTATCCATCAACTAATACACCCGTAGGA
CGACATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCGACTCAAGATATGAC
TAGTGGGAATTTTCATTAAAGATGGAGTCGCGTacaacagaaaaacaaaa
aaaaatagaagaataaaaaacaacacATAAAAAGATGATGTAAATTTTGT
TATGTGAATACAAAGAGAAGGCGGACCTTTAGCGAAATGGAGGGATATTT
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GAGAGAGGGGAGCCAAAAAATGGTGTAGAGAAAACAACCCACTTTTAACG
ACCAAAAAAGATTGGCGTCAAAATGTCTTCACACTTGCGTACGGGGGAGA
TGAGGCGTCAAATGATGGATaagaattagaaaattttgggcGAAAAAATG
AAGGTTTTCGGATGTCACACCAGTGGTATGAAATATCGCACGAAATAGAT
ATAGTTGTGtttacttcaaaatttttgggttGGTACTTGTTGTGGTTTCA
ACAATACAGATTACAATAATTGCGTTCACTAAAAGGGACTGGGTCCCAAC
TAGAAGGTAGTCAAACATTAGAGATAACAAACTCTTTCAAAGACTTATAT
AGGATAATCTCTTTCCCGCTTGGAATCGAGACTAATCATTTAGGATGTTT
TTTAATCCTCCACACACATTTAACGTGTTTTggtatatattttatttttc
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AGCAACAGATTCTATAAACAGTTCTAGAAACAATTTGCgttaaatttgcc
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GGTACCACAGCTCTGTGTTCCCTTTCGTGGGAGCAAAGTTATTTCTATAG
CTCCGTAAAGCCATTTTTACTTtttgcaaaattgatttttgttttaacAA
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CGGGGCCGAGATCAAGAAAGTGCTTTTCGGGTTTATATAAAACTGAAAGG
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CGCTATATAATATAAAACGGCGATTGTTTGAAAAGCAATcctaatatttt
attttgaaagaaaatgaaacaGCAAAATAATTCCAAC

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_86:992051..1005477-

Legend: exon

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>TCONS_00073049 ID=TCONS_00073049|Name=TCONS_00073049|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13427bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:992051..1005477- (Clytia hemisphaerica)
TGGAAGTGTACGTTTATGATAGGGGGAAGACGTTGAATTGAGGTAAAAGC
TTTTTTTTTTATTTTTGTGTTTTTGTTTGGGTTTTTTTATTAAAATACTA
TAATACTTTCTTTGTTTTTTTTTACCACAACAAAAGGTTTATTAACTAAC
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CATGTGCATTTTACATGTAGAAAAAGTCAGACAAACATTCTTTTCAAGGG
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TAGCTTAGTACCCGTTTTTCGTAGTACTTTTCATTTTTGCTGAACATCAT
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GAATGATGAAATCTAACGAAATATCGAAAAAATACCTTTCTGCTTGGGCG
TGTAGGTGGCGTTATCGTTATCAAATGACGTTATCCTACCTGATGACAAT
GATTTAACGATAAACGTACCGCTGTTTGTCGACAAAGAAAACATAGCCTG
AAAAAAGAAGATTGGATACTGTAGATTCAAAAAAATCTTTATACGGTTTG
TCCGGAAAAAAATCAATAAAAAATGGAAGCAATAGTCATATTGAATTTCG
CAGAAATTGCTATTTATTCCTACAGTACCTAGCCTGGGCTTTTTTGAGGA
ATTAAAGTCCGGGGGGGGGGGCAAACAGCCCACCCCTCATAAAATTATCG
AAAAGTCATAAAACTTGGTGATGCATTATCACGAGAAGGTTGTTTTGGCA
CTCAAAATTTTTTTATTGTACATCTTTCGATGACAACAACAGTTTTTGTA
AGAACTTTTGCAAAAAATGCGAAAAATGACCTCACTTCAAACTGCTATGT
TAGCTCTTGAAGTAGAAATGAATTTTCAATTCTGTTTCGATATTCTGAAA
GCCAATTAAATTCCTCACTAACGATTTCCAATATTTTCAGGTCTAAAGAC
GGTACAGTGCGCCAAAATTGTTATAATTAGTTTTTTCTGAAATGGCACTC
CATCATGGAAATATGATGTCATCGCATAAAATTTTTTTTCGATTTTTTCC
TTTCGTACCTCTATCCGTTGCAAAGATATCTAAGTTTATAATTTGTTAGA
AAATCCATACATTTTGCCTTAAAATTTGGATCAATTTCAAAAAATGCTGA
CGTCGTCAAATTTTGGAAAGCAAGAAAAAAAGTTTTTTCTGGAAAGTAAA
GCTAAGTAAAATTTAGTAAGACTCATGAATTTTCAAGGCTATATCTAAAG
TCCCTGAACTTCCAGGAAAACAAGTTTGTCGAGGGAGGGGGAAGCTTTGT
CCCCCCCTGGGCTAGATAGGTCTTCCTGAAATTTTAAGACTATAAAGCTT
TAAAGGATTTTATAGGGATTTACTGGTCAGGCAATGCAATTTAAGTATTT
TAGAGTCCATTCTGAAAAAAATTTATTTCATTTAGGTATTCAGATTTCGT
AATACATTATTTCTTTATAAGAACAAGCTGTTTTTGAATACTTTTTGACC
CCTTGAAAAGATACTTGCAAATCACCAAATCCAGACTCTATATTGTTTTT
AAGTTGTAATTCTTTTTTAACGATTTCGAGCCTCATTATTAATACTAAAT
TATTCTTACAAAAAAGAGAGAAAAAAACATAAATTCAAAAATCAATTTTC
CTAAATAGTAACCCACGTGAAAAAATAATCTGGGAAATAACATATGTTGC
ATAAGTGTTGTGTTGTACACAACATACGGAGGGCTTTTATGGGTAATTGG
CCTAATTGTTCGGAAAGCAAAACATGTGAAAACTAGTAATTAATTTAAAA
TGAAGCCTATTAACACTTACTACAAAGGCCAAGTGTTTTATCCGTTAAAA
TTGAAATCAAAACAAAGGAAAAGTGAAAATTGAATTTTTCGATGGATAGA
GGTCTCTCTTTTTCCGAATCCCTTTTAATTTTTACAGTCCCTTATTTCAA
AATTACACAATTTTTACAGTCCCTTATTTCAAAATTACACGCTTTTTTTA
TAAGAATGATGTTTTTTTCAATTCATCATGAACATTCTTAACTTTTTGAG
GAAAATCGCCCTTAAATAATGTTAAAGTAATTTTAGGTTTGGGTCCAATT
CCCAGCCAAAATCTAGCATGTAATAAAATTCCATGAACTAAACCAAAAAT
TTGGCATTGTTGTTGAAGCTTTTAGTATTGCTGGGTAATAATTGGCAATT
TAATGGTAAATGCTCTAAAAATGGCATTCTTAGGTTCAGTTACCAAATTC
CATGATGGCGGTATTTTTACCACATTTTTAATTTTTTTTGCCAATTTCAT
CATAAATATTCTTATCAAGTATATTCTTATAAAAAAAACGTGNTTTTTAA
TTTTTTGGCCAATTTCATCATATGAAATTATATATTCTTATAAAAAAAAC
GTGTATTGCGAAACATCAGTCAAAATTCAACTGCTATCTTATCATTTCAA
GACTTTCACTTTCGGTTTCAATTCTTTAATTTGTTATCGACTTTTTATAA
CGTTTTCTGTTTTTCAAAGAAATTACCAAGAGGCGCATAATTTGGGGTAT
AAACAATTGCCTTTAACAAGAGTCATACATATTTTCAACCTCTCTCTTTT
AATCTTTGCTTAAGTTCTTAGGCTGAGCCCCGCTTAATCCTAAAGACTTT
GGCGCGTTAAGAGACAAAACAAGAGGCTTAAAGTCCCTTTCTATATAGAT
ACGTGAGAAGCTGTCGTCAACTACAAAGAAAATCACAAACAAACGAAAGA
CATATGATAAAATAAATAAAAGCATAACAAAATATTTAATTTAATTTTAG
CGGGTTTCGCGTAAATGTAGTATTCTTTTCTTCTTTACATTATTTTCATG
ATTTTTTTAAATTTTCATCATGAAGCATGGCTCTTGGATTGTTCTTGGTC
ACTTTTTCTTCATGAAAATGAGGTAATCATTTAGCATGTAAGGAAGATTT
TCTGTTTTCGTAAGCTACAGTAATTTTATGTCAGATTAATGAAACCTAGA
GATCTGAGTGTAAACAAGTGCTAGTTTATACACGAGACCTTCCAAGTAGG
CTCAAAATTTACGCCATTACGCTGACTCCTGGAGTGCTCCGTACATTCCT
CTGTATCTAATCTTACCGAAGACGGTTTAAATATAAAGTTTCTAATCTCA
GGTTCTAGCTAAAGTATGAGCCAAAAAATTTCCATCAATTTTTGACAACT
AGTCGTTAAAATAAGAATATGAAAAAAANTTTTAAATTTTCATCATGAAG
CATGGCTCTTGGATTGTTCTTGGTCACTTTTTCTTCATGAAAATGAGGTA
ATCATTTAGCATGTAAGGAAGATTTTCTGTTTTCGTAAGCTACAGTAATT
TTATGTCAGATTAATGAAACCTAGAGATCTGAGTGCAAACAAGTGCTAGT
TTTTACACGAGACCTTCCAAGTAGGCTCAAAATTTACGCCATTACGCTGA
CTCCTGGAGGGCTCCGTACATTCCTCTGTATCTAATCTTACCGTGTAATT
GAGACTGAAGACGGTTTAAATATAAAGTTTCTAATCTCAGGTTCTAGCTA
AAGTATGAGCCAAAAAATTTCCATCAATTTTTGACAACTAGTCGTTAAAA
TAAGAATATGAAAAAAAACTAATAAATTGCAAGTGTCTCTTAACAAGCAA
AGGTGCCAGTAATTACAGAGTACTAGGTCAGAATCCAACTTTGGGATGAC
ATCTTTCTAACGTACATTTTACGTACTTTAGAGTACTTTACCGAGTCTTT
ATAGAAATTATAGGAAATAGATGCTAACGAAAAAAAGTTTATTCAAAAAA
TTACTGTTTACGCTCAAGGTCTTTTCAAATAAGAACCGCGCACACGCGCA
AATTATTGGGAGCCTGGCGCTAATTACTATTGCTATGGAAATAGTTTGTT
TTGAATGGAACTGAGAAATTTCGAGCTTATTGATTGGCGGACAGAAATTG
AAGCATGTGTTAAAAGAAGTAAACATGTAAAAAAAAATATAATATATATT
TTCTCTTTCTTTCGTTCAGAGAAGCATATATTGTTCTTTATATATATCTT
TTTTTTTAATTTCTTTATGGTTCACTCAATGTTCTTTTTTTCAAAGTTGG
GTGTTGAATGGTGGGGGTTACTAGTTGTAAAAAAATTGATACCTTATGTC
AAAAAAAGGAGTGAAAAAGAAATTGATAAGAGTTGTAGCCAATCAGAACG
ATCTATTCATAGTGTTTACGCGCACTTGAAAAATTCGACAAATCTGATTG
GTTGGTTTTTCTTCGTTCCTATTGTTTGTGAGGTGAGAACAATAAAAAAG
AATAAGAAAGAGAACATTTTTAAAAAGGTATCATTTTTTTTCATCATCTT
CAATGGATTAATTCTTTTCTTAATGATAGGTCGAAGAGAGGAGGGGGAAG
GCTTGAAAGAAGTTTTCTTTATGCTATTTACATTATAGATCTTTTGATTA
AAAGATGAGTCGAGTGTAAAGGCTAGTATTATCACTTCTACATTTTTTGT
GATGAGTAGACTTGAATAAGTTTGTGATTTTTATAGATCTTTTGATAAAT
ACTACTTTTTTTATACTTTATACATTCTTCTTTATTCTTTTGAGTACTTG
TTTTCAGCAGACTCCTTTTTATATAAAATTTCTTTCTTTTTTTTAAGTAC
CTATCAAATTCTAGGAATCTGTAATGAATGCTACTATATGTACATCTTTT
AAGGTGACTTTTAATAAGTTAAGAAGCTCTCCTCGCATTTGCTAGTAATT
AATAGAACATTTTAAAGGGGAACTTAAAGCCAATATATCATTGCCCTTTT
CAAAATGCTTTATGAAGCATGTTAAGAAATTTAAAATTGAACTTCTGGTT
AAAATCCTAAAGACAAATTGTGGTNTATAATATATATTTTCTCTTTCTTT
CGTTCAGGGAAGCATATATCGTTCTTTATATATATCTTTTTTTTTAATTT
CTTTATGGTTCACTCAATGTTCTTTTTTTTCAAAGTTGGGTGTTGAATGG
TGGGGGTTACTAGTTATAAAAAAATTGATACCTTATGTCAAAAAAAGGAG
TGAAAAAGAAATTGATAAGAGTTGTAGCCAATCAGAACGATCTATTCATA
GTGTTTACGCGCACTTGAAAAATTCGACAAATCTGATTGGTTGGTTTTTC
TTCGTTCCTATTGTTTGTGAGGTGAGAACAATAAAAAAGAATAAGAAAGA
GAACATTTTTAAAAAGGTATCATTTTTTTTCATCATCTTCAATGGATTAA
TTCTTTTCTTAATGATAGGTCGAAGAGAGGAGGGGGAAGGCTTGAAAGAA
GTTTTCTTTATGCTATTTACATTATAGATCTTTTGATTAAAAGATGAGTC
GAGTGTAAAGGCTAGTATTATCACTTCTACATTTTTTGTGATGAGTAGAC
TTGAATAAGTTTGTGATTTTTATAGATCTTTTGATAAATACTACTTTTTT
TATACTTTATACATTCTTCTTTATTCTTTTGAGTACTTGTTTTCAGCAGA
CTCCTTTTTATATAAAATTTCTTTCTTTTTTTTAAGTACCTATCAAATTC
TAGGAATCTGTAATGAATGCTACTATATGTACATCTTTTAAGGTGACTTT
TAATAAGTTAAGAAGCTCTCCTCGCATTTGCTAGTAATTAATAGAACATT
TTAAAGGGGAACTTAAAGCCAATATATCATTGCCCTTTTCAAAATGCTTT
ATGAAGCATGTTAAGAAATTTAAAATTGAACTTCTGGTTAAAATCCTAAA
GACAAATTGTGGTTCGTCATGCCCTTCTATATCAGCGAAGTATTGGGTCC
TCTTACAGTATTTGGAGTATGATTTCCAAAAGATATGTCAAACGCCATTC
TCATCTCTTTAAAAATGTCGTCCAAATCAACATCGCGACATATGCCTATA
TTTTCTTGTGTCTGCGAAGTCCTCTTGCCGACAAAATCGGAGCCGCGGTA
ATATACCGTAATATTCGCACGTTCGTCTAACTTACTTCGATCCGTCGCGA
ATTGAAGTTAGTAGAGTTGTGCTGACTTTATATTCGAAACACGGAACTGT
TAAACATGTTCGCGCGCGAGTTATCTTTTTCTTTTTTTTGTAGTACTTCT
GTTTTTGTTGACCTTTAAGTCGTGTTGTTTCCCGTGAAACACAGTTGCTA
CTACCGTTAGAACTCTCTAAAAAAACTTTTTTTGATATCACGATGGAATG
CTGTGGTGTCACCTCGATGTGGTTGGGTTTTTGGATTAGCTTTAAAGTAA
AAATCGACTTTTGTGCGTTTAATTTATTGCTTTAAAAAGTTAGCTTTAAA
ATTCTTGATTGCTGGACAAAAGGCTAGAGGCAATCTTTTATGTTGAGAAA
ATCTAAATCACATAAGACATGCCAGATGGATTGAGTTTAGACTCGCATTT
AGGGCTGGACTAGAAACTTTCGGATGGGAAATGAAGCTACTTAATTTATC
ATTCAGAACGCCCAGGCGTGGTTTAAACACAAACGTCGGATTGAAAGTAA
AATCTATCGCTAGATTTCAAAAAATGCAGTCCTCAAAAACAAAGGAACCG
CTAGATACAATCCGTCGTCATGATTGCGGCGCGTTCTGGATGGGAAATAA
CTGGCTTCACTTTTTCTTGCCTGGGAAAGGTTAGAGATTCTACTCTAGCC
CTTCGGCTTTAAACTCAATCATCAGACGTACCCAACATCGGCTCTGCAGC
CGTTTTGTATTCTGAGAGAGATTTAAATATGGCAGAGCGACATTTATAAA
AGTTTAAAGATCTTTACTAGAATATTTTCACCCTCTAACAAAGGTTTAGG
TATCCAATTACTGATTACTTTGTTATTTGCTTATTCATCATGACGTAGAG
TTTTATGTTTTTGATAATTAAGTAATTTAATAAGAATTCCCAAAAGTCAT
CAAATAAAATAGTTCAAGGATTTCTTTGTCCTAGTCTAATTATCACATTT
TGTAAAAGCCGCCAAATTTTGTATGTTGTTTTGTATGTTTCTTTGTCCTC
TCTTTTTATTATGACAAATGGATTTTATGTAAGGAGACTGTAATGAAGGC
GTTTAACAAAATTTACTGTGGTATGTTATGTTTTAAATTACTTTTAAGCT
CAGATTTATTAAGGGTGTCTTTTCGCAAAGGAAATTTATCTATTTTAGCA
TTTTCTGACTCATCTAAAACTTCAGAAGCTTTAACTTTTCCTTGAAAGAA
CCATAAGTGAAGCAACTAAATCTAAGATTGCCATTTTTAGAGCGATAAAA
ATCCGGTATAAATACACTAAACTGTCGTAAAAATACCATTCTTTTGCTTG
AGGTATGTATTACTTGTTAAATTTGGGTTAAGTTTCTAAGATGCTAATCT
AGGAATATTTTAAGATAAGAATATCCCTCATGAAATGGAAATAAAACGCG
TAAAAAAACATGTAAAGAACAGTACGGGAGGTTCAACTTGTAACTAATCA
ATGACTGAGCAAGCGGTCGATCATTAAGAGACTCAAGAGGGCAAGCTCAG
AAACGTTGTTCATATTATTACGATACATCTAAGGGGACAGTTATACGGAT
ATAAGATTGTCATTCTTAACCGCATCATTGTTTCTAATATAAACAATTTT
GTTTGTTTAATGTGAGTGTTAGAGGAAGTAAATTGCTTCAAAGTGCTGCG
TTCTTAAGATTAGCCGCTTCCATTTGCTTTCAGGGAAATTAGTTTTTTCT
TGCCTTATTATCATCAGAACTTACAGAAAGTATCTGGTAAGACAGTATGG
GACAACAAAAATCCAGCGAAATTTGCTTAAGGTAAAAAGTTACACTCAAA
GAATACAGTGCAAAAAGAATGCAAAGAAAATTAGGTAGGGTAAATGTATT
TTTTAGGTGGTTTGAATAATTTTTTCTGTTCTTTAGAGATTTCATCTGTT
AGAAAAAACATAAATAAAATCGACAACAACAAGAACAATAGTAACAACAA
CAGACAACTTCATGTACAACACTATGAATACCATGGTCGTGCAAGCCAAA
CCAGAAATGATGACACACATACCACACCCACACCATCAATTAAAACCAGG
TGTTGGTGGACCCGGGTCACCCGCTATGCAACACCCTGGTAAGAACTTTG
TTTGAGTGGGCTCACGTCCAAACGGTAGCGAACATTTCTAAGCTCTTTGC
TAAAAGGGATTGGCATGGATACAAACTATATAAGAGCTGACTAAGGCTTC
GATAGCCTTTAGTATTAAAAACAAGTTAAGAACACCCAATTTCTTAGGAA
ATTGCACAAAAATGCCCAAAAGATGGTGAAATTAGAACATTTTAGGAACA
TTTTTAGGCTGAAAACTGAAAAAGTTATAAACATTATGAACATTTTGGAT
GTTCTTATAAAGAACGTGTACATGTGCAATCTAAAACACCATTCGGGCAA
CCATATAGATATTACCACAAATAGACTTACAACAACATTACCAATCAAAT
CCACCCTTGAGACCTAGTTTATTGTAAGTTACTTTCAATGAATTTTTGTT
CTTAATTTTTATCATTCAGGGTTGGTCGCACATCCAGGATTAGTTGGATT
GAATGGAGATAACCATGTTAAACGACCTATGAATGCTTTTATGGTGAGTG
ATTTGCAACTATCGGGCATTCCGTGTACATAGTATACATTTTTGAAAACA
CGAAGTGGAAGTTTGGCCTAAGCTGAGATCAACAATTTAAGCTTAAAAGC
GAACTCGGTAGCATCTGGTCTTGATCGATGTGCTTTAGAATTCTCCAAAA
ACAGATAGTCAAGCCTCCAACTAAAATCTTTGCGTTCAAGCAAATTTAGT
ACCCACATAGAAGAAATTTGTAGTGGGTTAATATAGTCATAACATCGAAA
ACCCAAGGTTACACATCAATCCATGTATCCACTTCAAACTAGCTGACATC
TATATTATATTCTTTGCCTTAGGTTTGGTCAAGAGGAAAGAGGAGACAGA
TGGCCCAAGAACACCCTCGTATGCATAACTCTGAAATCTCTAAGCGGTTA
GGTGCACAATGGAAAGTCCTAACACCTGAAGAGAAACAGCCGTTTATTGG
TAAGACCTTAATTATTGGTAGCCCAATAGATAAAGAGTCAATCCTTGGGG
TTAAAAATTAGATTTTGATTACAAAACAATAACTTTTTGGAACGAAGACA
AAAAGCCATCCAATTTGAAATTGAACACTTAAAAATAGTGTANTGAACAA
AGACAAAAAGCCATCCAATTTGAAATTGAACACTTAGAAATAGTGTAGTA
TCCATAGCTGATAACTTGTTCGAGTTAAGATTCGAGATATTAGATATGAA
GAACCTACTGTGTAACATTTCATTGCGTGAAACCGGTTAACACTTTTGGA
TTTGAGTCAAAATTCTCTCTGTAAAACATTAAGGAAGGAAATGGGATACA
AGAACGGTCTAAGAACGTATGAAAAGGTGTGAAGCTAATTAGCCGGACGT
CAAGATCTCTAATGGATTATGACCTATTTAAGGGGCTGTACTGAAAAGCT
TTGTTTTACTTAGACACGATTTCCTGTAAAGGAAATGCACTGGTTGTGTT
GAGGATTGACAGTGAGCTTACTTACTATATTTCGAAAAATTTTGCTTTAA
TCAGACTTATGAATTTTGTAATCATGAGTCATCAACAGGGATATTTTACA
TTAGAATCGGCAAAATTAACCAAATAGAAACGACCAGGTTAAATGTTTGA
AGAATTTCTAAAAAGGAAGACTCTTCGAGGAAATTTCGTATTGGTATTCT
AGTAATTCTAACTTTTATGAAGTCCACAGTTTTTATATAATTACATGTGT
TTGTCGTGAAAGATGAAAGAAGTAACGCGTACAAAAAAAGTTAGTTAGTA
TTTCAATATTGACTTAAAGATTTTAATATTGAACGGAATTCAAAAAGGGT
GTTTACTGCCTTCTAACCGGTTAATATTATGATTCAACGAAAAAAAGGGG
ACTTTATTGACATAGTAATGTTGATTTGATTGCTTTCGTTTTTCTTTGAT
GTAGATGAAGCCAAGCGCCTTCGTGCCGTTCACATACAAGAACACCCTGA
TTACAAATACAAACCAAAACGCCGGAAGCCGAAACAAATGAAAAAAGACA
TGTACCCAGCTTATAGCAACATGGCAGCCTCGACTACAATAATTCCGGGT
ATGGACCCAAAATACGGCGGAATGGCCTACCAACAATCAATGGCATATGG
TATCTCGACCATGTCACCCGATTTATACGGAAAAATGAATGCTGCATATG
CCTATCCGGCTGCTATCAGCCCCGGATACCCTGTGATGTACTCTAACTAC
CCTATGACAACTATGGGTACCACGGCACCAAGCGCCGGCTCAGGCAGCGG
TGGAGCCCCTTCCCCAACCTCCAGTAATGGAACTAGAGGCTATAATACAG
CTTCCTTAGGGTCACCTAATGGTTCGTCAACAGGCGCCACGATGGCGGAT
TCAAACGCAAACACAACATATCGCCCAACTTCAACAGAATATATGACTTC
TAAGAGCTATTACATTAATGGTGGACAGTACAGCCCTCTCCCTGCAGCAA
ACGCCACTCAAGGTAAAAATTAGCTTTCAATCAATGGGTTTGTTGATAAT
GGGTCTAAAAGATAGTTTGGGCTCAGAAACGACTTTTGAAAAATACCAGG
GACCAAACATGTTCACAAGAAAATCTCTTTTGGGCTGGGCTGGATTATTT
TTAGGGTTCGGAGAAATTAAAGTAGAGCGGTGTCAAATAGAACTTCTATC
ATTCACATTTTCCTATGATTCGAACTTCGTTCATTTCGATTCAGTTCATA
CTTCGATTCTGAATTAGCAGAGTCAGAGGTTTTCCGACTCTGGTAAAAAA
TGTCTGAGAACAGATACAGTACAAAAATGAAATACAACTAATAATTGATT
TATATCAGGTCACTCACAGCAACCACAAGCAGCCAGATACCCTTCACCTC
ATGATGAAAGTCGAATCTCACAAAGCGTCGTCTCACAGAGTAATTCAGAT
GCAGCAACCACCGGCTCCATTTTAATGCCAAAAAGCGTAAATGGAAGCGC
AGAGGAACACAGCCCGTCACCACCAACTTATCCATCAACTAATACACCCG
TAGGACGACATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCGACTCAANCA
CACCCGTAGGACGACATTGGACACCTTCGGGTGGTTCCGGGGCACCGACT
CAAGATATGACTAGGTAAATAGTGAAAAGAATTCAAAGAATTGCTTTCCA
ACTATCTTCCTTCAGGAGTGGGTAGTAGAGCAGGTGTATGCACTTCGTCC
TTATCGGGATATAGTTTTTGATTTACATAATTAAACGTATTTTTAGGGAA
GATTGCAGCTTTTCAGGGGGACGGGGAGAATAAAGAAGTATCTAAGGATA
TTTTACTACTCTAGTTTTTCCCTAAATTTGCAATATTTTCTACAAGTCCC
AGACCCCTTAAAATTTTACAAGGCGCCAGGATATGGAACCATTTCCTCAA
TTGTGGAAGGCTCCCAGGATATACCATGTCTACCCAGTTGTGTAATTTAG
GTTTAAAATGAAAAATGGGAGGGACTGATATAATAATTTCCGTAAGGATT
CAACCTCATACGTTAGGGGTCTTGGCACCAAATTATATAATACACATCAA
TTATAGAATCTTGATTATTAAGCGTGTGGTGTTAGGGTGCAAATTATGAC
TCATTGCTCACTGAATGATGCAATCTGAATTGTGTCTCTTTAAAAAAAAA
ACCTTTGTAACAAAACGTATCATTTTATGTTTCTTCATTTTAGTGGGAAT
TTTCATTAAAGATGGAGTCGCGTACAACAGAAAAACAAAAAAAAATAGAA
GAATAAAAAACAACACATAAAAAGATGATGTAAATTTTGTTATGTGAATA
CAAAGAGAAGGCGGACCTTTAGCGAAATGGAGGGATATTTAGTGAAGAAA
AGGCAGGCTCCTTTTATGAGAAGAAGATATTTTTTATTATGAGAGAGGGG
AGCCAAAAAATGGTGTAGAGAAAACAACCCACTTTTAACGACCAAAAAAG
ATTGGCGTCAAAATGTCTTCACACTTGCGTACGGGGGAGATGAGGCGTCA
AATGATGGATAAGAATTAGAAAATTTTGGGCGAAAAAATGAAGGTTTTCG
GATGTCACACCAGTGGTATGAAATATCGCACGAAATAGATATAGTTGTGT
TTACTTCAAAATTTTTGGGTTGGTACTTGTTGTGGTTTCAACAATACAGA
TTACAATAATTGCGTTCACTAAAAGGGACTGGGTCCCAACTAGAAGGTAG
TCAAACATTAGAGATAACAAACTCTTTCAAAGACTTATATAGGATAATCT
CTTTCCCGCTTGGAATCGAGACTAATCATTTAGGATGTTTTTTAATCCTC
CACACACATTTAACGTGTTTTGGTATATATTTTATTTTTCATCTTCATTT
AAGAGATTTATTTACTTCATTTTTTTTAAATAACAAAAAGATATGAAATT
ATTGTCACACATTATGTTTCACAGGATATGGATCCGATTCAGCAACAGAT
TCTATAAACAGTTCTAGAAACAATTTGCGTTAAATTTGCCCAAAATTAAG
AAATACTTAAATAATATTTTAGGAGTCTCAATTTTTTTCCGGTACCACAG
CTCTGTGTTCCCTTTCGTGGGAGCAAAGTTATTTCTATAGCTCCGTAAAG
CCATTTTTACTTTTTGCAAAATTGATTTTTGTTTTAACAATCGACCCATG
GTCGTCGTTACAATATTTGTTGAAAGGTTTTGTTTATAATTTTTTCGACC
TACACCGAATCATGAATCATCAAGCCATTAAGGCTACACATTCGGCTACA
CATTCCAAAAAAATCGATCAAAGATTTTGTTTGGCCGAGGCGGGGCCGAG
ATCAAGAAAGTGCTTTTCGGGTTTATATAAAACTGAAAGGCATTATGAGT
AGACACAAACTTTTTATGAGAAAAAATAGGTTTGATATATTATGCTATCA
TCATATATATTTCGAGTTTATCAATCGACTACTTATTATTTTTATCAAAA
TATTGTTTTTTGCTGATAATTTATAATATTTGTTTATTAACGCTATATAA
TATAAAACGGCGATTGTTTGAAAAGCAATCCTAATATTTTATTTTGAAAG
AAAATGAAACAGCAAAATAATTCCAAC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_045293	XLOC_045293	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_86	supercontig	scaffold_86:992051..1005477 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0113939	5.21908	0.00190962	0.0026178	59.4135	39.937	12.7656	34.5934	11.9572	5.34764	19.5025	16.8692	3.96761	2.05412	0.00212456	0.00275258	12.503	13.9899	11.7672	0.633021	7.61505	15.5072	0.785741	1.27776	9.38831	17.9676	7.28072	5.50044	0.00703482	3.3386

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00073049 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SOX21 (Transcription factor SOX-21 OS=Homo sapiens GN=SOX21 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 125.946 bits (315), Expect = 2.529e-31
Identity = 54/68 (79.41%), Postives = 65/68 (95.59%), Query Frame = 1

Query:  286 NHVKRPMNAFMVWSRGKRRQMAQEHPRMHNSEISKRLGAQWKVLTPEEKQPFIDEAKRLRAVHIQEHP 489
            +HVKRPMNAFMVWSR +RR+MAQE+P+MHNSEISKRLGA+WK+LT  EK+PFIDEAKRLRA+H++EHP
Sbjct:    6 DHVKRPMNAFMVWSRAQRRKMAQENPKMHNSEISKRLGAEWKLLTESEKRPFIDEAKRLRAMHMKEHP 73

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00073049 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00073049 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SOX21	2.529e-31	79.41	Transcription factor SOX-21 OS=Homo sapiens GN=SOX...	[more]

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TCONS_00073049 (transcript) - C. hemisphaerica