XLOC_001351 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_001351
Unique Name	XLOC_001351
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000020:819644..834542-

gene from alignment at sc0000020:819644..834542-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_001351 ID=XLOC_001351|Name=XLOC_001351|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14899bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020:819644..834542- (Clytia hemisphaerica)
CACCTTACTCCAGCCATTTTAATATATGATCATGTTTTCTCTTGCAGGTA
ACATATAAAAGACATTTGAATAAAAAAATAGACAAAACTTTATTTCAATG
CTGGTTCTTAATGGATAGAGATTGATCATATTTTTCTTTTTTATGAGAAT
TTGATATTGTGGTGCAGTGAGACAGAAAGTTAATTTTCAAGATGAGCAGT
AGAAAAGAATCATCATGCACCAACCAAAACACGTTAACAACATCTATTGC
CAAGATAGGGTCTGCCGTCAACAGTCCTCGAAATCGATTATTTCAAATTC
GGCAACAACAAACACCAGTTTCCAGTAGCTCATCTATATACAATCCACCT
CAAAGACGTGTGGTGAACTTAGATACTTGGCCAAACAATGCTGGTAGCTT
TGACAATAATAATGCCGCTATGGCTCAAATGTATAGCAGCAGATGGGGTG
TATATGATAATACCACATTCAATATCGGTTACAATGATGGAGGATTCTCA
AAACTACCACCACTGAATATGAATGGTATTGATAATAATAGTATGAACAA
TGTAGACCATAATCAATTCTCACCTAAACACACCATGATGAACAACAGCC
CTAATATGAGTCCCAACAACTATATGCAACAAAATATGAACAACAACCCA
TTTACAACGGTACAGACTTCCAATAGTAACACGTTGAATGATAGTCTATT
TCACCAGAATCAACAACAACAGCAAAATCTGAACACTCATAACAATCATC
AGATAAACGTTACAATGCAAAATTCGAACTTTCATCACACAAATAACCAA
ATAAATAACACAACCACAAACTTTCAAACACAACACTCCCAACAACCTTG
TATAGATCTAAATACAACGAGTTTTAACCCGCAACACACGATAGAACAAC
AAAATAACACGAACACTTTCTTCCAGCAAAGCCAACAGACCCAGCATAAT
GTGGATCATCGACAGACTATAAATAGTGTAAATAACACAAGCAATTTTCA
ACAACAGAACATTTTTAACCAATTCGATCAACAGCAAACTGAAATAAACT
CTGCAATTCCTCAATCCTTAGTTGATATTGTTATGGAAATGGAAGAAGAA
ACTCCCGAACAAACATTTGAGCAGATGCTGACAGACCATAACAAAAATAT
TCAAAATACTTGTAGCTATGGAAACTCTCCAGTCCCAGAGACTTTCAACG
ATGATTCCATGATGGATATAAGTGATATGAATGACATTTTTACCAATATT
CCATCAATAAGGCCACCTTCTACGTGGAATTTCGATATTGTTGAACAAAA
CAATAAAATGAATATAGAAAACTTTGGATCGTCTACTTCACACTTGATTA
ACGAACTTAAAAAAGAGAATCTGAAAGCAGAGCCAGCGGTGTCTATAAAC
TCGCTATCAACAACATCAATGATAACAGAGCAAAATTCACAAAACTTTCA
ACAAACTTTTGAAAACACTCAGCAGACATTGCAAAATCAACAAGATATGA
AAAATTCACAATTACAACAAACTTTACATAGTGAGCAAATCTTTCAACAA
AATAGACAAAATCATCAACCATTTGTACAACAAAGTCACCGACCAAATCA
GCAACATGCCTTTCAAGAGCAGAACTCGGAACTAAGTCAAAAACCTCAAC
AAACTCAACAAACTCAACAGACTCAACAACAATTTTTGAACCAACAAACT
CAACAAACTCAAGAGAATTTACAACAAAACCAAAAAACAAAAGAACAACA
TCAAATCTTACAGCAAAATAAGCAAAATAATCAACAGACCTCAACGCCAC
AACGACAAGAGCAACAAAAATATCAACAACAACAACAACAGCAGCAAAGT
CAAAGGCAAGAAGAAGAGGAAGAGGAAGATATCCCAAGTGAAATTTTTGA
CAAAAATGGCGAAACGTGAGTTTATCTTTTTTAACGTTTTTTAACACTAA
GTTGAACAGGAGAATATTTATTCCCGAATGCTATTTATATTTTTGTTTGC
CCTGGATATAATTTTATTTTTTATCAAACAATGTTTTTTTAGGTTCCTAC
ACTTGGCAATCCACAACAGAGATATCAAACAATGTTTGGAAATTTTGGAA
ACACCTGTCCTGAATAAAGCAATCAATGTTAAAAACGCCAGTAAGGAGGT
AAGTAAAAAATTGCTCATAAAGAGTACACAACGTTTTTTGCCAGTAAGTG
CACTTATATAACACCCGCTGTAACCCCAGCCCAACTGGAGAATTTGGCAA
ACATTTCGTCGCCGGTGGAAAATTACCCTGGAATTTTAACCCCATTGAGA
AATTGACTTTGATTTCATCCCCATTTGAAATTCGATGCTTAAGAATTGCA
CTCCAATAAAACCATCTCCACTGGATTTTTTAAACTTGGAACAATAGAAT
TTCTCCATCAGGATGATCCTCCGGGGCTTTGAGACAGGGGTGTTATATAC
CATCATTCATATTTCCCTTCTTTTATTTTTCATTGGAAATTTTCCCCGCT
TTGAAACCCTTGTCTCGATGACCAGTAGTCTAGAGCTAGACTACTAATTA
ACATCAGTTTTACTCAAAAGTTTCTTTTAACAGTAGTAGAAAAAAGCTAT
CTAGAAGTTTGTTTACTTTTCCCGTACTGCTTTTTTCTTCTTTTTGACTT
TGAGGCAGGATTGTTCCTACGTTTTGTGTTAAAAGAATAGTGGTCTGGAA
ATCGAGGCTAAGAGACCAGGTGAAAAGCTTGCTTTGCCAGTAGAAGATAT
AATAATTTTCTTCCAATGGGTAATCAAGAATCAGCTCAAAGTCATCGAGG
AAGGGTCGAGGAAGCTAGCTTAGTGCGAAACATCAGACATGAATATCTTA
AATATTGTCATTGTTTTGTTAAATACTCATTACAGAGTTTGAAATCCTCT
GTCACGTCTTGACAAACTATTTCCGTCTAATATAGAAGCATAATTGACGG
AAATGAGAGAGTTTATATTTAACGAGTGAACTTCAATCTTTCGGTTTTGA
TTGTAAAATTGGAGAGAAAGCATTGAATGATTAGGAAATTCTATGTAAAC
GTACTATGAGTTTCTTAAATGAGCCCCCTCCCCAGCGGTAACTCTGATCA
CGATATCACGCAATTTTTTGTCTTCAATCACGATCCCGCAAATATGAAAA
AATGGACAATCACGCATCCCTTTGAAAAAGTCCAAATCACGATCACGTTT
TGACCTCTCATCACGCTATCACGTAATCATGCCCTAAAAAAGTCCCTATC
TACAATCAGGGACAAAATACTTGGCACAAAAGGGAAATTCACCGGGGTGT
TTTGAAACCACAATCGATTTGTAATTGCTCTAAAGTAGGTCTTAACTCTG
AGTTTTAACGCTAGACTTAAGACTTAGGACCTTAGGATCTGAGGATCCAA
AAGTTCAAAAATGGTCCAGTAGGGCTTGAAATATAGCCTAGAAANNNNNN
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NNATCAAGTTGAGGGCCTGAAATTGACATTCTCGCTCGAGCTTCAATTTT
CGAAAAATGGTAAATTAGCCAAAAGTGCAAATATATTATGGCACGGATTG
TAGTCATCACGAAAACCGCTCGGGGCCTCTTGAATAGAGGTTTAATTCAA
TACATATGTGCTAGCTCAATATGCATCAAATACAAACTAACAGATTTGAA
AAATCTCCTTTCCTAAGTCATGACTAACGAGCTATTCCTTAGAGGAGCTG
TTCGAGTTTTTGTCTTCAAGACACAAAAAAGGTACCGCCTAAAAATGGTT
TCCGGAAAGTACTTCCGTTGCCCTTAGCACAAATCGATTTGGTTTAAGAA
ATGTATGAATTTTGTTTGATAGCGAACCGATCATATAATGTTCTTTCGTA
ACCACAAAGAAATTGTGTTTATTTTGTCTTGACGCACAGCCGTTTTAAAT
CCCTTCTAAATGATCTAACAGTTGATATCTTTTAGAAATTTGGATTTTTC
GCAAATTATTTGAATGAATTTGGCAACTACAGGTTATCTCTACTTAGGAT
TTGATGTAAAGTATTAGAAATATCATCATATAAAACNAGAGACCAGGTGA
AAAGCTTGCTTTGCCAGTAGAAGATATAATAATTTTCTTCCAATGGGTAA
TCAAGAATCAGCTCAAAGTCATCGAGGAAGGGTCGAGGAAGCTAGCTTAG
TGCGAAACATCAGACATGAATATCTTAAATATTGTCATTGTTTTGTTAAA
TACTCATTACAGAGTTTGAAATCCTCTGTCACGTCTTGACAAACTATTTC
CGTCTAATATAGAAGCATAATTGACGGAAATGAGAGAGTTTATATTTAAC
GAGTGAACTTCAATCTTTCGGTTTTGATTGTAAAATTGGAGAGAAAGCAT
TGAATGATTAGGAAATTCTATGTAAACGTACTATGAGTTTCTTAAATGAG
CCCCCTCCCCAGCGGTAACTCTGATCACGATATCACGCAATTTTTTGTCT
TCAATCACGATCCCGCAAATATGAAAAAATGGACAATCACGCATCCCTTT
GAAAAAGTCCAAATCACGATCACGTTTTGACCTCTCATCACGCTATCACG
TAATCATGCCCTAAAAAAGTCCCTATCTACAATCAGGGACAAAATACTTG
GCCCAAAAGGGAAATTCACCGGGGTGTTTTGAAACCACAATCGATTTGTA
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CGAGCTTCAATTTTCGAAAAATGGTAAATTAGCCAAAAGTGCAAATATAT
TATGGCACGGATTGTAGTCATCACGAAAACCGCTCGGGGCCTCTTGAATA
GAGGTTTAATTCAATACATATGTGCTAGCTCAATATGCATCAAATACAAA
CTAACAGATTTGAAAAATCTCCTTTCCTAAGTCATGACTAACGAGCTATT
CCTTAGAGGAGCTGTTCGAGTTTTTGTCTTCAAGACACAAAAAAGGTACC
GCCTAAAAATGGTTTCCGGAAAGTACTTCCGTTGCCCTTAGCACAAATCG
ATTTGGTTTAAGAAATGTATGAATTTTGTTTGATAGCGAACCGATCATAT
AATGTTCTTTCGTAACCACAAAGAAATTGTGTTTATTTTGTCTTGACGCA
CAGCCGTTTTAAATCCCTTCTAAATGATCTAACAGTTGATATCTTTTAGA
AATTTGGATTTTTCGCAAATTATTTGAATGAATTTGGCAACTACAGGTTA
TCTCTACTTAGGATTTGATGTAAAGTATTAGAAATATCATCATATAAAAC
GTTTTCCTATAAGAACAAACCATATAAGATTATCAGACTTTGATGGCTAA
AATATTAAGAACATGTTAAGAACATTTCAAGGCTTTGCCCGGGAATTTAA
AACACCTATTTTCTTAGGAAACGGCGTAGAAAATACTCATTAAGTAATGA
AAAATGAATATTTTAAGAATATCTTCATGCTTAAAACTCAAAAGGTTTAG
GACATCCGAAGGCTTTAAAAATTTTGGATATTCTTATAAAAAACATGTAA
AACCGTGAAATTAGCTAGACAAAAATTGAAGAAACGTTGTGTCTGTGATA
GGGTGGGACCATGTTCATTCTTTTAAAGTTATATATTCACACTATCATTC
CATTTTCTAGGTCCCTATCCTGATATTACTGAAAAAATGTTTCACACAAT
GTGACAAAATCTTGGAGAAGTTTTTGGATCTAGATGTCCGTGTGAAAGCT
ATTGATCATTCAGCCAATAACATTTTCCATCTTTCAATATCTGAAGCACC
TGATGAATCTCAATGCCTTCAAATCCTGGACATTTTGTTTAAATATTCAA
AGTAAGTTAAAAAGTTTTATGAACAGCATGTTTTATCAGCGATCCAAAAA
ATATCTGCAATCTGATTGATTAAGAAGAGTACAATATATCTTGTATTTTA
CATGTAAAAATATAAATTGACGAAAAGATGTTGTTGTATTGTAGCGGTAG
AAGCAATCTAACGTGACTTTGCTACAAAAGTGTCTTCCATCATAAAAAGT
GTTTTTTTGGGTCACCGATAAACCATTTATCAGACATTTGCTCGTACAAT
ATGGAAATATTGTAATCGCAACTGTCTGATAACTATTACATATCACACAC
CCCTGTCTCATAGCCCCGGTGGAACTTTTTTCCACAGTGGGTGTGTACAA
TGGGAATGGAATTTCTTATCAAAATCTCTACGGGGATAAACATTATATTG
TTCTCATCTCATAAGATCTAGTGGGGATGGCTTTGGAGTGCAATATCTTC
CATTGAATTTCAAATGGGAATGAAATCATGGTCAATTTTACAGTCGGGCT
TAAATTGTAAGGTATTTTTCCCATCGGGGAGGAAATTTTTGCCAGATTTT
CAACTAAGGCGAGGGACCGCAGGGCTAGTGACACCAAAGTGTTTCTAGTT
ACGGTAAAAATCTAAAAGACTGCAAAATACAAGAAAGGTTTTGTGAATAC
ACCCAAAAACACAGGGTTTGATATCATGAAAGCTCACATGCTTTTCTTCT
CATTCATTAGATACAAAGAAGATTACAAATGGCTGATGAACCAACGTAAT
GTATCAGGTTACACCCCAAGCCATATTGCAACTATCAGAGGTTATGGAAA
AGCAATATGGAAATTTCACGAAAACGAGGCTAACCTTAACCTACAGGTAT
GGTGGTAATTTCCATAGGCAAACGGAGGCTACGGTATTATGTGCCGCCCT
TAAGGGTAACTTTTTTGGATTTCCAAAGTCCCACTAAGGGTCAGAGAAAT
AGGAAAATTTAAATTTTTTACCCCCGGAAAGATCGAAATTTGGTCAAATT
TGTCCCAATAAGGGTTTTCCTTAGTTTTCTCCTTTTTAGTCCCGGTAAGG
GTCCAAGAGTCGAAAGCCGAGCGGCACCCCCCCCCATCNNNNNNNNNNNN
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TATATATGATACTTCTCGATACTTCTTTTCAGGATTTTCAAGCACAAAAG
ACATGTTTAGTAATGGCTGCCGAAAACCAAAACTGGCCTCTCGTCACAGA
ACTCATTAAAATGAATGTTAATGTCAACGTGGCCGCCCGTGGCGATCAAC
GGGCAATTAATTACGCCATTAAATCAAGTCGGGCGGACATCATAACTTTG
CTGTTTGAGCACGATACAGAATGTTTGAAATGGAAAGATATTGTCCCATC
AGAGGAGGTAAAGGGTTTTTGAGTTTTAAGAGAATACTTTTTTGTAAGAA
CGTCGAGGCTTATTTTCATATTACTTTATGAGTATTTTGATAGAAAATGA
TCATGTATTAAAAACACGAGTCCTTTGAGATGGTAAACAGAGGGATTTTA
GTTTGTGGATTTTTCTATTGCATTTTTGAAATTGTAGAAGTTCTGCATCG
ATTGCGGTACAGTATATTCACTCATAGGCATTTGAAATAAGGCCATGGGA
CCGGAAAAAAACTCAAAGTTTTACTTACTTGGCTTATATCCTCAGTATAC
TTTTTTTTAGATTGAAAAATTGGTTCGTAAGTTGATTCGAAAGAAAAGGC
GAAAGAAGAAGGAAGGGAAAGTGGAACGCGAATGACAATGAATAACTACT
AGTGATGGAATTCTGGGGCAAAAATCGGTACTAGGTTATGTGCGGTCGGC
AAGGGCCGGATTTCAGAAGTCCGGTCCGCACATTCCCGACACTCTCTGAC
CCTAGTACCCCTTCTCCACGGGGAACAAAAAATGGATGAATGGATAAATG
GATGGAAGAATATCTGAATAGGCCATTGATCATGGGTAATCAGGACTCTA
TTAATGGCTTCCGGTTGGCTAGATGCAAAATTCTTCAAATCTTCAAAACT
TTGGACGAATAGTAAGTCGTCATTAGCGCGCAGTGGTCTTGATTACCCAT
TACGCTTTGCGACTGTGAAATGACCTATGAAGGAACGAATGGATTGTTTA
CTGTATAGATAAAAGAGTAAATGAATGAGCGGGTGACTGACTCGATAAGT
AAACTTTTGCTCAAAAACAGTAAAATCGTTTTCTATGGTCTATCTTCTGA
ATCAGGCTTCCAAATGTCAATTTCTGATAGATGATGTGTGATGGCGTCAA
AAGCTTTCAACAACTTCAAAATCGATCGAATGTGATTGTGGTTCTTGGAA
TCTTAACATATTTCGGAAATTTTTCGACAGGCCCATGGTATGTATATCTG
ACATTGCCAAAACCCTTTTGGAAAATAATATTTTTTAGAATAAATTGAGC
ATCCGCACAAAAAAAACTGGGCAAAAATTTATAAGTCATGTCCAGTATAT
CTGACATTGGGCCTGGCGGCTAACAACTGGTGTGGGCAAATATACATGCC
ATCGGCTGCTCAAAATATTTTTCTCATTTTCTTCCGCCGAAAACAACTGC
ATCACCTCGAAAATTTTTGTTAATTTCTTTTGCAATTTTCCCCCTTGGGG
GCGGAAAGAATTAATTTTAATTTTTGAGTGTTAATTTAGGCCTTCTAGCT
CTACCAAATAAGTAAAAGAAGAACTGGATATATAATCAATTTGTTTTTAA
AGATTGTTTAGCTTCGAACATATTGTTATATGCGTTTATACACGATTACT
TAAATTTAATCAAATTTCTGTACATAAATTATTTTTTACCCAAAATTTTA
ACTTTTTTAACACTTTCTTTAAAAAAATATACTAAAATGCTTGAAAAATT
GTTTGAATTGAAATATTTACATTGAAAATAAAAATCATCAAAATTAAAA

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00002525	TCONS_00002525	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00002525-protein	TCONS_00002525-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000020	supercontig	sc0000020:819644..834542 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.02	0.02	0.08	0.06	29.32	21.88	22.26	24.16	9.68	12.68	6.54	8.43	7.4	6.83	8.57	13.61	4.65	5.59	4.66	4.26	3.51	3.66	1.63	1.88	3.47	3	4.84	3	1	1.2

You are here

XLOC_001351 (gene) - C. hemisphaerica