XLOC_001946 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001946
Unique NameXLOC_001946
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000028:708860..718639-

Legend: gene
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>XLOC_001946 ID=XLOC_001946|Name=XLOC_001946|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9780bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028:708860..718639- (Clytia hemisphaerica)
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ATTGAGATTCCCAAACTCGTTGCCATTGACTGTCTGTTGTCATGTCATAA TCTGTCCTGATTTGAAATTTTCGAAAATAAGTTTGTAGAAAATATTTCTG GGCAGATATTCCATAAAGCACTTTTCACGTTAAATTTTCAAATGAAAAAT TTTCGGTAAAGTAGCACAGAGTGTGATACGAACCTATAACGAGTTACACA TTGGTCTGTTAAAGGTTGTTTTGACTCCTTGCATCGGATATTTAGTGATC ATTTTGTACCCTAATTTCATTTGCGATTTTTAGTTATCGGTTGTAGGTTG CGCTAGCTACGGTCTAGGTGTTCGTTTCATGTGCTTTTGATAATGTGTGT CTCCTATTTGTATTGTTAACAGGTGAAACCATCTAATTATTGGACTGAGA TTTTCAGATTCACGGTCAATACGATCCAACGCCATTTCCGGGACTGTAAG TTTAATATTTTTTTTTTTTTTAAATCAATTCTGAATGAATAGAACTGGAC AAAGTAGGGCTATCTCATTTTTCCAACAGTTATGTGGGTTTAAATGTCGG GTCGCTATTTTTCCTTGCCAAAGAAGGGGACAAAAGGGCGGTAATATTAT AACCGGGTAAAAGTGTTTCTCTTTTAACCTCAAAAGAGTTTCACTAAGGT CATTTTTTCAGGCGTAGGTCTTCTTAGAGATGATGATGGGTATGAAAACC ATCAAAAGAAAAGTCTTTCTAAAATCTTTTCTCTCGTAGTCACTTTTTTG TTGATTTTATGTTTCTACTTAGGGTCACAAACGTACTTAACCCGATATTC TATACCCTAGTATACTTGGCCCCCCCCCTCCGCCTCTGGGTTTTTCTTTG TTTTTGGTAGGCTGGCGAATGAAAAATTACCTTTCGAACGGTGAATTGTA ATTTTTGTAACTTCAATCAAAGAGGTTATTTTTGAACGGGGGGGAGGGCT CTGATAATTTCTCTTTCTGAAATATTTTATATGACAAGATTATAACTAGT AGGACTCGTAGGATTTATATAAGAAATTTTCGAAAAGCATTTAGATAACC TTATTAAAATTCAAGCATTGAAATATTTACTAAATTAGTCTAAATTATTT TTTAAATAGAGTCATTTAATTTTGATTTTTTGTAAATTACATATTTTTAT ATAGTTAAATTTTTGTTTTTATTTTTATATTACAGAATTTGTGTATTATA AACCTTCCTAAATCGCGACTATTTCTCTAATTTTCAATTAGACTATGAAT TTTTTTCCGGCTAGATTATCCCTTAAGATGTATTTGTAGAATGTCTTTTG GTTTGATTTTTGACCCGATAATTACGGAAATCTCAAAATTCATCAACGTA GAGGTTCTACACTACGTTATACTCTTATACAGTAAAAGATACATGAAGGG AAGAAATTTTCGCGGAATTTTATTTCGTGGTTCACAGCTCAAAATTCGTC AATATCGCGAAATTGAATTCCGCGAAAATTTCTTCCCTTAAGGTAATCCA CTGTATGTCTACACGTTTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACATA AGGCTTCGAGGCCCAAAAATTTAAGAACATTCTAAGAACATACCAAGGCT TTGGAGACTTAATNACAAAAGGGCGGTAATATTATAACCGGGTAAAAGTG TTTCTCTTTTAACCTCAAAAGAGTTTCACTAAGGTCATTTTTTCAGGCGT AGGTCTTCTTAGAGATGATGATGGGTATGAAAACCATCAAAAGAAAAGTC TTTCTAAAATCTTTTCTCTCGTAGTCACTTTTTTGTTGATTTTATGTTTC TACTTAGGGTCACAAACGTACTTAACCCGATATTCTATACCCTAGTATAC TTGGCCCCCCCCCTCCGCCTCTGGGTTTTTCTTTGTTTTTGGTAGGCTGG CGAATGAAAAATTACCTTTCGAACGGTGAATTGTAATTTTTGTAACTTCA ATCAAAGAGGTTATTTTTGAACGGGGGGGAGGGCTCTGATAATTTCTCTT TCTGAAATATTTTATATGACAAGATTANACAATAATTTCTGATTTCGCGT GTTTGGTGGTTGCGTGTTTATCCTCGTTATTATGGGAATTTCCATTCTAT TGGGTAAGTTGGTTGGTTATTTTGGTAAGTTCGCATGAAACGATAAATAA TTCTACTTTAAGAAACTGAATGCTTCTTAATATTTCATATATATCGCTTT TATTTTGGTCTGAAAGCAGTGGGGTGTGGACAAAAACCGCATATTACGTC TTAGTTACATAACATAGCATNCAGGATTTATATAAGAAATTTTCGAAAAG CATTTACTTGTAGATAACCTTATTAAAATTCAAGCATTGAAATATTTACT AAATTAGTCTAAATTATTTTTTAAATAGAGTCATTTAATTTTGATTTTTT GTAAATTACATATTTTTATATAGTTAAATTTTTGTTTTTATTTTTATATT ACAGAATTTGTGTATTATAAACCTTCCTAAATCGCGACTATTTCTCTAAT TTTCAATTAGNATGATTTTGTAAACACGCTTTCAAATGTGTAGGATCCAA AATTGATTTTGTAACAACTATTTGACCTTGACAGTTAGTTGAATAGTGTT TTAAATTACGTAACTCAAGTGATGTTACATTTCTTCGATGTAACTAACAC GTCGTAATTGTAATTTCAAAGTGTGATTGATAGGGAATCGCCTCTTTTTT ATTCAGTTACAACTCCTCTAAATAATTGATGTTTAATACTCACATGGTTT ATTTTTTTTGAACGTGAATAACAATTTTTTGTCGCGTTTTCTTTTTTTTA TAAGAATATCCAAAATTTCTGAAGGTTTTGGATTTAAATTTTTGAGTTTT AAACCTCAAAATGTTCTCAACTTATTTTTAATATTTTGGCTATCAAAGCC TTACGCTCTTTTATAGTTTATTTTGATGGCGGATTGGCGGCCGCCCTCGT TAAAGAATCCTCGAAAACGAGGACTGGGTTATCAGACCTCCCAAACCTTC CAAATGTTAAAAATTTTCCCTATCTTCCAAGCTTAAGCATCTGGGTGCCA GATAAGTGAAAAACGTGTACACGTCAGAAATACTGAAGGCCGAAATATTA AGAACAAGTTAAGAACAAGGCTTTGCGGAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003503TCONS_00003503Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003502TCONS_00003502Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003501TCONS_00003501Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003501-proteinTCONS_00003501-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000028supercontigsc0000028:708860..718639 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.88 2.89 0.76 0.47 4.64 3.71 4.39 3.96 2.79 2.98 3.62 2.85 4.77 4.13 4.16 4.18 4.88 5.42 3.67 3.69 4.44 4.27 5.12 5.42 4.83 5.4 3.33 2.61 8.5 7.55