XLOC_032960 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_032960
Unique NameXLOC_032960
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_209:44838..66151+

Legend: gene
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TCAGCGTGTTTTACGATATCTTCTAATGTTTTTAGTTGACTGACCTTTGC AAGAATGTCTGTTTGCATGATTTCGTTATGAAGACCTCTAATAAGTTGAT CTTTATGTGGGATGGCTAGAGATCCATGTCACATCCTGGAAAATTGAATT CACGATCGGGTGCTGACGTTTCGTCTTGATTTTGCATAAGTGCAGCGAAT TTCATACAGTGAACGGAAAGATTCGATCTTTTTGTGAtaatttgttcaat ttttttgagtagTTATGTTTCATTAATGGTAAAAATGTCTTTCACGATAT TAAATTAGCTATTCTGGACCGATTCATCGCAGCATCTATAGAGTTGAGCC GCTATTTGATTCTCCGCAATGCCGGTTATTTGCTTGAAAACATTCTCATC AATATTAAATTTCCGGAATTGTTGTAATGTCTTGTCTTGTTTAATACCCG GTAATTTTGGTGCAGGAGCCTTGATTTGAACTGATTGCAAGTTGGTCTTT TTCGCTGTGATGGTTCGAGCGTGTTTAATTATCGCTAAACAAGAATTTTT ATACCGAACTCTTTCAATGTCTCTTTGGTGATGTCTGGTAGCAGGTCCCC AGTCATCCTGTTTGTGACAAAGATCTTTGCGTATGACTGACTGTCTTTTT TTGGGTATATACGTGCCTCTAAATTTATCCCACGAAGGTTAATCCTTTAG TTGCATCGCCATGTGGAAACGTGGTGAGAATAAATGTGGTAAGGCCAGTC AACTAGCTTTATAATATAATGTTCCCTATAAAATTAAATATAAACATAAA GATATGTTAACAACAATTCAATAGTCTATTCATGATTAGATTTAGACCGA ATGAGACACGTATTTTGACCTTCAAAGTTTGTTTCTTTTGGGCATGTAAA ATATTCGTTTTCTTTAAGTCCTTTTCGCCTCTTGTTTAGAATTGCTCAGG TTGAATGGTGAGTTCTTTCTCTTGACCGTCGCTGAGGAAGATTTCATTct cattaacattaacatttttGCACTGATGGGCAACGTATTTATAACGGTCT TTTTAAGCCGATAGATGATGTTAGCATATACGTAGGCAAAAAGCTTTGCA TTGACATCACCGACATGTTCTATTAAAATCTTTACTTCTATTTTTGTGAA CATCTGTCATTACTGTCCTTTCCGAAATACTCTTGAAATTTATGCCATTT TGAGGTATCGACTGATTCACTTTTCGAGGAGTTCTATACTTTGGTATCTT GTACCTATCTATTTAATTGTTGTATGCATTTTCCTAAAATACTCCACGTT GAGGTTAATCATCCTGTCTCGTCTTCGTTTTTATTACAGTGAAGTCACAA ATGGAAGCTTATTTGAGCAGAATACTCTCAGTTCCTTCTCATATTTTATT CGAAAGGCAAAAGGGCTGCCAATAAATAGAATGACACTTCTATACTAACT TCTCAAACTTAAAACAATTTAACTTTATTCCTCTCCAATAGTTTCCAGCA TGACTCCCTAGGGTTTTGTATAATACGTTGCGTTTTTTCTcactttgggg gggggggggggttgcaAAGCTTAGTAATTCTATTATTTGGGAATAGGATT CTTTATGGTCTGTATTGTTTTTCAAATAGGATAAATATACTTTTTGTTAg agatttatttttaaagataCATTTTTATTGCTGTAAAAGTAAGGTagtaa attttagtaaaaaagatacaaatttatttttacaatCCAAACTTTCTGTC CACCATTTTACAGCTGAATCAGCTCATTAAAATAGTTCACGAGATTTCGA CGATTCCTCAGCTTTCGCTCTGATTTCGATAGATCTTTACAAGAGTCAAT GATTTCGACcacttttcaaatctttgtgAATCAAAATGTATCTTTAGGCT TGTTTAGTATTTTCCGTATTAGATTGATCCTTTTGTATCAAGAGTTCAGC GCAAGAGGTGCCTTTCAAAGTCAGGTCTGTATAATCGTAAGTatgtcttt ttcttttacctTGCCTTTGATACCACAATAAAATATGATATTGTTTAAAT CTGCTTATGTTCACGAACTCTTATATCgatgaaagatattttcttcgtca aatttttcaatacatCGTGCTCGAGTTTGTCATACTCGCTAATCTGTTTT TACTTTGTCTCAGTAATCTCTTCAGTCCTTTTCTGATTTGAGGATTTTTC CAGAAGTAAACGATGGGGTTGAAGAAGGAGTTATATGAAACAGCAAGCAT CGCAAAAATGTAATAATTCTGATGAGAATGAGCATCCCAAAAGTGTTCAA AGGAATCTGCAAGGTACACGATAATCCATATATTCTTCGGTGTAACGCAA CAGAAATATACCACCAATAGCCAGATGACCGCTTTCGCTAGTTTGATGTG TGCTTTCTCCGTCCTCATCCTGGATTTTCGTTTCGAGTCAGCCGGTGTTT GGATCTCAGTGATGTCATCTAATGGAATATCGGTACCTGTGTTTCCACCT TTCGAGTCATCTCCGGGATCTCCTGGTGTTGTTGAGGAATCTATGATGAA AGACTCTTTACGTCGTTTGATCAACAGCAATTCTTGCGCACGTAACGCTC TAGCGATCAAAAAGTAGGATACAAACAGGATGAAAAACGGAGCGAAGAAT ataacaaaaatgaagatcaaaTATGGGACCCTTCCCACCCAACGAAATGC TGGTGCACTGGCTGGAATAAGCCACGCTGCAACAATAAGTCCAACAGTCA AATGTTTGACCGATTTCTTGTCATAGAGGTTGTATTTGGTCATCAGGATG AAACGATCAAAGGCGACCACTGCTAAAGTCAGCACTGAGGATCCTTCAAG AAAAACGGCAAAGTAAACACGTGTATAGTCGACAGGACAGTTTATCAACC CACCAACAGCCAACACTTGATAAGCATTTATCGGGAAAACAACTAAACCG ACAAGTAAATCCGATACTGCTAATGACGTCAGGATTTTGTTAGATCGGGA ACGGTTGCTAGGCATCCAAAGAACGATAAGAACTAGACTGTTGGCAATAA TCGTGAACACACTTCCCATGATGAAAAAGGCACCATAGATTGTCGTTGTT GGGGTAGTGAGGTCGGCCATTCGCGTTTTACATTCTCTTGTCATGGTAAG ATTTGAGTGTCCTGCTACATTTGCCATCATCTCAGTCTTTGCGAATTTTT CTCTCAGCTTTTCTTCTCCTGTTAACCTCTCTGTTCAAATGTGTATAACT TCAAATGAATGCTG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052048TCONS_00052048Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052049TCONS_00052049Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052050TCONS_00052050Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052050-proteinTCONS_00052050-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_209supercontigscaffold_209:44838..66151 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.16 5.47 2.25 2.17 10.79 6.1 6.58 6.37 3.08 4.39 4.15 3.36 2.88 2.8 2.4 2.33 2.38 2.28 1.77 1.4 3.99 4.01 11.68 10.67 5.44 6.85 13.33 13 6.87 7.34