XLOC_034923 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034923
Unique NameXLOC_034923
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_253:497639..510928-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034923 ID=XLOC_034923|Name=XLOC_034923|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=13290bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_253:497639..510928- (Clytia hemisphaerica)
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ATCGAGTTGTCGATTGGAATGTAAAGCAGGGTACAGTCTGTCCGGCAACA AATATGTCACGTGTCATGGATCAGGACAATGGAATCGAGCACAAGGATCG TGTGTTGGTATGTTGACATTATTTCTCATTCCTATCTGTAGATATTTGTT TGTTTTCTTTATTTTGGAGAAATATATGGGACTCATTTATCATAGATTTT CATTATACCCAATTTTCCCTCTCAAATTTACAACAAAAATTATTTTGAAT TGCAGACCTCTATAGATATACAAACCCATAAGAAACTTTTTCGTTGGAGG ATGAGCAGAAGCCTAAACAAAAATCAAATATTCGTCTTTGTTTCTCAATT AATTTCAGATTCCCAACAACCAAACATCAAATGTCCAAACATTCCACAAT TCGGTAACAAAGAGAACGAAAATTACCAAGATATTGACCTGGTGGAAGCA TCAGCAACTGACAATTCAGGTCTTTCAGTCAAGATAACAACATCTCATGT CTTCCCTTTGAGAGTGTACGTTGGAAGCCCAGTAGAAGTCACTTACACAG CAACTGATGCCGCTGGTAACAAGAAATCATGCCGTAAAACATACATTGTT ATTGGTAAGTTAGAGCCTTTCCATTTTATACACACAATACACCTCTGCAC CAGTAAACTTACGTAGTACGCTTGATGGTTCTTTAACTCGAACATGATCG TCGACGTCGTGAAAAATTATCGGCCATAAAAAACATCCATCACTTAAATT TCCCTAACAAATCAATCTCGCCTTAACTTGAAAAGTTTCTCGTTTCCTTG ATATAACATAGCTATCACCCCCATTTTTCACTTTTCTCCGTATTTCAACA GATCAAGAATCACCAAAGGTAACCAGTTGTCCAGAACCGTACCGTTTGAT CAGAACTGGTAGTTTTCCACATAGAGTCTTTTGGGGAGACGCACAATTTC ACGATAACGTTGATTCAGCCAATCAGCTGGTTCATATTCCGTCACATGGA AATGGTTCACCGTTTCACAAAGGAAGACATACTATTGTGATCACTGCTCG CGACAGAGCTTTCAATAAAGCCAATTGTACATTTGTTGTTGAACTGGAAA GTAAGCCAACCTTCCAAGCTATCTTATCTGGAAACTTTTTTCTGTAGTTT GTTCTATCCAAGTGTTGTAACTTTACAATGCGCGCTGAAATAACTTCAGG CTTGACATTTCACAGTGCTCCTCTAGTACCTTATCACTCACTCCCATAAT TCTTATTCAAACATCTCATTCATTCTAGTTTATTGTTATATTACCTGCTA TTTGGTATTACGCTTCACCGTTAAATAGGGTCCTGATATGAACTAAAATA CTTTTTTTATCATTTTAGTGGTGAAATGTCCAGTAGCATCTCCGCCAAAA CACGGCTCAGCGCAATGTAACGTTAAAAAGAACGGAGTCAAAGAATCCTT CATTTGCACTGTATCATGTAAGCAAGGTTCGTGGTTCTTGCAAGGACCAA ACATCCCAAAGTTGTACAATTTCTACATGTGTTCGATGGATGGAGAATGG GGAGGTACAAACGCTTATAACATGGATAACTTAACACCTTCGACAGTCAC GAAAATCCCCAAAGGTGAACCATTATGGCCGGATTGTTCTGGTAAGTGAA TTGTTCATAACTTTCTGATGTGCATAGATTGCCAATGATTTATGATATGG TTGATGCCTCAAAAAAAACCATCGTACCGATTGTAATTAACCTGAACTGG TGCTAGTCAAATGATTTCACCGCAAATAGAGAATTAATAGAATATTTGTT AGATTATATCCTCGGATTTCAAGGTAACTTACATCTCAACTTTTATACTT TTTATAGTCGGGGCTACACCGGATGGTGCAGTGCTAGAAATGCAAGTGTT TGGTGGGAAGTGCACCGATCAGGCCGCTATGGACAAATTGAAGCAAGATT TCGTGGCTACATTACAAAAGGACTTCATCTTGAATTACTTGTTTTGTATT ACACATACTCAAAATTGTGCTATCGAGAACATCATCATCTACTGCTCAAA GAGAAAACGAAGAAATGCTGACGGATCACAGTCAGACCAAATGGTCATCA AGTTCGCTTTCGCTGTTCGTGAGAAAAATATGGACACCAACAAGTTGAAC CATTTGTCTGCAAATTTGGAAAAAGAGAAATCTATTATCCTACAAAATGT AAGAAATCTAATAAATGGACATCCTCCCTCTCTAGCAAAGTCCTATTCCG AAGATAATGAATACTTACTCAGGTCCATGGGCCCTGTCTACGATATCAAG TTTGGTTGGCCACGAAATCAAGAGATTATCGCTTGAGACTATTCCACTTT TCACTCTCAATGCAGGCTAAAGTAGAAAAAATACTGGGGTTTATTTGTTT TGAAAAATGCCAGTAGGTCAAGTAATTTATTCACGGATCATTACTTATCA TTCAAGGTCAAAGTAGCTGCACCGAAAGTGTTGAACGACTACAGTGCATC GGTGAGTGTTTCACAGAAAGCCGAGATCAGTTGTGAACCTGGGTACGAAT ACACTATTCCCGAGGGAACTTCACAGAAGAAGTGCTGTAAGTTTAAAACT ATTTCCAGTACCTTTTTAAAACTGAGGCTCATCTTCGATAGCGAAAACAA TTAATGGTTGAATTGAAAGACTTGAAGCTAAACAAAGTGGGGTTATAGAG TTTCCCCTAGAGGAGAAATATCTTCATTTTTGGATCCATCAGTAATCATA GCCACTTATTCTTCGTTATTTTTTCAGTGAAATGCCCTCTCGGAACATAC TTCGACAGTGCAAGTCGAACATGCGAAGTTTGTGAACATGGTTTTTATCA 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AAGTGGATGGAGTTGATCACTGTAAACATGCCAGAGGAATCAACTTCGTT GCAATCGAGGGAAAAACTGGTACATTTAGAATAAATGAAATAACCAGACT TTTGAATGTAGTTTAGTTTAGTTTAGTTTCGGTAATCACTTCTGAACAAA GTAAATCGGAATCCACAACTTTCAAATACCTGAAATAACCAGGTTTTTGT CAACGTTATGAATGTGTAGTTTAGGTAAGGTTAAGTTTTGGAAACCATTC AGATCGCTTTGTGGTCAGCTCTGGTAACCGCCTTTAAATCGGTCGCGAAT TTCTATTGCCTAAATACAACCAGTATAAATACGACTTTTTTCTCTTGATT TACAGGCAAAATGCATTCAAGTGCTGCTTTTGATTGGCATGGTAGTGGCG CTGCATGTGCATCTGCATTGAATTGGCTCAGAAACCTTCCCGATCAGTAA GTCTGCTTTTCACTGTGGTGTTCGGATTCGAAGACTTTTCTTTTTATCGA TAATTATGAGTTATAAAAGAAATGCCTTCTCTCAAAAACAACTTTGAAAC ACATCTACGGTGAGACGCAAGTTGCTTGAAAAAATAAACCCAAATATGAA GGGATTTTCTAAGCGTTCAGTTCGTCACCTGTTAAGACTATGAGAACTGT ATATAAATGATTACTTGCTAGGGGCCTTGCCCGTACAAGGATGTAATTGA AACTCGTTTCTTTCAGCACCATCGTCATGGGTGCGNACAAGGATGTAATT GAAACTCGTTTCTTTTAGCACCATCGTCATGGGTGCATACCAAGACGAAG CTACAAGTCGCTACATTCCTCAACACTGCGATCAAGCTTTAGAGCTCATC GGTGGCAAGAAGCCTTTCCAGCGTGAATACAGAGCATCTTTTGCCATTGT TGGATACAAAGGTGTTTTCAGACCCTTCTGGACCACACAGAAGATGAGCA GTTATGGACGAGGTCCAACTGACCTCAATGGAAGCATCAAACTCATGTAA AGATTTAAACCTAAAAGTTTACTTTCTTTAATTGGTCTTTTGTAGCTTTG ACTTGAGAGGTTTTTTATTATCTGGCTTTCTTCAAAACAACATGTACAAC ATGCCTAATTACATGCATAAACGGATTCGTGCTCCTTTCACTACTTGCGG TTTAGTAGATAGAGGTCTTAAATTCGGGCTGGATTTGTAAGTGATACCGG GAAGATTGGGTTTTCATATTTCTTTTCTTTATTCACAATTCAGGCCATCA TTCAAGTACGAGATTTCTTCAGAAGGATGGGAAGATGCATCACGACTCGG CCGCTATCCAAAAACTACCATCAAAGTTGACGGCACCGATCATTCAAAAC ATAAAAGAGGAATCAATTTTGTTGCTGTGGACGGGAAAACAGGTTCATAA ATTTTTGAATGATCGTTTGTCTCTGCAACAAGATCCACAAAAGATATCCC TATTTGTACGGGAAAAATATCAGAGCAGAATGATGCCTTGATGTTTGAAA ATTTGCGTCCACTGTAATCTACTGGTAATTGTGACGCGAACGAATCATTC TTTGCGCTAATATTTAACAGTCAATAATTTTTGTGATACCTTAATTGGGA TGCGTTTGTTTGTTCATTGGATTTTCTTTTGAATAGTACAGTCAGAACCA AAATGAAAATTTGATAATTAATAATATTAATATTAATACAATGATAACTG ATGATGGCGTAAGCCGAAACGCTTTTTATCTTTTTAAAATAGATTTTACT TGTGTACAAAATGAAAATAAAATGTAATTGTATTTTTCATTCATCAATTT CTCAATTTTTTGTCATAGGTACCTTCCAAAGCAGCTCACATTATGATTGG TATGCTGTTGAAGTTAGTTGCAAAAAGTCTTTGGATTGGATCAAAAGTCT TCCTGATCGGTACGTTTACATTTGTCTAATAGTTTAACTGCTAAACTACA GCTATTCATGATATTCATGACGTAATGTTTTCTACGGAAAGACCCCGGTT TTTGCCAGTAATGGCAAATTTTATACAACTTTTGTCTAGTTTAAAGTTGC CACTACTGGCTAAAATCGGGGTTTTTCCGTAGAAAACATTACGTCATGAA TATCATGAATTGTAGAGGATAACAGATCAGTTTGCTTTTAGAATAAAGGT TTTCATCCATTTTTTGGCGAAAAGCCGGTTTCCAAAGAGTTGTGATTGAC ATCGCCTTAGAATCAAGATTTTACCACTGCAATTTCTTGCCCTGTGTGTC ATTTGGTTATCTTGACAGCAAGAAATTTTAGTCGTGCTACTTTGAAAACT TTAGTTATGTCATGATAAAAGATATTTAAAAGGTATGGCCAAATGATGCT GTTTCCCTTCCTGTTGCGTGTTCGTAAAAATATTCACGTTTGAGAAATCT CATTTCTCAGTTTTTTTTGAAAGCGTCTATTCGTTAGACTGTACTTACTT GTACACCATTTGAACTAATTTCTAAATCTACGATAAGATAATGTATCGAA ATTACATTGGTGAAAAAAGCTAATGGCATATAATGTTTTTTTTACAGAAC GGTTGTACTAGCAGCATATCAAGATGAAGGTTCGAACATGTTCAAAAAAC ATCATGAATGTCGCAAGGCTTTGGAGATGATCGGTGGAAAAGCACCTTTT CAAACCAACTTCCGTGCTTCCTTTGTCCTCGTTGGTTACAAAGGGAAAGA TCTTCCCTACTTCGTCAAACAAGATATGAGATCTTCTAGCACTGGACCAA CTAAACTCAGCGGGGAAATCGTTCTTAATATTTCCAACTAATAGGTTTTT GTGCGATCATTTTCTTTCTTTCTCAGATATTCCACGGTNC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055514TCONS_00055514Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055514-proteinTCONS_00055514-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_253supercontigscaffold_253:497639..510928 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.22 0.21 0.13 0.11 0.08 0.16 1.71 2.03 1.38 1.54 0.84 1.31 10.72 11.39 5.88 17.39 3.49 3.63 49.61 56.79 17.28 19.5 21.46 29.97 39.55 37.66 0.45 0.27 1.56 1.71