XLOC_035481 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_035481
Unique Name	XLOC_035481
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_272:307634..316604+

gene from alignment at scaffold_272:307634..316604+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_035481 ID=XLOC_035481|Name=XLOC_035481|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8971bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_272:307634..316604+ (Clytia hemisphaerica)
GATTCCAGAGACAAATATAGCGGCAAAGCAGTTGATGTTTGGGCAATGGG
GATaacattattttgttttctttacgGCAAGGTATATATCATGTTCGTTT
TAGTCTTACTACTACTTAATGTGGTTTTGTGcgttacatttttcaaattg
tgGCAGGTAAATGTTATACTTCCAATCCTACATAAGAGATAAGACCTTAT
TTGGAAAAATCATCTTGTGCGCAGCTCCTTGACTAAACTAGTATATGTAT
ATGAATAAATTGCTATAAATTGATCCAATttgcaagttgcaagcaaaata
ttcatGAGGCTGTGCACTTGATTTGTAAGtaaagtaccttatcggggaaa
acttcgtcggggaaaaattcgtcacttgctggtagttggtaaacgcatta
agacCAGgggaaattttcgtcggggaaaatattcgtcacttgtccaaaat
ttcgtcatttttccccgacgaagttttcctcGATAAGGTATACGGTGTGT
TCTTTAAACTGGTGATTGGTTCATTCTTTCAGTGTCCATTCTACAGTTCA
TTGATGGGCGAACTcatcactaaaatcaaatcgGAGCCGTAAGTTTATGG
GgttaaactttgttttgataggCTTACGAAAGACTAGACAGCGAATTCTT
AGCAAATTCAACAATTTAATCATTACTCAATATCAATTATTTGATATTTC
CATTTTTATCTACCAAAACGTGAAATTGTCTAACTTATGGTTCAGCTTCA
TTCAATATACCAATATTAGTTAtatcaaagatttattatacactggataa
acgactcataaaacgatggagagcgaccattgtatttcctttgtttcaga
aaacaattgatgttctagctttgtccgcaaaggacaactgtcatggcggc
tcgaagatttctaattttttaaaatgtttatcagacttatttttaaaaag
ttctctagctctttctttttgtacatttgctgaaaaaaagtttgaaagta
aggctagcattccaagctggatacatttgtaaaatctaatgtgagaaaaa
catcattagacaataaattcagacaaaatgcttatagtgacacgaaatct
TTAATGGGAAATAtatttccaagactgtccccagaagagctgaaattaac
atacataagacttgagtgtcttgactccactgtggtatgaaaatcttttg
gaggcacgtggtggcaaggtggtttttttgaggttgaagtttgaaaattt
ccggtgtcaacattaaatttcttatacNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNGTTATATCAAATCTCTACTTCTTTATTTTAGACT
GGTGTTTCCAGAAAGTCCCATCGTCAACCCACAAGCCAAAGATCTGATAT
CAAGGATGTTGGCGAAAGATCCTAAAGAAAGAATAACCGTTCTTGAAATG
AAGGTATTCTTATCATGTTTGTCTTGTACTAATCAATTTTTTATGCGTTC
AAACTTAAACTTAATGAACAACCAAGGAAAGCTAATttgtcaaaattaca
aaatttgcaacgcgaaatgaattttaaaatttgaagacaTAACAGCCAAA
CAGTCACAAATGCTTCTTGAATTTGATTAAAACTgctttttcttaacttt
tttgaatacttcgccaccattttagtttagtgtttatccagagtctcttt
CATAATTCCATACTATAGTAACCAACTTCGAGTTACTCACCCTTTCAGGA
GCATCACTGGGTAACAGATGGTGGTCGTGTTACATTAGCAGCAACCGAAG
ATCATTGTACTGTTATTGAAGTCACTGATGAAGAAGTCAAAAATAGCGTT
AAAATTATCTCCAAACTTTCAAGTCTCGTAAGTTAGAAATTGTATCTAAA
TCAGATTAATTTTCGCAATCGACTAGGTTATTTTATTGTTatgtaaattt
gtttacttgTTTGCAGAATTAGATCTCGTGAAGTAAAATACAGAAAACTT
CACAATCCTTTAGctcttaaaataaaatttcgcgaaatcaGATCCGATTA
AGTTTAACAGACAGCTCCTTGTCCTAAAAGTCTTGGATAATTTTTTGGTT
CGGGTATTAAAGGAGATCTAACGGCAAAAATTTTGctacattttttttgg
aaattatggaaACTTTATATTGTGGGGATTAAAATGAGCTATATTATGTT
GAAAAATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNaagacccggtaggattttttcaaccaGTGAGGGTGAAACTAAGGGACT
GTTGGAAcatgatggggattgatattttttatgactggggacagtggcgt
tgtgggaaaatttttctggaggggccaaagtcaattttttttaaatggcg
cccccctcccccaattttccaaagtgatGTCCCCACCCaccattttctaa
acttttactaattcatttgcctaggcataatgaggaaggaaatatttagt
ggagaaTAAGAGAgtagatttatctttgatgaatggaaaagggataaaca
ggccccaccatggttggggacgactgaaaaattgtttttaaatcgactgc
caagaaaccctaaatcactaaataaacaaagacaaatttgacacttgcta
gagtgaaaaggaacttaaagaaacaatctttaatgcgagcgaagcgagcg
aaaaaattgatgttttatgatttcaatattgttgtcagcatattggtgca
gttagattttcatttaataatgctatattgtacacaaaaaaaacttgtaa
attagctacATTAGAAGTTACCTATtaactgtattgcgagcgaagcgagc
gaaaaaaattacaagaattttaaaattatctcagtaaagtTGGTCCTCGG
CGCAATTTAAGGTGcataaagtataatttttaaaattggggcgtttaaaa
aaatctctattggcgccccttgctcttcagcgccccttcaaaaaagctcc
gctgggggggccatggcccccctggccccccctgccacaacgccactggt
aCTAAAATcttcagacatcatgacatttagtgacgtggtggtactgcaaa
aaagttcaaaaataattttagtaccatgtgtactaaaataccaaaaagag
tggtcccttaaagaaatttttgaaaaatcttagtattttgttctaaaatc
agccaaaatggagcatttttttaacaattttggaaaaaatttgatttttt
ttNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNccccccccccc
ccccccccgtttaaaCAATGATAATTCAATCAATATGAAAGATTTAGCAC
TCGTtctttttgcaatgttttttatttaattaggCCTGTACtctgtcaaa
aaataaggataaagaaatttttgccgTTAGATCTCCTTTAATGAAGAAAA
TTTAAGTGGTTttacttaaggccggtctccacttgcgcgcgctttgatcg
tactttttcgagcaaagcttccacgctattggtcaaaagaaaaatgaagc
aattccattggcgcgatctgacgtaacggttgaaaaaagttgaaatgtgt
tcaattttttttttgagcgcgcgctacatttttatgacgtaatctttttt
tccaagcaaaaagaattgaagccaaaatgtgcgatcgcagcgcacgcaag
tggagaccggcctttatacATAATTAGAGAGAGGAATACTTTTCCATCGT
GAATTATGGCtggttttctttgaaaaaaaaatttcacctgATTTTTCTTC
CATGTGATTTTTTCAACGCTTTGATCACTGAGTTAGATTCTACCGGGTCA
ATTCTATAGCTAAAGGGGTGGCTATTCCACTTAAATTAAGTTATgcttca
tttcttttttccaggtATTCGCAAAATCCATATTAAAAGGTCGATCTTTC
GTCCCTGGCagaggaaagaaaaacaaatggaAGAGAAATCACTCCTTACC
AACCCCTAATTTATGATAATTCAtgttaatttattttcaaatcattaACC
ATGTACGCACTTCATGGTTTCGTTGCGTTGGAAAAACCAAACGAAGCTAT
CTTATCGGTCTAtctaaagggataatcagatggtttgtaatattttgcat
gtgggatccttctattgtcctgagcaaaatctcaaaatatttttgcctta
ctattttccaaagtcgagatatttaagttacaaggttttggcttttagga
tgaaaacaatagaatttcaacgtaagaacccattttcaaaaatttcaaat
tttgatatcttgattttagaaaattgttacacaaaaTACTTTGGGGTTTT
ACTCAGGACCGTAGAAGGTTTCTACTACAggtcaaatatctcaaaccatc
tgattatctctTTAAGGAGTAACGCCATTTTAAGCCAATAGAATGAGTTT
CGTTTCTTTTCGTGGAACAAAACGGCACGTAATACATGGGAACATAGACT
TGATAACAAGGCCTGGTACTTTAAGTATTTCTAACgtttttttaacgttt
tgagGTGAAAATGGTGCGTAAAGGTATCTTTGTCACATTGGTCATTGACA
ACTGCTGGAACataacgttgttttgacgttcatCTGGCGTATGCTATGGA
CGTTGACAATTTGACCTAGCCAGTACTTAAGAGACCAGGAAACACAAAAT
CTTTAAAGGTAGACTAAAGATATAAACAAATTTAGACAAAAGTAAAACCA
TTCTTAAACATTTGGTTCAATTGGCTCCAAAGAAATAATTATCTTCATTG
GTCAAAACTCCATTGCATTTTTATGTACATACTAATGTTTTTGTCGAATA
TATTTTTATGTAAATATTCTACTATTTTGATACTTCCCTCTATATATGAa
ttgttgtttttaaaattttattagatAAAGTATCATttacaaaatgaaga
aaatactttttttaattttgc

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00056325	TCONS_00056325	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00056325-protein	TCONS_00056325-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_272	supercontig	scaffold_272:307634..316604 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.61	1.42	1.28	0.76	7.85	5.61	6.58	6.41	5.74	6	5.61	4.74	4.64	5.8	5.62	8.52	4.78	5.71	6.4	6.23	4.05	4.26	3.58	3.56	5.08	4.11	4	3.44	35.37	36.63

You are here

XLOC_035481 (gene) - C. hemisphaerica