XLOC_036648 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036648
Unique NameXLOC_036648
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_307:184734..226882-

Legend: gene
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>XLOC_036648 ID=XLOC_036648|Name=XLOC_036648|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=42149bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_307:184734..226882- (Clytia hemisphaerica)
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TGACGTCAATGATTGACCAAACAGACATCATTTCTTTTGCATTATTGGAT TTTATGGATTATATATTCAATCATTCTACCCGTAAAAGTCATCAATGAAA TCATTTCGAAATTTGATGATTTAAAGGTTTTTGTTTCTCATACCGAAAAT TGTAATTACTCAAACCCGGGGGGGGGGGGACTAGGGTTGGCGGATGAAGA GTATGTGCGGATGGGACCTCCAAAAAACGACCCTTATAGAGACTGATTTT GCTGAAAAGATGACTCTTAGAGATACTTTTTTGGAAAATTTTCTTCAACT TTTGAAAAATTCCTTACCCTTAGAGAGACGTTTTTACAATTCTTTCATTC TAAATCAAAAGAATTTCTTAGAAATCGTGAATTTTCCGACCCTTAGAGAC TTTGAAAAGTGAAAAAACCGATCCTTACCGCCTATTTGTTTGGAAAATCA GACAAAAATGTCCATAGAATATTGAAACTAAGAACATTCTAAGAACATTT ATAAGTTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATCCTAAAGCTTCGAAAATTC GAACATGAAATATTTACATCTTCAAACTGAGCAAGGCGTAACTAAATAAC CCTATGCATATTTTCTCTGCTATTTCTCAGAAAAATGGCTGATCATGGGT GGAAATGACGTCACACAAAATCGGTAAATTACCCTTTCCTCTTTCTCTTT ATTTCAGCCACTGTTTGTGAAGAAGTCGATAGTTCAGCTACAGAAAGAAA TGCAAAAAATTCACTCATCGAGACGGAAGAAATCCATACTAAATCGGGAA ATGTTCAGCGAGAATTGAAAACCGAATCGGGAAATACTAACCAAGACGTG AATACCGAATCGGGTGATTTGGACTTTGAAAAACAAATAAAGTTTGATAA AGAGTGTAAAACTGATTTTGATTTACGAAACTTAAGTCCAACATTGGAAT CCATTTCGCCCGTTTCGGATTCAGACGGAAACACGACCTCAAGCACTGGG GACGAGGAAGTTAATGCGAACCCATTGTTAAAAAAGAAACTAAAAGTGAA CAATAGTGACGGCCATGTGTCTGATGAATTCAAAGTACGTACAGACAGTG TCAGTTTAAAACAAAGAGATAATGTTATTTATAACGACAGTAATAAAGAT AATGAAGCTATTAAAGAGCAGGAAGAAAACCCTTCAAATCAATCACGTGA TGGCGAGGTTCAGAACAACGGAAGAGAGGAGAAATGCGAGTGTAATTTAA ATTTGAATTCCGGACATCAACAACAACTACCGGACGAATGTAACAAACAG ACTATGAAAAAGTCGAATCAAAACAATCAGAATAAGAAAACCCAGCGTAA TTACGGTAGTAAACATTTATCCAATCGCCAGCGTAAAGAACTCGCTAAAC AAGAACGAAAAAAGAGACGCGAAGAGTTGAAAAAAGACGGTGCGAATATT TTGACCGTTGCTAATGGTGATGGTGATGAAGTGGCGGTTGTTCCAAAAGA TATTCAAGTCATTGCTATCTAAAAGGTAAAAAATATACTTTTATATATCT GTATATTATCAGGAACCAGGATAGTTCAGCGGTGGCAAATTGTTATAAAG TTTACTTTGATATTAGGTTGCACGCTGATATATTTTGATATAGGAGATGC GTGTCGTGTATAAGATTCTTGTCCAAGAGTCGCCCAAATTTTGGGGTAAC TTGTTTCAATTTTCTTAAAAAGCTTCAGAAATCCGCTGATTTTATTAACC TCAATCTTTTATATAAAACTTACTAATCAAGCTAATCAAGTTTCTAAAAC TCGAATACACAAAGACACGGGTAGCTCTCGGACAGGAATCTTATACATGT TGCAGGTCCGTCAGAACAATCGTTAAAGTGGGGAGGCTGAAGGCTCAAAA TGAGATAAAAGTTGCTAGGAATTTGAGAAAAAAATCTCATTTGCTCACTC CCCGCTTCCGCCGATCCTGTGTTGTACATCCTCTATATCAAAACATATCA GAAGGGATGCGTGCAACCTACCTTGATATTGAGTCTCTCAAACCCAAAGT CTCTTTTGTCGATTTAGTCTTTATGGCGGTTTTGACTTACGCAAATTATA GTTGAGCCACATCGCCTTACAGCTGAAGTTGCTTTTCCATAATGTACGTA CGTTGGGCCCCTTGATTAGAAACATATACGATACTTCATATAATTAGTTT TGTTAATTTTACAAGAGCTATATTTTCTATACAAATAATTTTTACAATTT TACCGTAATGGTAATGTTCTTCTTTCAATTTCGATATACTTTGGGGGTTC TCAAATGTCCATTATTTGCTGTCTTGGTCCACTTGTATCCCGAAGATCTT TACGCCAGATGTATATGTGCATTCTTTTAAAAGCCCTTTTCCGAATTTAC TTACAGCTTTCCCAGAATATTTTTAGCGAGAGATGCCAGCTCACATCTGT GTTCAAAGTAGAAAGTGCTTACCGCACTCTTAAAAAAATCCTTTTAAAAG AGCTTTTCTTCGGTATTTAGGACCAAACTTCTGGTCGACTACAATCAGTG ACGTAAAACTTGGCACAAAAAGGAAACCCACCGGGGTGTTTTGAAACCAC AATCGATTTGCAAGTGCTCTAAAGTAGGTTCGAAGGGTAGAGTTTTAACT CTGAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGACCTTAGGATCTGAGGATTC AAAAGTTCAAAAATGGTCCAGTAGGGCTTGAAATATAGCCTAGAAACCAA TAAATCCCTCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNCAAGTTGAGGGCCCGAAATTGACATTCTCGCTC GAACTTCAATTTTCGAAAAATGGTAAATTAGCGAAAAGTGCCAATATGTT ATGGCACTGATTGTAGATTCATACCACTTGTCGCGAAGTGACATTACAAA TTACTTAGTTATCCCGTGGATTCCTCGAATCTTTCTATAATTCGAACATA TTTTCAGTTCCCATCAAAGAGTGACCCCTCGTAAAATGCGATTCGAACAG ATTCATGGAGTTAGACTGACAAATGTTTACTGTGTATTTGTAATTTTTCA AAAACCTAACCTGTATGATTTTAGTTTTGCAAATGATTTTAGCTGTGAGG CTTCGACGACAAACTACGTCACTTGATACTTTGATACCCGCCTAGATTTT TACGCATCCTAAACCATCCATCTTTGTCGGTACGGAGATCTGACTAGCAA ATCCAGGATCGGCGCCATTTTGAATTGGATTTCCATCACGAATGTTGTAA CCACACAACGGGTGTACCACATTGTCAAAAGATGTCCAATTTGGGTCGCA GTGATCAGCGGAACAAGCAATGTTTGCACGGACATTCGGTAGAATACTCA GAACATTCTTAGCATAATTAAATCTGTAATGAAATCTATCTCAAAGGGTC GTGATTTTCAAAGATTTTGACAAGATCGAGTGAAAATCGACAAAAATTAT AATAAAAGCCTCTCTAAGAGTCCCAAAAACGCCAGCAATATTTTCTCTCT CAAAGGGTCGATTTTCGATTTTTTGCTCGGACATATAAATCACGCAAACC TAGAAATCCTTAAAACGAATATAATGGATTATGTCTCAAAGTTGTTCTGC CAACAAACTGGTGGAGCCATTAGAGTGGTGGGTCAACCTAAATTGGGGAG ACATAATTTTCGAATGTTGGGATTTTGACACTCTTTTCTTTTCCCTATTA AAAGAGCCCCCACCACCCAAAAAAAAAAATCAGCCGTTTGGGGAGTGGGC AGTTTTTGCGGCAGAGGGGGTAGTTTTTAATTTTTCGATGGATCCTGACC GACTGAGGGCGATGGTAAATCGGCACTTCTATCGTCATCAGTTAATTTTG CATGTCAGAACAGACTTCGGATTGCTCTAAATTGTCCATTTCACCCCTAC GCCATCCAAACATAAATTTGGTGTTATACCAAGGAGGGCCTGATAGGGAC ATTTGACGTAATTTCTCTTCGGACCCTCTTGCGCCGTGAATAAAGTACAA TCATGGACAACAATTTTGAGACAAAAGCTAATGCTCAGTGCTTGGTGTGA CGGCCTTGCGGACTGGACATTGCAGCTGGGGGAATGGGGGAGCCTTTTTT CTACATTTTCACTGCAAATTATGGGGTTTTTCTCAAACATTTTTGTCCAT GATTGTACTTTTTTAACCCTGGTGCATATAAAGGTCAATAGAGAAAGTAT TGTTCACTCTGCATTAAACCTTGGAGGTGTCATCTCATAAGGTTGTTGGT CATATTAGTTGGCTTAGTCAAGGAAAGATTTTGGGATAATTTGTTTACTC GTCTGGTTGCATCATCAATCATTGTTAAGTCATTTTTGTCACCCAATTTC TTACAACGATGATGCGCAAATGAATTTATTTATAATTTATCCCCTGCAGA CAGGCTCTTTTGAAAGCTTTTCAACCAATGATTATAAAGTCAAGCCTACT CTATTGATTAATGTTTGATCCGTCTAAAAAGCTCAATATTCTCATTCTCT CACTCTCTTACAATGCCTGCTCTTTGACGCATTTTCAACTTATAGCTGCA TTATAGTTAGAATCCCTTTACACTGTCTGCACCCCAAAATGTCGATGAAT TTTGTTTTCTTTCTGACGCCTCAAATAAACATTGGAAATACAAAAATGAG CCTAATAACACTTATTTGTCACCTAAAGATTCTTTCCCAATGCATAATTC CATTTTAAACCATTGTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNATAAATTTTAAAAATAAGGGAATTGATCCAAAAAATTGTCAAA AATCTAAATTGCTTTTCTACTGCACCCCAAAATGTAGGTGTATTTTTGCG TGTTTGCAGAAAAATTACATCAAAATTTATGTTTTTTTGTAAAAAAGTTT TTAACCGGAGACCTTTTGTCAAATTATCAAAAGAAACCTAAAAGTTTTGC TTCGCTTGGTGTTTTAAAGTAGCATTTTAATCAGTTTTAGTTCCGTTTTT CACGGAAAAATTGCTACTTTTTGACGTTTTTGACGTCAGTTTTGTCAAAA TTTCGAAAAATGAGGGTGCTTCAAAATGGAATATCTTTTATTGGGTTTGA GCTACCGGCATAAAATTTTGACACAATGTTCAGGATAAACAGGGCTTTAA AGTCGACCCTAGTTTTTAGGACTTATCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTCCAA AGTTTTCTGGCTGCAAACACGTTGAAAAAATTTCAGTGGACGTCAAACCA AAAACCTACATTTTGGGGTTCACACACATTTTGGGGTGCAGACAGTGTAT AAGGGGATTAAAGTTAGCTTATGGAAAAATCTGCTTATTACTCGTCGTTT AATGGTAAATGCTTCTTTTAATTGACTGTACATTGGAGTAATGTCTCTTT AAAGTTCAGTGTTTTTTGTATTTCGAGTGTTATGCTTGCAATATTGTAAT CATTAATTCGCGTGTTTACAAACGACTTATTGCTGAGAGTTGTTCGCGAG GAAATTTGAGACGAGATTTGCTGTGACCATGTATTAGCGTGTTTAAAGGG CCATGACGCATTCGTTTTGAGGGGAATTCTTTATTTGGTCGATTTCCGTG GAAAGGAGTTTACTACCAAAGATTTCAAGAGAGAGCAGGGGGTTGGTTGC TTTGTAGGTTCTATGATGGATAGCCAAGTAAGTTTTATTTTGTAAATTTC GATAATTAAAGATAATTAAATTTGCTAAACTAAACTGGCTTTGAACGAGC TTATTGCTGGATGTAATCTTGCATTTTTGACGACTGGGAAGGTTATTTTA TCTCTGTCTTACATCTTTACAGTGCAGGTCAAGATCGCGGAAGCCCCAAA ACCTCCAAGCCGTTTCCCGTCACTTGAAATTGAAAATACATAAATAAGCT AAGACCCTATATTAGACCCTTAGATTGTCTATAGTTTTTACTGTATTGTA TTTTAAACAATGAATATTTAGGTCAATCGACATCAGATACTCCGCATATG ATCATGAATGAAACTCCTTTCCTCTGGCATTCTCTTTTCTTAATTGTAAT CAAGCTGGTCTGATCTTTTTGTCACCTTTATATCAAAAGCAATTAATTTC AAAGAAGGGTTTAAGATTAGAAGGACTTTGCACATAAGAATTTAACGCAT TAATCTTCACGTTTGATCGAGATTAAGAATTAAAAATAGAATGGCCTCAT TAATCAATTTCTTCCTCTGAACAGCAATCTGAAAATGAAAATGTTTATTT GGGAAAGTTTGGGTTCACAAATAACTCAGCGATAAAGGCGATCATTTTGT ATCCTTTATTTCAGCAAAAAGAAGATGTTCCCTTGGTGTCCGGAAAACAT TACGTTCATCCGTCCGAAAATAAAATCTCCAAAAAGTTATCATTGGTAAG AAAGAATTTTTCATCTTCCTATCTCTGCTTGCAAATTATATCTCAATCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058165TCONS_00058165Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058164TCONS_00058164Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058163TCONS_00058163Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058164-proteinTCONS_00058164-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_307supercontigscaffold_307:184734..226882 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (1.88 tpm) - - (14.08 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.9 9.2 8.66 6.47 3.27 2.97 3.92 3.59 3.77 3.75 1.9 2.19 7.99 6.56 3.58 4.79 5.22 6.22 14.08 10.51 2.23 1.88 9 9.62 6.76 7.06 3.72 2.75 7.43 8.11