XLOC_036640 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036640
Unique NameXLOC_036640
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_307:300718..358052+

Legend: gene
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>XLOC_036640 ID=XLOC_036640|Name=XLOC_036640|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=57335bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_307:300718..358052+ (Clytia hemisphaerica)
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CAGACGAGACTGATGGCGTCAGATCTCATACTCCGCTCACGCCCAATCAG ACGCCCATGATGGATGCTCTTACGCAATCCCTCCCTGAGTACTCCATgaa caatttgaaaaatgaaagtccGAGAGGAATTTTGAAATCGTTATCTGATG CAAATATTCCGTCGTTACTTAGAGACGGACAAGCACCGCAAGGTGATGTC CGCGTTATACATAACCGGTCACAGAGTGATGAACCCCGGAAAGGACAGAG TTCCGGATCATCACCGAAACATTCTACGGTCGAAGAATCACCCGGCATGA GAGCTTTAATGGTGCTCAGTGAAAATCTGGAAGAGTTAAATCAGCAACGA ACATCTTCTGCTGGTAGTAAACCAAAGATGTCGGTACAACAACAAAATTC GGCGTCTCCGTCGTTACGAAAAACTGCGATCGTGAACAGTTCACCGCAAC TGAAACCAAAGACCTTTGAGAGTGTGGATGATGAAAAGCAAGTGATTTTG AGATCGAACAGTTCAATTACACCTTCGCAGTCATGGTCTTCATCACCCAA ACAAATGACCAAATCGTTAAGCGAGCAAAATATGTACTCTCATAAACGAA ACACGTGGCATGAAAGCATGTTCCAACACAATAAGAACAGTTCCGCTGAT CGTACCATTTCTCCGGTTCTCGAAGAAGATCCAAAGTCCAGCATGGAAAG AACCTTTTCTAAATCCACAGAACAATTAAACTCAcctagaaaacaaaaaa gttttaagaaAACATTATTGAAGAAATTCTCGGACGCGCGTCTCATTGAA CGTGAACAACCGCAACAACATTCGAGTAGTGACGACCACGTGACGTCATC AGTTTCGGACACCAGTATGGACAGCAAACAAATGAAGAAACaaatggaaa aagaaaagaaagaagaaaagaaacgaTTAAAGGTGAGAGGTTGATTCTAA TTATTCCGCACATGGCACGCATGCGCTCCAAAGGGCATGGGTCCGTAAGA GTCACATTCGCCATTNCTCCGCACTGACACGCATGCACTCCAAAGGGCAT GGGCCCGTAAGAGTCACATTTACCATAAtcctttagagcagagcgtgaTA TGCGTAGAATGGCTGATCTGACATGAGATTAATTATTGCTTGATTTTTTA GTAATCACTTAAAAAAACATAGTAGCTTTTTCTCGTAAACTTTTGCCTTA ATCTTTcctaatgttttttttcaaatctttcccTAAATAAGGATATTGTT CGAAAGTTGCTCAATGCCAATCttgcattttttttctttggatttttttg ttttggaaacGTCCTGTATGTAAACCTATCGAGTTGAAAGCCTAATTTTT CGTATCTTTGTTTTCTTCAGATGGAAAAGAAACTTGAGAAGAAGGAGAAA AAATATTCCAAACGACGATCTGGTTCCCATACCTCTCTTACGTCATCCAT TACGTCACTACCAACCAATAATGTTACAGTTCAATCATAGGTGAGTTTTA TCCTTTATATTGCTTTTATTTGCTATTATCTTGTTTTATGCTCTATTTAT ATGTATTAAAGTTCGACATTAAAAAATGATACTACTAAGTACGTAAGctg attttcaaatatttgagTTGAGCAGTCGAATTAGCTGAGATGGACTTTCT ATCAATTTTAATCATATTGGTTTGAAGTATTCCTAATTGGGAATAATTAT AAGTGCGATCAAAGTTAACTCTCTTCACCTGAAGTGCTGTAAGGAGAGAA TTATTTTCGATAATTTTGTGAATTGAATATTATCCTTTAATTTAATGTCA ATTTTTCGTCGTTTTTTTTAGATTGACATTGCGATATCAGAAGAAATTTT TGGTTAAAATGGGGAAATGGGGCAATATCTGGAAATTGTTacattatttt gtattttttagaattttttttttttcctgttTACACAAAATCATAAATac attcaaaaaagtttttttttgtcaaatttaagttttttaaggaaaatatt actacgtcactttttttcttaaattaattgatatatttttttatactcCC TCAACAATTATTAAAAGAAAGCAAACTTTTGTCTTTAAAAAAGTCTTTGT ATACtttgtgaatattttgaaagtaattttttgttattataATGAGCtct attgtttattttattttgaatatttgaaaagtatgatttttgtcgtacaa aaaataaagaaacctCGAACtgttaaatttaaaaa
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058139TCONS_00058139Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058140TCONS_00058140Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058141TCONS_00058141Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058142TCONS_00058142Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058143TCONS_00058143Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058144TCONS_00058144Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058145TCONS_00058145Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058146TCONS_00058146Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058147TCONS_00058147Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058148TCONS_00058148Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058142-proteinTCONS_00058142-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_307supercontigscaffold_307:300718..358052 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
18.46 17.78 6.55 4.82 69.68 49.37 39.72 43.18 25.99 43.63 28.74 31.92 29.66 26.61 17.08 23.06 46.93 43.78 41.18 45.73 48.42 47.46 47.74 49.15 35.36 34.96 51.35 56.88 47.52 50.49