XLOC_042665 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042665
Unique NameXLOC_042665
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_483:2977..35383-

Legend: gene
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>XLOC_042665 ID=XLOC_042665|Name=XLOC_042665|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=32407bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_483:2977..35383- (Clytia hemisphaerica)
CGGTCTATCTACATAATAATTACAAAAGTGATCTTGAATCGTAACGTAAC GGGAGCTGGTTCCACGCCGGTATGCACCTGTAATAAAATGACTTTGTTTG CACACCCCTTAAATCCAGCACTTTGTGTTTTGTCATTTCAGATACTTAGT ACCAATAATAAACAATATAAACAATGGAGATGACGGGTATTGCAAGCAGG TGACAACAAAGAAGTCATGATGATATCAGAGTTGAAGAACCTTAAGCCAA TCAAAGAGGTAATTTTTCTTCTTTGTTCTGGCTATTCTTGGATACAATTT TGAAAAATCGATTACTGAATAAGTAAGCTTACAATAACTTTTTAAGACCA TTTAACCCTGAAAATCACAAAAAAGGAACATCAAAAGCCAAAATTTACTG GTTAATAAAATGAAACGTATAAAACCAATTTGTTTGGGAACACTGTTTGA TTTCTTTTTTTTATTGCTTCAAATTGCAATGTAGTTTTCAGCTGGTTCAT TTAGAAATCGGAAAACAGCTAGCAGTAAAAAAAGCTTGATTTATAGGGGT ATTCTAAAACGACCCTGAACCTCTTTTCTCCATTGTATCCTCAATCCACC TGATTGATAGACATGGTAGATAAGATTTGGAAAACATTGGTGCTGTCACC AGTTTACCAAGGCCAAATAATGTTTGAAACAAGGGATAGTTCAGTATCTT TATTATGGTTTATTGTGTCGTAACGTGTTATAAAGGGCCAGTACAGGTTA TTTAAGTATTATCATCTGTTTATTTAATATTAAAACATAATAAACAACAA CATGAAATTTGTTTGTCCTAACCAATCAATGGCTTTAAAAATAGCTTTTA CTTCTTTAAATCTAGTTCCAATTCATTAAAAGCGATATGATAATCAAAAT GTAATATGAATTTTTTTCTTTGTCAGTCTCTTTTGCATCAGTGATGACGT 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GTAAGCATTTTTCATTGTGTCTGCTATTCTAAGTCTTAAGTATAACACAT TTTTGTTGACAGTTTGAAATCTAATGGATAAAATACTTTAAGTTTCATAA TTGTACGTTCAATTTTGTGTCGTTTACACCTAACTTTATACCATACCATT CGCATTAATTCAATATCAAATTCTAAATTCATTTTCTCATTTTCTGCATT GATTTTTCTAGTTTTTGTTGACACCGACAGTGCACCGTCAATCAGTGGGA AGTGAATCCCACCCCACTAGTGGAAGTGACAGTATAATAACATCAACTCA TCCTGTTTCGCCTTACAATATTCACAACATTCAAACACCTTCATATTGGC AACCTCAGATTTGGCCAACACCCGTATGGCTATGTTTCCTCAAAGGTAAG CGATCTACAAATTCATTTGGTAGAATAGTTGAGATACTGAATTAACTTCC CCGAGCGTGGTTTTTGTTTTTGATTGATTCTAGTATGANTCATCCGACAG AACGTCAAGCATCGCTCCATCACCTTTAACTAAATCACTGTCTTCGCCTT TGATTAAAAACATTCCATTGAGTCCTTTATTGAAAAGTCCGTTAGATTTT ACTCAATATTTATCCACTAGTTCGAGTGGTTCCGGATCACAGAGCCCATA TCCAGTTAAGGACCGTTACGGTAATTTTTTTGACCGGAGGAACGATTTTA CACGGAAATACGGCACAGATGATTTCACACAAAGAGGATCGTTATCTGAA TACACTCAACAATGTCATCAGAATAATATGGAGTTCCGTAACCAATGCCA ACGACTATCAACGGGCGATCTTTCAAATCCTCGGTTACCTTCAGTCGACT TTCAATCGCAACGTTCTTTCGATTATTTTGATCGCCGACCTGACGGTGGT TTTCACAGCCCACATCCAGGTCACCACGGTGTTTACAATAATTTCAACAA 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ATGAAAATTAAATACAACCCCTAGTAGTCCTAGTAATTTAACTTCTGGTG ATTTTCCCGATCATGATTTCTTGATGGTCAATGTTCTTTTTAATTTCGAG AACGGATTTTAAGGTAAAGTGGTGGTACTTCGTCCACTTTGAGCCCTATC AACTCTTAAAAGTTCTTAGAAAAAAATATTTCTTATAAAGCCTCTATGAT GTCTCCATATGAGCAAACTAGCGTACAATCAATTTTCTCTTTTAATTAAT GACAAGCGGCTGACGACAGCGTTGAATGTCCTACCGCGCGCACTAAATAT AAAATTCACAAGCGGAAATGCCTGACTAAATGGCTTGTTAAGAAATCTTA ATCGGAAATTAATAGCCGGGTGATCAGATCAAATTCTAAGCTTTGTTTAA GAGTTTTCAAATTTTTTCCATATTTTATGATAAAAATACCCTGTATTTTA CATGTACCATTTAATACCAAGCTTAATGTTTATGTTGTCTAGTCCTGATT AAAAACTATAATACCGTTTTTTATGTAAATTCTATAGTGGGACTCTATTG CATCTGTCTACTACCCACGAGTGCTTTCGTGTATAGAAACCTCCTGTGAT CAGATTTTATAAACGGGAAATAGGGATTTACGGATCGGTTGATGACGCAT GCTGAAAATACTCTTATCAAAAGAAAAAGACTTGATGAGCCTGTGATTTA TTACATGGGACCTCCTTTGATTTCCTTTGACTTGATAATTCGGACGTGTC TAATTTACAATCTACGTACTATACTTTGAAGCATTTTATCATACCTTAAA AGTGATTTATCCAACTTCTACGAATATGATTTTCCATTTGAAAGTCACCG CTTACGGCCGAAAGGGTCTCAATAAAACCATGGTCTTTAAACCATTATAA TTTTTTTTCTGTTTAGAAAACTGAACCTCCTTCCTCGTCATCAACTGCAG 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GAGCCCTGTACCATGGGAGAGATTCCAAAGTTCCGAAGGAAATCTCCTTG TTAGCATGATTCGCTCCAAATCTTATGTTTTTTTGGACACAGTTAGCTTG TAAGCTATATTTTTCTGCATTCGACATTTGAAACCTATTCTTATGTCCTG TTCACAATGGAAAAGTCACCAGTCAAAATATTTTTGATGATGCTGTGATG GTTACTACGTTTGTTCTATTGATAAAGAAATACTACCATTTTGTTTATGA GACTATGTGGCTTCAATTTGTTTACTTCGTTCGACCCATATTTCCTTATG CAAGGATTAGGTCACTGAAATGCTACCATTTTGTTTATTGGCCTATGTGG CTTCAATTTGTTTACTTCGTTCGACCCATATTTCCTTATGCAAGGATTAG GTCACTGAAAACTTTGGTTCATCCAGAGGATAATAAACATTCGAAAAATT CCCTGGTGTTGAATGGATTGCAGGTAGAAAAAGTTTTTTATATCAGAACA TTTATTTTATATTAAAAAGTATTGAAAATTGTGTATTAATTATATACCAT AACAAGTATTTTTTTGTTCGTTTTGTTCTTTCTGCATTATTATTTTTTAT GATCTAAAATACGATGACTATTTTTAAATTTAGTTCGTTTCTTTGTTTAT ATTTACTATCTTTTGTTATGTNACTATTTTTAAATTTAGTTCGTTTCTTT GTTTATATTAACTATCTTTTGTTATGTTCATGAATGGATTTTTTCTGTCC TATGCCCTCTTTTTCGTTGGCTCCCATCTTTTATTGGTTTGTTTTCAAGC CTTTAAAATTTTACAGCTTTGTCTACACCATCAGTTTTCTACGCCGCTAT GATTACTCCTAAGAAATAAATTTCTGTCAATTTTTACCCCNTCTTCTACG CCGCTATGATTACTCCTAAGAAATTAATTTCTGTCAATTTTTACCCTATC CAAATTTATCAGCTAGGTATAATGAAATTTACCTTGGCGAATCCTTCCAT AATAAATTTTTTCTGTTATGCTTCTGATATTATCATTATCATTAACTTGT ATGCAAATAATGTAAATACTAATAAAACTTTATTTTTTACTGTTCATACC TACAAAATTTTTCCCTTTTTTTTAGTTTCTAAAAGAAATTTCCAAAATAT TTTTTACCCTTTATGTTATGACTTTAAACTTATTGTTAATTATTTGTTTG GTTGATGAAGCAGGCAGTTTTGAACTATAAACTTTAAGTTGTATGTCCTA AATCTTTGTCGATGATTTGACTAAATAACCACGTTTACGTGGATGGAAAT TTGAAATGATCTTCCCATTATAAAAACACTGGTCTGGAAGGCTTTTGTTT CCTTTTATTGTTAAAAGAGATAGAGCTTATGTACCAAATCAATTTATTTT GCAAATGTGATTATTTTGATCATGTGATTAGAAAATAGACTNAGATAGAG CTTATGTACCAAAATCAATTTATTTTGCAAATGTGATTATTTTGATCATG TGATTAGAAAATAGACCAATCCCAAGAGCAGATTTTGGTAACGTGATCAA AAAGTATGCAAATCGCAACTTGTCTTTTGTTTGTAACAAAAGAAAATTTA ACAAAAAGCTAAAACTACATTGCCAGATTGGGGTTTTTTATAATGACTAT GGTTCAAGTACATGCATGGCAGAATGATTTCTGTTGACTTATTTTAGGGC TTACTTGTCTACTTCATTCTAGAATATTATCTTTTGATTTATAAGTAATT TAAATGTTTTTTACTTTTCCCTGTTTTTTTTTCTTCCTGAAGATGTATAA CTTAATGATTATTTTCTGAAAACTCTATTGTACTATTATTATGATGTTTG CATTTTTTTTAAATCACAAGAATTAAAATTAACGCTTAATTTTTTAGACG 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00068363TCONS_00068363Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068362TCONS_00068362Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068361TCONS_00068361Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068360TCONS_00068360Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068359TCONS_00068359Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068358TCONS_00068358Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068357TCONS_00068357Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00068356TCONS_00068356Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00068361-proteinTCONS_00068361-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_483supercontigscaffold_483:2977..35383 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
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6.63 5.68 6.19 6.23 74.62 54.31 57.9 62.33 23.64 38.69 18.18 21.97 35.46 27.1 12.1 18.1 33.43 39.64 31.04 50.98 27.85 30.24 15.59 18.6 36.55 26.91 57.62 49.46 28.46 25.69