XLOC_042987 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_042987
Unique Name	XLOC_042987
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_491:155849..166317-

gene from alignment at scaffold_491:155849..166317-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_042987 ID=XLOC_042987|Name=XLOC_042987|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10469bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_491:155849..166317- (Clytia hemisphaerica)
ATTTTCCCCTTGGAAAAATATAAAAACACCCGCTGGAAATTTTTCTCGGG
TTACCCTCTGGAAATGTTCGTCCCCCCTGTATGGATATAAAATGGACCGG
CCCAATGAGTGAGATCCAAGCAAGTAGGTTGAATGACCCGTCTCTGACAT
GAACGCAATTTTAATCTACGCCAAGAAATAAAAGAAAGACGAATCACATT
CATGCGAGTAATAACTAAATAGACTAGCCCAGTTCCACATGAGACTGAAA
GTTTTACGTCTGCCAGAGTTCTAATAAGTCCGAAGATTATACTTGCTTAT
AAAAAAACAGGTGCCTACTTTTGTCACTCTCATCTTTAATTTTATTTTCA
AAGAACAAATACAAATTATAAAACATAAACAAAAAATCGATGAGAAAATG
GGCTGCTGCTGTTCCAAGACGTGTGGAGATAACTGCTGCGTGGAATGTAC
TCAAAAATGTGCAGTCGGTAGTTACCTGTGGAGAGGGAGAGCTCGAAATG
TTATCGCTGTCGTCACGTCGAGCAGGAAAGTCGAGAAACGGGGTAGCGGA
TGGGTTATTCTAACCAATGACGGGCACTTGTTTTATTACTTGGACGCGGA
CGGCGCTACGGAATGGTACGGCGCAAATGTTTACCTTGAGTTCGGTTCCA
CAATGTCGTACGTTTTCGATGTGCCACTAGGCCTGGTAACTAAGGTTGGG
TACGAGAAAATGATTGGTGATGACCGTGTGACGTCACAATCTTGGTTTCA
TGATTCGAAAGCAGTAGAGGGCGGTGAAAGTTATTTAGCGTTAAACATGA
CTTTCACTAACGGCGCTGAGTTGGTTTTGTACATTTGTATGCAAGGTGCG
TACGATTTATTGAATCTCATCCAGGAAATTCTGAGACATCAATCTAGCAC
GTCTCTTCCCAAAGATTTCAAAATTAGTTATGTGGATTATAACATAAATA
GGAGTGTTTGCGTTCCAGCGCAAACTTTACAAGCACCAATTCTGTTTGGC
TTCACTAATACCAATCGTCGTGGAATGCCAACGAGTCGGCCAATCGTTTA
AACGGTCGTGGCTTCTTCGTACGGGTGACAGTAGATCTTGTATTTTTCTA
TCTTTGATCTGGAGTTTTCTGGAGTTTTCTGAACCTTTAGAATGTTTCTA
AGTTGGACTTTTAGAGTTCAATAACAAAAAACTACTTCTACTTTCACCCG
TACGAAGGAGTCAGCACCCGTTTAAACGGCGACTTTATTATGGAACCTTA
GAGGTTAGATTATGGTCGTGAGTTTTTTCTTTATATTTTAAATGAACCTG
TAACTATGAATTATTGTGCTTGTAATTATTATTATTTATAGAACGATGGC
CGAGTGGTCATTTCTCAACCTGGAACCCAGTCCTTTAAGTCGTTTTTTTT
TGTGATTTTGATAGCGCTTGAAAAGGTTTCTATCATGTCCACCAGTAAAG
ACTAAGAGTGGTGCAAGTGGCTCTTGGTATGACTGTAGTCATTGCCCCAA
ACTAGGGGTTCACAGTTCGAATCCCCGTACCATCCAATGGCCCGTTCAGT
TCATAGATAGCAGAATCGGCTGGCCATGGAACCGTGAAAACAATCGAAAG
ACTGTTCAAAAACTCCTTAATTAGTGGGCTATCCACGTAAGATATCGACT
CTATTTTTACAGACAAAAATGTCTGCACGATGTCTTCATATCTATCTTCT
AAGCACAAACCAAGCTAAAAATTGACTTCCCCCCTCATTTTGTCGGATTT
TTTAAACATCAATTGTTTCAATTTTTTGGTATTTTTTTATCTTTTATTCC
TTATCTTCTAGTAGAATTTAAATTGTATTGTGTCTTTGTATTTAAATTTT
TTCATCGAATTTGGCACGTAAAAATTATTTCTTTATAGTAAAGTGTTCTT
TCTACCTACGAGCCTCTGCATTTTAATGTAATATTTACTCTTAGGCAAAG
ACAAGGGGCAGGGTTTTGTTTTAAATAGCAATGGGCTTGTAATGTCTTTC
AAATAAGTTTAACAGCCGGGAAGTTAAGATCGGCATTCCCCACAGGAAAT
GATGAAATACTAAGAAGAGAGGTGTATGAAATAAGTGGATATAACTAGTG
TTCGTTAAGCATTTGTGAAATTCATGATATGCACCATTGTAATGGACCCA
GCAGCTGATTGGTTGCATGTGACGTATTAAATGATTTTACGTTACTTAGA
ACCAATCACCTTTGGGTCCGTGATGTAATGTCAGAAGATATTGCAATGTT
GCATATCATGAAATTAAAAAGGTAAAAGAATTCCTCTGTACAAGAGGATA
TGTTAGGTATGACATATTGAAAAGCTCCACTTATGTATATGGAGTACATG
TTTTTTTTTTATAAGCAAGTGTATGCCCCTAGGTCAGGCTAGTGTATGCT
TAAGTTCTTAAAGCATCCAGGCATAGTTTATGCTTATTATATCCTTAAGA
ATCATGCTTATGATTCACCCAGAGCCAAGTTTTTTAATGAAATTTCAGAA
ATTTTGTAAAAAATTTGTTCAGATTTTGGGAGCAGTGGAATGTAGCTAGC
CGTGGAATGTCTTATTTCTTACTTGACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TCTTTTATCACATACCAGAATCAAAAGGGCAACAACCTCTACATACACCC
ATCAAATTTAAAGCTTTAGGAGGAGACTAGATTCAAGTTCCCCAAGAAGG
AGTGACGTCATTTGTCTGTATCTGTCTAGATCTATTCAAAGATACTAGAA
CTTCTTACTTACTATTACCCTGTCTCCTCATGTTTCATAGGTGTATAGAA
AGATTCTTATGTTGATGTCGGTATACTTCTTTTGGCAACTTGCTTAACTG
CTTTTGATAATTTACTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGT
CAGTTCTTTTATTAACTCGCTTAACTGATTTTCATCATTTACAGGGTGAC
TGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTTGCTGAACTACTTTTGATCATTTACAGG
GTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGGCA
ACTCGCTTAACTGATTTTTATCATTTACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTA
AGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGTTAACTCGCTGAACTACTTTTG
ATCATTTACAGGGCGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCA
GTTCTTTTGGCAACTCGCTTAACTGATTTTCATCATTTACAGGGTGACTG
AGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTCCTTTTGTTAACTCGCT
TAACTGATTTTCATAATTTACAGGGTGGCTGAGGCTTGACCTAAGATTCC
CTTTTGATGTCAGTTCTTTTGGCAACTCGCTTAACTGATTTTCATCATTT
ACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTT
TGGCAACTTGCTGAACTACTTTTGATCATTTACAGGGTGACTAGGGCTTG
ACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGTTAACTCGCTGAACTAC
TTTTGATCATTTACAGGGTGACTGGGGCTTGACTGAAGATTCCCTTTTGA
TGTCAGTTCTTTTGGCAACTTGCTGAACTACTTTTGATCATTCACAGGGT
GACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGGCAAC
TTGCTGAACTACTTTTGATCATTTACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAG
ATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGGCAACTTGCTGAACCACTTTTGAT
CATTTACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGT
TCTTTTGGCAACTTGCTGAACTGATTTTCATCATTTACAGGGTGACTGAG
GCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGGCAACTCGCTTA
ACTGATTTTCATCATTTACAAGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCT
TTTGATGTCAGTTCTTTTGTTAACTCGCTGAACTACTTTTGATCATTTAC
AGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTG
GCAACTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTGATGTC
AGTTCTTTTGGCAACTTGCTGAACTACTTTTGATCATTTACAGGGTGACT
GAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTAATGTCAGTTCTTTTGGCAACTTGC
TTAACTGATTTTCATCATTTACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTC
CCTTTTGATTTCAGTTCTTTTGGCAACTTGCTTAACTACTTTTGATCATT
TACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTT
TTGTTAACTCGCTTAACTGTTTTTCATCATTTACAGGGTGACTGAGGCTT
GACTTAAGATTCCCTTTTGATGTCAGTTCTTTTGTTAACTCGCTTAACTG
ATTTTCATCATTTACAGGGTGACTGAGGCTTGACCTAAGATTCCCTTTTG
ATGTCAGTTCTTTTGGCAACTTGCTTAACTACTTTTGATCATTTACAGGG
TGACTGGGGCTTGACTGAAGAGGATTCGATGGCTGACATAAAAAGACAAG
CAGAATTTAAGAAAACGTTTTTACCAAGTGCAAAAGCACAAATACGCGTG
CTCAACCAATCGTATCATGTAAGCTGTTTTGTTATTCAAACGAAAGTGAT
TTTATCTGCAAGTAATTACCTTTAGGAAACACTTTAAATCTGTCATGGTG
CCGCATGGAAAATTTCACCGAGTTATAAATTGAACAATGAATTTTTCACT
AATTATCAAAATGATGTGGGATTTTGTGTAGAAACAAACTGAGACGATTA
CTAGCCTCAAATTTCAGAAATGGCCCCGCATTAAAACATTTTGAAAATAT
TTAAGCCTGAATTTCATGAGGAAAAAAATTGCAGCCGTTTCAGCTTTATC
TTCGAGCATATTTTAATACTCGGCGTACGTATTCACTTTAAAGGCCATGT
ATCCGTTAGAGGATTTGTCTATGTCGGTGCACCGCTATGATCTATGTCAT
CCTGATTTAGGATGAATATTAAATGAGCTTTTGAGCGCACTGAGTGGCTT
AAGCTAAACAATCGCCAAAGTCAAGTGCCAAACATAAACATATACATTAG
AACCCACTTTCGCTTCCGCTTTCGCTTTAAAGCAAAAGACAACGCGGTTC
TGAATGTTTTAGCTGAAGAACAAGGTCAGATGGTCACATTCGCCATAGCA
ATTTAGAGCAAAGCGTGGTATGCGTAGAATAGACGATCCGTTATGAGATT
AAGTTTCAGCCATTATCGACTGGCTTTCATACAAAAAAGCGTGTATATTT
TTTAAATGATTTATTTTTTCATCATAGGATATGCTCCAACAATTCTTAGT
GATGTTGAATAGCCATTCGGACGTCTCCTTACGTTTCTTGTGTTTCCGAT
TGGACTTTAACGAACATTATAAGAAAATGGAACCCAAGTTACGATCACCA
ATGAAATACAGTTTCCGGAAAAAGAGAGCGGATGTTCCTATCTTCCGTGG
AGAAACTNTAACTACTTTTCATCATTTATAGGGTGACTGGGGCTTGACTG
AAGAAGATTCGATGGCTGACATAAAAAGACAAGCAGAATTCAAGAAAACG
TTTTTACCAAGTGCAAAAGCACAAATACGCGTGCTCAACCAATCGTATCA
TGTAAGCCGTTTTGTTATT

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00068989	TCONS_00068989	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00068988	TCONS_00068988	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00068987	TCONS_00068987	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00068987-protein	TCONS_00068987-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_491	supercontig	scaffold_491:155849..166317 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
9.12	9.2	6.85	6.78	16.97	13.3	17.96	18.33	9.85	16.51	8.58	5.61	46.92	30.28	13.58	13.84	8.53	12.9	67.7	80.82	6.15	7.29	16.91	18.07	41.83	39.03	60.03	70.69	7.45	6.18

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