XLOC_044542 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044542
Unique NameXLOC_044542
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_63:128107..140759-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044542 ID=XLOC_044542|Name=XLOC_044542|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12653bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_63:128107..140759- (Clytia hemisphaerica)
GTTTTTCAATTACATTGTATTCCTCCTTAGAAAGTAAGCCATGTGTCATA GTTGAGCGTCTCGATTCTCTCAATGTAATGACCATTGGAATCAACCGTCC ACAGAAACGAAATTGTGTTAACATTGAGACAGCTGGGCTATTAATCAGTG CATTTAAAGAATTTGAAAAAGATGATCAAATTCACTGTGCTGTTTTGCAT GGCTTTGGAGGATTCTTTTGTGGTGGGTATGATTTAGAAGAACTGTCGGA GACCCCAGAAAAAGATAGGCAAAAGAAGATATCAACTATAATTTTTGGTG ATGGACCAATGGTAGTTTTTACAGTTTTTATAATTTAGAAAAAATAGCTT ACTGACGTGTGATTTGGCATTAATTTGAAATTAATTCGATCTTTTATAAA TGTTCTGTCAGGCTCTTCCATTATCAAAGTGCTTAAAATTATTATTATTA GTAAATAAATCATCTTTCAAATATTTGAAATTTCGATTTGTAAAAAGATT CAGAATAGATTCTAGACAATATAAACATGTTCTGGCTTTTAGGGTCCAAC ACGTATGGCACTGACAAAGCCTTTAATAGCAGCTGTATCAGGATATGCTG TCGCTGGAGGACTGGAACTAGCCTCAATGTGTGATATGCGAGTTGTAGAA GAAAATGCTCAATTTGGTGTACTTTGCAGGCGGTTTGGTGTCCCTCTGAT TGACGGTGGTACTGTTAGATTGCCGAAGCTGATTGGTCTGTCAAGAGCAA TGGATATGATTCTGACTGGTCGATTAGTTGGTGCCGAAGAAGCCCTTGCT TTTGGACTTGCCAATAGAGTTGTCAAGAAAGGTACAGGTGGGTAGGTTTA TGACTTCAACTATCGAGATGTTTATTGTTCTCGAAGCCTTTTTGCTATTT ACGTTGGCGTTTTGTTAGCAAATATTTGAAGAAGGATTATAAATCTATGA 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GCTGAAATCCTCTCACGATGTTCTTATTACGTTTAGTTTCTTTACAAAAA CTTAAGTAGGTTTGAAAGCTGTTAAAATCAGTAATTTTCTTAGTAATTTT CTGAAATCTGAAGCTCAGGAGGATTGTTTTTTATTTTGCCCTTTGGTTTT GACCAATTTTCAGCGTCGTTTTCTTTTAAAAAAAGCGTAAAATGTGTTAC TGTACACACTACCATCCACCCAAAAAAAGTAACTCCGTTTCTTTTATTTC AAGGAGTCCATTGAAGGAGCCAAAAAATTCGTTTCTGGTCAAGGAAAGCA TGGGCAGTTCAATGTAGGTGATTTTAATTGAAAGAAAGATGATAATTAAT TTTACTCTGATTCCTGATTGATAAATTGAAACGCGAATGTCAATCGTAAA AAGACAGGAAAAGGAAAGTTAAAAGTTCTTAAAGCACTGCTGTATCATAG AGGCGATGGTTTTGATGGTCAGTATCCAATGGAAGGAATAGTTCAAGAAA TCGTTACCGTTGAGAAAAACTCTTGGCATTTCATTTACCATTTGAAAACT ACGAATCTCAACTAAGGATTGTTAGACATACTCCATACACTGGCATTTCA TTTAACCTCGCTGGCTTTAACTGGGTCAATAAAAAAACAGGGGTGAACAA AAGTTAAACAGAGCGCTGATTCACTGTATGTACACACGTAAACACACTTC AAANAACAAAAGTTAAACAGAGCGCTGGTTCACTGTATGTACACACGTAA ACACACTTCAAAAAAAATCAGTGTTCATCCCAAGCGTTTTGATTTAGCAT TTTTTGAAGTCATTATAAAGTTTATACACCACCTTCTCACAGACACGGTA GGATTTTCTCAGCCAGTGGGGATAAAATAACGGTCAGAAACTAAATGGGG ATTGATATTCCCATATTTTTATGGCTGGAAATTTCAATTCTTTTCTTTTG AAGTCNATAAAATAACGGTCAGAAACTAAATGGGGATTGATATTCCCATA TTTTTATGGCTGGGAATTTCAATTATTTTATTTTCAAGTCAGAAAATTCA GTAGGGATGGGGATAAAAAGCATAATATTTTACATTTAGGATTGGTTAAT TTGATTATTTTCTACCGGGGACAATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGT CTGTGAGAAGGGGGTGTATAAACTTTATACTGACTTTGCTTCAAAAAATG CTTTAAAAAATGCTTGGGAGGAACATTGATTTGTTTTTTGAAATATTAAA TGCTCTGTTCATAAAACTTTTTGCTAATGTTGCAACAAGAATATTCTTGG CTGGTTGCAATAAAAAAGACGAATTCCTGGAATTTATGACGACGAGAATA CGTAAAATGTACGTTGATCGAACAAATGATTATTATTCATACGTATGTTA AATTAAACTAATTTTATATTTGCACATTATCAAATTTTTTGTCATTATTT CGAAACTGCTTTTGTTTTTGAAAATATGTCAAATTTGTCTTTATTCCAGT AATTCCCCAGGATGTACGTGATTTAACTTTTTTTTCCTTGTAAGAATGTG TTTTTCCAGAAAAAAATTGAATATCGGGGGTGGGGGATATAACATTTTTT AGAAATTTACCCCGTGGACATTGTGATTTTTGACCCCAGACGGACAGCAG GTCTGACCCCCCGGACAAGCATCAGTTGACCCTCCGGACATTCAAAATAA CCCTCAAACCGAGCAAAATTACCCCCAAACAGAGTAAATTCCTGGGACCG GGAGAATTTTGTAGATTTTTCACTCTCCCCGGACACTACATCCCCTATAT AGGGACATATTCTGGAAGAGCCCAATGTGTTAATGCTCAAATTTCAGGGT GTGGTGAACAACATTTTATCAAGAGTCACCAAATTAGCAAAGAATCATTA 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CCAATAGATTTCACTCTTATGGTTTTACCCTTAGGAACCCATATTTAAAG TTCTAGTCATTGATTTTTACTGTACTTAACCTTTTAAGCAAAAAAAACAT GAATTCTCATTTTAGCCATATTATTATTCTAAACTAATTAATAAGCATAT TTTGCAAGTTTGTAACTATTATTAAGTATTTAATCAAATTATGAACAAAA AGAAATTTGAAGTTTAACAGATTAACATCAATTTCTAAGAATCGTTATCA ATGACACTATATCATACACCGGAAAAATAGTATTACTTGCTAGGTCAACT GAAAGTAATTATCTTTATAATACATTTATACTCCTGTCCGTTTTTACCGT ATCAAATTCGCTTTTCGCTTGCTCCATGAAATCTCACCCAAGCAATGATT CCATAACTGTAATATTTGAATTTTTTTAATGGCTAAGATTAAAAAGGCTG TAAATTATGGGAGTACTAGATTGACTAAGGTATGAGGGAACCTTTTTATC TCGTCAACTCTACGAAAGGGTGAAAAACCCACCATTACAAATGACCCCTT CTCGATAATTCTCACACGAAATTATATATGCCTTGTGTTAATAACTTCAT TGCTTATTATTATCCCAATATGACGAAATCCTTGTAGACAAATATCATGG AGTCGAGACGATGGATCTCCTCTGTGATGCCATTAGTCACGATCACACTT GGCAATATATCTAAAAGTTAATTATCGTAGTATTTACCCAAAACAAAGTC ACTTCAACAAATATGATTGCAAGTCCAACGGGCTTTAAAAAGACATCCGT TTCTATTAACTTCTAGAAATAGTTCTGGCGGCAGTGTTCTTAGTCTTCTT GCTCATCCTCTAGCGAAAAATGTTTCTTATAGGAAGTATATCTATAGAGG TCTGCGATTCAGATTACAGTGTTCTGTTCTGTTCAAGAGTGTTCTTTTAA TATCCGCTGCCAGCAGTAAGATAGAAAATCCATTTTCTAAGATTTTGATT GCTTTTATTTTAGTCCATTTTTGGGGGCCTGGGTCCATTAAAAATTTGAA TTTTTTATCCATAAATTCTTATTCTGACCAATTTCCACGGGTCTAAAGAT TTTTCTTGAATCATCGCATCAACGCAACACCGACAACAAAAATAGCACAC TGTTCAACTCGTACACTCCTCTTTGAACTGTTTTTAGGCATCTACTGAGT AAATCTCAAAAGTTTTGGTGCTACCCATCACTCTGTCTTGATTTAAGCAA AAATTTTGATGCTTTTTTATTATTTTCGACCTTTATTTAAGAGATTCGAT GGCTTGCTCGTGATTCTAAGAGAAAATTTTGAGTAAGAAATCAGGAGCCA CTACAGTTAAATGTTACCGGTACATTTTTGCCTTAATGGCCTTCTATTTG GATCCGGGGGGGGTACTAGGGTTGCGAGCTGACGACTTTCGACCCTCGGA CCCTTACCGGGACTAAAAAGGAGAAAACNCCGCCCGACTTTCGACCCTCG GACCCTTACCGGGACTAAAAAGGAGAAAACAAAGGAAAATTTTGTGAATT TTACGACCCTTACCGGGACAAATTTGACAAAATTTCGATCTTTTTGGGAG TAAAAAGTTGAAATTTTCCTATTTTTTCTACCCTTAGTGGAATTGAAATT TGATTTTCTGATTTTTCCGACCCTTAAGGGGACTTTGGAAATCCAAAAAA GGTACCCTTAAGGGTGGCACATACCGTACCCTCCATTTGCCTAAGTACCC GGGCCCCCCCGGATTCGGATCAAGCTGGAAGCTGGAACTCAGGACTATCA AGAAATAACTTTAGAAGTTTCAAGATGAGTATCTTTTTTATTTGCTGTTA AACGGTATGTTATTCGTGGTAAAAGGTGTCTGTTTGAGTTTTGTAATACA CCCCTGTCTCAGCCCTGGTGGAACTTTTTACTTCAGTGGAGGTAAAAATT CCCATCGAAATCCCAATGGGGATAAAAATTATATTGTTCCAAGGTTAAAA AATCCAGTGGGGATGGGTTTTGGAGTTTTTGCCAAATTTTCCAGTGGGTT TGGGGTCCCAGCGGGTCTGTGACACAGAGTGATGTANATTTTCCCACCGG GGACGAAGTTTTTGCTAAATTTTCCAGTGGGTTTGGGGTCCCAGCGGGTC TGTGACACAGGAGTGATGTTATACGACTGCTGTAAACTTTAGTTAGACTC AAAACAATGTATGATTTATCTATAAAGATATCAGCAGAGTGTTTTAAACT ATATTCTTGCTTCCATAGCATCAATAATGATATCTAGATAATGATACCTA TAACTCTTTGTAAAAATGTCTATTAAGCTCTAGCTTTCATCTAAATACCT ACAGTAAGTCAATTATACGGATTAAAAAACAGGAAAATCAAATTTTAAAA GTCTAACAGTAGGATAAAGGGCGATTAATCATAAAGAGATTGGTTAGGAC AAAGTCGCCCCCCCCTCACTGAGTACTAGTTTTGTATAGTTGGANTCATA AAGAGATTGGTTAGGACAAAGTCGCCCCCCCCCTCACTGAGTACTAGTTT TATATAGTTGGCCTGGTGTCAATAGGGCGTCTGCAAAAAAGTAGTGGTTA ATTAGGACAATTAAAAAAGGGTTTTTTATAAACTTACCTTATTCACAAGG CCAAAAAAATTGTCAGTTTCGCTTATTGTCTCTATGCATTGTATAAGTAG TGACGATTACCCCCTCCCTCATCTGCCTTTCTTAGAAAACAATGCGGGAC TGATTGCATGTATTGCAGGGAATATGACTTAAAGAAAAAGAATTTTTACT ATTTCAACGAATGTAGAAAATTGCTTTTTATTTTTTTTAGAAACTTGTCC GGGAATCATGAACTGAACTATATATTTACAAAGAATAGTTCCAACAAAAG GATGCGTCACAATACCTTTGGTGGGTTAAACCCGAAAATGACTTCAAATT TGAAGATTCGAAAAGTATAAAAAAGCACAATATCGGTAAGGATTCATTTT AAAGTAAGGGTCAATAAATTAAAGCTACACACTAAACGATTAGAGAAGAA TAAAGCAAAATAATGATTTTTGAGAGATTTTGGTTTCTTTTAGTTTTGTT ACATTTAGGTAAGAATTTTCATCAGGGATAGAGTCAATATTTTACTGGTT TGAATGAAATGTGAATGTACTGGTTGAATGCATTGAGTTTTAAAGCCCGA AGGGCTAGAGTAGAATCTCTAACCTTTCCCTGGAAGCCACTTATTCTCCA TCCAAAACGCGCCGTAATCATGACGACGGATTGTATCTAGCGGTTTCTTT GTTTTTTGAGGACTATATCTTTTTAAATCTAGTGATAGATTTTACTTTCA ATCCGGCGTTTGTGTAAAAACCACGCGCGGGCGTTCTGAATGGGAAATAA GTGGCTTCGTTTCCCATCCAGGAGTCTCGAGTCTAGCCCTTCGGGCTTGG AAGGCAATGGTTGAAGGCCGCCGATCGAGCAGAAGATATATCAAAGCATT TGGTAATCCACTTAATTTTTCTATTTTGCCTTTTTTAAGGTATCATATTT CATGAAATTCATGCGAGCCCTTTACCGTTGGATGGAACAGAAAATTGCGA TTGGGGACAGATTATTCCGACTGAAATGGAGATTATCGAAGAAATTTACA TATTGGTAGCAAAACCTTTTTGGACTGAAACAATCAACAAACTTGATGTA AGTTTCAAACTTTAAAGTCCAAAAAAGATTCTTATCTCTTAAAGATCAAA TCCGATAATTTTATAATCTGAACCGCCTTTCAAAACTACTACTATTCAAA ATCTTATGATCAGGGCTTATTCTATCCCTATATCAGACTCGCTTAGCATT ATATTTCTTAAACAACAGAGTCATTGTTTAGGTACCAAAACTGGAGCCTA CATATACTCATAAACGTAATTCTTATGGTAAAAAACATGTATTTAAAAGG GATAATACCCTTGCTTTAAGTACCTAGAAGACGTAAAAATATTTTTGATA TTATATATGAAACGATGAAAGTAAATGCCTACATTATCTTACACGCCTTT TTTTCTTTTTTAGAAACAGGAAATCAAAAGGACTTCCACCGATATCATTT TTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071706TCONS_00071706Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071705TCONS_00071705Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071705-proteinTCONS_00071705-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_63supercontigscaffold_63:128107..140759 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
8.53 9.68 3.8 3.6 4.22 3.6 5.07 5.24 6.36 5.4 4.21 5.55 4.07 4.91 5.61 6.63 6.55 6.3 3.11 3.56 4.72 4.16 8.28 9.42 5.38 5.89 2.06 1.59 5.36 5.84