TCONS_00002265 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00002265
Unique NameTCONS_00002265
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2415

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00002265 ID=TCONS_00002265|Name=TCONS_00002265|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2415bp
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GGCCAAAATCCTTATTGTAAATAACGTATTTAATAGTGTTTGAATTTGTA
CCTTGAATTTTGATAAAAGCtgtttttaataagaaattGTTCTATATGGT
CAAGATTGCTAGATC
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00002265-protein

>TCONS_00002265-protein ID=TCONS_00002265-protein|Name=TCONS_00002265-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=615bp
MAYVLVFFLPFLIGLSNADDFFQIAPTDVNIYYDTPKKFERYCIPPGQSD
FVITWWRDDKRLGSQDKPNANINIPSRIKIRETSDLQSTKWHSVTPGSKI
SLLQINSVLPTDQGEYSCVATNKSGHFSAKFDVKVTDACRGGSFKCAIDK
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000019:647286..665359+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00002265 ID=TCONS_00002265|Name=TCONS_00002265|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=18074bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:647286..665359+ (Clytia hemisphaerica)
TCGGCCTCTGTTTTACtttaatttagatttaaaaaaccAAACAATGACTT
GATTGTTGGTCAACACTCAGGTTTAGCTTCTACCTCGACGGCACATCGAC
ATCTCAACATGGCTTACGTTTTAGTATTTTTCCTCCCGTTTTTAATTGGT
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AATCCACGAGGAAAGAATCTTAAAACAGAAGAACTGGTtctagttttgtt
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TGATTTTCAAAGTACTAATTGAACTTATAGCTACAGGCTAGTAATCATAA
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TAGATCTCCACCTACACTGCGATGTTTGTGACTGCCTTTAAATgatgcac
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GTGACTTTCTGGCTCTCAATTAGTTTAGTTTAATCCCCTTATATTGGGct
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GTTACAAATTTCAACGAAGTCTGCTTTCGAATCTTTCAAAGTAATTCCTT
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ATGGCTTACGTTTTAGTATTTTTCCTCCCGTTTTTAATTGGACTATCCAA
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CATAAATATCCCTTCTCGAATTAAAATAAGAGAAACAAGTGATTTGCAGA
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CATGTCGTGGTGGATCATTCAAATGTGCGATAGACAAGAAATGTATATTA
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AAGGCGACGCATTATGAAATCGAGATCACTTATCCAGATGGTAGCAAGAA
AATCATTTCTAAGAGCTCCCGATTCAATATTGCTGTCATTGATGGTCTTA
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GTTAGCAATTTTACTGACCAGATTACGGTCAGTACTAACAGTTTAGAAAC
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ACCTTTCGTTCACCTGATGGATCTGTTAAAAAGatttttcgtAGCAGCTC
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TGTCAGTGTAGTTGTTCCAGATGATCAAAACAATACGCCAGATATGAAGA
CAAAGAGCGGGCGCCAAAATGACAATAATATTCCTGACGGTAAAAATAAT
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Position
The following features are aligned
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Expression

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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
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Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00002265 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
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