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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002267 ID=TCONS_00002267|Name=TCONS_00002267|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=908bp
TCGTTCGGAAAGAAGATACGATGGAGTCACCATTACTGGAAACATAGATT
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GGTGTTGGCCCCACCGCAATTCCAATGCCAGGGGCATTCAGTGGTATCAT
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GCATCAAAGacataataataatgatatgtataagaaattgaatagtTGAT
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TTTTGATAAAAGCtgtttttaataagaaattGTTCTATATGGTCAAGATT
GCTAGATC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000019:657440..665359+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002267 ID=TCONS_00002267|Name=TCONS_00002267|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=7920bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019:657440..665359+ (Clytia hemisphaerica)
TCGTTCGGAAAGAAGATACGATGGAGTCACCATTACTGGAAACATAGATT
TATTCGAGGTTAGAAAATTtagagttatggagtaaggatTATAAGGATTG
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AACCATGACAATCTGTAATAAAAACCCAATATACATTTtggaagaaataa
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TGTGTTCAGAAAAGAAATGTAGCCGCGAACCACTGGTTTGagacgaaaac
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TTtgctatttgaaattttggtgttttCTTTCGAAATGGTAACTTCGCCCG
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TTAGGTGTTTAGTTTAAGTGGTACATAGCTTTTACAACGAAAGCAAGGGT
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ttttataagaaccattaaATTTTGTCTATAATCCTTGGCTGGTCGGGTGA
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ACTTTTCAGTATGACCAACCATACATTGTCACACTAGATGGTTTCGTTAT
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AAAAATGCGTGatccgcgtggttttcacacaaaagccagattgaaagtaa
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ggctAAATTCCATCTGTCATTCTAAATGCGGCGCAAATCTTAAGGTTTCT
CATATTTTGCTTTAGAAAAGTTGACGAAGATTTCTCTTCGGGCTTTAACT
TCAATGGGGAGTATATTAAATAAAGGCATACGCATTTTTTCAAGATAAAT
TCGCTGATTGAATGATGATTTTTATCGTCACTTTTCTTCGGTTACGTGAG
GCTCGAAGAAACAACATTTAATTACTCTTACATCAAATTGCGGTCAACTC
GAGCAGACGCGATAAAATATGAATCATCAATCAAAAATCTATTAACGTTA
CAAATTTCAACGAAGTCTGCTTTCGAATCTTTCAAAGTAATTCCTTGTTA
TGCAATTACGTCTGAAAGCTAAGTGGAGAAGTGCACCTACTGAGTTAAAG
TACTTTCCTTAAATGGAATATAGTGATCTCCTACGTGGCTCCTTTTTGTA
CATAACATTCAATAAGGTAATATGACATTTATTTGACGTAATAGATATAT
ACCACATATTATTGATGGGTTTTTACAGCGGAAAATAAGCGAAGCACCCC
CTATTTGGATTACAGTAGATTGATGCTATAAAGGATATCTGGTATATTGA
CGGTTGACAGGATTGTTGAAAAGAAATGTAATGAATTTTCGacagttgaa
attttttttcggttgaaTTTGTATTTATATTAAAGCAAGGTATGTTTTGA
TACCAAGGCTCAAAAAATAGGCTATCTAAATCATTTCTCGAACCTGTACA
TGATGAAACAAATTGATAAAGCCTTGTCACTACAAGTTTTATGGTTCACC
ACGTGGTTacggtggtggtggtggtaaAGTGGTTAACGTGCAGGTTCAAT
AGATACCATTTAGATCATCTGTGGCTTAACTTTCTCTGAGGAGTATCGGT
TATTTGGATATTCATCACATTGCAATATGCGCATAATTAAATTGATGTTT
TCTACCTCTATACACACGTGTGATGATTTCTCACTCAACCAGCCCCCAGA
GTACATCTTCTATTTATGTTTTTCAATCTTACCTGCGGTACTTACTGTAC
AAATTGTCGTTGAAAGTTCTCAATAAGCCCATAAGATATTTCTTGATGTT
ACTACAGTTAGAAAAGTTTAGCAAAGAGATTTAAATCTTGTAAGGAAACT
ACAATTGATGATTATGGGTAATCAGAAGGTCTTAGTATCAAGTAGCGGAG
AAAACTTTCTCCTCCTCTCTCGCTGGTTGAAGAAGAGTCTCTCGAAACGT
AAcataaatctcgtgatccaagccacgacaAACTTCCAATATGATAGTAA
GAAAAGTGTTGCTAAGAAGAGCTAACTAATGAGAGAGGTAggtaacccag
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gaacgttatattaacgttaaaacaacgttgtgtgccagctgggaattaGT
ATCTCATTATCGTATTAGCATCTGCTAGAGAATAAAGTCTTGCGCACGGA
TTTGACCTATCAAGGGTTTAACAAACATAGTGTTAGAGGCTTAAAGAGGC
TTAGCACTTCTAAATGCGATATCCAGTCTCCCATTATTGAATATCAGTGT
TTATCTCAGCGGGTAGGTCCATCGAGATGCTTTGTTTTGAGCAAATACCT
TACATTAAGAAAGTCTAGTTGCTTTTGAATTtagttttgaaagaaattcg
CTCTAGAGATGTTTGTTTATTTGTGTTTACTAAAGTGATATTGCTTGGTT
CAGACGTCTTTGCGGTTTGATATTCACTCTCTTGAAATAGATCTTatcaa
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acccctgaaacaattccacaatgcatcgctgttttaaaaaactccgataa
gggcTATTCAACTGGTTGATAAAAATTACTGTTTTCACTGAAATTTGAAG
TTAACgaagaatattttgattttatggaCTTGTGTTTTCTTGTTTTCCTT
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AAACGCCAGGTTTCATAGTGATaatttctaaaagttttaaTTCTAGAATC
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TTCAAAACACTCTTTAGATATTTTCAATGCAGTCAGTCACCCTTGGTCCA
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TCATTCCAGAAATCTAATTTTAAACTAATGATTTCTAAACAGTTANAAAA
TTAACCTTTCTATTTCAGAAATCTAACTTAAACTAATGATTTCTAAGCAG
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TTGGGAATCAATAACATTGAAGGGGGAACGAGGACAGGAAATTTCACCAT
TGACATGTACACACCGAGTAAGTAGAATTTAATGTCTTTTGTTTTTCCCT
TCGTCACGCCATTTATTAAGCAAATTCTTTTTGCACTCATCACTTAATTA
AGAAGATGgttaaaatttgtcatcacgtaaaaaaattcatgcatcaccac
agatctgtaaagcccgaagggctagatttacggcttttatcgaaaagtga
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AGTACTTTTTTTTAGaattaatgtttgccttttgggaatttaaattggtt
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GTGCAGGCTTATTACAAATGttagtttaaaaaaagtatttatcTATAGCC
CTTTTTACTATTCCATTGTACGTAGTGACAAAAAAAAGGAGAGCTCAAAa
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GAACCTGAAGCAGGTGTTGGCCCCACCGCAATTCCAATGCCAGGGGCATT
CAGTGGTATCATCATTTTTGCTATAGTGACAGCTGGACTTTGTGTTATTT
TGTTAGTATCGTTTTTCATGGCATGGCTTTGTAAATGGAAACTTCTCACA
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AGCCTACATTCTCCAGTCTGTTTGGCTTACTGACGTTAATAAAGACTGAT
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AAAGTGAATTTGAATTTAgagacaaaaataacaaaaaatcctGATATTGT
ATGTCGGCCAAAATCCTTATTGTAAATAACGTATTTAATAGTGTTTGAAT
TTGTACCTTGAATTTTGATAAAAGCtgtttttaataagaaattGTTCTAT
ATGGTCAAGATTGCTAGATC
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1491911889:657440..657497 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1491911889:657440..657497 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1510915933:657440..657497 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1510915933:657440..657497 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1575043694:657440..657497 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1575043694:657440..657497 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1491911889:663032..663156 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1491911889:663032..663156 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1510915933:663032..663156 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1510915933:663032..663156 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1575043694:663032..663156 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1575043694:663032..663156 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1491911889:664635..665359 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1491911889:664635..665359 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1510915933:664635..665359 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1510915933:664635..665359 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00002267-exon-sc0000019-1575043694:664635..665359 | TCONS_00002267-exon-sc0000019-1575043694:664635..665359 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019 | supercontig | sc0000019:657440..665359 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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