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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00003132 ID=TCONS_00003132|Name=TCONS_00003132|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1275bp aaaaaaaatcacaaaataacaaaaaaattagaaaatatttaGTTGAAAGC CATGGACAAAATAACGAAGATATTTGCAGATGTATTCAATGAACAAACTT GGCATAAAGTGAAAGATAACACATTAGCATTTTCTGGCTTGATATTTGGT GTTCTGGTGGTTTTCGTCCTCATTGCTATTGGTTGGTTTGTTGtatggaa aatgtttttagtTCGATTCCCATTGATACGCGAGCTGGTGTACGGTAGCA GTGCGGAGAGTGAACATAAATTAAAATCCAAAAGGACGTCATCTGCGTCC AGTCAGAATGGATTACAACCACGACGAAGCGCTCGGTTACGGCAGAAGCA AGCATCAGTTGATACTGTCGATGAATAATAAATCAAATAATATTAATGGA cttgtttatgaaattttgaactgATTTTTAAAACGGATGTTTTAATGTGC ACAGACCAATGTCAATCGAATAATAAACCTGGTCTGGAAGTCGGGCTGTA TTGAATTTAGAGGATGCCTTCGTTTTAATGGAGGTCCAATGCACTTATGG CAATTGTTACACATTTTTGGTTTCGATTTTGTTTGGGTGGCACAACATCA GTCAAGGGAAGGAAGAAGTTTCGCATGATTTCAATTAATGAGGATAATAA GAATTCTGAAGatctattttgaagattatTTCTACACTTTAATTCTGTTG AATCGTCATATATGGCTTTCTACATAATCAACATTTTTTTGGACAGATAA AAACCACTTTttcattccaaaaaaaaactctATGATTCAGTATTTaaccc tttttgaaaaatatgtaatattgttatATTAATGGTAAtagaaaatccaa aaatttgtacaaaattaGATATATAGTTGTTATACATTTTTACGTATTTA ATGCATTTCTCATAGGAGATAAGAACCATTTGGGTCACACTTAACCAACC GAACTCTAAAGTGACTAGAATGGCCAAATCGTACTNTTATACATTTTTAC GTATTTAATGCATTTCTCATAGGAGATAAGAACCATTTGGGTCACACTTA ACCAACCGAACTCTAAAGTGACTAGAATCGTActgatttcgaaaaatata agCCATTCTAGTCTTCTTTTTAGAGTTCGATGGATAATATTTTCTATTAG ggttttaaaaaacaaatttaacaggttttaattttaatcgtgcaagtttt tagttttaaaaaaatgtcttaatTTATAGTGTAGCTTGGTtatgtacttt ttgttttagctCATAAGCATGTGTT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000025:864436..868291+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00003132 ID=TCONS_00003132|Name=TCONS_00003132|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3856bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000025:864436..868291+ (Clytia hemisphaerica) aaaaaaaatcacaaaataacaaaaaaattagaaaatatttaGTTGAAAGC
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TGTGTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1491911889:864436..864616 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1491911889:864436..864616 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1510915933:864436..864616 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1510915933:864436..864616 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1575043694:864436..864616 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1575043694:864436..864616 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1491911889:865263..865597 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1491911889:865263..865597 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1510915933:865263..865597 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1510915933:865263..865597 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1575043694:865263..865597 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1575043694:865263..865597 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1491911889:867533..868291 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1491911889:867533..868291 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1510915933:867533..868291 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1510915933:867533..868291 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00003132-exon-sc0000025-1575043694:867533..868291 | TCONS_00003132-exon-sc0000025-1575043694:867533..868291 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000025 | supercontig | sc0000025:864436..868291 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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