TCONS_00047807 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00047807
Unique Name	TCONS_00047807
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1174

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_136:353439..370822-

transcript sequence

>TCONS_00047807 ID=TCONS_00047807|Name=TCONS_00047807|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1174bp
ttctagtgtactaataaaaaaattaattacacTAATAATATTCATAATGG
CTGAACCGAATGCTAAAAGAAGCAAGACTGACAGCAAAGGAAAAGTATGC
TTGGTAGGCAGTGGCATCGTTGGTCGAAGCTTTGCTGTCATTTTTTCCAA
AGCTGGTTATTCAGTTAGTCTACACGATACAGTCGAACAACAACTGAAAG
ATGCCATGATACTCATCAAAGCACAATTGgaagattttgaaaacaaagga
TTACTGAAAGATTGTATTCACAAAACTGCTGACGCTGcattttcaatgat
ttcaacGACACTTGATTTGAAAGAAGCTATGGATGGAGCATTCTTTTTGC
AGgAAAATGTGCCAGAGAACCTTGAAttgaaacagaaaatctttaaagaa
tttGACGCATTGGCATCAAAGGATATGATCCTCAGCTCCTCAACTTCGGC
TATCGTGCCATCAAAATTCACCCTCAATCTCAAACATACAAAGAACTGTC
TTGTCTCGCACCCTATAAATCCACCAGCATTGTGCCCGTTCATTGAGATT
CTTCCTTCACCAGAAACTGACCAGGAAGTAGTTGAGAAGACTTTATCGCT
CTGGCGTGAATGTGGAATGTCACCGATCACTGTCAAAAAAGAAGTCGCTG
GCTTTGTTCTCAATCGATTACAATACGCGCTGTTAGCCGAATCTTATCGA
CTTGTGGAGAATGACGTTTGCACCCCTGATGACGTAAATATCACTCTTAC
AGATGGTCTTGCAATGCGCTGGTCGTTGATTGGTCCATTCGAAACTGGCC
ACCTCAATGCACCAAAGGGTATCAAAGATTACTATGAGCGATATGGGCCA
CCAACGGAAGCCGTTCTAAAGGAACAATCAGAAACCGTTCTCAAGTTTAA
ACAAGAAACGATTGATAAAATCCACGAATCGATGTGTCGCATCGCACCCG
TCGAATCGATCATCGAACGATCGAAACTTCGAGATTCACGACTCTCCGCA
CTTGCTGTTCATCGGAATAACGAGAAAGCAAAATTGTAAGAAATTTTGTA
ACGgagttttgataacttttgattttgataatggTTTTTAATAGCAAGGT
AattcgtattttttacttttttacgcTTTTGTAGGGTAGATTTTGATCAT
ATTTAGTTAATGGTTAATTTTTNN

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_136:353439..370822-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00047807 ID=TCONS_00047807|Name=TCONS_00047807|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17384bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_136:353439..370822- (Clytia hemisphaerica)
TTCTAGTGTACTAATAAAAAAATTAATTACACTAATAATATTCATAATGG
CTGAACCGAATGCTAAAAGAAGCAAGACTGACAGCAAAGGAAAAGTATGC
TTGGTAGGCAGGTAAGGATTAGATTTTTGAAGAAAAAAAATAGAGCTAGC
ATTAGTGGGTTTTCTACCTGAGGCCAAACGACCTAATTTTATTATTACCA
AAATTGTACTAATTTGTATGTAGTCCTGATACCTGAACGAGTTGTTTTGG
GACATTCTTTGGATACTGACTTTAAAATCGTTGTATTGATTCGGCTTAAA
TAATGAATATTTCTGCCTAAACACGAGAAAAACAATATAGGGTCATTCCG
AGAAATTGTCAATCACAATTTGGAGACTGAACCGCCTCTATGTGCTCTTA
AATGTTGCATGGTCGCAGCGCTCTTAGATCCCTGCTGGCGCAGTATCCAG
TAAAAAACGGGTATGACATAACGCACTTCCTCTGGAATGGCCGTTTAGTG
TTTTGTGTAAGCTGTCTGTGATTTCAGTTCAATCTTTTATCTTTTTAGTG
GCATCGTTGGTCGAAGCTTTGCTGTCGTAAGTTTTCAGTTTTTTAAATAC
GCATCATACTGCGCAACATTTTTTCATTGAGTTTTCTATATAATCATTTA
GGCATAAACTTTACACTAAATACAATTAGTTACGCCGTTTTCGAGGGTAG
AATATGGGATATAATGAACCAGCAAATTCTGCATCAGATTTCGATTCAGT
CCGTCTATTGTGCTTCAAAACATTCAAAAAATTTTGTCCGTCTCAATCTC
TCTAATAGTTTTTATGAATCTTAGCGCGGGAAAAAATACGGTATATTTTT
TAATATCCCCATGATGGCTTATGGGTATTGAAATTGCGAGAAGATGTGGG
ATAAAAGTCCCGTTTTTTTAAACTAAGAATGCGCTAAGTTATCATCGAAA
TCTTTTACTGGTTTTTGACTTATTGCATACCAGTGTCTCGAACAAACAAA
ACAGGATCTTATTTTCCATTTCAGATTTTTTCCAAAGCTGGTTATTCAGT
TAGTCTACACGATACAGTCGAACAACAACTGAAAGATGCCATGATACTCA
TCAAAGCACAATTGGAAGATTTTGAAAACAAAGGATTACTGAAAGATTGT
ATTCACAAAACTGCTGACGCTGCATTTTCAATGATTTCAACGACACTTGA
TTTGAAAGAAGCTATGGATGGAGCATTCTTTTTGCAGGTATATTTTTATT
GTCATAAGTATGATAAAAAACTCATTTTTCTTTTTTAACACTTAATTTAA
TTCATTGTCAGAGTTCGATGGATGAAAGAAACTCATCTTCAACTCCAAGA
TATCAATGGGGTAGAGGTACCCTACCCGACGTTAACCTCTCCCTCCAAGA
AGGGGAATATCGCGTGAAGGATTATTCGTGAAGCCTTCTTTTTCTGGTCA
AAGTAGATCACTTTTCTGACTTTCCTTGTACTGCTAAAATGGAAATTATG
CGTGATCGCTTTCTCATTTTTAGACTAATTTAGCGTGGTCTTTGGGTGTT
ATTTGGCTTGATTATTCCACACTTTCTCCTTTTTTCATTTTGTAGGAAAA
TGTGCCAGAGAACCTTGAATTGAAACAGAAAATCTTTAAAGAATTTGACG
CATTGGCATCAAAGGATATGATCCTCAGCTCCTCAACTTCGGCTATCGTG
CCATCAAAATTCACCCTCAATCTCAAACATACAAAGAACTGTCTTGTCTC
GCACCCTGTAAGTGTATCTTACATAATCCTTTTGCACACCCCTGTGTCAA
TGAATCAAATAAGTTTTTTTAAGGTATTGACAATGAAATGAAAGTTTAAA
TTCAAATTTCTAATAGTAGGGGGAAACCCTTAGGAACCGTGACGTAACTC
TTGTAAATCGACTGAAAATGACATCAAAACTCAATTTCGACGTTAATTTT
ATCGAGATAGATCGGGAAATATCCACTTAAAGGTTTTATTTTTTTCATAA
GTGTTCCGTTTCATATCAGGACAGTGTCTGCTTATTGTTATATTATGCTG
ATATAAGCAAAAAGTTGTTGTTCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTGCTC
CACATCCGTGTCAAACTAATGTGAAAGAGCTTGTGATTTAAAATTGATGA
GTAAGCAAACGATGTCACTCTTATTTAAAAACAAAACCTTTAAAAGTCCT
CTATATCGTTTTTGAGAGCTTTCGATTGGCATAAGTGGTTTTGGGTTTTA
TTGACTTTGAAATGTCGTCAAATTTTTGGAGGTTTTGGGGTTTTGCCTGT
GACGTCATTTTTTGGGTCCTAAAAAAGTTTCCTTGCATGGCCGAAACCCC
CCTCGCGAAAAGATCTAAAGATATTATATTCTTTGAAATGGACCAGGTAT
GATTGCGTCGCATAAAAGATGTCACGGGTCCTAAAGGGTTTGCCCACTAC
TATAACAAGCATAATGCCCTTTTTAATACAATAATTTAATGGGAGTATCC
CAAAGTCAATTTCAAATATCCAAAATTTATTGAAATTTATCGAAATTTAT
CGGCTAAGATGTTACGTTGATCATTCTAGAAAGTGGTTAGAATGTGAAAA
TCACCGAGTTTAAAGCCCCGAATAGGCTAGAGAGGAATCTCGAAAACAAG
AAAAAGTGAAGCCTTAAGTTTGCCCCACATTTAGAAATTTTGTTTGAAAA
ACACACGGGTCACGTATTCTGGATGGGAAATAAGTGGCTTCATTTCCCAT
CCAGGAGTTTCGGATCTAGCCCCTTCGGGTCTTTAAAATCAATGGTGAAA
ATATCTGTTTATCTTTTATCAAGAGGAATTTTCGAGCCAGTGAGAATGAT
ATGAAAGTTATAAATTTTTAATAAGTGTTAACAATGAAAACGTGAAAATA
TCTGTTTATCCTTTCTCCATAGATAAATCCACCAGCATTGTGCCCGTTCA
TTGAGATTCTTCCTTCACCAGAAACTGACCAGGTAATTTCCGAATCCCTT
TTTTCAAATATAAACGTTGCGAAGATCAACTGACATAATAAATCTTTAAT
TATTTTCTCTGCTACAAATGAAAATGTCTAATGTTACAAAGATAAGAAAC
AGTGGAATCTCCATAACTAACAAATCTGTCCGAGTTGAGGAGACATTCAA
GTTATAGAGTTTCGAGTTAAAGTGACGCCACCGTTTTTTTTTTGGTGACC
TTTATTTTGCCTTTTTCGTGTAAAAGAGGAAACAATAAGTCTCAACTTTC
TGAATATTATGATGAAAATTGTCGGATTTGGCTGAAATTTGGCACACTTG
TTCCTTAAGTGATTATCTGGGGATTTTTTTTTCATTTTTCAGAAACTTTT
ATTTTTGGTGCCTGGGGTCAAGTTTTTCGCCAAAACGAGGCTAAAACTTT
GGGGCAGCAATCTGGATCAGGCTGAAATTTTGGACACACTTGTTCCTTGT
GGATGAATGAATGAATATCTGGGGGTCTACAATTGGGCCTATAAATAATT
TAAAGCTACTGAAGTTGAGATTGGCCCGTTTGAAAAAGGATATCTCCCAT
TCATAGGAAGTAGTTGAGAAGACTTTATCTCTATGGCGTAAATGTGGAAT
GTCACCGATCACTGTCAAAAAAGAAGTAGCTGGCTTTGTCCTCAATCGAT
TACAATACGCTTTGATGGGTGAAGCCTACCGCCTTGTCGAGGTAAGTTTT
TCAATTTCTTTTTTTTTTCATTTCTCAGTTTCCGTTTCAATTGTTTAAAA
ACTCCCAGCTGGCACACAATGTTATTTTAACGTTCATCTAACGTTATGTG
GACGTTGTGAACGTTAGATAAACGTTGTGTGCCAGCAGCTGGGCTATTAA
GTTATTCTGTAGTCAGGGTAAAACTTCATGCTATCGCTATTTTTTCACAT
TGTCTGGCTATCTATTATTCCGATGCCGGATTGGCGGCCGCCCACGTCAC
ATTAAAGTTCTAAAGGAGTGACCCAATTTCCCATCAGAGAGAGAAAATAA
ACGGCCTTTGATGTGCCGCATCCCCAGTTGGGTTCAACTACCCTTGCACG
TAAATCTGAAAATATTTCAGTTGGACTCGCCAATCCCCGCAAACGAGGAC
TTTGGTCTAGATATCCCGCTGCAAAATCCTTGACGCGGTCTTGCAAAATT
CCGTAATATAAACCTTCCAGATATTGGAAATTTTCCCGAGCTTCAGAGCT
TTAGCTTGTCGGATAAAGATTTCTGCATCTGGGTGCCAAATAAGGTGTCT
GGCTTAAAAGCGAAAGGTTATCGGTGGAAAAAATATTTTTGTCGTGTGCG
TGGTGCTTCAAATTAGCAATAAGAAAACCTCAAACCTAGTGACAGATCAT
CACAGTGGAAACCTGAGGAAATTATGACAGCTTCATTATCAATAAGACTG
ACAAAGATAACAAAGTTAGTAAACTCTTACATTATGTAACGTACACCAAA
CTCCTTAGAAGGTTCAATATTTTTTTATGGAGGAGCTATTCCATCAAAAG
AACTTTATAATCGCTCGCCCAATGAAACTTCAAAAAAAACCTCGTAAAAA
AACTTGCTTAAGAGCAATGAAACTCGAATTCGAAAACAAAAAATTTCCAG
AACAGCTGACAATATTGAAGGTCGTAAAATGATAAATGCAAAGTAAAAAT
TTAATCTTCATCAAAAATAAGAACAGAACAAAAACAACCTAAAGCTCTTG
TAATTTGATAACTAAAGTCTGTATTTTGATTACTTTTCAAGTTGGTTCAG
GCATAAGATTGAGCGAAGGTTGAGAGATGTTAATTGTTTATTATTTGTTA
TGTCCTTTGTAACTATGCCAACGATGAAACTCCCTCTCCCGTTCAACTTC
TGAGTTAACATTGATGATAGTGTTCTAGAATTTTGAAATTAATTTTCCAA
TCAGTTTTGCCAGTGACAATCAAATCCATCTAACAAAGCAAACATCAAAA
CTTTTCAAAGCGTTTACAAGTTCTTAACCTTTTTTCAGGTTGCAAGTTTA
TCTTCTTAATCTTAAAATAATGTTTCTTTTTATTTAAGTCAGTTTTTTTT
GAAAAATATTAAAAATGACCGATTTTCCCCAGGAATGGTCATGGCTTAAA
CGAAGATTGCACATTAAAAATATTTTAATAATTAATCATGTCATCAATGT
TGTTAATTAAGTTAGTTAATGAGCTTTTATCAATGATTGAATGAATTTAA
TACCTCTTTTCGAAGGTGCATTTTAACTTTGAAAGACTTTCAACAGCTAC
TAAATTTTATGATAAACTACTAAATTTGGAAGAATGAATACACTTTTTTA
TAAGAACAATTTCATAAGAACACGAGGCTGAAAATTGGTAAAAACCTAAG
AACAAATTAAGAACAATCCTCAGACTTCAGAGACTATAGAAAATACTGAT
TTTAACAGATTTTAATCCCCATTTTAAGTAAAGAAACTAAGCGTTTTAAG
AACATGGTAAGAACATTTTAGCCTGAAAAATTACAAAATAAAAACTAAGA
ACAGCCCAGCCTGAGCCAAAGTTAAACTGGTTCTTATAGAAAAAGCGTGT
AATTCAGTTTCAGTGGGAGTCAGCAAACATTCAAAGTCTATTTTTTATTC
ACCTGACATATTAAAACAATGTAACTGATTTTCAAATAATCAAGGAAGGT
CACAGGTGATTGAATCCAGTTCAAAATATTCATTTAGCTAAATTAAAAAA
TAATTATTTTGATGACAAACATTAAAAATTGAACAAATTCGTTTTCGAAT
AAGAGGGAACGAGAAAGCGTTTCTTTGATATTGAAAAGATTAAAATTGAA
ATGTTTCCATAAAGAGAATACCTACACGTTTTTTATAAGAACATCCAAAT
ATTTCGAAGCCTCCGGATGTTTTTAACTTTTTGCTAGTTTTAAGGCTAAA
AATGTTCTTAACATGTTCTTATTTTCAGTATTTTTGTCCATTTTGCTAAG
AAATCGGGTGTTTTAGAGTAAGAAACTTTTGTTTTACATTTTAACAAATT
TAATTTACACAAATAAACGTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAACAT
AAGGCTTCGATGGCCAAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAAGC
TTTGGAGACTCTAAAATACCCAATTTCTTAGGAAAATGGACAAAATGTCC
ACAAAATGGTGAAAATAAGAACATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTAAAAC
TAAAAACTGTTTTTTGTGTAGAATTTTCAATTGAGTGCGAATTTATAATG
GAGAGTTATTAATCTAAATCGACGATGTTCATATGTTCATGTTTGTTTGC
TCCTTGTTTGCTCCTCTGTGTACTCATATCATTTTTCCACATTAACTATT
TCATTTTCATTTGCGGTCGATCGTTTTCCGAGAATTTGAGCGTGTGGTCC
ATGAGCACCTTTAGTGACGTCAAAAGCGGCTTGGTCATCAAAGGGAGCCG
AATGAGCGGCGCAACCAACATCAAGTTCGGGTGCTTGATGCGGCATCGAT
CGAACATCATCCTCTCTAACACCATGTGCACCATAACAAGCATGATCTTC
AAATGGATCTTGATGTGCGCATGTCCGAGCATCATCATCCAAATTTCGGA
CACCTTGGTTACCTAGCAACGGTTCATTCTCGTTGATTTTTGGTTGACAA
CGTTTTAACATTTGAAGACATTTGTTGGATAAATTGTCCATGAATTCGAA
ATATGATTTTCTCAAATTTTTATCAACGAGGATGGTGATTATCAAGCTGA
CCATTGGGAAAAGCAACATTGTTGATAGTTGTGGAATTGGAACCGAGAAA
TCAGTGTATTCATAATAGTTTTGGTAAAAATCGATGTCAAAGCCTAAATC
ACAGAGTAAAGTGTTCATTGTGGTTGCCACTAAAGAGAACCACACAGTAT
GGTGTTGAAGTTTATTCCCGTACGGTCGATTTCTTGATCCGATAAGAATC
ATCAAAAGAAAGGATAAAACTGTTAGTATAATTATTCCTATGGCCATGTA
GTTTAATCCTACATTAAAGTCATCTCCTTGATGTTCAATGAGTATAGGGA
TGCCAAACGTGATAAAGAAAAATAGTGATTTGAGGAAAAGATGTATTTTG
TATGTGCCTGTCGGATGGAAAGTCAGAAAATATCTCATAGCTATGTATGA
GATGCAACTTATTTGTTGACTCAGTGTGATGCCTTTTGTGAAATGGTTTA
CAATGGTTTGATATTGCTCAAAAAAATAAGTATTGACACGTTTCCCCTCC
TCGATATATGGTGGAAGTGGTCTGAGGTAGATATACGATACATAAAAAAC
CATATCAAGCGCGTAAGACACCAATTGAAAAATCAAAGTTTGTTGATATA
AAAAGATGGCTGATTTTTCGATGTACGTTGATCGTTGAAGTAATCCAATC
AATAAAACATGCCAAAATAATGTCCAAAAACATACGAATCCCAAAATTAT
AGCATTTTTTCTCGCCTCTGAGGGCATTATCTCTGTCCATTGGTTTTGGA
CCCCCGTATCCGGGAATGTTTGATGATTATATTCTGTTTTAATTGAAACT
CCATAAGCATGATTTATCCAGATGCAAAAATATATGAGAAACAGTAAGGT
AAGGAAAAATATAAGTGAGCCGACAGATAATACCCTCATGTTGACGATGG
ATGTTCCAAATGTGTCTATTTGAATGTTGCTTTGAGCGATTTCTTATTTC
TACTGTTAAGACTTCTTTTAGTAAACAAAAGTTCTTGTTGAGTTTGTTTA
CCCAAGGTAATATGAGCGACTATTTGATATGATATGATATTTCGACAAAA
TTGTACTTTATAAAATTTTGTTTACGTTAATTGAACACATATGATGATTT
TTACTTTAGTATTAAATAACATTTAGAAATGGCACATATTTTTGGTAAAA
TTATCATCTTCGTTTCTTTGTTGTTTTTTATTTATTTTTGTGTTTGGGTC
AGTGTAGCAAAAACTGTTACCCTGAAAACATCACGCAGTCAAACAACCTA
TATAATTATAAGGCAATGGACAGAAATTGATCCATTACATGCAAGAGTTA
ATGCAATATCATTGGGACTCGTATGTTTATGGACATTATTTTGGCATGTT
TTATTGATTGGATTACTTCAACGATCAAGGTACATCGAAAAATCAGCCAT
CTTTTTATATCAACAAACTTTGATCATACAAATAATTGGGTACACCTTTC
CAATGACTTTTGTTTTCTATATATTTGTTTCTACATTCAGGGAATTCAAT
GACGTCAAGTGGTTGTTTAATAACTGGAAACTCGTTTTCTCTGCTTTTAC
AATGATTTTCGTTCAACAGCTACACAGCCTCCTTTACATACTTCTACGAT
ATATTTTAACTTATTATCGCAATGGGACCATTAACATATTACTCAGATAC
AAACTATTGTACTTTTTCGCAACACTAGCACTACCTATCATTGCATATTA
CCACCCAATCTACAACGTTAATCTTTTAGTGGCCGCTGGTTTAACTTTCA
GTTCCATCGCTGTTATATCGTTTCTGGTGATGATAGCTTTTGCTTCCAGA
TATCGATTTCAAGGCAATAAGCTTCGTCCTCACACTGTATGGTTCTTCTT
CATCATTACTGTATCATTATTCATTTTCGTCAATATGGTGTCAGATGTGA
GAGCTACTTTCAACCCAGTTGTTGATTTCTTCAAGGGACAACCTAATCTA
TATTTGTGTGCAACACTCATTTGTCCAATGGTCAGCTCAGTAATCACAAT
TCTCATCGACAAAAATTTGAGAAAATCATATTTCGAATTCATGGACAATT
TATCCAACAAATGTCTTCAACTGTTAAAACGTTGTCAACCAAAAAACAAC
GAGAATGAACCATTGCTAGGTAACCAAGGTGTCCGAAATTTGGATGATGA
AGCTCGGGCATGCGCACATCAAGATCCATTCAAAGATCNCAACGAGAATG
AACCGTTGCTAGGTAACCAAGGTGTCCGAAATTTGGATGATGAAGCTCGG
ACATGCGCACATCAAGATCCATTTGAAGATCATGCTTGTTATGGTGCACA
TGGTGTTAGAGAAGATGATGTTCGATCGATGCCGCATCAAGCACCCGAAC
TTGATGTTGGTTGCGCCGCTCATTCGGCTCCTTTTGATGACCAAGCCGCT
TTTGACGTCACTAAAGGTGCTCATGGACCACACGCTCAAATTCTCGGAAA
ACGATCGAAAGAAGATGAAAATGGAGAAGGGAATTAAACTTTGAATTATT
CCTACTTGAATCAAAGAACCTTTTTGGTTGAATGATGGTTATCTGAGAAT
ACTGATTTTAAAGATTATGTTTTTATTATAATTTACTCAAAGATTACGTC
TCTGAAGTTTTAAACTTCTTTTTTAGTCGCGAGTACAATATCTTGTTGTT
GTTTTTTTTACTTTAAAAAAATTATTACATTACATCACCTGTGCATCGAT
CAGCAACTCTGAAAAGTTTTATTTTTCACAATAATCTTGAAGTTTATAGT
CATACAAAGAATTTGATGAAAAATACTGAATTGATCCAATCCTTAATAAT
TTGAAAAGCATTGAGATGTAGTTGTCTTTGTCACTAATCATTGGCTCCCA
GTCCAAACCCCCCCCCTTCCATTCCATTTTACCTTTGGCTCATAAGATAT
TCGAAAAACTTTCTAAAATTCCTAGGATTCGATGTCCACTCCCTTTCTTT
ATAAGAACCAGTAAGTTTCTGTCAAGGCTCACTTGTCCTTAATTTTTGGC
TCTTTTAGCTTCAATTCTTTTCTTAAATTCTGTCCTTATTTTTAGTGTAA
AATTGAGGTATTTCAGACCTTTTATCAAATTTTTAATATCGACCTTTATT
TGCTAAATATTCAGCAATCCATGGAATGACCCCCCCCAGCCCGCAGGGGG
GGGGGCTACAAACAAAATCTTCCTGAAAAAGGCTGGGGCTGGATTTTTTT
TTAATTTCAGGGGGTACCTATGATCTCTGGGGGTATCTAACTTTTATACA
GTAAGGTCTGGGGGCTGGGGAACTATATTTTATATCTTGCTTTTATCTAA
CTATCATTATTCTTTTTAATTATAAAAATATACAATTTTTTCATTTCTTG
ACATATACTCAAGTCACAGGGGTTACCAATCACAGGGGTTACCTACTAAC
GTCTGTTGTTTGGGGGTACCTAAAATTCAGGGGGTACCTATTTTCTTAGG
AGGTACCTAAACTCCTGGTCCATGTCATGGCCAGGCTCAACTTTGCTCTT
AAAAATAGCTCTTATTATTTGTCATTTAATTCTCATTGTTCTTATAGAAT
TGTTCTTAAATAGAGTTTCGTTTACGCTCTTAACGTTTTTATTCTTACAT
AAGTGTTCCCGTTTCATATCAGGACAGTGCCTCTCCATTGTTATATTATG
CTGATATAAGCATAAACATATTTGTCTTCTCCTATTTCTGACCAACTTTA
ATGATACGTGGTTCGCACAATGTTTACATTTTACTACTTTTATGTCCCTT
TAACGGTTTTCTAGATTTTTTGAAACTCATTGCCTCTTGTTTCCATAAGA
AGCGCCCATCTAAGACATATCTTTATGTCATTCTAGATCTTGAATCCAAA
AACACATTCCTTAACCTTTTTGCTTTTTGCTGTTTTTCGAAATACAGCTT
ATAAAATTAGTTTTTGAAGGACTCCTGTGTATTGTCGTTCAAAATAGTGC
TGCATAACTGTGTAGAGCGAATTTATAAATTTATTTCAAGATTCAAAGTT
AAAAAAGTTTCCTACCTTACGGCAATCATCAAATACTTTTTTTCAGAACA
CTCTGTATGTTTTCTTTGTTTCAATCTTTCATAGAATGGCGTTTGTTCAC
CTGAAGATGTCAACACAACATTAACAGATGGACTCGCTATGAGATGGTCT
CTCATTGGCCCATTCGAAACAATACATCTCAATGCCCCTAAAGGTAGGCG
ATAATTGTCCATCATAGATACCATTCGATATCTCTTATGAAGCTGACCGC
TAGGAGCCAGTGTTTACGCGACCTGATAAAACGCTAGAGTCAACAATGTA
AATCAAACAGAATCAAAAATAGCGAAATTGAAGAACACGTTAATACACGG
GTTGCTAAATTATATCAATGCAGTCAAAACATGTGATTACTCGAAAAAGT
TCACGTGATTTTATTCCCATACTTGCTTTACAACTTGAAGCTGATAACTT
CATTCGTGTCAATAAATTCGAACTAATCAGAAATAAATGTCATGTAAAAA
GCGTGATTTGTCTTCGGACTTTAATTTTGCAACCTGTGTATTGAGGTATA
ACTTAAATTCACTTACCGAACAAACTTTTTTGTTGTTTGGAACAGAAATT
CGAAAAATATGTTTTTTACATATACCCTTCCCCTTATAGGCGTCAAAGAT
TATTTCGAGCGTTACACAGCCAGTATGGAGCCCATCATACAAGAACAAAC
AGAATCCAATACAGTCTTCAAACAAGAAACAATTGATAAAATCCACGAAT
CGATGTGTCGTATCGCACCTGTCGAATCGATCATCGAACGATCGAAACTT
CGAGATTCACGACTATCCGCACTCGCTGTTCATCGGAATAGCGAGAAAGC
GGGCATCGTTGTACCGACAACCGTCGGCAATACGATGAGCAACGAAGGAA
CAAAAGTGGAAAGTAAAGGCAAAATTTGCATCGTCGGAAGGTTACGATTC
TATTAACTCGTATTCTTTTACTTAACATCTCAAACTTAAAGTCAATAATA
ATACCTTAAACTTCAACATGATTTGACAAATACGTTAAAGTTATGGAGCC
TTAGTTAAGCTTATTCTGAGCTCCACACAGGACTGAGCTGTGAGCTGGTC
CCCAATGGTCTTACAAATGGAGGCCATTTTACATAAGTTACAAGAAAATA
GCAATGCAAGTTCATCTTTTCATTATGATTTGGCCAAAATAGACCAAAAA
TCATCCTTTCCCTAAAATATCTCCAGATAGGTAAAGAGACCCTGAAGTTG
ATTTTGAACACTGCAATGGCTTCTTTGCGGGTACCACTCTAAGTACCACA
AAGAGACTCTGGTCAAAGATTTTGGGCTGCCGAGTGAGAAACTACCTCTA
GGATTTATAAAAAGCACTATATGATTATACCTGATGGCGAGTGAAAATGA
GTTTGAGGTCTTTTAAAACTTAGGCCAAAAAGTTTGTTCTGGATTCTCAT
TTCATTTTAATATTTCTTATAGTGGATTGGTCGGCCGAAGTTTCGCTGTG
GTAAGTATAGATCGACAATTCCTCAAAAGCTTATTATCATCCTTTTCCCT
ATTAACAGATTATCACTTTAAAAACCATGGAGAGGGTTACTGACCAAGAT
ACTCAGCAGATTTCCTCTTGCCTTTGTAATGGCGATAACAGTTGCTCAAA
ACATTCGATTTTACTTTCAAATGAAATAACAGTAAATGGTCTTTTCCAAA
TAAAATTTCCAACCGTTGGCGGCTGGAAATGCCAAAACCCCCTGAATTTC
AGGCTCAAACCCTTTTGAATTCTGAATTTTTGTAGGATTTTAAAAGTCAA
TGGAATTCCAGTTATTTTTGACAGACTTTTGTATATCCCTATGGAATTCT
GCCACAACCTTACTTACCCCCTTGAAACTGAAATGGATCTCCTCAAGCGG
TTTTTTTTCTTGAAAAGCCCCATAAACATTCAATGGAACTTTTTGATTTT
ATTTCTTTTTAGATATTTTCCAAGGCTGGTTACTCAGTCTGTCTATACGA
CAACGTTGAAAAACAACTGAAGGAGGCCATGATTCTAATCAAAGCCAATC
TTGACGATTTCGAAAATAAAGGATTATTAAAATACACGGCTGTCAAAACT
GCTGACGATGCATTTAGTTTCGTCTCCACAGCAACAGACTTGAAAGAAGC
AATGAATGGAGCGTTCTTTTTGCAGGTATGTCTCAACGAAGAATGTTTTC
TTGTTTTCTATACTATATGAATAGATTTTGGATTTCCTCCAAATTTTCAT
AGAAGTCTTGGGGCCCTCCCGGAAATAATAACTTTCTTGAAATTAGAATG
ATTGATTGACTAATACATTGATCCAGAGATCCTTGTAACACAAAGTCTTC
CTAGAGATGAACGCATTTTTACGGGGAAATTCTTGCCAAAAAGTGCCTAA
AAAAGTTTTTTGGACTTTGTGTGGGAAATTGCTTCATTAGTTTTTTCTGA
CTTTATGCATAAAGATGGAGGGCAAGGTTCTCTAAAAGGCTGAAGCAGTT
TTTTCGGAAAATCTTTTTTGGCCGTAAAAATCGGATTTTCTTATTTGGGG
AAGTTCCCTTTTGTCATATTTTCATCTGATTCTTATCATCGGGTAGGTCC
ATTCAGCATGTTGCTTGTTGTTTGTGAGATTGAAAAACCTATTTTTGTGT
ACTCTAAATTCATAGGAAAGTGTTCCAGAGAACCTTGAATTGAAACAGAA
AGTCTTCAAAGAATTCGACGCATTAGCATCAGATGATATGATCCTCAGTT
CGTCTACTTCATGCATTGTACCATCCAAATTCACCCTCAATCTCAAGCAT
ACAAAGAACTGTATAGTCTCTCATCCGGTAAGTAGAGAAGTCATGTTTGG
TTATAAGTTACCGATTTCTACCATTTCTGAAACCATACGTTTGAATCTAT
AGAGGCGATCCCTTACTCAAATCGATTTTCATCAATAACAGTGGAAAATT
GCATTGCGATGCATCCTCTCACATCATGAATTACTGTTTGTGTTGATTTG
ATTTGAATGAAAATTATTGACAACCGAAAAGATTAAAGGCCCAAGTCTTG
ATTATGAAATTGGAGGGTTCAAAAATATATGAACTAAGGAAGCGCAACCA
TGGTTTTGGTGGACTAGAAAAGAATTTCGATTTTGACCTACTCATATGTT
TTAAAATGGCCCTATTTTAGACTGATTTTCCCCCGAATTGAAAAAAAGGA
AGACATTAATGAAGATTGATTTTACAACCTGTTAATCATTCCATATATCA
ATCTTCTTGAAAAAACATGCTCAATGCATATAAGAATTTATTTATTTCTT
TACAACAGGTCAATCCACCAGCGTTGTGCCCTTTCTTGGAGGTCGTGCCA
TCTACTGAAACCAACCAGGTACCTTCATAATGATCCCTTTAAACTTAACC
TAATCTAGAAATGGTCATCATTTTCTTACGGGTACGGTTAACCTCTGTAG
GCGCTTGAAAATAAACCATTTGAGGAAAATAGTCAATTTTATAACGAGGA
TCTTGTCCCGCGCCGGAGCAGATGTTTTTTCGTTAACTGAAGAAGACCTG
ATTTAACGGCCGAATACCTGAAACTGTAGTTTTCGCTAATGTAAAGGCCG
ACTGCTTGCAACTTCGGCTGAATACCTGAATTTTCTCAATTGGTATAATT
CACTAGCGGTCGAATACCTGATTGGACGACCGAGGATCTAAAAAGCTTTG
TTGTTTTCTGTCACTCGAATTATTATCAACCGACCGAGTACTTGATGAAT
TCTAATAAATTACACTAATCAAGAATATTCAGGTATTCGGTCGCATTTGT
AGTTATTCGTAGATTTGCGAAAGCCGCAGTTTCAGGTATTCGGTCGTTAA
ATCAGGTCTTCGTTCGTTGACGGAAAAAAATCCACCTGGCTGGTATGGTA
TATATTTTTTTCGATATGGACATCTATTACTTCTTCCGAAAGATCTCCCC
TCCAAAAGTCTTGACCAGGAAAATTGTTGAGCAGTGTTGAGACATTTTTG
TTTTGACCCTATTTTTTGCTATTGCATTATTACAACATTGAATTCTACAT
TAGTCTATTTTCATTCTAAGCAATTAAATTTTTTATTGAATTCACAGGAA
GTAGTTGAGAAGACTTTATCGCTCTGGCGTGAATGTGGAATGTCACCGAT
CACTGTCAAAAAAGAAGTCGCTGGCTTTGTTCTCAATCGATTACAATACG
CGCTGTTAGCCGAATCTTATCGACTTGTGGAGGTAAAAAATATGTAGTAC
ATTTTTCATATGGTACCCTATTTTTAAACACAATCACGTAACTCTGTTGT
CATTTGATTTAACGAAGCGCGCTCTTTGCAAAATCAAGATAGCTTATTCA
CCGCAGATAGTTTAGTTTCACGCATTCCTTTACAGCTTCAGCGTTGTGTG
CAAAAAACAATGACAATCTGATTACAGGTCACTTAAACTAAACTGTGCAT
CTTCCGATCTAAGAGACATAGGCTAAATTAAGAGTAAAGTAAGGATCTAT
GATAATAGTCCGTGGGGTGGAAATTTTGTTTAGCTTTTTTTGAACGAATA
TTGCTTATAGTAGAGAAATTTTCGAGAGGAGGTTTATGGCCTAAAGATTG
ACGTTACAGGTAAATTGCAAGGGAATAAGTGCATAACAATCGATTTCAAT
TTCTCGATTTATTTAAAAAAAAGCTACCGAGAAACAATTTACTCTCTGTT
TTAGATGCAAATACCCTGTGTCAGGGTTAATAAAAAAACTTTTTAATCGC
TCAAAAAGTTGCTAAATACTATTGATTGGGAATTTCTTTGTGGGGGGGGG
GGGGGGTTTTGGGTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGCGTACTAGGTT
CCTTGTATGACGTGTGGGTGGATGTTATCCGAGCTTTAAAGTCGGAAATT
TTTTCGGTCAAAAATCAAAGCAAAAAAACTTCGTGACCCTTACTGAGACT
TTTTAAGGTCAAAAATAGATATTTCCTTTTTTTGTTTGGAATTAGATTAT
GATTTTTAGACCTTTAATGGGAAGGTCCTAAAAGGTACCTTTAAGTGCTC
TAATACTGCACACTCAGTATAGATACCATAGATATTTACCATCAGTGATC
GTACACTCACAGTTTTTAAGTTAAGTTTTTCCTAACGACCTAACCCTTTT
GGAGTCTTTTTTTCAAAAATAAGTGGGAGGTATTTTTGTAAGCATTTTCT
GAAGAGCATTCCACCATCGTATCAAATGCAACTTCCATGCGTATAAAATA
AAGGTTTGTTTTGATGTGCTAAAAACACCCCTGTGTCACAGATCCGCTGG
AAGCCTCAGCCACGCTGGAAAATCNAGCGCGCTCTTTGCAAAATCAAGAA
AGCTTATTTACCGCAGCCACGCTGGAAAATCTGGCAAAAATTTCGTCCCC
GGTAGGAAAATACCCTGGAATTTTAGCCCCACTGGGAAATTGACTTATAT
TTCATTCCCACTGAATTTTTTAACCTTTGAACAATATAGTTTCTATCCCC
ATTGGGATTTCAATAGGAATTTTTATCCCCACTGAGGAAAAAAGTTCCAC
CGGAGCTGTGAGACAGAGATGTTAAAAAGAATTTGGGCGAACAATGAATA
ATTCATCCACAGTTAACATTATTTGATCTTTCAGAATGACGTTTGCACCC
CTGATGACGTAAATATCACTCTTACAGATGGTCTTGCAATGCGCTGGTCG
TTGATTGGTCCATTCGAAACTGGCCACCTCAATGCACCAAAGGGTAAGAT
GGTTAACTAGATTTCCATAATGCCTAACTGACCATGTCCGGACTTTACGG
TTTAGCATTGATTCGGTACGGGTTTTCCTAAGGAATCGTTTTGCTTTGTA
ACATCATCTTTTTTGATGTTTCAATATTTTTTGTGTCAACACAGCGTAAC
TTTTCCATGGACTCTTTTTTCATTCTTAGTTTAGGCCATTTGTAAGCTTT
CTTGCTAATTTTGGTCATTGTTCAATTGTTTCTACCCAAGTGATAGGTCC
ATATAGATTCAGCGACATGTCAACTAAAATTAGCCAAATCTATAGTTGGC
TTTTGTTGATCCTGGGGCCTTCCTAAAATCTCTTTATGAGATTTAATTAT
TGAGTTAAGGCCATTTGCAAACATTTTGGCTCATTTGGGTTAGTGTATAA
TTGTTCTTAGCAAAAAAAGTAAAAAACGCTAAATCTGTAATTTGACTGTG
TTGATCGTGCGACCTTCCTTATAGCAAGCTTTTTGGCGCATTTGGTCTGA
ATGATTTTAAGATCACCTTTTTGTTCAGGTATCAAAGATTACTATGAGCG
ATATGGGCCACCAACGGAAGCCGTTCTAAAGGAACAATCAGAAACCGTTC
TCAAGTTTAAACAAGAAACGATTGATAAAATCCACGAATCGATGTGTCGC
ATCGCACCCGTCGAATCGATCATCGAACGATCGAAACTTCGAGATTCACG
ACTCTCCGCACTTGCTGTTCATCGGAATAACGAGAAAGCAAAATTGTAAG
AAATTTTGTAACGGAGTTTTGATAACTTTTGATTTTGATAATGGTTTTTA
ATAGCAAGGTAATTCGTATTTTTTACTTTTTTACGCTTTTGTAGGGTAGA
TTTTGATCATATTTAGTTAATGGTTAATTTTTNN

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_030419	XLOC_030419	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_136	supercontig	scaffold_136:353439..370822 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.833785	0	0	1.00095	0	0	0.709784	0.549972	1.72569	0	0.00032358	0	0.348771	0.513423	0	1.09963	0	0.962645	1.83196	0	0	1.65266e-07	0	0	0	1.99022	0.544628	1.31896	3.60404e-08	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00047807 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CRYL1 (Lambda-crystallin homolog OS=Homo sapiens GN=CRYL1 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 261.151 bits (666), Expect = 1.525e-83
Identity = 128/312 (41.03%), Postives = 208/312 (66.67%), Query Frame = 2

Query:   77 TDSKGKVCLVGSGIVGRSFAVIFSKAGYSVSLHDTVEQQLKDAMILIKAQLEDFENKGLLKDCIHKTADAAFSMISTTLDLKEAMDGAFFLQENVPENLELKQKIFKEFDALASKDMILSSSTSAIVPSKFTLNLKHTKNCLVSHPINPPALCPFIEILPSPETDQEVVEKTLSLWRECGMSPITVKKEVAGFVLNRLQYALLAESYRLVENDVCTPDDVNITLTDGLAMRWSLIGPFETGHLNAPKGIKDYYERYGPPTEAVLKEQSETVLKFKQETIDKIHESMCRIAP--VESIIERSKLRDSRLSALA 1006
            + + G V +VGSG++GRS+A++F+  G+ V L+D  +QQ+++A+  I+ +++  E  G LK  +  + +   S+IS   +++EA++GA  +QE VPE+LELK+KIF + D++    +ILSSSTS ++PSK    L H K C+V+HP+NPP   P +E++P PET    V++T +L ++ G  P+ V+KEVAGFVLNRLQYA+++E++RLVE  + +P D+++ +++GL MR++ IGP ET HLNA +G+  Y +RY    + VL+     + +F + T +K+++ MC   P   E +  R + RD  L  LA
Sbjct:    3 SSAAGCVVIVGSGVIGRSWAMLFASGGFQVKLYDIEQQQIRNALENIRKEMKLLEQAGSLKGSL--SVEEQLSLISGCPNIQEAVEGAMHIQECVPEDLELKKKIFAQLDSIIDDRVILSSSTSCLMPSKLFAGLVHVKQCIVAHPVNPPYYIPLVELVPHPETAPTTVDRTHALMKKIGQCPMRVQKEVAGFVLNRLQYAIISEAWRLVEEGIVSPSDLDLVMSEGLGMRYAFIGPLETMHLNA-EGMLSYCDRYSEGIKHVLQTFG-PIPEFSRATAEKVNQDMCMKVPDDPEHLAARRQWRDECLMRLA 310

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00047807 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00047807 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CRYL1	1.525e-83	41.03	Lambda-crystallin homolog OS=Homo sapiens GN=CRYL1...	[more]

You are here

TCONS_00047807 (transcript) - C. hemisphaerica