TCONS_00052325 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00052325
Unique Name	TCONS_00052325
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4287

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_213:186463..202094-

transcript sequence

>TCONS_00052325 ID=TCONS_00052325|Name=TCONS_00052325|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4287bp
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transcript from alignment at scaffold_213:186463..202094-

Legend: exon

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>TCONS_00052325 ID=TCONS_00052325|Name=TCONS_00052325|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=15632bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_213:186463..202094- (Clytia hemisphaerica)
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ATCAAATCAAACTCTACGAAACAACCGACTCAAATCAAAATTGACCATAA
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GCTCGGTCTTGTTCGGAGACCCATTTTGAAATTATTTTGACTCTTTTAAT
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AGTTTTGGTGCGAATCACAGGGGACTGATGTTTTTTACCTAAGTATTGCG
CCTTGCGCAATAGATAACATTTTTATTCACCTTGAAGTTTTTGACTGCGC
TTTTTGACGATCCACCCTATTTCTGTTTTGTATTCTAAGTGTTGTTTTTA
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ATTGTTCCGTTTAGCCAGGATAATTAGTGTCGTGTAACAAATTATAAAAA
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TAAAAAATCTGAATTCAATTAGTGATAAAGAAATGCTCACTTTCTTCGTT
GTGATTTACTTCATTTTTTCGAGGTCTAAATCAGCTTCTGTGTGAATATT
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GCGTACTAACTTAAGATAATTGTCCTAGCAGCTTGAACTCGATACTTCTA
ATGATTCCAAGAAGGTATGAAATAAATGAGAAAACTTCCCGGTTGTCTAA
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TATTATTTTGCGAAAAATACTTGAAACCAGATGTTGTTTTTGTGTCGTCA
ATATTGCTATCTTAAATCAAGGAACCTGTTTAAATCCCAGAATATGAGAC
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TAAGCTTACACTTTTTTGAAATGAGTGTCGTTACTTTGAGATGGCCTTGA
AAAAATACAATCCACAAAATGAAGGGAAAATGAAAGCAAAAAGGCCTTTA
GTCTTATGTAAGCAAAATCGTGGCGTAACTTAAAGGTGTAGCATAATTTG
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TGTTTGATGAACTTTCATTATTTTTCACAGTTCTCCTTGATCACAAATTA
TTTTTTCTTTGATTTCATTTAGGATGAAGTTGTGGAAGCTAGCCGTCAAG
TTGTTGTGGAATGTTCCAAATTTGCTGCTTGGGAGTGTACATCAAAGATT
TGGCATCAAAGCTATGGGACCACTCTGTATGATGGAGTTGAAGTGGACAA
GTTAAAAGCTCTCAGTAAAAATCAACAGAAAATCATACATAGAAATGATA
ACTCTCTCCGAAAAGTGAAAATTTTGAATTTCCCGCAGTACAACCGGTAC
AAAACATGCATCAAAATGCTCAATCTTGGTGTTCCGATGACTTACTTTCA
GCTTTTAGCCAGGGGTGGTTTGGACATCAAGAATTTGAACACTTTGATTT
TATTTTCTAAGAAACAATTTGAGAAAGAGGACGTGGAAGACTACTCGCCA
ACACTAGACGTACCAGGTTGGTGAACTTAGATTTCAATTCTGATACAGAT
CACTTGGTAAATACAATTTTCAAGATTTCATCTAGAGAAATTTTAAAAAT
GCGGAACCCTATTCGAGGTTATCTGATAGTCGACGTCAAACTTTTTACGA
CACGCTAAAGGCTCTGAAGTTTGGGGAAATCTTTAACTAGGGGAAGGTTT
TCATTATTATAAATTCGATCTCTTGATTACTGATAGACAACGTCCTTTTC
AACTCTTTACCCAAGATTTTGATATCCTCATCTTGCTTTTTCATCAATTG
AAAAACTTTACTTTTTCTGTATAGTTCCCGTATTCAAAGGTCGACCTCGA
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CTCAAATCAAAATTGACCATAAAACGAATGGTAGAATCGGTCCTATTCTG
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ATACGATTTGTCATGAAAAAAGAGAATACACATTAAAGGTATTATTTTTT
ATTTTTTATTTTGAAAGCAATCACAATACCCTAGAAATAACCACAATAAT
TCAAACGGGCCTTGTGAGAACGACAGAAGCCTAACCGTAGCTCGGACTTG
TTCGGAGACCCATTTTGAAATTATGTTGACTCTTTTATTTCCTTTTGGTC
TTATTTGGCCCTGAAAATCATCAATTTTTGTGTATTTCAAGTTTTGGTGC
GAATCACAGGGGACTGATGTTTTTTACCTAAGTATTGCGCCCAATAGATA
ACATTTTTATTCACCTTGAAGTTTTTGACTGCGCTTTTTGACGATCCACC
CTATTTCTGTTTTGTATTCTAAGTGTTGTTTTTATCTCTTGAATTGTTTT
GAAATTCTCTAATAATCTTTCTTATCCGATTTTGATTGTTCCGTTTAGCC
AGGATAATTAGTGTCGTGTAACAAATTATAAAAAACTGTAAAAACTTTCA
ACCGCGGTAGAAAATTTCGTTGAAAATCCTGCCGTAAAAAATCTGAATTC
AATTAGTCATACGAAATGCTTCTTTCTTCGTTGTGAATTACTTCATTTTT
CGAGGTCTAGAGCAGCTTCTGTGTGAATATTGAAAGTCGTTTCTTGTACA
AATCAATCAATTCGACGTGTTTGATCTTGTCTTAGCTATGAAGCAAATTT
GACACCAAACGTTTTTTGATAATCTTGTCAAATATAATTAAATGCCAAAC
CATTTCTTACTGCGCACTGACTTGAATTGTCCTAGCAGCTTGAACTCAAT
ACTTCTAATGATTCCAGGAGAATACCCGGTTGTCTAAAGTCGTCATTCAT
TCCTTATGTGCCATTATTGGAGGCAAGGAAATGCAAGGTATAATTTAAGA
GGAAATAGGATGTTCAGTTGATTTAAAAAAAACCTTATTTTGCGAAAAAT
CCTTGAAACCAGATGTTGTTTTTGTGTCGTCAATATTGCTATCTTAAATC
AACCTGTTTAAATACCAGAATATGAGACTTTTTTTTAATCCAATGAGTTT
TTCTTAGGATAAAGAGGAACACCATCGATTCTCAGAAGATTTGCATCGTT
ACATGTTGAACAATGGAACACCGATTCTCAAGATACCACGTATCGGCTGT
GCGCCAGGTAAGGATTGAGGAAAAGCATTTTTTCGTGGTTTTCTGATTAT
TGCTCTGTTGATTATTTTTTGCAAATAATGCCTTTATTATGTAATACGAT
AATTGAAGTTCTGTTGTTTAGCTTCATTTAACTTCTAATGATTTTCGAAA
TTAGAACACTTGAATAATTTTGTGTCCATTTCAGATGACGATGGATGTTA
GGAAAGTCTCAAAATTTCTTTTATCCCTGTTTGACCGATTGTCGTTTGCT
AAAATATTTCTGGAATTCGAAATAAATGCTCAAATTATTTCAATTCCTTT
TTTATTCTTTTTCAAGTCAACCCATTGGTTTTGTACAGAGCTGTCATGGA
TAGAGGCGGATTTGCACAGGTGAGATAACCATCCATGATTTATTTATCGT
TTAAAAAACCTGTACGGGTCAACAATTAACGAAAACCGTGAACGTTTATA
CGTCTAAAGTATTCAATAGTGACTTCATATATTAACCCTATTGAGACCCC
TGGTATGACTGATACCTTTTGGAACAACCCGCAGATTTGACCAGCGTAAT
CGAGGACGGTAAAAGTGCTGATTTACTGTCGTCTTCAGTCCGTATAACTC
TATCTATCCCTATCCGTCACAGGAAAAACGCCATACATAAACTTGAATTC
TTGCAAGGCTTATGAAAAAGTAGGTGGGAACCAATGGTGTCCCCATCGAA
CTTAGGAGGATTTTTTTTCTTGTCAAGCGCTCACCCTGGGCGCTCACTTG
TTGCTATCATCCTCGAAGGAAGTACTTATGATTTATCATTACGTTTACAT
AAACCCAATTTAAATGATTTTGTGGTCTCGATGCAATATCTAGATTTTAA
TTCGATTTTCAAATCGCAATAAGTTTGGCCACTTAAACTAAACTTGAAAA
CGTTGGGTCTTTCCTTTGTGACTTTCCATTGTCATCTTGTTGTCAAAATT
AGAGAGTTGATGCGTGTTGTTGTGCTTATAAATCGCTCATATTCTGATTG
CGTTGATCTTAAGTAAGTATTCAAGCTTCATGTTTTGAACTATCGTTTAA
TCTGGAGAATTTTTTAAATTATAAGATTTTTAGCATGTAGTTTTAGAAAG
CTCTACGTACTGGAAATATATACTCGCTACGTATAATCTTTCCATACAAT
ATAAAGAAACCCGAAAACTGTGTTTGGCCGTTTACGATAGAAAAATGACG
CAACCAAGACTTGTGTGTGTTAAAGGTTTTTCAGTGTATCATTCTTTTTT
CGCAGGTAACATTACATCGTAATTGGCGAGACGTATACGATTGTTTGGGC
CATTCCACTATGATCACAAACGCTGCTACTGCTACAAGGAAGCTCTATGA
ACGGTAAGTACCGTATTACTTCAAATAAAACGCCCGCGCCCCGGGCGTTT
ATTAATTCATTTCTTTAGGAGGGGGCATCTAAAAGGAGGGAGAGTTTATT
AAATAATCTATAATGAAGGTCACTTTTAAATGAAGTGTGAGTTCGAATCA
TAAGTTAGAGATGAAAAACAGGTCAAAACCAGTTTGAATTCAAAAAGAAT
ACAATTGTTATCATATATCTAAAGTTTCTCTTATTATAATTCCTTACATC
TACTTGTATCAAATAAACTCCCCTCCTGGAGGGGAGGTGTTTATTTGAGG
GGGCGTTTATTGAAAATTATCTCTCAAAAGAGGGGCGTTTAAAATTTGGG
ATCGTTTATACGAAGTAATACAGTACTAAAGCAATTGCCTATACAATCAA
ATCTCGTTAATTCAAACTCTATCATACCCATTTATCTTTGATTCGAACTA
AAATATTGGTAAACATTTTCCCTCAGCTGGGAAACCGTATTCGAAAATAT
TTTCTATGTTGAATCTTTTTCTTATTCGAGGAAATGTTCCCTTTTAATCT
TTAGAATGTTGCTTCCCTACGAGAACCACATGCGTAGTAACCCTGGGAAC
CCTGGGAAAAGAATCAGTGACAAACGCGCTCACCAAGCCACCCTACCAAA
ATTCAGTTCCAATGATCTTATACGACCTCGAGAACATTTTGAACACAAGA
ATCCTGAGCAACAGACACACAGACAACAGCAACAACCTATCGTTATCGCA
CCAAAAGTCCCGCATGTTAATAGTATGCCACAAAACGCAGTTAACAGTGC
GGAAAATCTCTCTATTTCCTTAATGATGTCCAAACAACGTGGTCGCCCGT
CTAAGAAATTCCGTAACCAAATCGAAAAATTACGGTCTCGTCAAACGATG
CAACTCAACGAAGAACAGCAACACGCCCCGATGTTTGCAGGTAAAACCGC
GCGCCTACCACCCCGCAAACAACCCTGGGTTAATGAACTTAACGTTGATA
TTGCTTCGCGTCAGCACACGGAAGTGCCAATGTCTTCAAACCCCGCATTT
CGCAATAAAGATAAAGAAAGGCGGTTAAGTGATAGCTCAGATATAGAGCT
TATTTCTCCGCGTCGGGGCACGGAGATCCACTCGCCGCTTCGCCAGGGAC
GCCGAATATACCCTTCAACTAAAGATTCAGTGGGTACCTCGTCAAGTGGA
ACGAACGGGTTTGTTCCGGACGCTTTTGTATCAAATGTACACAACTCTAC
GGATAAAGAGCAGCCTAATTCACAGAAAAAAGGTCAATGCGAGTTCAAAA
TTCAATCAGTGCGTAGCTTAGCAACAGTTGACGAAAACAAGCCTTCATCT
TCACAGCAACCGAATGAAGCAGCCTCTTCAGGCACCACCCAGTATGTTCA
TTATCCTTACAGTACAACGAACACTTATGAATATATTCCAACCAAATTCT
ATTCTCTAAGTGGTTCCAATAAACTGGTACCCATTAACGCTCTACCTGTT
GGAAACTCGGGAAAACAACCTACTCAGAAAGCAATGTTCCGCGATGCTGG
ATTTTCGATGCGGACTTTTCGACACGATCAATCTGCAGACAACACTTCGT
ACAAAATCAAATCGACTGCTCTTAAAAATCACGAACCTTACATAATACAT
CACCCTTCGCATTTGAATAGAGGTTACCGTGAAATTCCGGGACAATATCC
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GCTCTACAAATTACGTAAGGCAAGATATGCGGTACGTCACGAGTGCTCCC
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GCGCTACGAAAAAATCTCCCCACGTAGTTCCGGGACAACGTCGACGCGTG
GGCGAGGGCGTGGACGTGGACGACCGCCGTCACGCCCATCCTCGTCTACA
ACTTACGTTAAATACATCGATCCGCCGGCACAATCAGTTCAAAAGTGGCC
TGCTGGTACAGAGCTATTGAAAGTTAAAGCCCATGTTAATATGTGATTTG
TCCATTTTGAATAGGTCGATGAAAATGTTTTATTTAGTGCTTTGTTTGTT
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CTTCAGATGCTTCTATATTTCGCCTGATTGGTAGTCTGAATCGCAGACCT
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GTGATCGGTAATCATCAGACATTTTTTGGTTTCCACCGGCCATTTTGAAG
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ATGTAACGAAGCACTTTCCCTGCTCTCTTTTATTTGTCACTTGTTTTATT
TTCTCATAATCAGTAGCATTCAATGACTAGAGAAACATTTAGTGGTATTT
TAAACCTAGATCTTGAGCTATTTTGTCACTCC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_033089	XLOC_033089	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_213	supercontig	scaffold_213:186463..202094 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.452631	1.03919e-06	0.0092932	0	2.13766e-07	6.63047e-09	0.570102	1.21358e-09	1.63482	3.70937	1.5793	0.0859152	3.24859	3.59881	1.72479	0.866765	3.66546	0.0807176	2.25574	2.19407	1.58369	1.0299e-05	0.84946	1.67047	5.55411e-06	0.160015	0.638964	3.54986	1.91147	3.86111

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00052325 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00052325 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00052325 (transcript) - C. hemisphaerica