TCONS_00061303 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00061303
Unique NameTCONS_00061303
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2770

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00061303 ID=TCONS_00061303|Name=TCONS_00061303|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2770bp
GAATTGAAAAATCCTGGTGTAACGACTCTGTTTGGCGACAAGACAAAGAC
TCTATATGTCCCGATCTTGGATTTCAACCGGGACAAACGCTGAACATCAG
GACAGTGCATTACCGAAAACATTAGAAATTCAACTACTGTCTTAGACAAT
CTATATTTTGTTGTGGCTTTGATCTCGAGACTTACATTAGTAcaaataca
gtcaactctctctctaattcgaacttctttaATTGGAATCTTTTGTGTTA
CtcgaactaaaacattgatTCTTTTAACTGGAAAACGGTATAAAGTACTT
CAAATAATTTGAAGAAGATTCTCTATCCCTTGAAAATATAATTAGAGAGG
GTCTACTGTAGTGGGGAAAACATCCCACACCTTGTCCGAttatgggagaa
gaatctctcgaaacatAAGTAAATCTcatgatccaagccacgatgaGCTT
CAAATAAATATGGTCTGAATTCTGCTTAGTCTCTTTCAGCCagttttctt
ctctcgcctctAACAAACACAACGTGACCGAGCATAACAGAAACAATAAA
ATCGCCATCTCTGTTCATCAGTTAGTTTTAGTCGTTATTTTTCTAACACC
CatatcttttgtaaaaaataacatTTGTAAATATCTTCTGATCAACTTTT
CCCTTTGTTTTTATTGGGCTTCACTCACCCCTGCGTCTTGCTTTACATTC
TAAAGCTTAACTTGGTTACAGATAAAATGATTGGCCTAAAATTTAATCAA
TAGCTCTACAGATTTTCAGCTCTCCTAGGAAACAATTTCAGGGGGAGCAA
TTTTCTTTGAAGTTCTATCGCTTCTCTTAAAACCCTAGGAGAATTTAAAG
AATTCGTCCACATAAATTGGGTATCAAACCGCAGAATTGTCCTTTGTAAA
GATCGACAAAGATTAGTTCCCTTAAAGATTTCCAATATCCGGGAAATGTT
ACCATAAAACAACTATCAACCCTAACAGCGCGCTCTGGGGCTGGTAACGA
AAATACAAAGCGAATTTTTTTGATGTAGGATACCCTTGAAGCGATGAAGT
AACGTCAATATAGTTGAGCTATTTGAACCATTTACCTTTATATatcctgg
accaagtttctcaatcccggccaaactaaatctttgatcggagtttttcg
GAGTACCCTAATAGTAGCACTAAtcaatagcggtgaaaatgcatcgagag
cgctagatctactgtTCCTCCAATACTTTAGTTGATGTAGCGCTGTttaa
cgttaatttttaacattacaatggcttcttctcgggtaccagaAGAAGTT
CATTGATTCGAATGCTGAAAATAATTTGCTTTCCATAACAGAGGCCCAAG
GAAATGTCTCTCATATATCATGAAGGTTTGGCGGGAATTTGCTTGGTTTG
TTTTTAGAAGCAGTCTTAAAATGTCGTTTGCCGAGAACAAATATTCCTTG
TAAATTTATTACCAGTCTCCTAAAAAGCTAGCCTGTTAGTCGAATGTTTT
TGGACGGGAAAGTCCGTCCAAGATTTTCTCTTCGGCGCGGCGCATTTTGC
CGTGACTTTGGACAAGTTGCACTCCATCGCATGTACCTTTTTCTGATatt
caagaagtcattgcattgcttCGAGCGGTAAACttcaaatagattttcga
actttcgaattttgtgattcgaatgttgaaaattgtttgttcAATCATTT
CTTTGCTTTGGGTTGGATCCTAGCCATGATACACGAACTTGGTTTGgact
ttttgtatgttttggGATGGCAACGAATATCTTTTGGATATGACTTGAAA
CCTAGAAGAATTTATCCCTCGCTTATTCCAGTGGAAAGAAGaactaaact
aaactaaactgtttgtttgttattgtttttattggtgGTTCGACGTGGTT
TGTGATCGCTTGTTTGAAAATGTGACATGAATTGAATTGTAGAATGTAAA
TTGACATACGATTGAAAGTaaactgaaatttgattgtattcGACTCGAAA
GAATTTAATGAATGTTGCTGGGTGTGGAAATGATTTTCTTACGCTCTCAG
CACCAGTGCATTGACCATTGTAATTGGCAAATCTTGACATATCAAAACTT
GAcactatttttttgattttgatttaaaaattatgcgCTGAAGTGTTATG
TACACCGTCTACGTATGGcttttaccgaaataccgttgttttttatgaga
attacctcatcccggacgaaaaatcaggtgttttaccgtcaccgtggctc
ttgcaaaataccgtttcccgaacactttttatcgtttttatcGCTTCCCG
GCCCTAAATTAGGCCTTATCCCGAATACCGCCagatcgtacgccccccac
gATACAATGACagattttctatatttttatgGGAAAAGTTTTGTTCTGTA
TAATTAGAGTTTAAAGGTTTACTACCAATTAATTTCGAGTGAagattaaa
aactttcaaattcctCAACTTTGGAAGCTAGATAGCCAGTAAAAATTGAA
GGTTTTGCTTCGAACTGTGGGAGGAATCTAcctaaattttgttattttta
tctgACTTTCCTTTTAAGATTTTACAGTCATGGTCATAATTTTATTAcaa
cttttataaaaactttgataattttttaagtAAGTAATGATGTagcaaat
atttatttttattttgtacctCTGTACCTTGGTTTGGAAATGTACGAGAT
CGACTTATTCCATCAAATACTAGTCTTGGAATCCTCATTAttttacatcc
ctgtttcaaaGACTGGCTAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_355:329022..345164-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00061303 ID=TCONS_00061303|Name=TCONS_00061303|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16143bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_355:329022..345164- (Clytia hemisphaerica)
GAATTGAAAAATCCTGGTGTAACGACTCTGTTTGGCGACAAGACAAAGAC TCTATATGTCCCGGTAAGCAGTGTGAAGTTCAGTCTTTTGCTTCTTAGCA ACCTACCCTGCGGGCACACAGCGTTGTTCAGATCTCACGTTTAAAGGACT GTCTCCACTTTCGCGCGACACGAGCGAAAACCTTTTTACGTTTTTGTAAG GGCATTGGTCGGTCGAAAAATGAAGCAATTCCATTAGTCAAAATTGACGT AACGGATCAAAAAAGTAGAACTTCCCTCAACTTTTTTTTTTGTTCGCAAA CTCGAAACTTTTTTATGATGTAATCTTTTCTTCAGGTAAAAAATGTTGAG AAAAAAACCGTCGCCCATTTCGCTCGAAAGTGGAGACCGGCTTTAACGTA GCATTGAACATTACGTGAAGAAATCTCCACGGAGAACGTTCTTTTTGTGG AGCGTGCTCTAAAGAAGGTGAGCATCTCCGGCGCACTTTGAAAATGTTTA GAAAAGTACAGACAATTTCCGTACTACTACTACTACTCAGTGAAACAAGT TAACGCTGTTTTCAAGCTTATCCAAATCTGCTCCTTCTGTGTCAATTCTC TCTCGTAAGGCTAATTTTCTTGTTCGAAAGAAATAAACCCCCACGTTGAC ACAAATACACTCTTCTCGAGATGCATAAATTCATTGTTGTCCTCGTTTTC AAACAGATTTCATTGCTGTAAATTCACATATTCACAATGATAATTGTGTT GTTTACACCTCATGAGACATTTTGAATTTCAAGTACTTTTGTATTAGAGT TAATGTTTGCCTTTTGGGAATTTAAATTGGTTTAAAAAATGTATAATTTC ATAGCAATGAAATGTGTTTGAAAACGAGGACAACAATAAATTTATGCATC TCGAGAAGAGTGTATATTTTCGCGCATTTCTTCTTTCAACCAACGAAAAA AGCCTATTAACGCATCTACGTGCTAGGGGGGGCATAAGATTGTACGATGA GGCTGTGAAATCTGTGAAAACTTGTCATTAATTTTCTTCATTTTTGTGAT TATGTATGAACACGATTTGTTGCTAAGACACTTCTTTCAGCAAAGTTTCT TATCATTATCAAATAACAGAAACCATGGTATAAAATGAGCTTTATCAACA ACTTTTTTTTGTTAGTGTCACGCTGACGTCAGCATATAATATGTCAGCAA TTTTCTTTTCTCTCTCTTATTACACGCAGTTATTTATAAAGGGCATTTTG ATGTGAAAATGTTATTTACAAATTGAATCGAGATTGTTACAGCAATACTC AGTAATACTGAGTATTGCTGTAGTTGTGTGCCTTTATACAGCATGGAAAG CCACCATTATGCATACACTCTCAAAGTTTTATGGTATAGCTTTTAGACAA CATTAGTAACTTGTGGTGCCAAAGTGCTCTATACCAAGGAAGAGCTAATT TCAAATTTTATTTTTCTTTAAAAAATTAAAAACATGGTATAGCGTTTAGA AGTAGACCATAGAAAATGGCTTGACTTGGCTTGACTGATTTTCAAAGTAG GTATTCGTATACGTTTTTTACTCTCTAGAATATTCCATCACTGGAGGCAA GCACCCGACCCAACCTTTCCAAAACGTTGACATGTAAAAGAAATTTGCCG GGTAGTTTAGCTTGGAAAACATTACGTAATGACTCCAAAAGCATTACATA ATCTTAGCACAGGATATTACAAGCGCTGAGAAATCTCTACACTGCTATTT GTAAATTAATAGTTGGACCAAGAGATATACATTAGAATAAATATAAATAT TATAAGACTAAATTAGTTAAAAACGAATAATAAGAGGCAAACAAATCAAG TATCACAAATCCACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCAA GTATCACAAATCCACATCATAAGGATAGTGGCATAACCTTGCGGTCACGC CGGGCGCAAAACAAGGGGTTAACGATAATGCAAAAGTCTGAAAAAAAATA ATCTCAAAATCGACGAATAATAAGAGAGATTGACTAAAAATTTCTCCCAG TAGATTCATGAATTTCAATCTCATTCATATCAAGGTTCAATTTCCTAACA GTTCTCGATCCACGTAAGCATAGGATAGCTGATCGTAGCAAGCAATATGA GAGCTTAGTTCTCAACCAATTCAACATGATACCAAATNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTCTATACTTTCGAACATCACCGGG TCGACAAAAGGCTTTGGACCATGGATCAAAACGGATTCGTCTGCTTCTTG TGCTTCTGGGTGTTTTGATTTCAAACTGTCGATTACATCTTTCGATAGGT TAAGCACACCGCATCCTTCTTGTTTATCGAGCATTTTCAGAGCAGCGTTG ATTTTGCCCATGAAAACGAGTTTTGCGAATGTCTTTGAAAATTGTGCATC ACGTTGTTTGCTGGGAAACATCTTGAGAGCTTTTTGGATGGTTCGTGACT CTCTCATTAGTGCGTCAAAATCACCCTCGTCCCATAACCGAAATCTTCTT TCCAGACATAAACTGTGTTGCTTAGCGGTTGATTTGTAGCTGGGTTTCTG GAGAAGCAGTGCGGGCATGACCATTACGACGGTGAGGGCAATATTCTTGT ACGACTCGGAATCATCGACCCATCGCTGCAGCCATTTGGTTGTTTCGCCG ACAAACCTCTTTCCATTTGCACCACTCGGGACGAGAAAGATGTTTCGTCT CCAAAGCACGATTTCACTATACATGGCTCGGAATATTTGATAGATGTCTT CCTTGGCGTGGTTTCCCCATATATGGTTTATTTGAAGCGCTGAGAAATTG ATCCGTTATCAGATTATGTTATTTTAGTTATTACGTAATGTTTTCGCTGC TAATTTGGGTAATAAGATTCATCAAACCTCTACTTTTATCTAAATGTTTC TAAGCTAAGGAAGAGGTTAGATGCTTGACTACTTTTCTCGCTTCCCTTCG AAGTCCACCGTCCAAAAATTCGGTCTAACGGTGCCCTCTCTCTACTCATT ATTATTATTATTATTATTACAACGAATCCAAAGTTCAGGCACGCCGTGGG CCTCTAGAACTGGTCTTTGTTTATTTACAATAAATAGCGTAGTTCATGGT TTGCCCATGCTTTGTTTAAATTATTCTTGAACGATTTTATCGATGATGCT TCTGCCACGTATTTTGGAAGCGCGTTCCATATTGAGATAGTTCTATAAAA GAAGGACTTCATCGTCCGGGAAATTCATCTGAAGCTCGTGTATATGCTTT CTACATGGTCGCGTCCTTTTGATAAACTTTTTTGGTGTTGTTTTACTATC ATAGATGTGGATATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNTTACGTAGTTCAGCATTAATTGGAATTTTCCCTTTCTTT TTCCAGTGAGGCGCTCCTACATACACACTGAGTTTTATAATGAACCCTGG AAGAAATTTCTAAATCCCCCAGCCAACAAAAATATTTTGATAGGAGTTTT TAGTTTTTTTTAGTTTTTATTGAATATTTATACAGGATTACGCAAACAGT TACAAGTATCTGATATTACCTTTGGTCCTGTTATAAATCTAAAATAATAA ATAAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNCTATTAGTGGCATTGCTTTTTTCTTTAGATTCTGTG CCACTTTGGCGTAATAATTACAAAACATATCGGCTTTGTCTTTTGGGCTA GTAGCGGTTGCGTCACCGTCTTTGAGAACGTCAGTTGGTTTTGATTTTAC GTTTGAAGATGGTAAAAGTTTTTTGATGTGACCCCAGAACTTTTTACTAT TTTTGAGGTTTTCGGTGAGGATTTCTTTATGGTAATTGTTTTTCGCCTGT TTGATGAGATTGGTGCATCGGTTCTTTTTACGACGATAGATATTTCGATC ACCTTCGTCTTTCGTTCGCCTTGCTTTTCGATCAGCTTTGTCACGATCGT TCAGGTGTGCTCGGATTTCTTGGGTGAGCCATGGACATGGGCGACCTTTG ATGCGTTTTGTTATTTCAGGGGCATGGCGATTGAAGGAGTTAGTCACGAT TTGTTTGAAGTATTTCCAAGCAGCATTTGGTTCGGACTGTTGATATACAA GATTCCAATCGACTTGGCGAAGTTCGTTGTTCATAGCATCAGGATTGTAC CGCGAAAAGTTTCGGCATTTGATGGTTTTGGGTTCATATCTTTGATGGTT ACGTTTCCGAACAACTCCAATCATATCATGATCACTTAGTGATAAGGGAA TTACGGTTTCGTGGGAGATTTTCGACTTGTCGTTTGTCAGGGCGAGATCG ATTAATGTTGAAGATGTGTCAGTTATACGGGTAGGTTTTGTTATAATTTG GTCAAAACCTTGCAGGTTTAAGAAATGTTTTTCATCTCTGTGGTCGTTTC GGACGAGATAATTGATGTTAAAGTCCCCCATTAAGATGACCTCTCGGTAT TCGTTCATGTTAGCTGTTAAATTGTTCTGAAAAAGTTCATCGAAGTCGGG AGGGAAATAGTCAGACGTATCGGGTGGACGATAGATACAGCCGAGGAGAA ACGGACTTGTGTTAGTTTCGAGGACTTCGACCCATATACACTCTAAACGC TCGTGTTCAAGGTCCTTTCGTCGTTTGTATTTGATCCGGTCAGATATGTA GAGAGCTACACCTCCGTGGGTGCCTGTCAGCCGATTCTTTTTGATCAATT CGTAGTTCTCGATTGAGCAAATGTCGGTTTCTTCGAGCGACTTTTCGAGT TATAAAAAGTTATTTTGAAGGTGGTACCTGCATCGAGAGCTATCTACTTT GCTTGTACACTATCTCGCACCTAGATAAAGAAATTTTCAGCCAACATGCT AAAGCTCTGAAGGTCGGGAAAATTTTCAACACCTGGAAGGTTTAGATTAC GGAATTTGCAAGACCGCGTCAAGGATTTTTGCAGCCGGGATTGGCGGGTC CAACCGAAATATTTCCAGGTTTACGCCTGAGGGTATTTGCGGCACATCAA AGGCCGACTATCTATCATTCCTCTCGGATGGAAAATCGGTCCGCTCTTTT AGAGCTTTAGCGTGGGCGGCCGCCATTCCGCCATCGGAATATCAGATGAG CACACTAGTGATGTAGCGCCGTTTGTCATTAGGAAAAGTTTCAACACTAA AAAAAAACACTTAAAAAAAACTCTGATCAAAGATGGGGAGTATATCTTAG TCTTGGATTTATAAAGGTCAGTAGGTAGATAATGTAAAAGCGTAATTGAG TTTTTATCTACTTTACAAAAAGCTCTCCCCTTGTAAACTATGTTCGCACG TAACGGTTCCGTTCCACTTCAAAACAAAATGAAGTCATTCTATTGGTTAG AAGTGACCTAAAAATTGAATTTAACCAATGGAATGGCTTCTTTTCGGAAA CGGAACCATAGCGTGTGAGCATGGTCTTAGAAAAAACAGGCCTTTTGTTG ATGACTACCATTCACCAATATATTTGCCATTAATATACTACAAGGAAAGA ATCTTACAAAGAAATCTGAGAACAATTTGGTAACTTTGTCAAAAAATATC ACGTCCCCATGATATCACCTCCAAAAATTTTAGTTGTGTTTTAACCTAGG TAAAACAAATTGACCATTTTCTTCTGAAATCTATTATTGGACCTGCTCTT TCTGATAATGAGGCTTCATTCTTTTCTTCGTTATAGATCTTGGATTTCAA CCGGGACAAACGCTGAACATCAGGACAGTGCATTACCGAAAACATTAGAA ATTCAACTACTGTCTTAGACAATCTATATTTTGTTGTGGCTTTGATCTCG AGACTTACATTAGTACAAATACAGTCAACTCTCTCTCTAATTCGAACTTC TTTAATTGGAATCTTTTGTGTTACTCGAACTAAAACATTGATTCTTTTAA CTGGAAAACGGTATAAAGTACTTCAAATAATTTGAAGAAGATTCTCTATC CCTTGAAAATATAATTAGAGAGGGTCTACTGTAGTGGGGAAAACATCCCA CACCTTGTCCGATTATGGGAGAAGAATCTCTCGAAACATAAGTAAATCTC ATGATCCAAGCCACGATGAGCTTCAAATAAATATGGTCTGAATTCTGCTT AGTCTCTTTCAGCCAGTTTTCTTCTCTCGCCTCTAACAAACACAACGTGA CCGAGCATAACAGAAACAATAAAATCGCCATCTCTGTTCATCAGTTAGTT TTAGTCGTTATTTTTCTAACACCCATATCTTTTGTAAAAAATAACATTTG TAAATATCTTCTGATCAACTTTTCCCTTTGTTTTTATTGGGCTTCACTCA CCCCTGCGTCTTGCTTTACATTCTAAAGCTTAACTTGGTTACAGATAAAA TGATTGGCCTAAAATTTAATCAATAGCTCTACAGATTTTCAGCTCTCCTA GGAAACAATTTCAGGGGGAGCAATTTTCTTTGAAGTTCTATCGCTTCTCT TAAAACCCTAGGAGAATTTAAAGAATTCGTCCACATAAATTGGGTATCAA ACCGCAGAATTGTCCTTTGTAAAGATCGACAAAGATTAGTTCCCTTAAAG ATTTCCAATATCCGGGAAATGTTACCATAAAACAACTATCAACCCTAACA GCGCGCTCTGGGGCTGGTAACGAAAATACAAAGCGAATTTTTTTGATGTA GGATACCCTTGAAGCGATGAAGTAACGTCAATATAGTTGAGCTATTTGAA CCATTTACCTTTATATATCCTGGACCAAGTTTCTCAATCCCGGCCAAACT AAATCTTTGATCGGAGTTTTTCGGAGTACCCTAATAGTAGCACTAATCAA TAGCGGTGAAAATGCATCGAGAGCGCTAGATCTACTGTTCCTCCAATACT TTAGTTGATGTAGCGCTGTTTAACGTTAATTTTTAACATTACAATGGCTT CTTCTCGGGTACCAGAAGAAGTTCATTGATTCGAATGCTGAAAATAATTT GCTTTCCATAACAGAGGCCCAAGGAAATGTCTCTCATATATCATGAAGGT TTGGCGGGAATTTGCTTGGTTTGTTTTTAGAAGCAGTCTTAAAATGTCGT TTGCCGAGAACAAATATTCCTTGTAAATTTATTACCAGTCTCCTAAAAAG CTAGCCTGTTAGTCGAATGTTTTTGGACGGGAAAGTCCGTCCAAGATTTT CTCTTCGGCGCGGCGCATTTTGCCGTGACTTTGGACAAGTTGCACTCCAT CGCATGTACCTTTTTCTGATATTCAAGAAGTCATTGCATTGCTTCGAGCG GTAAACTTCAAATAGATTTTCGAACTTTCGAATTTTGTGATTCGAATGTT GAAAATTGTTTGTTCAATCATTTCTTTGCTTTGGGTTGGATCCTAGCCAT GATACACGAACTTGGTTTGGACTTTTTGTATGTTTTGGGATGGCAACGAA TATCTTTTGGATATGACTTGAAACCTAGAAGAATTTATCCCTCGCTTATT CCAGTGGAAAGAAGAACTAAACTAAACTAAACTGTTTGTTTGTTATTGTT TTTATTGGTGGTTCGACGTGGTTTGTGATCGCTTGTTTGAAAATGTGACA TGAATTGAATTGTAGAATGTAAATTGACATACGATTGAAAGTAAACTGAA ATTTGATTGTATTCGACTCGAAAGAATTTAATGAATGTTGCTGGGTGTGG AAATGATTTTCTTACGCTCTCAGCACCAGTGCATTGACCATTGTAATTGG CAAATCTTGACATATCAAAACTTGACACTATTTTTTTGATTTTGATTTAA AAATTATGCGCTGAAGTGTTATGTACACCGTCTACGTATGGCTTTTACCG AAATACCGTTGTTTTTTATGAGAATTACCTCATCCCGGACGAAAAATCAG GTGTTTTACCGTCACCGTGGCTCTTGCAAAATACCGTTTCCCGAACACTT TTTATCGTTTTTATCGCTTCCCGGCCCTAAATTAGGCCTTATCCCGAATA CCGCCAGATCGTACGCCCCCCACGATACAATGACAGATTTTCTATATTTT TATGGGAAAAGTTTTGTTCTGTATAATTAGAGTTTAAAGGTTTACTACCA ATTAATTTCGAGTGAAGATTAAAAACTTTCAAATTCCTCAACTTTGGAAG CTAGATAGCCAGTAAAAATTGAAGGTTTTGCTTCGAACTGTGGGAGGAAT CTACCTAAATTTTGTTATTTTTATCTGACTTTCCTTTTAAGATTTTACAG TCATGGTCATAATTTTATTACAACTTTTATAAAAACTTTGATAATTTTTT AAGTAAGTAATGATGTAGCAAATATTTATTTTTATTTTGTACCTCTGTAC CTTGGTTTGGAAATGTACGAGATCGACTTATTCCATCAAATACTAGTCTT GGAATCCTCATTATTTTACATCCCTGTTTCAAAGACTGGCTAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038464XLOC_038464Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1575043694:345102..345164TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1575043694:345102..345164Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1575043694:329022..331728TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1575043694:329022..331728Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1510915933:345102..345164TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1510915933:345102..345164Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1510915933:329022..331728TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1510915933:329022..331728Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1491911889:345102..345164TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1491911889:345102..345164Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1491911889:329022..331728TCONS_00061303-exon-scaffold_355-1491911889:329022..331728Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_355supercontigscaffold_355:329022..345164 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0 0 0 0.139768 0.164503 0.358524 0.419933 0.66308 0.779069 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00061303 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top