TCONS_00068909 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00068909
Unique Name	TCONS_00068909
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	8184

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_49:766687..791293-

transcript sequence

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aattaatatttttttttttgaggccGGATTGATTTCATTCTGGATTGTGT
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aacgttttgaaaactGACGCGGGTTTTTAAAGAAAGGCCGTTCGACTTTC
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CAGATCATCAGATGTCGATGAGTTAGTCTCCATTGTAGCAAGTATCACTG
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GATACTTCTGTCAACGTCGGTGAAGAGAATTTCAATATGATGGTGAACTT
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TGTCTGCCTCAGTCTTTGGTTCAGACGCAACGACTGTATTTACACTTGAT
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GTGATGTTTTCACTTTAGATGGATACGCCAGACAAAAGGTTCCAAAAGTT
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AGATGCTGTGGAAGAACTTAAAGAGAATGGTGTTCAAATTATAACAATCC
CTATTGGTGAAAAAGCAAGTCTAGCTGACATGGATGCTATATCTTCATTA
CCATTAAATCGATATGTCAATCCACAAAACTCATATTCAGAATTGATTAA
TggtatttttattcaaaagatttCGAGTATGATTTGTTCTGGTAAACCTG
GTATCTGTGAGGAGCCACCAATCCCAGAGAGCTGTGGCAATATTGTGTAT
AACTGTGATGTCGATGTCGATTGTCCAAACGAACGTAAATGCTGCTTGAA
GAATTGCGAACAGACTTGTGAACAACCCGTTACAGCTTGTATTACAGCAA
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ATTGACATGAAGAAACTCGCTGAACAACTTGTTGACAATTTCAAAGTCAG
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ATTGCTGGTCTCAAATCGGATGGAGGCTCAGTCAGTAATATGGGAAATTT
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AAGCTCAACCACGTGTCTTGGTTATCTTCACAAGTGGCAACATACCAACT
GCTCAAGAAAGTAGGGCTATCGAGGCAGCTAAATCGTTAAAGAAAGCTGG
TAAAGATGTCTCGATTATGATTGTTAATGTTGGTGGAGCGAGTCAATTAT
CAACATTGAATGAGATCGCATCTGAACCAAATGAAGCTAAAGTGATCAGT
GTTTCTGATTCACGCGATCTGTTGAACTTGGAAACAAAACAGAGAATCGC
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TTTCAGCAGTTTGTGGTGTATTCGATAACTTGTGTCAATCTGATCTAGAT
TGTCCAGGTTTCCAAGAGTGTGTCAGTGATGGTTGTAGAAAGTCTTGCCA
GTACTGTGGAAAACGGTGTGAAGATAAAATCGACCTTCTCGTTATGCTTG
ATGACTCATCCAAAACTGGTGAAAAAggattcaaaaaatcaaaagaattc
gTCAAATTATTCATGGAATGGTTCAACGTAGCACAAGATGGTACCCATGT
TTCTGTCATGACATACAGTGATAAAGCCAGACTCCAAATGGAATTGCCAA
AACCAGGATCAAGCGATCCAGTACAAACGATTACAGATTTATCAACCAAA
GTTGATGGGTTGACATACTCTGGTGGATCTTCTTCAAACCTTGATATTGC
TTTGGGAACAGCAGCAGCTCAAGTATTCCCACCAGGAGTACCAAGCGGAC
GGCCTGATGCCAAAAAGGTAGTCATTGTTGTGACGGACGGTAATGTCGAT
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AACAGTTGACGGTAAACTATACAGTGGAATCCGTATAATGGCTGTCTCAG
TCGGAGATAAAATCAATTTGGATGATTTATCACAAGTTATTACACcacct
attgataaaaatgttttccttGCTGCTAATTATGATGACATGTATAATGC
AATGAGACAGCTGGCTGAAGATTCTTGCGAATATGCTTCagCTGTTGTTG
AACCTCCAATCATCTACGAACCAGGAGATCCAGGACCACCAGGGCCTGAT
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TGTAGGACCAAAAGGTGAACCTGGAATGAAAGGACTCAAAGGAGAAGATG
GAGATCGAGGACCACCAGGAGGTGTTGGTGAGGGCTCAAGCACCAAAGGA
CCTGATCCTGAAGGCGAATCTGTTGGAGCTTCCATTGAAGGTACTCCATT
CCCAGGACCTGGAGGTATCATCTATGATCTTCGAGAAGGTCCACAAGGAC
CACCAGGACAAGCTGGTATCGTTGGTGGTACTGGTCCAGCTGGAGACAAT
GGACCACGTGGTAAAGATGGCCGCAAAGGGTCACGTGGATCACGTGGATT
CTTTGGTTTACCAGGACCTAAAGGAGAACCAGGAAAAAACGGAAACCCTG
GAGACAAAGGAGACTCTGGAGCTGCTGGAGAACCTGGACAGCAGGGACCA
ACTGGTACACAAGGTCGACGTGGTCTTCAAGGACCTTTCGGTTTCAAAGG
AGAAGCTGGCTTAGCTGGAGCTTCAGGAGAACCTGGAGAAGCTGGTCGCA
CTGGAGCTAAGGGTTACCCAGGAGAGAAAGGAGACCAAGGAGCCGTTGGA
GAGACAGGTTTCCCAGGACCTGAAGGACCCGAGGGACCAGAAGGGCCACC
AGGACAACGTGGCTTGAGAGGTCAAGACGGTAAACGTGGAGCAGCTGGTG
ATGCTGGACCAATCGGTTTGAAAGGACCCACTGGACCACGCGGACAAGCC
GGAGCTAAAGGACAACAAGGAATGCAAGGAACTCGAGGAGAAAAAGGTGT
TGCCGGTGAAAAGGGACCCGATGGAGAATCAGGTCTTCAAGGTTTAGCTG
GACCTGCTGGAGACGATGGTAAACCAGGAGACGCTGGAGTTGAAGGTAAA
GAAGGACCTCAAGGATCACCAGGACCTGCTGGACCACCTGGACCAAGAGG
AGAAGCTGGACCACAAGGAGCTCAAGGAGAAACTGGATTCGTAGGTGTAA
AAGGTCTTCGCGGAGAAATCGGTCTTCGAGGTACACCAGGAAACAAAGGA
GAAACTGGTGTTGCTGGAGAAATCGGACCACCAGGACCTGCTGGCCAACA
AGGTAAACAAGGAAAGACTGGCCCCGTTGGACGACGTGGAACACAAGGTG
TCCGAGGTAGCCAAGGTTTACCAGGTCAATCCGGAGATCCAGGACAATCA
GGAAGAACAGGACCTAAAGGTAACAGTGGTAAACAAGGAGAAGTTGGACC
TGAAGGAGAAAAAGGATCTCGTGGCTACACAGGACGTGTTGGAGCCAAAG
GATTCCCAGGAGAACCAGGAAACGTTGGACAACCAGGTTTAACAGGGCGC
GATGGTAAAGATGGTCAACGTGGCTTGAACGGTAAAGATGGAGACCCAGG
ACCACAAGGACCTCAAGGTATCCAAGGTGTTCAAGGAACAAGTGGTGTAC
CAGGAACAACAGGAGATCCCGGAGATACTGGAAACACTGGACGAACAGGT
GCAACTGGTGTCAAAGGAGCTCGTGGAGCATCAGGAACTAGAGGATCTGC
AGGACCTCCAGGACCTACTGGTGAAAATGGTCTTCGTGGAGAACGTGGAG
AACAAGGACCCAGTGGAACTCCAGGAAGTCAAGGACCACCAGGACCTACC
GGAGCTGTTGGGTTACCAGGATCTGACGGTATCCAAGGACGCAAAGGATC
TTCTGGACGACCAGGAAACCCAGGTTTGATGGGAGAACAAGGCGTACCAG
GAGCTCCAGGATTACCAGGATCCCCCGGAAACAATGGTAAACCAGGAGAA
CGTGGAGATCCAGGACAAGATGGAGGACCAGGAGATCAGGGACCACCAGG
ATCACCAGGAAACCCAGGTGCCAGAGGACGTGAAGGAACTCCAGGACGAC
CTGGCCGACGTGGAACACCAGGACCTAATGGAAAACCAGGAGCACCAGGA
GCAGCAGGACCAAAAGGATCAGACGGTCGACCAGGAGAACGAGGTCCAGA
AGGATCTTCAGGTCCACGTGGAGTCAATGGAGCACGTGGAAGCCCAGGTC
CAGATGGAGCTGCAGGACTTGATGGAGCTCAAGGACCACCAGGTGACATT
GGTGCACCAGGAAAAACCGGAGCCTCAGGAGTACCAGGACCTGTCGGACT
TAGAGGACCAACTGGACCACCAGGAGTTCGTGGAGCTAAAGGATCATCAG
GAGATTCTGGTGATGATGGTGAACAAGGACCTGCTGGTACCGCTGGACAA
CCTGGTCTTGTTGGACCAATCGGAGAAATTGGAGAACGTGGACAAGTTGG
AGAAGTCGGAGAAATCGGAGAGACTGGTCCACAAGGTATGCCAGGACCAA
GAGGTCCACCTGGACCACAAGGACCGGAAGGCCCAGAAGGAGCCCCAGGA
CCAATGGGTAAAGACGGAAACAAAGGACCTGTTGGAGACCCAGGAAATGC
TGGCAGACCTGGCAAACAAGGAGAAAGTGGAAAGCCAGGAAAAGACGGTG
TTCCAGGAAACCCAGGAACTGCTGGTAAACAAGGACCAAACGGACTTTCA
GGATCATCAGGACCACAAGGACCACCAGGAGAACAAGGTCAGCGAGGACC
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GCCCTGACGGTTTGAATGGATTAACAGGTAAACGTGGATCACGTGGTAAA
GAAGGACCTCAAGGACCCACTGGTGTCATTGGCCGTGATGGTCGCGATGG
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AAGGAGATTCTGGTGAACAAGGAGATAATGGAGCACCAGGATCTACTGGT
GAGAATGGTGATGTTGGAGAGCCAGGAGTCGGTGGTGAAGATGGACCACA
AGGACCTAAAGGACCCAATGGTAACCCTGGAGCACCAGGTGCCCGTGGAA
AGACAGGACCTAAAGGAGACCGTGGTGGTAAAGGAAAGACTGGTTCTGAT
GGACGTGGTGGCTCCAAAGGACAGAAAGGAAACATGGGACGTTATGGTAT
GCAAGGACCACCTGGTGATGCAGGAGAGAAAGGAGATGAAGGCCCACAAG
GAGAACGTGGACACCATGGACCACAGGGAAGCCCTGGAGATTCTGGACCA
AACGGACCAGATGGCGAAGAAGGATCCAAAGGATCTCTGGGAAACCAAGG
ACAAATTGGTAACGAAGGTATCCTTGGTGCTCCAGGACCTGGAGGAAGTC
CAGGAAGTGCTGGAAATCCAGGTCCCCCAGGTCCACCAGGACCTCCAGGA
GATATGTCTGGTGCATTAGCCGGCAACTTCTGGGATTACTTGAATACTGG
ACATAACATGAAAGGTCCTGGTTATTACAGACAACGAAGATCTGCTGAAA
ACCACAACGATATTGAATCCATCTTCAAAGAGAACTACAGGGTATTCCAA
AACTTCGACAACTTGTGGAATCGTGTTATGGATGATATTGTCAACAAAAA
ATCTTTGGGAACCAAAGCTAACCCAGCAACCACGTGTGCTGATCTCTTCC
GAACAAGAAAGGGATTATCATCAGGCGACTACTGGATTGATCCAAATGAA
GGATCATCACACGACGCCATTTTGGTTCATTGCAATGCCACCAATTATGA
AACATGTGTTTATGCTAAACAACCGGAAGCCGATAAAGATGTTTGGTTCG
CTGGAAAACCATCTTTCTTATGGGCTTTCAAAGAATACATGGATGAACCA
GAAGGCATTTCATATGCTGCCGATTTGGTACAATTGAAAATGATGAGATT
GTTAAGTAACACCGTTCGACAGAATATTACACTTCATTGTAAAAACTCTA
ATGGAGATATGAGCATTATGACGGATGAGAATAAAGAATATGAATTCAAT
TCATTACCACGTGGTATGAGATCAAAAACCATCTCTAATGGATGCTCGat
caAAGATAACCAATGGCATAGTCGCGTTGTTGAAATCTTTTCCGACAATC
TCCGTGGATTCCCAGTTCAAGATATTGGAAAATTCATTGCTACTGAAACT
GAACAAGTTGGAGTCACCGTAGGACCTGTTTGTTTCAGTTAGAAGAATGG
CATTAAATTTTTGATCATCTGGAAGATCTTTTTGATAGAAGAACAGAGGC
AGTTTGGAGAAGAATAGACATTAGATTGAACCATTTCCTAACCATTGCAA
CGAGTAAAGGAAAAATTTATCACATACACTGCTTTCACAACTACTGGGGT
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CTCCACATATCACAATTTtagatttcaatcaaaaattttagattaacagt
tttttatagaaattttataataaactagaatttttttccatttaataaCA
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ctcttgtttgttctttttccaaaaaagactGCCACTATCTTCTTGAAATA
AGATTTTACTGTCATTATTTATAATTTCAACTTAAAAGAGGAaacaataa
aagagaaaacaatTGCTTGCGAGGGAGCTTACACCACACCCCTTTGAAAT
GTATTTACAGTATGACACGGCTTCAAGtactttttttactcttttattca
agaaaaagcTAAAAGATAATTGAAAGAGTTTGTCGTCGTatatttgtgag
tattttgacTTTTACCTCTTGTACATACGTTATTTACtatgaacaataaa
aaaattaaattggtACACCTTTTATAGGGAAATAATAactataaaatatg
aaaaaatNattgcttttgtaaacaaaaaaatagcaaagttgatttcgagc
aaatttgcaatagaatgttttgattataaaatag

transcript from alignment at scaffold_49:766687..791293-

Legend: exon

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>TCONS_00068909 ID=TCONS_00068909|Name=TCONS_00068909|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=24607bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_49:766687..791293- (Clytia hemisphaerica)
AATTAATATTTTTTTTTTTGAGGCCGGATTGATTTCATTCTGGATTGTGT
TTATATGACTATATTAACCCGGTGAAAAAAATTCGTCAGTACAAAATAAA
AACGTTTTGAAAACTGACGCGGGTTTTTAAAGAAAGGCCGTTCGACTTTC
TGTGAAAGTGCAAAGAAAAGCACGCCACTTTTTTTTTTGAAAAAAGTGTT
GGTGTTTTTCTGTGTGTGTTTGGAAAGAAATAGGCACATTTTTGGTAGAA
TTGTGAACTTGCAGTATCGGCGGTGTGTGTAACCACCTTTTTGGTTAATT
GCAGCGGGTATATCACCGTTAAACCCCTTGTTTCACAAAATGGCTATCAA
GGCGAGCATCTTTTTGGCTTTATGCTTACTGGTGACCGTTTATGCTCAAG
GTAAGGTTGTCATGGAAACTTGGTGTTTTATCTTGGAAATTTTTTCAATT
CAGTTGTTTATAGGTTTTTTTGGAATCCATTTTCCTTGCATTTTCCAGTA
TCTGCTAAAAATGTTGTATCTGATTATTGAATATGACTGATATAGTATAG
TATAAAGATTGTCTTTCAATATCATCTTAAAATCTATCTTTTACAGCTTA
TTGGTATTTCCAAAATCAACAAAATTATAGCTCAGTTATTATTATAATAT
AATTATTTTGGAAAAATTATTCCCTTTTTGTTGCTTTTATCATTATTATT
ATTATTGATCTTGGCATTTAGTTAAAACTTATGAATTTTGGTATTATGAT
AAGAGGGTTTGACTCTTTTTATTGTATACAAGTAGTTAAGAGTAGCAGAG
CTAGTATATGAGAGGAGAAATGGTTGTGTTTACAATTAAGAGTGTCTGCT
TACAATTAGACATGAAAATATGAATTGGGTAAGGTTACAAGATTTTTTCA
AGTAAAAGGAAGTTAAGGTGACATATTTTTATTTTTACTTTTTTGTAATC
ATATTGTTTCTTTTATTATGCTTTTTGGGTACTTTATTTTTGTTTGACAA
AAAAAAATTCTGTTTTGTGTGTGATTTGAGAGCCTTCTAAATTTTGTTGA
AAATTCTGATTAAGGAAATAAACTCGATGGGGTAAAAAGATTTTAGCGAA
ATTCCAAAGGGTGAGTTAAAAAAAATTTTTGTAGTCATAACAATAATAAT
ATAACCCCGAAGGTTTTGATATTGACAAAATATTATTTTGAAATTAAACG
TCTTTTTTTTTATAAAAAGGTCGATTTCACGGTTATTGACATATTTAAAC
TGAGGAGGGGGTTTTTATAAAGTTGTCCACCACACTCTAGCAAAGAAAAT
CACTGTTAGGCGCATATTTACTGAGACAACACTTTTTGATAAAGTGGGGG
AAAAAAAGAAACTTTATTTTTGTTTTATTTGATATACTACAAGGGGTTTC
TTTTCAATATTGATCTGAAAAGGATATCAAAATTGTCGGCTTTATTAGTC
CCTCTTTACCTAACAGTTGTGTCCTTGATGACTTTTATATGACTATGTAT
GTATAATGAAATAAATTAAAATTTGACACTTTTTGACTGAGGCGAACCAC
ACTTGAAAAAGGTGCTCACAGCAAGCGAAAATTTTCAAAACAAAAATACT
GTCTGTCTTTTACTCATTTTACAAAGAGTAACGTCTTATTTTTGCTACTC
AAACTTTCCTTTTTGGCTGAAAATTTTACCGCAAAAAATGGAAAAAATAA
GTCTCAAATTTGCCCTTTAAAAATGGATGATCTTGACCCTTGAAATAAAA
CAGTTCAGAATGACTCACTCATGTTTAGATAGGGAATCCAAGTAAAAAAC
CATTTTGGCTCCCCTGCTGGGTAGAGTGATATAGTAAAGTGGATTTCGTT
TTATTATAATTTCTATCTCAGCCCAAAGTAAGAGACAGTGGTGTATGTTT
ATACAGATTTAAAAATAAAGTAAACTCTCAACCCACAATTTACTAGATAA
GAAACCTACTTATTCATTCCCAATGTTACAGTATTTGGAGCTAGCAAATA
TATGGCTTGATTTCCATTTGTAAAAATCTAATCCTTGCTATTTTTAATGC
AAATGATCAACAGACCTCACTGTATTACAAAATTAATATTCCTTTGTTTC
AAAAACGCAATGTAGACGTGTACTATCATCATCAAGAGTGAACATTTTTT
GTTAAAATCAAAAATTACGAGGTGTTAGAAAGAGAAGATTATAATTTGGG
GTTGTTACGAGTTCCATTTGACCACAAGGAGATTCAAATATCTTTATATC
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AATAGCCTATAAATCCAAATATTTAGTCATTGGAATGAAAGTCACCTAGA
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AGGTTACTAGGCAAACCCCTTATTTTTCTACTTTGATGATAACTACTTAT
TGCATTTCATACAAAAGAGAAAAGTAAAGTAATACAAATATTTCATGATC
TTCTTAGAGACCCGTTAACGTCTGATTTAATGGACATAATGTAAGCCTTC
AGACCTCGTTAACCCCCTGCACGTTTTTTATAAGATCAACTAAGAGCCTT
CAGATGTTCTTGGCTTTTCAGTTTCAAGCCTTAAAATAAATGTCCTTAAC
ATGTTCTCATTTTCACCATTTTTTAGTATAATAAGAAATTGGGTGTTTTA
GAGTCTGTGAAGTCTTAAAATGTTATTCCTAATATTTTTGGCCTTCAAAG
TCTTGTGTTCTTATGTTATTCTTCTTCCAATAAAAAACATACTTTTTCTT
AATCTATCAAGACATCCAAAAACACCCAATAAAACCCCAAAAGTCATAAG
GATCCTTAAAAGATAAATTATTTGAATATTTCTTTTTTTGTGAGGGTCTG
CATTAGGTTTTATACCCCATATTAGACATAACTTTTGTCCAACCTCAAAG
GAAATGAGCCAATTAGAATGCTATGAAATTATTCGACCCCAATCTCATTA
CTTTAATCAAAACAAAAGAAAAATAGTATTACACTATGTGCTTCCGTGAC
GAATCATTTTATATTTTACTGTATTTGAGTTAATGAAAAAAAGGAATTTT
GAGCTTTGCAAATCATATAACCTTCTTAAAATCGACAGTAACAAAATCTT
ACATAATGCGGGTGGGTCCACCAATCGATTTTGTTCTAGAGAGAGGGCGT
TGTCCTTACTGTTTTATTCTAATTTAAATGAATTTGATTACCATAATCTT
GAAGTTCTTTTATTATTTATCTTCAATATTTTACTATTATCATTGTTATT
TATTCAATATATTTTTTCAATTTCGAATAGCGTTCGAAAAATTTATAATT
AGTCAGTCTATCAGCTTATAATCTTTGGACTTGTAGCAGTTTTTTGTTAT
GATTCAAAGGCAAGATTTCCAGCCTAGAATATATTTCTACTCAGTTTTGC
ACTACTAAAAACTAATTCATTTTAGCAGATTTTTTCCACCAATCGACATT
CGAATTCGTCAGGATCCATCGTGTCATCAAACAAATCACTTTATTTCAAA
AATATGTGGAAACTTTTTGTGAAAATCTGGTACGGCGGTCACTGTACCTG
CCGTACCCGGTGCGCGTCGTGCCTGACCATTGATGACAAATAGTATCGGG
GACATGTCCATCATCCAATCATCCGATTCCACATCCGAAAATTAACGCCG
ACATTGTAAATTCCACGTACATTGGCTAACGTAACCATCAATCACAAGCT
CACCTGATATCCTGACAGTTATATCATTACTTCATGGGCCCGGCGAGCCA
TTTTGAGTGAGGGGGCCAACATTTTGGAAAAAATGTCGCCCACCATGGTT
GGGTGACGAAGAAAATTTTTCACTTTTTACACCCTCAAAACACCTTAAAA
CGATATCTAATTGGGGAGAATAATAGTTTTTGTGGTTTGATTTGGTCTCA
AACCAGCTTAAAATAGTAACTCTTAAAAACGTTGACGGGGCCCATGTACT
ATTTTATAATAGCATTGTTCTAACATCTCATTTATCATTAACCTCTATAA
CAATCATTACATTTTCTAGAGACACGCCCGAAAGAGTGTACACCGATAGA
TCCGAATCAGGAATGCGGACCACCAGGTTCTGCACCAACTGAATGCTCCG
GCAATAATGATTGCGGTAGTAACCAAGTTTGTTGTCTTGATAGATGTAAT
GCTGGCACATGCGTAGAAGCAGGTTTGATAACATAAATCCTCAACATTTT
TTCACCAAAGTTGACTAATTTCCAAACCTCTCATTTTTAAAGTCAAATAG
CCTAAAGAATAACTTTGAGTTTAGATTCAACCTTTAACAACTGTCAAAAG
CTCCAAAAACTTCACTTATCATCATTCATTGAGACTCGGAACACTTATGA
ATCGTACTCTCCCCATTCTCCTATTCAGGAAACAGTTTATCATGCATGCA
AGTTTTAACATCTGATTACTGAGTAGTAAGGGAGACAGTTCCAAAACTCG
TAGAAAGACAGTTAAAAAAAAGAAAAAGAAAGATATAAAAATTTAAAAAA
TAAAATTCAAGAAGCGACAGGTAGTGCGAATAATTTGCGATTTCAGGATT
TTTTTAAAATTGATATCGAAATGGCGGCCGGAACCAAAAGAATAAATCAA
CAAAAACAAATAATTCTCAAGCAAGGGACAGATTGAAGAACACAGCTACT
CCAGGAAAGCCAAAAAGTTTCAGAAAGATTTTATCCGTCAGGATCAAACC
CATTAGAATTCAAACCGAAGGAAATTTACATTGGACTACAACACAACATC
AGGTAAAGTAGAGATGACACGAAGTAATAACAATCCACAATAGATCTAAC
ATATTCTTCTTCCATCCCGTCCATGCAGAAGCAGTGAAAGAAGGGACCTG
CCCGGAAGCCAGCCGGACAGCAGAATGTCCACCAGAAGAAACCATCAACA
ACGAATGTCTTTTTGATGAACAATGTCCAGGCAAGACGAAATGTTGTTCT
GACGGATGCGAATTAAAATGTACAGAACCAGTGGCAGATGAAACAAAAAC
AGAAGGTTCTTTTAATTAATTTCTTTTAGACTTTCTTTTTAAGCCTTTCT
TGGAAATTCTTCTGTAACACCCCTGTGTCACAGACCCACTAGGACCCCAG
CCCCAATGGAAAATTTGGCTTTGATCTCATCCCCATCCGAAAATCCATGT
TTAAAAACTGCACTCCAAAACCATCTCCACTGGATTTTTATCCCCACTGA
GGAAAAAAGTTCCACCGGGGCTGCGAGACAGAGGTGTTCTGTATTTTTAG
GTGATTTCGACTTTACCTAATACAATGCTTCTGGGATTCTTCCTATTTTA
CCTTTACAAGTCAATTTCTATTAACGATGCTCATAAGATCTTATGAAATT
GTCCGGTATATATATTTACCAGAGGGAGGCTAGAATAAGAATACACAGGG
GGTTGAGATTTTCGAAAATTAACTAACGCTAATTGGAAACCCGAAAGTCA
GGATTTACACAAAAAATTAGCTCATTAAGTCCACGTTAAAACTCTAAAGA
GACAAAAGACCTCTCTAACACTTCTCTGTGAGACGAAAATCTGTTTGAAA
TGGAAGAACAGTGAGTAAACATTACATCATACCTGATTTAAAATTATATT
CACTACCATAGTATGTGCTGTTCCTGTTGATCTTGGTTTCATTATTGACG
CATCTGGATCCATTGGTAGTGTGAATTTCCAAAAGATCTTACAATTCGTC
GCCAAGATTGTAGATGCTTTTGATATCCGACCAAATGGTACACATGTTGG
TGTTATTTACTATTCCGATGATGCTAAATTGGCTTTTAATTTCAATAAAT
TCGAAGGAGATGCCTTGAATAGGGAAAATGTTGTCAATGAAATTAATAAA
ATCGTTGTGACTGAAGGACAAACTCGTATAGATTTGGCTTTGAAGAAAGC
TAAAGAGGAGTTGTTTACAGAGGCAGGTGGCATGAGACCTGATAAACCAA
AGGTAAGACATAGTAACCAGTTGGTACAAAACGTCAAAACAAGGTCCTTG
TAAAGCTCTTAACATACAAATAATGTTATATGAACGTTAAATAGGCATTG
TGTGCCAGTCATTAACCATAACCATGTGGTCCGTGAAAATAAGACTCAAC
TCAGCAGATCTAAATAAAGAAAATTCTAACTCTAAATAAAAAATCTCTGA
AGGATAGATGTCAAAGTGGTCTTTGATATCTGTGTCAGAAACCCGGGGTT
CAGGTTTGACTCCCCGTTCCTGTCAGTGTTCTATACTAGCCAGACATCCC
AAAGTCCTAAATTTATATACTTAGATAGATAGCCTTCCACATAAAACAAA
CCGACTTCAGTCATACATATTACCGGCAAATGGTCTCTCTTCTTCTCAGA
TTGTCCTGGTCATGACAGATGGTCGCCAAACGAAAGGAGAGGACGCTCCT
GACGCAGTTGATCTTCATATCGCGTCACGTCCACTCAAAGATCTTGGTGT
ACAAATTTTCTCACTTGGTATAGGAAAGAATTATGATATTGGTGAATTGT
TGGATATTGCATCTGATGATGCCAGTGTCTTCAGATCATCAGATGTCGAT
GAGTTAGTCTCCATTGTAGCAAGTATCACTGAACAGACGTGTAAAGGTCC
GTAGTTCGCAAATTTAAATTTATCTCTTGCATTTCTAAATCTTTCTATTG
CAGACCTTAAAAAAGATTCCTTGCATATTCAATAGCAAATTTTGACCAAA
AGCATCCTGCAAGCACCGAATTAAATTCCCGGCCAAATTGATTCTTTTAA
GCACTCCGCCAAATTAAGTTAATTTCCTCCTTTAAGGTAACAAGATTTTA
AATCTTGATTCAAGGTGGATCGATTTCGATGAACGAATGTATTCATAGAT
GAATTTCAGAAATATTCAGAAATTCTTTCAATTTCTACAAATATATTGTA
ATATTTTTAATCAAAATAATCATTGTATTTCTTTCTCTTAGGATGTACTC
GACCAATTGATATTCACTTTGCTCTTGATACTTCTGTCAACGTCGGTGAA
GAGAATTTCAATATGATGGTGAACTTTGTTAAAGCTGTTGGATACAAATT
CGTTATATCAGAGACAGGTTCACATATGTCTGCCTCAGTCTTTGGTTCAG
ACGCAACGACTGTATTTACACTTGATAAAGCGACCACACAGAATGATTTC
CTATTGGTTGCAGATGATATCCCGTATTTAGGAGATACTGAAGCTAATAT
AGATTTAGCTTTAAGAATGGTTGCCAGTGATGTTTTCACTTTAGATGGAT
ACGCCAGACAAAAGGTTCCAAAAGTTTTGGTCATGTTAACGGCTAGTGAT
TGTAGTACGTGTTTGGAACCATTATCAGATGCTGTGGAAGAACTTAAAGA
GAATGGTGTTCAAATTATAACAATCCCTATTGGTGAAAAAGCAAGTCTAG
CTGACATGGATGCTATATCTTCATTACCATTAAATCGATATGTCAATCCA
CAAAACTCATATTCAGAATTGATTAATGGTATTTTTATTCAAAAGATTTC
GAGTATGATTTGTTCTGGTAAACCTGGTATCTGTGAGGAGCCACCAATCC
CAGAGAGCTGTGGCAATATTGTGTATAACTGTGATGTCGATGTCGATTGT
CCAAACGAACGTAAATGCTGCTTGAAGAATTGCGAACAGACTTGTGAACA
ACCCGTTACAGGTATGACATTTATAAGAACAACTTTATAAGAACCCGAGA
CTAACAATTTGCCAAAACCTAAGAACAAATTAAGAACAATCCGAGACTAG
ACACTTTAGAAATTACTAAGAAAGTCCTGATTTAACATATTTTAACAGAT
TTAAAATTAATTCTAAGTCTTTAAGTAAAGAAAATTTAGCATATAATTAT
TCTTATAAAAAGCTTGTATTCTAAAAAAGTTGTAGAGCATTTTAGAATCT
ACCACGGTCTTTAAGCTGTTGGGATTAAAGTCTAACATGTGTCTTTTTTN
GCAATATTGTGTATAACTGTGATGTCGATGTCGATTGTCCAAACGAACGT
AAATGCTGCTTGAAGAATTGCGAACAAACTTGTGAACAACCCGTTACAGG
TATGACATTTATAAGAACAATTTTATAAGAACCCGAGACTAACAATTAGC
CAAAACCTAAGAACAAATTAAGAACAATCTGAGACTAGACACTTTAGAAC
TTACTCTAAAGAGGTCCTGATTTTAACAGATTTTAACAGATTTAAAATTG
ATTCTAAGTCTTTAAGTAAAGGAACTTAGCATAGAATTATTCTTATAAAA
AGCTTGTATTCTAAAAAAGTTGAAGAGTATTTTAGAATCTACCACGGTCT
TTAAGCTGTTGGAATTAAAGTCTAATATGTGTTTTTCTTTTAATCTTTGG
TTCTAGTGAAGCTTATCCAATTCTTCCTTCTTATTTTAGCTTGTATTACA
GCAATCGATTTGGCGTTTGCTTTTGAAACGACATCCTCAGGTGATAACAA
CTTTATTGACATGAAGAAACTCGCTGAACAACTTGTTGACAATTTCAAAG
TCAGTGCAGCCTCTACACATATCAGTTTATCAACATTTAGCGACACTCCA
GGCTATATTGCACCCTTCAATGCATTCAAATCTGCCGATGAGGTCAAAGC
CAAAATTGCTGGTCTCAAATCGGATGGAGGCTCAGTCAGTAATATGGGAA
ATTTCTTGGAATATGCTAACAAAGAGATGTTTAAGGTCAGCTTTGGTGTT
CGACAAGCTCAACCACGTGTCTTGGTTATCTTCACAAGTGGCAACATACC
AACTGCTCAAGAAAGTAGGGCTATCGAGGCAGCTAAATCGTTAAAGAAAG
CTGGTAAAGATGTCTCGATTATGATTGTTAATGTTGGTGGAGCGAGTCAA
TTATCAACATTGAATGAGATCGCATCTGAACCAAATGAAGCTAAAGTGAT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


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Blast

[Close]

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            A+      S+  ++Y V     +L N++   +  +   G++ NPA TC DL  +    SSG YWIDPN+G + DAI V+C+ +  ETC+ A QPE              K VW       + A  ++    EG++      QL  MRLL+N   QNIT HCKNS                   + D+ ++ + N  + +  L          +GCS K N+W   ++E  ++     P  DI    I    ++  V +GPVCF
Sbjct: 1119 ADQPRSAPSLRPKDYEVDATLKSLNNQIETLLTPE---GSRKNPARTCRDLRLSHPEWSSGYYWIDPNQGCTMDAIKVYCDFSTGETCIRA-QPENIPAKNWYRSSKDKKHVWLG---ETINAGSQFEYNVEGVTSKEMATQLAFMRLLANYASQNITYHCKNSIAYMDEETGNLKKAVILQGSNDVELVAEGNSRFTYTVL---------VDGCSKKTNEWGKTIIEYKTNKPSRLPFLDIAPLDIGGADQEFFVDIGPVCF 1365

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00068909 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00068909 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CO1A2	3.169e-34	29.66	Collagen alpha-2(I) chain OS=Homo sapiens GN=COL1A...	[more]

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TCONS_00068909 (transcript) - C. hemisphaerica