XLOC_000489 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000489
Unique NameXLOC_000489
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000005:560072..571566-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000489 ID=XLOC_000489|Name=XLOC_000489|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11495bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000005:560072..571566- (Clytia hemisphaerica)
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CATTGTCTTTTGATATAATTCTTGTCATTAAAATACTTTTCTTTCTTGCT ACGAGGTCTAACACTTCTTCCGGCATATATCTATATCTATATGTAAGCCT CAGTATTTAGGATTTGAGGTCGATGTATATATAACCCTTCCCATGACACT AGAGGAGACGATCTTTCGGTGTGGGGGGGGGAGCGCATCACCGACCCGGT AGGATTTTTTCAGCCAGTGAGGATAAAAATCACGGACTNGAACGATCTTT CGGTGTGGGGGGGGGGTGCATCCCCTTCTCACCGACCCGGTAGGATTTTT TCAGCCAGTGAGGATAAAAATCACGGACTGGAACTCGATGGGGATTGATA TTCCCATATTTTTTGGCTTGGGATTTCAATTCTTTTGTTTTCAAGTCAGA AAATTCAGTGGGGATGGGAAAAAGGCATATTATTTCGCAGGGAGGATTGG TTTGTTTGATTGTTTACAGTGGGGACAAATATTGGAGGGTAATTCTCCAC CGGGGACGATATTTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAAGGGGTCCTAGGGGG TCTGTGAGAAGAGGGTGTGGGAGAGAATCATAACTCAAAAAGTCTCCCAG TCCCACCATTCACGTGGTTGACACATGATATTAATTGTTCGTTTCGCTCT ACTATTTCTTTTTTAGTTTCTGGTTGTGTGCCGTTTTTATTGCGAAGTTG CATCAAGAATATCAAAAACCGAATATTTGTACAAAAGGTTTGGTTGTGAT TTTTCTTGCTCAAAGTTATTTTTATTAAATGAATGGCTAAATTTGAATTT TGAGGCAAAACTTTAAATGTGAATGAATAATGTTACTTTGGACTTTTTAA ATTCTAGGATATGTCTGCCATTTTTAATCATTACGTCAACATATTATGTC ATATTGATCATCGTCAGCATAGTTCGTATGAAAGCTGAACACGAGTGTAA AGGTATGGATATTTTTTGGGGTCATGCTTTTTTGTTGACAATTCAACACT GATAACCATCTCTTCCGTAAAAACAACCCTTCTTGGTATAACTTGTATAC CTAGGTGTAGTTGGAGCATCTTATAGCCAGGTTAAGGCAATCCAAATAGG AACAGGGAAATTCTGATATGAAACCGCACTTACATAGGTTGGCGTCTTGT ACAGGGCTCTCTCTTTGCCTCATGGGGTGTTTGACATTTTTAGACCATTA GAAAAAAATAAGCTATCAAAAGAAACAATCATGACCTCTCTTAACCTCAC CAGGGTTCAGCTCAACTGCTTTTCCGAGCTAAGTCTTCACAGACCTAGTT TGAAGGATGACGATGATGATGTGGGAATGGGAGGAAGTTTAAGAACGACT TACTATTTTCCCCTTTTCCACACTCTAAACTTTGTCTTGATTTAGAACCT GAATGGATTCAATTATCTTCTTCGGAAGTAGCTTTGGGGATTATTTTCAT CGCTGTTGGTATCTATATCACCAATCACATCAATAACCTGAAAACAGATT CTACCTACAAAAGGAATATCCGATTGTCTCTATGGGGGTATGTTACATGG AAAATTAATAAATCGACCATTTTGTTTCATTCTAACTTTCAGTACTAACT GTCTATTGTCGGTAATTTGGCCAGCTGTGATGAATCATTTTGATTCCCGT CTTGTCTCAAAATAATATTGGGTGATGATCCAATTATACTTAATATGATA CAATTCGTTTGCAATATACTGGGCATTTTCCTCGATTGTTACGCCCAGGG CGTATTTCTTTACGATGAAGCTTGATGCCCCGATACGAGAGCATATGTGA CAGGACTGAGTACCAATTTTTTTTTTTTCTAGGATAATCTTGAGTTTCGA ATTTTCGTCTCTCATTAGTGCTATCTATGATGTTCTAATGATCGTTTGTA AGTATTTACTACCTTATCCATTATCTCACAAACATGCTTTTTTTTAAGGA TTATAAAGTTTACTAGGCACTTGCGAGCCCCGGGGGGGGGGGGCACTGAC CTTGAAAGCCGATGGGGACGTATCGCTGGAGTCTGAGAAATGGACCCATG GATGGTAATTTTATGAGACCATGTTAGAAAGAAAGATTTTTCCATTTTCA CCCTGAAAATTCTGATTTCCATCCTGAAAATTGTCAAAAGTTACCTAAAG TCGACCCTTTCAGATACACATCTTGAAAATTATTAGATTTAAGACCCTGT AAGATATCTTCAGAGATTAAAAAGGGACCCTGACCAGCGGCACACCCCGT ACCCAATTTTGCCTAAGTCCCCCCCCCCCTGGTTGAGAGTACAGTGTAAA TAGATAAGAGTCCAAAAGGAGCCTTGATGATTTTCAAAATAAGACTTTAG ATTTGAAATTGCTCGAATACCTGCCAATTCTAAATGTTGTATTATCAGAC TGTAATTTTATCTATCAATTGTTTTCAGATGGTGAAATGAACAGATGTAG AGGCATTTTTGTAAGCATCTTATTACTTATCTTTTTATAAGACTTTATAT GTTAGTATCTCTCGATTTTGTGTCAAGTTTAGTAAAAATATCTTGTTATA TTTTAACATTGTTTTTGAAATTGACTATGCAAAGGGAAATTAAATTCTTT TTCTTCGATGACAATGTTTGTTTGTAATTTCCACACAGGTCACTGATGCT GCACTTTTCACGTCTGTACACATCTTTGTTAAGGTAATCTCTTTCTCTAC TCTGCTCGGCTCTTTAGGATATTTATTAGCGCATTATGTACCAGTGATAT CGTTTTCTGCTCTTGTGTCTCATGTATCATAAATTACTGCTCTTTTTGCT TACCGCACCCGTTGGTTTACCTCAACATAAAACGACCTTGAGATCCTTTT CATCGTCCAGCAATGTACTGGTCTTTTTTATATCTTTACATACTTCTGGG TCAAGGTACATTGGTCTGAATGTATCCACGTAATGTTGTGTCTGTTTATT TCGGAATCCCTAAAATTATTCTGTATCTATATGATAGCTTAAATACCTTT AAACTAATAAGGTCAATCAGTGCTCAGAGTTCTTCCGTTTGTATCTAAAG TATATAAAAATGTTTTTCCGTCTCAAAATTCAGCACAATTCACCGAAGTT TTAAAAATATTTGCTAATTCTGGCTAATTTGATGTGTAAAATCCATCTTC AGTCTCAGACGAAAAACCTTGCTTTGATCACTGGCCAAGTGTGTTTAACG TCTTGAAGGTAGATGAAAGGAGTTTTTTTTACTTAGTTGACAAAATGGTT GTTACCTATCTGGGCCATGATGATCATTTTCAAGCCGGAAACATTTGGAA CGAAGAGCAGTAACTCAGACGAAGAAGAAAATTTCAACGATCAACCACCA ATCATCAGAAATTCTCTTATGGGGGTAAATTACTCTTAAAATTATCATTT AATTCCTTTTATTTTTACGGTAAATGAATATTGCTTGATTTAAGAAAAAA TCTCCCTGTGGGTTTTTTCGTTAGTTTAAAAAGCAGTTGCCTTTTGATAA ACTTGAACGAACTCTTTAAAACAGATGGTCCCGGTACAGCTTAAATAAGC GAAAATCGTAGAACACTTATTACTTCTCAATTGTTGCTCTTTTTTTGCAA GCGAAGCAGATATAATAGAGAATTCATAATAATTTTCATATTTGGCTAGA ATTCGCCCGAAATTGTACTAGTTAGATATTTAGTTCATATATAAAGTTTT TCATCGGCTAGAATTGTTGTAATCACAAAAAGAGTAAAACAACTTCGACT GGTAACTATGTTTTTAATCGGTTTCTCGGGATTTTTGAGGTACCAAGAAC TTGCAAACATTCGAAAAGGAGACATCATTTTTTATAAACATTTTATGAGA ATTTTCATTGAGAAAAGCAAATGTGATCAATATCGTACAGGAAAATGGGT ATTTATTGCTAGAACTGATAACATAACATGTCCATTTCGCTCTCTCAAAA GATACATCAGAAAAATTAAGGCTTCCGAGTCAGAGTTTATCTTTCGTGGT TTGACATACTTCAAATCGACGAACTCTTACTTGTATACAGAAACAGTGTT TTCTTTATAGACCGGAGTGAATTTCACCCCGAGGTGATCTAGAGTAATGC AGGGTTCGTTTACTTTCGGAACAAAATCTTTTTCTTTATTTCTAAGGTTT CCTTGGATGTTTGCAAACTTTTTTCCTAGCCAGAACTTTAGGGTAACGTA CTTCATAGTTTCAAACAATGACATTGCAAAGCCGTTATCATGTGTGACTG CCACTGACTCTAAAGTGCGATAATATTAGATGCTTGATACCCGCTTTAAA CTTGGTTTCATTTTGTAGGATTTCAAATCAGAATTTCGTCCTCGGAACCG TAGTTTCAACTACAAGCATTTACGTGACCCTGACAATGAAGAAGAACGTC GACTGTTCAACGAACAAAAAGAAAACGCTATCGTCGAAGCTGAAGAAACG CCAAGAAGAAAACGAAAGAAGAACAAAAGTGGGAACAGCGAATCTTCAAA TACAAGTTCAGCTGGGAAAGCTGTTACCCAAGATGCACCAGTAGATTCTT CTTCCAGTAAAAGGCATAGAGATAAGAATCGTAATCGAACCAATCAAAAA CAGAAGAAACCATCACGTAATGTTGGAATCAATTCTGGTGATATAGAACC AGTCAAAGTTTGATACACGTGCGCCCGGTGCGCCAGTGTTTATGATGAAA ATGATATTTTGATTGTTTGTGACAAGTTTGATTACATCAGAAAATATGTG GTGTTTTGTGCAGATTATTGATTTCAAAGAGAAGACCCATTCTGTACAGC AAAGCTATCTGAATGTGGTCCTTTGTATCGTCTTAATGATATCTTGGCGT ATGAAAACTTCAAATCGAATATCAAATATCAAGCTTAGAGTTAGCTGTTT GGGTGATTTTTAGTTGCCTTCAAAACCTTTATTCGATTTTGTTTTTTGTC GCCATACTTTTTGTATATATTTTCGAAATATTTTTGTAAATATTTTAAAG AGATTTTATAAAGAAGTCGTTTTATAAATGAGCTGGTACAGACTTGTAGT AGTAGCTTCTTTTTTATTATGTTAATGATCAAATTGATGGCAATTAAAAA ACTTAAGCCAGTATAAACTTCATAATTTCTTTATAGTGAGCATTTTTATG GAAACAAATTTCCCTATAATTGCTTTAAAGATGATAGAAATCTCGGTAAA TTGTTTTAAATTGTGCGCCCAAAAACACGTTTACATAAGAAGTGAGTATA CATTACATTGAAGTTCTATTTTGTGAATAATATACCTGTAAATATTATTT AGAAAACCCTTTATATATTTATGCATATAATCACTATACCCCATAATTAT AAGCAATTAACTATTTTAGATTTAGATTTAGATTTTAGTTACAGATTTAT TCCTGTTGAGTTTTAAGTTTGTCTATATTTTTTCGCTGATCCACATAAAA CAGATTTTTAATTTATGAGAGAGAGTTTTTTAAGTAGGGTTGATTTGGCC TCTTGACAAGATTTCTGAAATGTTCCGACGAGAAAAATCAAAGTTTCAAT ATATTTTTTTAGCGAATGAGTCACAGTCCACAATCATCGATTCCTTCATC TAGGAAACTAATTTTCCCTTGATTTGGTCACCAAGTGACTCTTTCACACA CGGATGTTTATTGCTACTTTTTCAGTTCCCCGCAAAAATAAAACGGATAT GAATTGTACTTAGTTTTCTCTTTTATTTTATAATAAGGATATTTTTTCAA AGGTCAATTCCAAAAATATGTCTAAACTTTTCAAGTTGAATTTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000815TCONS_00000815Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000815-proteinTCONS_00000815-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000005supercontigsc0000005:560072..571566 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.13 2.11 1.05 0.97 8.62 6.05 6.75 6.98 5.37 4.91 5.49 4.76 5.94 4.85 4.28 4.8 6.26 6.93 4.81 4.81 8.62 8.78 4.25 5.52 7.57 8.22 3 2.44 4.04 4.15