XLOC_001854 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001854
Unique NameXLOC_001854
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000026:653877..664742-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001854 ID=XLOC_001854|Name=XLOC_001854|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10866bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000026:653877..664742- (Clytia hemisphaerica)
GTGTTTATGACGGTCTAGAGTGGAAATTGCCAAAGTTATTTGATTAATTA
TTTTCTCTCTGGTTGAGGTTTGTTACACTTGTGAAAAAGAGTATCTGAGA
GTAATACGTACACCAGCGAGATATTCGATGTTTTTTGCTGCTTAAAATTT
TTGTAATAATGCGATGCCGGCCCAGGCCTAAGTCGACACCACATTATTAA
CGGGTGGAGGACTAGTCCAGACATCAAACAGAGAAGGGGAGACTGTACGT
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AACACACGGCGTGTGAAGGCTGAGGGTGCGTGTCCGTATTACGACTATCT
AACGCAAAATTAAAAAATTCAAATTGGATTAAAAAAATAGCTATACTTAC
ATCTCTGTGTCCCTTCTGTAGGTCTACCTTTGTGCTTCGAAAACTGCAAG
TAATTGTGATTATTAATACATTTATAGGCAATGACTGTTCTGTATTTACT
AATGTTGTTTTTCTTTTATTGTTCAGGTAGCCGACGAAACGAAGGCAACG
ACTAATGTCCATTTTCGTTGGAGTGTGGTGCAGTCATATAAATCACCTAA
TTCTCTGGGCCCCAACCTCGTTGCAGACCCCAACGTGAACAGCATTATAA
AAATTAAGACCGTGATGATAGAGTTAGAAATTGGAAGTTAGAATGGTTCT
CGTTCTCTGGTTCCTTAACGACGATCGTGTTCAGGCTTTCTTTTCGAGTT
TTTTNGGTTCCTTAACGACGATCATGTTCAGGCTTTCTTTTCGAGTTCTT
TTATTTTCTCCTTCTTTCTTTTCCTTAGCTTTGGCCTTATTAGCCTTCTT
TTGTTTTGTTCTGCGATTGAAGTCTACAATGAGGTTTGGGTCTAAAATAT
TTTCACTAGGCTCCCAAGTAGCCTGCGACAAGGGATATCCTTGCCACTTC
ACAAGATAACTCGTGATTCCAGATCGTTTTCTGGATTTCAGAATTCTTTC
CACCCTATAAACCAGGTCTTCCTGTTCGATTTCCACTGTCGGATCGGGGA
CGTGCGGCATAGAATCTAAGGGGATGCAATCCAACGGGACGTCACAAAAT
TCGTCCTCTCCTTCGACCTCATTGTCCGGTCTTTCCCTGGGGTGTACTTC
TTTATTCTGGAGGCATGGACATTTACTGGGACTCTCCTCCCCTCTATTTC
GAGTTTAAAATTGACAGGCGAAATTTGCTCAACAATACGATATGGTCCAT
GTCAACGGAATCTCAGTTTATTAGAAAGGCCCTTGATAGAGTCCGGCACA
TGTAGCCATATCAAGTCTCCTACAAGAAAAGGCGCGTCCACTGGTGTTTT
TCTTTCTTCGTTCGCTTGCTGGGATCGTTGCATATTTTCTTTCGCGGTCT
CTTGGGCCAAACGAAGGGAGGTTATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TAATGTGGGTATCCTAGTCGTCCTGAAATGCGTCAGTGAACTGGGCGAGT
GTACGTGCTAAAGTTCCATTATACCGCTCCACCAGTCCGTTTGTCGCTGG
GTGATATGCTGTGGTATGAACCCTCTTAATTCGCAAAGCAGTGCTGAGTT
CGGCAACGAGCCTCGCCAGGAAATTCTTTCCGCNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTCGTCAATGTTCGGAGTGAACCCCTTTCTCTCCTAGGTTCTGGACATTC
CCTTGAAAAGTGGCCCAATTTATGGCAATTGTAGCACTCCACACTTCTCC
CATTCGACTCTCCTCGCCTCTCATTCATTCTCCCACCGTTAGTTGGACCT
TGTCCATTCCACTGACGGTCATGGCCGCCTCCTCTCCCATAACTTCTAAA
CTGCCGACCACTAGGTCGAAACTTGCTATGGCCGCTATTTCGTCGATCTT
CAGCCCTGATCTGAGCCTCCGAAAGTTTTGTAACAATGTCTTTCAGCGTG
TCCATCGTTACATCCGATCTCGCAGTAGCAGCATCTGAGGGCTTGTAAGC
CGTCAGATAGCACCTTCTCGCGAGATCCTCTGCCTCCCTGGCCGTCTTTG
GCGATCCAAACACAACCATGTTCCTCATCTTTTCAGTCAGTCCTGATATG
AAAAGATCCATGAGAAACGTGCCATCGTGTGAATCCAAAATCTGTCGGCG
TAGTCCCCTACCGACTCTTTCTCTAACATCTTTATCCTTTCTAGGCTCGA
AAGGGTAAAAACGGTTTTGAACTTTTCGAGGAAAAGCTTCAAAACGTTCT
CCAAGCTTGTTTTATCCGTAGCCGGAAGGTCCTCGAGCCAACGCGCGGCC
CTTCCCGCCACGTATACCGAGAGATATTCAAGGGACTCATTATCGTCCCA
TATCTGAGCCTTAGCTAGAAGCCTAAACCGTTTCACAAAAGCCACTGGGT
CCTCGTTATCGTTTCCCGAAAAAATAGCAACGCTAAACTTAGGGGCCGCT
GGCCGTTTACTTTTTGAAACATATTTTAACGCGTTAGTAAGGCTCCTAAG
AACCTCATCGTTTGGGAGTTCAGGTGTAGCGTCTTCGCGGGGCGCAATCC
CTTCAGTATTCGCCATTATATAGTGGTCCTCTTCTAAGCTGTTGGGGGAG
CTGGACCGTTCAAAACCTAGCAAGGGAGAAAAGCTAAGATCGTCGTTCAT
GGGACGCTGTAACAAAACAGTTTCTTAATCTTTTTTATAAGATGCGNNNN
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ATCTCAACAACGTAAACCTACTATAATCGCTATCAACAACACACTATAAG
TGGTACCTTGACGTCCTGGTTGTTCTTTTCCGTGTAGTCCCTGTGTCCGA
TTGACAGGCTGGTATCGATTCCACCAATCAGATTTCGTCAACACCAAAAA
AAACAACAACTAATAACTCCAGGTAAAAAAAATTTTCAAAAAAATTTCAA
CGAAATAACCAATAAAAAACAACGAAAATTTCAAGGTCGATTCAGGTCAT
TCTACTCCACTAATTTCAAATACTCTTATTCAGCATTCACTTTAATTTTT
GTTCACTCACAGTCAATCATTCGCTTGTTGCACAAAAAACTTCATGGTTG
GCCCAACAAACTCAGTAACTTTGCCTGTGTATAAACAAAAATTAAAGGGA
TCGCTGTGAAACAATCTCAACACTCTTCTGTTATTCTGTTTGGTCATGAG
CTAATCTTGTTCAACTTTCATCAATTCTATTTTTAGCTTGTTTATCATAC
CAAACAGTGTTTCTATTTTCATGTACAGAACTGCGCATATTCTGTACAAC
TAATTTTCTCTGCAAATTTGCAATTCGATTTTCTCCGAAATTTCTCGAAA
ACCTAAATACGTATATCTACTAAACCTCCATCATGATTCCTATATATCTC
ATTAAATTTCTATTATCCACCAACGTGACTGTTCCACGCTCGGGCGCTAA
GCTATGGTCACACGTGGTCCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AGAGTAAAACACTTTCAAGTTTATTCAACCGTAACGAGGGCGTTACGGGC
GTGGAAGGTGGTTTCTGGGCGTAGTACAGAGGCTATAGAATCGCCTCTGT
ACATTTTTATTTCAAACGAGATAACAAGACGTAAGAGCAAACGATGCAGA
TGAACGGGTCATCGAGAAATTGTTACTACCTACCAGTGCCAATAGGTAAC
TCGACGTTCTGTGGATTGAAGAAAGAATGGTCGCCTCGTTTCAATCAGCC
TTTATTGCTGGCAATGTCGATCATTCCTGTATCTTTGTATTGGATGTTTT
TATTCGTATATCTCAAAGCTTTATACAGAATGTTGAAAAAGATGCACAGG
AGGAGCGTATACCGCCATGTTGAAGTCGCAGAGCCTTTTTCAGTCTTCCA
CCGTTATAAAATGTCGTACCCCGTGCTGCAACATATACGAAAAGCAGATA
ATTGAAGTGAAATTATGGTACGTGGTTGTAATAACGGTGTTATTCAAATA
TCTCTGGGACGCTATTGACATCACTTTAGATGTTTACATTTTTATCAATT
GGAGCGAGGAGATGTTATTGATGAGGGAATATATCGAAACACTAGTGTCA
ACAATGCCATATATATTTTTGCCTTGGTTGGATGTATTTGTAAAGTGTTC
ACGTGGAGAATATTTAGACATATGTCAATCTTCCGTGAAAAGTCTTCGAG
TATTCGATCGCCTTCGCAAGACGAAAAGTTTGATCTGTTACACATAGCAA
GAATGAAAAACATGGTTTATGTAGCCAGTTTCATTTTTGAAGATGGTCCA
GAGCTTCTATTGGAATACTTTTACATCGAAAAGTATGTGACGTCATTCAC
TTGGGTTTTGCTGGTTAAAGATATTCTCCTTGGTATTTTCGCCATTATCA
CTTGTATAACCACGCTCAAGTTTTTGCTGTATGGATATAATCAAGAAAAC
CGCACGATTGTCTCATTTATTTGCTACGGTATTTTAGTCATGGCATTTAC
CTTGTCATCCTTGCTAAGAGTTGGTGCCGCATGCTATCAGTATTTAACAA
AGAAATTTAACAGATCTTGTTTTGTGGTATCTGAAGGGAAGATTGTACAG
ACTCCCTTTGAACAAGGTTGCATGCGTGAGATCGATTACGTCATCGCTGC
CCTGACTACAGTCCCGTTGGTCTTATTTGGATTAATCATCATTGTAAATT
GTTGTTCAAGCATCATATCAGAATGTTTGTTTGAAGGCCATAACAAAATC
CCTAGAGAGGGTTCACGCAAGAGGGTTATCACTGTTTCATTTTTCATGTA
TATTCTCAGTCCTGCCGGTGGGTTTACAAACCTTGGTCAACAATCCTCAA
AATTCTTCAATTATATATACGTCAAATTTGGATGCAAGATTTTTGATTGC
TACAAGAAAAGAATGGATTCCACTGTACCAGCTCCTTGTGAGGAGTTTAC
TTCTAATGCAGCCACCGTAAATCAATCGGAATTACACCACTTTGGTGAGG
CAGCTTCCACCGAGAAAAATAATTCTTCGGTTTATTGCGACACTCGCCTT
TGATTTATAGTCTTGAGTTAATGGAAAATTAGAAAGCATTTTTCTTGCTG
CTGAATATAAGTGGAATCGACGCCTGTATTACGAATTGACGCATGTATTT
ATAATTTAAGACAGATAGCTGATACGTCTGTATGGCCTCTCGAATTCCTT
TTTAAAAATTAATTGT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003351TCONS_00003351Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003351-proteinTCONS_00003351-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000026supercontigsc0000026:653877..664742 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.39	0.65	0.88	0.91	4.04	3.51	2.21	2.37	1	1.96	1.85	1.11	1.93	1.74	2.26	2.59	0.98	1.13	2.38	2.09	0.38	0.49	0.03	0.14	1.57	1.03	0	0	0.1	0.03