XLOC_002564 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002564
Unique NameXLOC_002564
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000045:648923..703446-

Legend: gene
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TGTGAAGTTACAGTGATGGTAAATAGCCAAGCCTGGCTATTTCAAACGAA GATGTGTTGATGAGACCTCGACCAGTAATCACGTGGTCAAATTTCGCCGT TAGATTTCTGTTGACCCTAAAATTGCACACTTTTTATGAAAAAAATTCTA TATGGAGATTGAGAAAAGTCACGATAAGAAAATTTATAAAATGTAACCCA AAGGAATTATTATCTTCGGTAATTAAAAAACGAATTTATTCTTCTTTCAC CAGATTTGAACAGTGCTGTATCATCAGAAACGATGCCAGATTCCGAAGAT TCCATTTTCAAAGATGACGAAGATGAGAAAGACAAAAGAAAACAAAAGAA ACGAGGGATTTTTCCCAAAATGGCCACCAATATCATGAAAGCTTGGTTAT TTCAACATTTAAATGTAAGCAGTATATTCAATATCTCATTTAGGCTTTGC GAAATTGAATACGATTGTAATTTTCAAAACCACTCTTGTTTGAGTTGATT CTACTCACATGTTACCTACTTAGGCTCATTAGTTTGGACTCCCACAGTAA TAATGTAATAACTAAATTGATGCCTAAGCAGATTATTCACGTTAAAGTGT TACCCCATCTATCAATGCATTCATGAACCTATCTGCCGCATCTGTAACTG AAACTTTTATGAATATTTAACACTTCTTTTTTTTCTAGCATCCATACCCC TCAGAAGAACAAAAACGTCAACTGGCAAATGAAACTGGTCTTACCATACT TCAAGTTAATAATTGGTATGTTTTCCAACAATCTTTTAACAACCTGGCTA TTCGTAAACGATAGACAGTATTCCGGTTCTAGAAGGCTGCCCTGTCCGTA GACGTCAAATTTCATTTTTTTACCTTGCGCTGTAATTTTACATAAAACTA TTTGTTTTTTTTTTAGATTGACGATGTGCTCAAGCGCTAAACATTGAATT TCAAAAATTTTCATCATCTGTTGAAACTATAGTCCCCGATCAATACTTTT CTTTTCCCTTTTCAGAAAAGCTTATCATCGTCAATATTTTTTCATATTTC ATGTAGGTTTATCAATGCAAGGCGGCGTATCGTCCAACCCATGATCGATG CATCAAACCGGGCAGGTAAATCACCGGTTGTCACAGTATATAAATCACGT AAACGTAAAAATTCGGGATCGGACAGTATTTCACCAGGACCTTTTCCCTA TCCACCAATGGGTGGCCATTATTCGGCGCCATATTTAAACGAACATTACT CTGGGATGTATTCACAATACCATAATGACATCACAGGAGCTTCAACGACT ACACCGCATGCGCACTACAGTCCAAGGTCGTACGGGTGTGGCGCATCTGA TCAACATTCGATGGGTGTCTCTCTACCTCCACAAACCAGCTGTGCTCCTA TGAGACAGCATTCTTCATCTTCTTATGGAACTTATAGGACCTCCCCGGTC CCTCCTACTCCACAGTCTCCCTTCTTAGGGCACACACATCCTTCAATGAT GCCACCGTCTACGAATACGCCCAACCTTCATGGTTACCACCAGACACACC CAGCATCTTATCCGCCCCCTCCGCCTCACCAATACACGCCCCACGAAGAA CTCACGCCCCATACCGTTCATAGTGTTATGAATATGCATAATATATAACA CTTGCCTCCCTTCTTTCTCCCTTATTACGATATAAATAGTTTTCACCATT AATTTTTTCTGTGTGTTGTTTTTTATACTATTTTTTAAGAAATTTTATGT TGCTGTTATATTAAATAAATCATAGTTCATTCTCCTTAGGGCCATGTAAT GGTCTGGAGAATTTTTTAAAAGAAATTTTAACCATTTTGTTAGATAAAAA AAAGTTAAAAGCGGTCGTTAATATATGTTTTCTATAATATTTTTAACCTA ACTTCGGAGAATCGGTGATGAATATCCTTAAATAACATATTTTCACATTT TAGGAAGCTATTTCTAATGGATTCCTTTTGAAAATGCAATCGTTTGATGT ATTTTGAGTTTTTTAAATTCTAATTTTTCTTAAAATTCCAGTTGCTTTTC TGTCTTAACTTTAAATTAATTAAAAAGTGCTTAATATTTATTTTATATTA TTTCGCTTGATTTTTTAAAGAAAATACTTTTTTCTGCTTTTAGAAATTTT TGACCGTTTAATAATGGGCTGTAAATAATGATGTAGCTTTGTCCTTTTTG TAATTTTACCATATTTTAATTAAAAGCAAGAACTTTAGTTCTTACCTTAT TATATGAGAAAATTTGAAATAGAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004570TCONS_00004570Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004569TCONS_00004569Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004568TCONS_00004568Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004567TCONS_00004567Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004566TCONS_00004566Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004565TCONS_00004565Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004564TCONS_00004564Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004563TCONS_00004563Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004562TCONS_00004562Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004561TCONS_00004561Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004568-proteinTCONS_00004568-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000045supercontigsc0000045:648923..703446 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.71 1.92 4.81 4.24 0.99 0.7 10.4 11.42 14 14.43 9.3 9.88 3.36 3.03 42.33 21.01 47.22 38.59 1.53 1.33 33.61 36.59 16.35 24.94 27.04 30.6 237.44 153.79 105.25 115.35