XLOC_029671 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_029671
Unique Name	XLOC_029671
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_112:976..10666+

gene from alignment at scaffold_112:976..10666+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_029671 ID=XLOC_029671|Name=XLOC_029671|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9691bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_112:976..10666+ (Clytia hemisphaerica)
TTGACAAAAAGATGGTAGATGATGCTTCTAAAaaattatatctacagtat
tcttcaaattttcctAGAATATTTagtaggggtcacctaaattcttgagg
ggggggggactagAACCTGCTTATAAGCCATGTTAtactttattatttgt
ttttaatcCCCCAGATAATATCTTTTTACaagttattcttataataaaga
gcGTGTACTTTTTTGATTATTCAGGGACAGAAGTTGACTATCCTATTGAT
GTTGGGCCGATTAAAGCAGGGAAAGCAACCCTGCGCTGCATGCTTTTGTG
TTGGACAGGGGACTACCCGGCACAATGCCAGATTGGCAAATTCTCGAACA
AGGGTACTTTTGGTTGTCGTGTCGATGATTGTGAAGGTAAAAagaagttt
gttttcaagtttacTGTTTGTAACACTTGTAACANNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATTTCTATGAAGATT
TCTATGAAGATTTCTATGAAGATTTCTATGAAGATTTCTATGAAGATTTC
TATGAAGATTTCTATGAAGATTTTTCTTATTAGTCACTCCCGGTGACTCT
TAAAATTGGTTCGACAATTTTACATACTACATGGTGTTCAtaaatatgta
ttttccaaaaatcaaaatgttaaaaacataacTAAAAGTTTCATGCACTT
ACGTACAATCATCAGATGATGATACATGGtgtttatattaaaaaaatccC
CAAAAAACGATAGTTTTGAACAACAATAGATTCTATTGTTTATCAAGGAA
TTTTTATGGTAGAAAAAGTAGATTTAGTTAGGTTCAGTGTTTGTTTCACT
CTAAATAGTTTCTGTTTAGTGTCTGGCAGGCTCTTCTAATGAATATCCAG
TCCCTTAGTacgctctgggtacgagattggaGTAAAATGTATTGTAAACC
AGGTATTCAATCAGCAGCATTAGATTAACTTAAGGCAATGACTGTTGTCG
AAAACCAACTTCTCCATTATTGCCTGCAGCCCCTTTATCAAaggaatgaa
ataaaaatacttaCAGCTTTTCTAAAGATAGCAGCCAAAAGGATTGCGAC
GATGACAGCTTTTAGTGGTTGAATGACCAATACGGATTGAAAGAATCCAG
CAAACATTGACGCAAGCCTATCCATGAAGTGAAAgagtaaaaaatgctgt
cacagAGATTGAACTACTCAGGGTGTATCTCATTTATAATGCAGTGAAGA
AGAATTCTGAAATTTTCGTATATATCGGGTCTGCTCACAGACAAAGATTA
AACCTACAATCtcagtcaaaatatattgagaattttggtcgATTCCACGT
TTTTAGCAATTACTCCAGGCGCTGGGGAAACTTTCGTATGCAAATCACTG
CGTACAGTTGAAACCTTTTGATTCGTGTTATGTATGGTCTAAAGTTTCTA
AAAGATTTGGTCCCGTTCCCGTGGGCGGTGGCACCAACCCTGGGAACGCC
CTTTTGGGCGTAAAGAATCGTTGCTTGGGTGGTTCCGCCAAAAGTGGTCA
TATTATATATCAATCGACGCGAAATTTTATACTGATTTNTCAAAAGTGGT
CATATTATATATCAATCGACGCGAAATTTTATACTGATTTGAAAAAAGGT
TAACGTTATGGGCAAAAAAATCGAGTGTTCAAAAGTTATTAACGTTTGAA
TGTGGAAGGGTAATTTATAGAATTATCTACTCGTATTAGCCATTTAAACG
TCATTAATGACTCAAAAGAGCAGATATTATAGATTAACACCTTTTTCTTa
acaattttttgtttctatttatttcacGATAATTGAATCATTTATTTGAA
TCATAAGTGAACCATtgatcttttttctaaaattttctttttcttaatgA
ATGGAAACGTCTCTTTACGCTGAAGAGGAATTTGAATTTTGTGTAGTANN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATGTTTGCCATTTACCAAACATTA
TAAGAGTCATAAGTCAAAATAAAAGATGTTTTATCTCATAATAAAAGGCA
GCATGTGATACAAGTCAAATCTGAAGAAGATGGTAAAATGTTCCTTTCAC
TTGTCATGATTTAATTTTATAGGTTGAAGAAGAGATCAGTCGAAAGCCAA
ATGAAATTGCATCAATGTGTCCAGATAAGCGAAGCCTCAGTCATGTTCTg
gaatgtcaaaaattgatcAAAGGGGGCAAATTTTCCAACCGTGGTGTAAT
TCCAGCCGAGTTTGTAGTAGCCGAAAAAACAAATTTCGATGAAATAGAAG
AGAAAACCAATCGTGACTTTAAAATATGGTTAAGCGCAAGATGCATCGAT
CGAATTGACGACCATCCAAAGAACATACCAACCTTTTCAGCTATGAACAG
CTtgcttcaaaataaagaaattgtTAAAACTAAAATTGCATTCACCCCTA
TCCTGCCATACGTAGCAACAGAATATGACACAATCCATACAATAATGTGT
AATTTCCAAGATGTTCTTCGTCAAAAGTCTCAACCATACGGTCCACTCTG
GTGTGATGAAGGTGTGTATCGCCTGGCTAAAGAACTCCAGCTGCTCAACC
AAAATTGCTTTTGTGACATCTTTTTGGGACTCGGTGTGTTTCATATGGAA
AAAGTTCTGATCGCTTGTTGTGGAAAATATCTTGAGGAAACTGGCATTGG
TACAGTCCTGTCTGAGAACGAAGTTTATGGTCCTGAGAATGTAAAGTCTG
TCATGGATGGTGGTAACTATGTGCGCGGTGCCAGAGGTATGTCATTGATT
GCCGAAGTGGTCCAATCACTCAAGCTGAACCAATTTGCTAAACAAAATGG
GGTGAGCGTCTTCACAGAAACCGACCGAATCACAGAAGACATGCTAGAAA
GCaaaagtaaaaatgaaaaagatgacaCTTTGACTGATGCATTACTCCAA
CTAAATACGAAAGCATCCTCGAAAGAGTTTGAAACCTTCCAATCCAATGG
TACACAAAGTAGCCATCAGTTTGCTTTTTGGAATACCTTTCTCAGCACCA
TCTACCCAGCTTTACGTGACCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNGCACTAAGACGTCTGCATTAAAAATGGCTTCAACGGGAAACTT
CTCTGGTTTAATTGCCTTCGGTCAGTCTGAGATTATTAATCAACGTGTGC
TCGAAGACGCGGAGGATTTTCTGCTTCGGTGTGTCTCCAAAGATGTTAAC
TTCAAGACGTTCGATAGCCTTCGAAATTTTGTTTACTACAAAAAGGCTAC
TGAGGTAAACCTCGAAAGGCTGCCTTCAACATCTTCCAGTATCTACTTAC
ACATCAAACGGGCGTTCCTGCAAGCATTTATCTGGTTGCATGCTCCTTTT
TTGGCAGAGATGGATATCGACCCATTAAACTTTGGGTACAAGATGGAGGA
GGAAGATGTTGATTGTGAGGATATTAATCCTCAAATAGTCACCGATGTTT
TACCAGAAGACTTTCCTATGCCATGTAAATGTGTTAAGTGTGCAAAGGAA
AGATTAGAACTTTGTGATGTAATTCTGTAataattgcaaaattttgaaat
tttcatttccacGAATGAGGATATCAATAAAAGCTTTAACTTGGACTGAA
ATTGACCTAATAAATAGAATTCTATGATATGCCTAAACGTAATTAGACAT
ACAATAAGTATATAGTTCAAACAAAGTTgtatatagaaaaaaaatttgta
aacacttatttaattaaaaagttaaatattttttcacaacATGTTTGCCT
GACAACACGTTTACCTTGGATATTTCAAATGCTTATAACCTTTGAACACT
TGATCTTTTTGCCCATAAGATTAACCTTTTTTCAAATCAGTATAAAATTT
CGCGTCGATTGATATATAATATGACCACTTTTAGCGGAACCACCCAAGCA
ACGATTTTTTACGCCCAAAAGGGCGTTCCCAGGTTTGGTGCCAACGCCCT
CGGTAACGGGACCAAATTTTTTAGAAACTTCAGACCATACATAACACGAA
TCAAAAGGTTCCAACTGTACGCAGTGATTTGCATACGAAAGTTTCCCCAG
CGCCTAGagtacaagtcagaatcttcatttcaatgaaaacctccgttttg
ggggccatatactgtagtactcttaggttccaaataaacgggggggttgg
aaaatttttccagATTTCAATAaaggggggggacctaattgccggggggg
ttggaaattgtacttctgaaacccaaaaataaggtagaaataggctaaaa
tcaggctatttagagcaaaataaggggtcttctctttgacagctgaaaat
attcttagagattaataaacggggggggNgccttctctttgacagctgaa
aatattcttagagattaataaacgggggggggtcctaataaggtccgggg
ggttggaaaattttcgaaaaattaacaagtttatttggaacctaagagta
aacagctacaaaatttaaagtatcaaaaataagacaaaaggccaaaaata
cttttttagaGTATCAAGCCTGaaacaaaGCAGAGAAGTGCAACTGCTAA
AAGGCTAAGAGAGTTAAGACTTAAAAAATCTCCTAAATAGTTAACCAGTG
TATGataataagaaaacaaaaataagtttaaaacactaaaattcatggat
aaaataaattaaatgaataaataaattagcTCAAGATTTGGAAAGATTGG
CCAAAAACCCTTAGAAACAAGGAATCGAATTAGTTTGAAATGTAAGGTTT
TAATGAAATCGAGGAGGAGATTCAAACCAAATCTTATTGTGGTTTTTTCA
TCTTAGGAGTTTCAGTAGAAGGGAGTAGAACTAAATATTACACCNTAGGA
ATGGAATTAGTTTGAAATGTAAGGTTTTAATGAAATCGAGGAGGAGATTC
AAACCAAATCTTATTGTGGTTTTTTCATCTTAGGAGTTTCAGTAGNAGGA
GATTCAAACCAAATCTTATTGTGGTTTTTTCATCTTAGGAGTTTCAGTTG
AAGGGAGTAGAACTAAATATTACACCAACAACCGCCAACGTTATACAGAG
CCATGGAACAAACGAAACTTTGTAACCGAGTATGACACCAN

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00046486	TCONS_00046486	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00046487	TCONS_00046487	Clytia hemisphaerica	transcript

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_112	supercontig	scaffold_112:976..10666 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.33	0.43	1	0.37	21.06	19.02	9.48	12.97	4.76	8.13	3.51	1.6	2.61	2.75	1.85	3.54	2.71	1.95	2.38	3.48	1	1.25	1.24	0.92	8.95	9.42	1.17	1.21	0.56	1

You are here

XLOC_029671 (gene) - C. hemisphaerica