XLOC_030052 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030052
Unique NameXLOC_030052
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_122:129761..151791-

Legend: gene
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>XLOC_030052 ID=XLOC_030052|Name=XLOC_030052|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22031bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_122:129761..151791- (Clytia hemisphaerica)
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ATTTTACTTTTTTATTTGGTTTGTATGGCTCCATGCAATAATTTTATCAT ACTTTAAATTTTCTCACTTTTCTATAACTCTTTAGTGGGAGCTAACATGA ATAAGATGATTGCAAGCCCTCCAGAAAACAAACAGCTCACTTTTGCACTA GTAAGTATAGACAGGGTTGAAAATACCTTGAAAGTGTCTTTTTTCAAGTA TTTTACTTAACTGTGTTACCAAGCATTAAATTCACTTTAAGATTTCAATG ACATTCTTTTCTTTTTTCCAGAAATCTGCGCAAGATGATAGCGCAGAACG AGACGAGAAAACGTTGATAGGTTACGCAATGTTGACACTGAATAACTGAA ACGTCAATCAGTCATCACAAGTAGGAAAACCCTTTCAATGAAGCTAAGGC TGCAGGCATTTCAGACTCGTGTCGTAACCAATGAACTTTTTAGTAGACCC CTTCTCGTGACACATAGAACAATAGCCAGAAAAAAAACGTATCAAGTTTT CTGCATTATTGCCGCCATGTTATGTCAAGAAAATGTTTTATTTTTATATT ATGATTCAATATACATATTATTTACTACTATGTTTGACCTGAAAATGTTT TTTCACAAAAACACAACTAGCGTTGTGGAGTCGACTATCTACTAGTGAAA TTTTGAAATCTGATACTCTGCTTTCAAGCACAGAAAATGATACTAATAAC GATTCAGCATCCCTTTTGGTCGGATTTTAATTTTTATTTATTTTGAAAAC AATATTTGCGTGTTGGATACTTTCTTACTTAGGTGAACACAATCTGACTC AATTGAAACACTTCTCACAGACCCAGTAGGACTTTTTCAGTCAGTGGAGA TAAGAAGCATATATCATAATATTTTACAGTGAGTGTTGGTTTGTTTGATT ATTTTCAGTGGGGAAAAATTGAAGGATCATTTTCCACCGGGGATGATTAT GTTGGCCAATTTTTCCAGTGGGAATGGGTCTGTGAGAAGTCTGAAGTCTT TTTTATACATAAACGGGGTGTGTCTGCTAAATGAAAGCATTGAAATGGTT ACTTATGGCTGTTAACACAATACATCGTTTAAAATGCAAGTCTTTTTTTA CATACACTCAAACAGGTTAGGTTCTTTCAGGTTTCCAAACCTTGTTCTGT TCAACTTTTTTAGATTAACGTACAAGTATACTGAAACTTTTAGAATGAGT AATCTATTGGGATTGGTTTCCTAAAAATCAACCCTGGACATATCTAGAAA AATATATGAAATAAAAAAGATTTAGGTTGGCTTTAGCACCGAAAATACAA CTTTCTAGAATTTCATACGGACTGATTTTACAAGTCAGCAATCTCACACG ATTTTACGAGATACAAATTTTTATCTCGCTAAATTTAATTCAATAAAATC CGATTCGAGTATACAATTAGATACGATAGACTTTTTCATAAATTAAGCCA CGAACATCACTTGCCTCGTTTTGAAATTATGTGCCATGGTGATTAACTAT TCATAAAAATCATTTGATGTCTCAAGGGATATGATCACCATGGTAATTGT TTGAATACAAGACAAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGTTTACGTCTAT TACGTTCCAGATGTTTCTGACTACCATCATGTAGAATTTCAAAATGTAGA AAAAATCTTTGAAAATTTAATGAATAAATTGCTACAGTATCACTTTTTTG ATTAATTTGTTATTTAAAATTTTTTGTCTTTGTAAAAAACTATCTTAATA AAAGAGGAATATCTGTCTATTTTATATTAATAACCCTTTGCAAATTTGTA GTAGAAACTGTTGTTGAACATGTCGTACAAAATTTCTTTAGAAAACAAAA GAAATCAAAAATCCTTCACTTTATTTCTAAGTCTTGTATTCCTTTCCAAC GAGAGAATTTTACTTTGATAAAATGGGAATGAATTTTATGAGGCAGTTTT AGATCTATATTTTTCAGATGTCAGTCTTTGTATCATTTTCGCGTGTTTTT ATACTCGTATCCCTGTCTCAGTGACCCTGTGGAACTTATTTTTCCATGGC GATAAAAAGGGGCTGAAGAAAATGGGGATTGAAACCATTCTTATTTTTTT ATACGTTTGATTTATATGGGTGTTTTTTGTACGGGTAAAAACTTCAGGTG GAATTGCCAAGCTCTTAGGATTTTAATGGTAATGAATACAGAATATTTTT CGCACAGAGACATCTTCTTGGCCTATCATTCCAGTGAGTTTGAAACAATT TGTCTTATGTTGTTTTCTTTAACTTCTTTTAATTATAGTTTGAAAGAATT CGAAAATATGTTCAGCCAAACTAGATTACCATTATTACTTCAAAAAGCCT TCAAAAGAGGATTATGTACAGACCGGCCAGTCAACGAACTTCGTGTCGGT ATCATCGGCATGGGACAAGTCGGAAACGCCGTCATCAAGAATCTACAAAA ACACAAATTCAACGTCACTTCCATTCTTGATCTCGATACTTCAAAATGTG AAAGTTTCAACGCCACCTTAGCGCCCAACCCACGCGCCTTAGTTGAAGAT GTTGATATAGTAGTAACCGCCCTTCCTAAGCCACCCCATATCAAATCCGC CTTTGAGGGTGAAGACGGCATTTTACAAGGCATCAAGGAGCATAAAATCT GGATCGACCATTCAACGACAGATTATGAACAAACGCAAAATTTTGCGCAA CTAGTCAATGATAAGGGTGGACATTTACTAGAATCCCCTGTGACGGGTGG ATTGGAGGCGTTAAAGAAGGGACAAATGACAACATTGGTGGCTGGTGAAA AAGACGTCTTTGAATACATTAGACCAATCCTTGATGCTAGCTACCACAAT GTGTTATTTACCGGACCACTTGGTACGGCCCTTATCCCGAAAGCCATTTC AAACACTTTCGCATCCATGATTTGTATTGCAGCTGCTGAAGCTCTCATCA TTTGCAAGCGCGCGGGGATGGATGAAAAAACTGCTTTTGACGCCTTTAGA GCTTCCACTGGAAACAGCTTTGTTTTTGAAACAGCAGTTCCCATGATTTG TCAAGGGACTTATGATCCATCTTTTACACTGGATTTACATTGCAAGGACA ATCAGCTGGTGCATGATTTCGCACGACGACTTGGTGTACCCATCGAACTT CTCGGTCACGTTCAACAAATGTAAGTCTCGTTTCCTTCTTCCTAGTTTCC CATACCTGAAAGTTTAGAAAAAAAGGTTTTCATTTGAAACTTAATTTTAT GGGAATAGATTAGTTGTCGGTCTCATATATCAGCTTTGATGGAATGTTCC TGACTTTTTGTTGCCTCTTCACGGAGTGAAAATATTACTGTAACTCATTT AAGTACATTTGATCTAGCTAAACAAAATAACAAAAGTTGCCTGGACTGAG GGGTACTTTTCACTGAGCACTGAGGATCGTAGTAAATTATCAAAACTAAT CTCTAGGTACAACCCTTAAAATTTCACAGAAATTAAAGCAGTTAAAAATC AAAAGATTACGAATTGAAAAACTCGAAAAACGGGCAGATCAAGAAAGCAA AAATTTAATTAAACTAAGTTTTAATTAAACTATTTAATTATCTGTAAATT ACCAGGTACAACAGGGCCCTGAGTAAGTACGGTCCAGATGCACCTTGTTA CATACCGGCCAAGCTTGTAGAAGATGCTTGTCACGAGAGCTTACAAAATG ACGCTTTCAAAGATTGGAGTTACAGCATTGAGAATGTGGATGGGTCAGCC GTCATTCGCCATAAAGGTATCGATACACCACGCACCGGCCATCCCATGAT CTGATTTCGCTTCAACTTTCAGCATTTTAGAATCTTTCTTTGAATTGTTA TTTGTAAATTGTTAATTGCTATATAATGTTTTGATTGTTTGTTAAATTGG TAAATATTTTTCAATTTTTTATAGTATGATAAATCTGTATTGATGAAGAG AAAAGAAAGTTTTAATGTAAACTCGCAGAGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047142TCONS_00047142Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047141TCONS_00047141Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047140TCONS_00047140Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047139TCONS_00047139Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047138TCONS_00047138Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047137TCONS_00047137Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047136TCONS_00047136Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047135TCONS_00047135Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047134TCONS_00047134Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047139-proteinTCONS_00047139-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_122supercontigscaffold_122:129761..151791 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
STK39PREDICTED: STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase isoform X1 Homo Sapiens
OXSR1PREDICTED: serine/threonine-protein kinase OSR1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
40.71 36.93 43.9 43.04 41.82 34.18 50.12 54.75 45.36 48.56 40.69 37.11 44.46 42.08 45.6 52.82 80.7 66.02 34.22 36.04 45.38 48.73 49.27 47.73 47.9 47.86 56.45 44.51 175.97 103.28