XLOC_030055 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_030055
Unique NameXLOC_030055
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_122:211674..232092-

Legend: gene
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>XLOC_030055 ID=XLOC_030055|Name=XLOC_030055|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20419bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_122:211674..232092- (Clytia hemisphaerica)
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CTCAACTCAACTGGGATATAAACGAAAAATAGATCCTCGATAGACCTTTT CATAAATCACGTCACGAACATTACTTGCCTCGCTTTGAAATTATTGCCAT GGTGATTAACTCCCAGCGGATTTTACTAAAACTACTTCCTATTCATAAAA AAATCATTTAATGTCTCAAGAGACATTATTACCATGGTAATTGTTTGAAT ACGAGGCAATTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAACGTCTATTGAAGT AAAATTTTAGGCCTTTGCGTGAAAAAAAAATTACTAGTAGTTGAATTGCC TCAACTTTTAACTCCGTTATGCTACTTTCTTTTATTTTGGAAAGATATTT TTTGTTAACTATCGGTCTCTTTCTCTTATCAAAAAGGTGTTTGCACATAG CAGCGAAGAACGGGCTATCTGACGTTGTCAGCTCACTGGTGGATCGTGGT GCCAACTTTCTAGCGGAAGATAAACAAGGTACAAATGCAACTGATCGTCG TACTTCTGTTACTAGATGGTGGCAAACTTAAAATGTTCATTATAAACATC TCATTTCTAAATTTAAATTTAAAGTAAACTGGAGCACGATAAAATCTAAT TGGCATGTCAGTAATTAATGTTTGGGATTTTTGCTACAAGGGAATCATAG GCGTAGCGAGATACCCTTCAAAATTTATGGATGAGAGCGGTTTTTACGAC ACTATAATTATTGTCTTTGTTTTATCGAAAGATAATGAATATATGTCATA AACGTCTGCACTCCCTCATAAATTTTGCAGGGTATCTCGCTTCGCCTATG GGAATCATCTTAAATTCAGTGTCCTTAAGGTTTGAAAAATTACATATTTT TTGCTTGCAGTTTGCATGTTGTCATCATACAGTAAGAAGCTTGCTTTTTA GCTCAGAACCTCAGAACCATAACATGCCAGCATTCGCAAGTTTTGTAATA ATTGTTAGTTGTATACTTGCATGACGATTCTCCTGCTTTTTTACACTTAG GATTCTGGCCAGCATTGGCGTGTGCCCCCAATAACGAAGTTGCTGAATGT CTACGCATCTTGATTTTGGCCATGTTACCTTCGAGTGATGCCTCTACTCT TTCCAGTACCATGGCGCGCACGTCTATCGTCTCGCCACTTGACCAGGGGG ATGAGATGCACGTGGATGAGTAGGTTTGTTGATTGGACCAATCAGTGTTC AGGTTTGAATTGATCATCCAATGGGATGGTGCATGAGGAAATGAATTAAC CAATAAGCTACCGCGCATTTGTTGTTTTCGAATGACTAACGGCGTGTGTT TTGAAGTTTGTCAATTTTGTGACAACCAACACACTGTAATGATTATGAAA AGTTGTTTTTTAGAAATGATGATGATAATTTTAATTCCATAAGTCTATAT TTTTCTAACCTTATAAAACTTTAGAAGCCACTGATATTGGCCGTGTTGTA CGCAATTGTAGATTTACAGCTTTTTATCGAAGCACTGATGCGTTTGTAAC GTTTTACTGAACAGCAGAGCGAATTTTAGTCTAGTCGAACCTGAAATTAT TACACATATCAACCAGGAATTTGTTGATCATTTGGGCATGTTTATACTCT GATTATTAAATTTATGTCATTTTGAGACAACTGAATCCTTTCGCAGGTTT TCTGACCTCTTCAATTTTTGATAAGTCTTTATAAACAACTTTCCATAACT CGTAATAATTCGAAACAAATTTACGTTCCAAATGCGTGTTTGAGTTATTG AGACTCCCCTGAAGCGACTATAGGTTTGCCGAAGCTTCGTCTTATCTTTC AGGTATTCCTGAATTGCAATTGTAGAATACCTAATAGAGTTTTTCAAATT AGATATTAGATATATTAACTTCTTTAGTTTGGGCATGATAACATGAAAAG AAATTTTTTATCTATTTTTTCATCAAAAGATATTACATGCATACTTTTTT GTTCTTTTATTTTTAATGTTTTTTTTTTCTAACTTTATTTGATTCTTTTG CTTGCAATTAATTTCTTTAGTTTTTTCTGTTTTCACGCTAAATTAAGGGA ACCTTCCTAAGTTGAGTGGATTGGGTATTATTTTTCGTGTAGAAGAAAAG AAAGAACAATGTTTTGTCTTTTCGAGTAATTTTGATCTTTTATTGTTCCT ACTTGTGTAATTGAACCTCTTTGAGATGCAAGTTTAAAGTTCTGATTTTA ACTAATATGTAATGAAATCTTTTTGAATAAGATTATGGAAGAGCTCAGAA TTATAGCAGCACTTTTCCATTAGACTGTTAGAAATTACATGAAACACTTT ATTAGAATAATTTTGTAACTTTAGATTTTTTGAGTTCCTAACAATAGAAG AAGATATTTTGTAACGAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047148TCONS_00047148Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047147TCONS_00047147Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00047146TCONS_00047146Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00047148-proteinTCONS_00047148-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_122supercontigscaffold_122:211674..232092 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ANKRD44PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit B isoform X1 Homo Sapiens
ANKRD28PREDICTED: serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A isoform X2 Homo Sapiens
ANKRD52serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit C Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.94 10.62 4.75 4.37 69.2 52.41 35.95 39.14 23.1 31.33 22.5 19.85 15.39 16.25 16.35 19.22 33.45 36.93 15.09 17.67 21.26 22.64 21.68 24.46 22.97 21.67 16.63 15 25.33 27.36