XLOC_031568 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031568
Unique NameXLOC_031568
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_166:21135..48994-

Legend: gene
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>XLOC_031568 ID=XLOC_031568|Name=XLOC_031568|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=27860bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_166:21135..48994- (Clytia hemisphaerica)
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TTTCGCCATTTTCGCAAAAATAAAACTCGCAAAATCGTTTTGGATCATTC GCAAAATTAAACCCACCTAGATTACGAAAAACAAGTCCGGTAAAAAATTT GCTCGCGTATATAAGAATTTGGCATTACTAGTACAACTGCTATAAATTTG AATATAAATCAATATCTCGTATATCAAAATTGTTCGAGGATTTTCCCCAC TGTAACGTTTAAACAAACTATTATATGAAACTTTCACATAAGCCCTAGTG AGGAGAAAGTCTAAATTTGGGATTAAAGTTTTACAACAGGTTTTGTCATA TCTCGATAATTTAGTCCCTAAGGGTCAATACCCCCTCCCCACCCTAGGTT CTTCCCCATTTTAGAATTTTATTATACCCCCCTCAGATTTTTTAAATCCT ACCGTAAAGCTACTGATGAAACATCAACAACAGTGTAAATAAGTAAATAA TAAGGAAATCCGGACTTGGTGTACACTTTGAAGACGTTGCACATAAAAAA TCAAACTTCTAATTTGGGAAAAAAAAAACAAAAAAACATACCACTGACAT CTTCACCCTTTATAAGGGGGGGGTTGGCAAACTATGGACCCATAGACTAT AACAATAATTATTAGATACCAAAGATTTCTAAAATGGTACTTGATGCCTC TCTGCTTGATGCTCAGCAATTAAGAGAAGGATTAAGGGTAAGTGGAGCAA TCCAGAGAGAAAGGCGCCCTACACTACCTTCGGGTAGATAGCTATCGGTA GAGGAGCCCGACCGCGGTCGCAGATCTACTTACTAGAGTCTTAAATATTA TGACTTTGATTGCAGGTCTTGGACAAAGAAAACAACGAACTAGTGGACAA TCTCACTAAACGTATCGATGGCTTAGATAATGAATTAGCTGAACTCAACA AATTACTTTGCGGTGGCTCATCTGATGATTGCGGTGGCTGCACAGCGAGC 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CTCCCAGAACTAAAGAAGAAATACAATCGTAATGAAGAAAGAGTCAAAGA TTTAATGGACGAATTGAAACGTCTTGAGATCCTGGTCGGTTCATCAAAAG AAAAATTAGTTGAACTATCAAAATGTCATGCTAACTGCAATCCTTTTATC CTGGGTAAGATTTGTCAAACACAATTAAATAGCTTGGAAACTAAACAAAA GAACGCATTGGATACCCATGATGCTATGGTAAAAAATCGAAAGCAGGCTA GTGAATCATAAAAAGACATGTTGGAAGTCAGGCTAGATACCTGTTTTTAC AAAATTATTGCTATTTTGACGCAAAAATACTGTTTAAAGATATGCTAATG CGTTATTAGAAGTTAGCGAAAACTGACTTGCCTCGCTTAATAACCTCTAT AAAAGAACAACGGACGAAGTTATGGTATGATTGAGCGAGACAAAAAGATG ATAGAAGTGAGCTGTTAGTAATATTTATGCTTAGGAAATTAATTTTTTCT GTTAGAGGAAATGCGAAAAATTACAAAAAAGTTTTTTAAGAAACTTATGA CAAAACTTTTTTTTCGAAGATTTTTTTTTTAGATATCACACTTAATCAAA TTAATCAAATAATTTTTTAAAGATTTTCCCCCTTTTACATTATACCACCG TATCTTTTATTAAAAAAGTTGATAATTTTCATGAAGAGGCAAATATCAAT GGTCTGTATTGGTCTCATTGAAGGCTTTGAACTTTTGTAACTTGCTCTGA AAATAAATAATTTTGACCCCTTTTGAGTTAGAAACGTGTTGGACAACATT TGAATAAGAATTTGTTATTATTTGGTAACCACCCTCCCCCCTCCGCCACA GGGAATAGAGAAAAGAGAAGTTGTTGCTGTCTACTATTGTCTATTATATA CTCAAAATTTGATATACCGATTTGGGATCTTTTAAGAAAATCTTTAACAA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049799TCONS_00049799Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Subunit beta laminin proteinTCONS_00049799-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_166supercontigscaffold_166:21135..48994 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
LAMB4PREDICTED: laminin subunit beta-4 isoform X2 Homo Sapiens
LAMB2laminin subunit beta-2 precursor Homo Sapiens
LAMB1laminin subunit beta-1 precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.1 0.11 0.1 0.04 71.24 60.49 112.64 128.89 41.5 66.81 53.11 17.08 95.68 94.07 41.13 44.24 91.25 124.69 69.28 62.02 75.05 72.85 23.02 30.49 60.39 54.94 2.08 3.61 47.68 55.23