XLOC_031874 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031874
Unique NameXLOC_031874
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_169:163500..176142-

Legend: gene
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>XLOC_031874 ID=XLOC_031874|Name=XLOC_031874|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12643bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_169:163500..176142- (Clytia hemisphaerica)
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AGCCTTAAAACCGATACACCTTTGGCAGCGTAGTATTTTTTTCTCCCCCC CCCCCCTGTGTTTAAATTTCATTTGGCTTATCTGCAGATAAGTATTTCGC TCTTCCAGGGAATCATCAATTTAGCTTAAGGGTAGCGACCAAAGCATAAA CCAGGCTGATTCAACAGGGATTAAAAAGTTCTGAGCTTATCTTTAATTTC TTTTGGGATAAATTTACATTTTATAGAGCTTCACGAGCGTCAATTGCATG AGCAAATGTTGAATCAAAAGTTGAGTGACTGTGAACACGAGAGACAAAGC ATGGTACGTATATTGTTTGCTTCCAAGAAAAATCAAAAGTCTTTCGAAGT CACCTCAATATTTGGTAACTCCCCTTACCTCTAAAGCCTTAGAGGTATCC CGCAGCTATTTGATGTTCGATGAACGCTATTGGGACATTGTTGCGTTCAA ACTGGGCTAGACAATTCTCGACAAATTAAAATAGTCGCCCGTGCCGCTGC AGCTAACGTTCATTACGTTCGCTTAGCATAGTTATTTCCAAACTAAACTC CAAACTTATATCCACGATTTGTGAGTAGAAAAGTCTACAAAATTAGCTCC ATTTAACATGTTCTATTTTGAAATGATATATCTTTGTAATTTTTTTTATT TCTTACAGGAGCAAGATAATGCTTCTAGACGNGAGTAGAAAAATCTACAA AATTAGCTCCATTTAACATGTTCTATTTTGAAATGATATATCTTTGTAAT TTTTTTTATTTCTTACAGGAGCAAGACAATGCTTCTAGACGAACAGAGAT GGGCTCCAAATTATCATATGCGCAACAACAAATAAAAGAGAAAGAACTCT GTAAGTAACCTATAGAATACAAACTACCATCGGATCTTCTAGTAATAAGG GACCTTAATCTTCCATCTCTTTAAAGGTAACTAACTTACTGACCGACGAA 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TCTAAGCAGCGAGCTATCAAACTTGCGCCAAAAGCTAAATGAAAGAGGAT TGGATTCGATTTTATTTGTGGCGATTTACGCCAAAATCACTGTATCGATG CACAGATAGTGATATTGAACACGCTTCGATGGGTTGACAAGTTTTTTATT TCAGTCTGCTAATTTTTTCCCTAATGTTTCTTTTCAAATGATAGAATTTT TCAGTTTATAGGGCAGTTTTATGCGCAAAAGAATAAAACAAAAAACGGGG GAAAATGGCATAAGTCGGTTGAAGCCGATGAAATAAACTTTTGTAAAAGA TCCCGATATACAGTCAACTCTCTAATTCGAACCTCCACTATTCGAATCTT TCTCTAATTCGAGGAAAATTCTTGGTCCCTTGAAGATCGAATTAGAGAGA GTCAACTGTTCTATTCTCGAACTATAGGTTGACCAATTGATTAAAGATTT GAAAGCATCACGCGGTACGAACGAACAACTTAAACTGGAAATGTCCAATG GTAATCGAGAACGACAAAACTATCACAAACAAGTCCTCCTCCTCGAAGAA CAGTAAGAATGATGACTCGTTATTAGACCTTTCTTGAGATTTTTTCATGA TTTCTTTCTTTGCAGAAGCTCGTGAATTTCCTGACCCTTCCACATAGAAA CTGTATGATTTATTACTACTTGGAGGTAGGAAACAGATAGTCAAGTAGAA TTTTCGTCGAAAATAGGACCATCCTTGGAAAGTTTTAGCTCAAAAGGTTT TGACATACTTCTTCATTTAATTTCTTTCTTTCTTCTTTCTTTTCAGACAC AAACAGACAGTGAGTGAGATGCATATCATGAAAGAAAAACTGTCTTCAGT TGAAAAACAATTACACGTAAGCAGCCTTATGTAATTTCAACACCCCCATC ACTCACCCAATGGAGTTAACACTAGTCCTGTATACTTATTTTTCAGGTCC 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CTTGTCACTAACAGTCCGAGGGTAATAACTTGGGCGTGATAATATCGTGA TAATCACAATATCAGGGCGAATTGACTCAGGGGTGGTCAACTGTGGTTTA GACCATTTATCATCTAAGGAAATTACTTTAAACTGAATTTTCAATATTCT TCTTTCAGATCTTGTTCAATGTCATGCGAAAGTGGTAAGAATTACTTTTC ATCTATTACTGGTAAATTTTCCTACGCAAGGACGGGTTAGCCATCCCATA GACTAGCCTACTTTTAGCCTTACTTTGCTTTTTCGATCATTTTTGATGAC GCTGAGTCTAGCGAAGTACACTAGGAGCACTTGACACTTGGCCATTCTGA AGTTAAAACACTAAAAGTCAAAATAGCAAAAAAATACTTGCCGTTGAAGT ATATAATGAAAATGATAAACCAACATCAAAAACAGATTTGAAATACCCTA TTTGCAAATAAAAAGATTTCTTCATCCTATCCTTAGCTTTCAAAAGCAAC TAAAATCTGGTTGACTGTGCCTAAGCAAAAAGCATATTACCATATACGAT CAGGCCACTAAATTGCACCACCATCCAGTCTTAAAAAAGCTTTAGTGGAC TCCGATCAAGCCATTTCGGGGTAAAACTCAACTTTTTTTTTGGGGGGGGG CGAAATAATGCGCAAAAAATGCCTCTAATTACTAATTTCAGCGCCCCTAT GCTCTTTTAAACCTTAGATATGGCAGTTTTCGGCCAAAAAGAGAGAAGAT ACCCCCAAATTTTCGTGCTTTTCATAAGGGGCGCCAAAATCTTCTAAAAT TGCCTCCCCAGTTTGCCTGAATTTTAGTCGACCCACCACGCTACTGGTAC AAGATGGATGAATAAGGCGGCTCATAGTGTGCACCCCCCCCCCTAAATCA AGGGGAGTTTTGTTGATTTTTGGTTCAAAATCTTTAGGTGGGACTTTTTG GATTTCAGGGGGGAAAACAGGATTAGGTGGGACCTGATTTTGTGGGACTA AGGTGGTTTGGTTGTAAAATTAAAACATCTCATCAACATCAATCAATGAT ATATAACTTTAGTAGTTACCTTTTACTATTGAAACCTAGTGGATAATCTT GTACATATGACCTGTATTATACTTGAAAGAAGACTTAATTTTTTTTTCCT AAATTCTGCTGGGAATTCAAATTTTTCAAAATCTTGGTGGGGGATATACT TAGTGGTGGTACCATGCATGATTGATTCTAGGTGGGGATTTTAATGTGAT TTAACAGAAAGATTTTTGTATCGTTGATTGTCTGAACTTTCACTTTCTTT CAGGAATACTACCAAGAAAGTTTTATCGAGAAGCAGGAGTTACAAAAACT GAGAGCTGACCTCGAAATTAAGGTTTGTCTTTCGATAATGTTTCACCGTT TACTGAATGCAAGGAGCTTTGTATCCTAGCAAATTTTCAGTCAGAGATCA TGACGAGATATAGTTTTAACAGCTGAAGGACGAAATTTTAAAACTTACGT GAAATGTATGAACTCAGGTCCTGATAATGATTCTAACTGAAATTTCTCAA TATTTTTATCCTCATTTATTTTCACTTTCAGTACAAACTTGACTTGAACA CACAACTGCAACGAGTTGGCGATATGTTCGAAAAAGAGGTAAAATGCTAG GCTCGACCAAAATTTATAAGATCACACCTAGCTCCACTCTTCCATTCCCA AGCCAAATGATATTTGAACGAAAGGAGTCCTAAACCTGCTCTCAAAACCT CAAATCCTAAAGAAATAGGAGCCCGTGAAGTTCGGACTCCTCTTTTGATA TTCTTTCCAAAAATTTATAACAAGTGCTTCCCCGGGCCTACGTTATTTCA ACGTTCATCTAACGTTAAACGTTTATTGACAAGTGAAATTACTGAGTTTT TAGGGTAGCAACTTAACACTCGGTATGAATAAGAAAATATTCTAACATAT ATTTCAATTGTTCTTTCAGCAAAATGAATTGATTGAAACGATGAAGACGT CTTTGAACGCGAGAAGTGAACCAGAGATGTATCATACTGCTGTCACTCCT GAAGCTCTCCGTCTCAGGGATTTCTATCGTGCTCACACTTAAATTTTAAC CCTCCTCCACTTTTCTTTTTTTCTTCCATTTTCTATTTATTGTTACACTT CTTTCTTATACTCATAATAAAATAATAAAAAACAAAACGGCAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00050344TCONS_00050344Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00050343TCONS_00050343Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00050343-proteinTCONS_00050343-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_169supercontigscaffold_169:163500..176142 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
131.76 146.23 133.32 135.19 30.58 23.42 2.49 3.6 1.12 1.55 1.14 0.46 0.78 0.33 0.03 0.02 0.17 0.1 0.12 0.05 0.3 0.06 27.57 28.96 54.54 23.2 0.96 1.78 3.55 7