|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_210:115840..122437+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_033004 ID=XLOC_033004|Name=XLOC_033004|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6598bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_210:115840..122437+ (Clytia hemisphaerica) GAAGGTTtcatacttctagactatacaCATAAGATGAGCACCAAAATTGT
AACTAGAAAATTGGAGAAAGAAAATGCAACTTTGCACTCTATAGCATGCA
ATATATGCCATAATGGCGGAGCAGAAGTTGACAAATACTTTAAAACATGT
ACCAGAGTGGTGGATAATGAAACAGGTATATTTTTCATCTTATTTTATTC
TTAGGTTTTGCTGTTATATTAGGAAGTTAGTTACCTTAAAGGGTATAAAT
TAATGCGAGAATAAATTAATGTGAGCAATCCCCCAAAACAATTTATGTTT
TGCGGAATGAATTAACGCGAATAGCCCCATTTAGGGATTTTGTGGAATTG
GGTCCAGAAAATGAATATTTAGGGTTTACACCTCCAAAATCGGCaatatt
ttagagaaaaaaaatgcgAACCTTATAAATGCGAACGACCGAAATTTTGC
GGAATCTAATTTTGCGAAAAGGGGCCAAATTCGCATTAACCAGTTCCGCA
CGAATTAACTCCGCATTAACTAAttccgcattaatttattctctcgtgaa
tttattcccttaaggtatgttTTATTATCAGGATGTCTTCATAGCTCGAA
CATGCACGGGGAACACAGATTTGTTCCAGTTAATGAAAGTTCGAGTTATT
GAATAGGGTTTAAAtttattgttaactgaagggacgagaaaacttgtttg
agttaaggagacgttcgagttaaagagactctactttGTTAAAAAATGAT
GCATATTGCAAAGTGACCTCAATAAGTAGTTTTTTGAATGAACTCAAAGG
AATTTTCGTAGCACTTTTCCCTACAACTGTTTTCCTCacaatttgaatta
aaattgagtTTTAACCACCGTATAAGTGGTAAAAATACttggaaaaaaat
aatgaataagtCCCTTGAAATAAGTCATGGTTAAAAGCTCATCATGGTTT
CAAAACTCAGCAATTTTCTTGATGCACAGTGTTAGTGTAAGTAAATAtgc
ttattggaactaattttcgcgggaattaattttaacgtttttcatggttt
ttttggcaaaaccgcaaaatgcaatttttcttttcgaACGCGAatttaag
ttcccgcgaaaatgagttccaataaggtatgctTGTCTGGGAAAtataaa
taaatccaaaaagtaacatttttacagttattttaaagttatttcaattt
aaattttttgcagGTATTTTTAAAGCCTCTTTTCGTGGAAGATGTTTAAT
GGGGAAGAATGTTCAATTACCTGATGGTTATAAAGGTTTGTGGTTATTCT
CTTTGGCGATTGCAActgttgttttgaaattatggGCTTTAAGGGTGGCa
attctaaataaaaaattataaatttttagcataatttttaaacctcgctt
tctttatttttatttaatctttattttgaatgcccgtttacttttttttt
agtcTAAACAGGTCTCAATCTCAGCATTCtaccctttttttataagaatt
gaaGAAGTAGAAGCGAGACTCGTGATTCTTAAAGGGTCTCAAACGTGCGA
AAAAGTGGTAAGAGAGAAAACTTAATAAAAAGCCGAAACTACTTTCTATA
AGCTTAGCATTGTGTCTCTAAGCGACGCTCGGTTTAAAATCTTTGaagtt
ttaagaaaaacattcTCACTGAGAAAAAGATCATTATTGATCATTGTTAT
CAAATACCTCCGTGTGACAGACCTGCTGGGACCCCGCCCCGCtgaaaaat
ttggtcaaaatgttcgtccccggtggaaaaaatacctATTATCAACCACA
CTGGGATATTGACTTTGgttttttacctatttgaaattcaatagaaGAAA
GtttcactccaaaaccatttCCACTGGATGTTTTGAGCTAGGAACagtag
aatttttatccccattagGATTGGGATCTAGAAATTTTCCACTGgtgctg
tgagacaggggtgttattaaGGTTTTAACTTTATctgtattttttttgct
tactgGTGCTTTTATCCCTCAACTTatgatttcatttttcaggtGTTGTG
TTGAAAGAAACGGCTTCCGTCTATTCTGATCAGCAGGTGAcacatgcttt
tttataagaatagcaatgataaaaaaaaatggcTTGCTGAACAAATTTTC
TCTGACCACGTATTTTTTTACCGAAGATTACTTTTTATCGACAATTAAGT
TTAActgagaatttattttgaacTTACGAATCATTTTTTTTACTGACAAA
TTTTTCACTGATAAGGTATTTTGtgaattaaatgaaaattttccagagaT
TGGTTATTGTTGGATTAGCTATGAAGCTCTTTGTCTTTTTCCTGCCTATC
TTATGCCAAAGTCAGATCTTTTTTCATTCTACATTTATTTTTTAGGATCG
AACTCTTGAAATCACAGaacattttgaccaaatgaCGTATTGGAATTTGG
AAACGAAACCAACACAAAACGACCAATTTGTCACTTCTATGGACTGGTTG
TCGGCCGCACAAgttgtatgtttttaaaaaggcTTCTCTAATTAATTTAT
TGCTATATCTAACATGAATTTCATTGGGTGGGTTTACATCTGTAGGGGAG
AATCGATTAACACTCCCTTTGTCGATAACAATTCACAACATAAACGaaac
aaaagctcaaaatcaaatcaaatcaaaagaaatcgtgGTATTTCTATTGT
ATTTCTTAATCGATTCTCTCCTAGATGTAAACCCACCCATTGGAGATTCT
GCATTGTTCCATGTGGAGCTTTTAATATTTTATACCTGTTGTTGTGAGAT
GATATTAATGCGCCACTCACTTAGTCTAACCTACGGCATGAGCCGCCCTG
AGGGTAGGTTTTTCGTGACCCTCGAAATGCACTTTatgggtgtacttttg
atagcgTACACTACAATGATCCTCTTTTAGCTGGGTACAGTTTTGACTCA
CATCCGTTATAATTTGTTTTGCACATCATTTTATATCATTGAAAAGCTCT
CGAGAATGATATAAAGGACTTTTAGGTAGCCTATACAAGACGTCTATTCA
TTCCACTTTATTGGAGCCCAGCTTTTCgagctccaaacattcgatttttt
gacgtcactttaaactttcgtAGCTCTAGCAGTAGGGAAAAAACGAATAT
GCGTCAGAACAGAGGGGGGGATACCAAGTCAGTGTACTGACCCATAAGTT
ACTAACTTTATTTTAGgatttatttccaaaaaaaatagaccaccaccctt
tttagtacactgtactatttcattgtatttttctcagaggaccacccttt
tagacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagaggaccaccctt
ttagacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagaggaccaccct
tttagtacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagaggaccacc
cttttagacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagaggaccac
ccttttagtacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagaggacc
acccttttagacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagaggac
cacccttttagtacactgtactaactttgtcaatgtatttttctcagagg
accatcctttcagtacactgtactaactcaatttaatctaaaaaatacac
caccccactgaacacttgaaaggcttcgtTTTTCATAAAATCATGAAAGT
GGAGCCCATCAAGAAACGAAATGAAATATCCCGGTTTttaaggcgtacaa
actttcgcgagcagaaactttcgcgattttctggaattttggcccttttt
aacAGGGCAATTTGCGAAACTTTATGCTCGCCAATGTTTATACGCCTAAA
ATACTCGCTAATTTTTAAGCGGATATGGTCGATTTCGATTCAAAATTGTT
TGTTCTTCCTCTTTGCCTGTatgaaagattttcattttgttatgtgacat
ttgttttgacatGTGTATCTCGCTGCATACagttgtttacaaattttgtc
agtacttttatgtccctttaaaaaaatcatcaattttatgatttttagct
ACATGCTCCAGTTGATgattttgaagaagaagaagaagtgaataaagaaa
atgattatCAGCCCAAATGTACACCCCCTGAACGATGATCCTGAATCTAG
TAAGTAGGGTAATttatagactagagtctacttctgactgaactttgctt
tttgatatttttatgacgCTTTTCTTATAacgagtccagtgaagtagact
aggagcatttgacgaggtcgccattttgaaaaaaaaatgttaaaaaaatc
caaagaaCAAAAAAGCTCTCACAGTTAAAAGATATAGTTAAGAATAAGAA
AcgaacatcaataacagattttcaTCTGTTTTTACCTTCCGAAAACAAAT
AAAACCTGCCTAAGCAAAAggatattaccatatactaccggtcCACTTAA
TCGCGTCAttcagtctataaaaaaagctttaattgTTCCCGGGGCTAGGT
AATTTACTAAATGTTTATTATGCATTCTCAGCAAAAAAGGCGCGCTTCTT
ctctatttcataaaaaacattttcaaagctAATCTATACATACAGTGTGT
CTCAAAAAGAGCGGAGAAATTTTCATACAAagtaaaatcctaaaaactca
TCATTATAAACTGGGCTTAGAATTattaaaataagataaaataaaatctc
tGTTCAATTAACAGATATTCAATTCGAAAGACAATTGACTaggttttaaa
gatttaaatatTAATTATACAAGcaatgaaattttgcataaattatacGG
ATTTTACTTTACATAAACACTTGTCCGTTTTTTGGAACGCACTGTATATA
TGAAGCTGATTTAATGAGGGCTACGCCGTATCTtttgtttcgagcgtaaa
actcctaaaAGGCCTAAAAGCcaggagctgtctattgtgcaGACTAAGCT
GATTGCTTATGTTGCAAAAGCAATAGAAAATATTGACTTGATACAATAAA
AATATAGACCATTCATTTATcttattcaacattttcaaccTCAAAGCGTT
TTGTTTTAATGCAATGATTTAGCAAGTTCAGCATCTTTTTTATAGCGATT
CAGAAGTAAATGTAAATATCGTTAACCTGGTTTTAagtttctttttctat
tttcgtTGGTTTTAGCATCGAGTCGACAATGAACGTGAAAGTTTGCACAA
CTCTTGCGATTGATTATTTTGTCGGCTATACACTGGTGTGAAACTTACCA
GAATATATCAATCATCGAGCGAACATAGATTGGACAATTCCTTTTGCATG
CGCCAGTCACCGACAGCTGGTATAAACGTTTGAAAACCATACAACCAACC
ATTTTATCCTTTGCTGGGCTATATTTATCGGATTTGTTGGAAAGTTTTCG
GATTGAAATTGGTTATGAAAATCAACTCATTTAGATTGAAGAACTTTTTT
TACATTCGAACCTTTGGGAAGGTTTTGtcctgttttttttataagacaaA
GAATTGTATCAATGAAAAgataaatacacgtttttttataagaataagtt
tataagaacacgaggctgaaaattgaccaaaacctaagaactAAGCCCTT
CTGTAAAAAGGGAAATGTttaagccaatccaagaagtatttgtccctcta
agttattttttcatgtgaaaattctcaattttacgtcttgattcgcgagt
aaatgtaaatgtcgtgaatttcacgatttttcgtcctcgcgtaAATTTCT
GCTCACTAAAGTTTGTACGCTTAAAGTatttaagaacatcataagaacat
tgAGCCTGAAgattcgaaaaattaagaacagcccagcctgagccaaaatt
tactggttcttataaaaaaagtgtgtatttgAGGCTGTGCTCGGAATAAA
AGAACGAAATAGATTCTctaaaaaagtgtaatgctTTTTTCGAACGAAAA
TTCTCATATTTTAAAGGAAGGAACTTTctcggaagaaattttcgtgaGTT
CGTGATTTTTCGGCCAAATCGCGAATATTAAGTCCCGCAAAAAAGGCCAA
ACGTCGCCATCCGTGAAAGTTAATTCCCAAGAAATATATAGTGGAATGGG
CCATTCGCGAATGTGAATTCCGAAATTTGTGATATTTTtgcctcgcgaaa
gtttctttctttagaaaaagtaggCTTGAttaataaatcaaaataaaagt
tatcaataattcagaaattttatgtCCTGGGTAAAATCTATAACAATCAA
TACACAGGTTGCGAAATTTAAAGTCTGAAGACTAATCACGCTTTCACCCG
AAATTTTGATGTTGCTtgttatttctgattggttcgaatttattgacact
aattaATAAGGTAATTAACTGTTGTAATTAAAAGCAAgcaacatgggaat
aaaatcacgtgaattttttcgagtaatcacatgtttttaCTGCACATATA
ACTTTGCAACCCGTGTTTTCTGCTTTTTTTCGATCGCAATGTACGGGCCT
GGAGTCGAGGCAAATACCAAGGAACACTTTTATTTATTCGAAAGATTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_210 | supercontig | scaffold_210:115840..122437 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog Name | Description | Organism |
RNASEH2C | ribonuclease H2 subunit C | Homo Sapiens |
|