XLOC_033382 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033382
Unique NameXLOC_033382
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_220:12498..24528-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_033382 ID=XLOC_033382|Name=XLOC_033382|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12031bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_220:12498..24528- (Clytia hemisphaerica)
CCTGGAAAATAATTAGTCAAAAATGACCCTTGAAACCCTTGAATTTGTTG AAAAAGAAGTGCTGGCCACCATGATTTAATATTATTTTGTTCTTATATAA AAATACGTTTACATCATTTTTGAGCTAAGCTATTCAGCACGTACGTCATC TTGTATGCGAAGAAAAACAATGATTACTTATTATTCAAGTTCAATTCAAG TGAAATTCAAAATGAAAAATAAACTAGATCCTATTAATTTGTTTTTAGAT GAAGACGTGATGATTAAAAATGAAAATTACTTACAGTTTAATTGTTATTT TGATTTTGGTTTGCTATAAAGGTAAAGTTTTTTATCTACAAAATATTGTT AATTGTTAATAATATGAACAATTATAATTAAAAATTTTTATAGTTCACTT TTAACTTGTGTAGAGTGAATTCGAACTTCTAAGCCATGGCTATAGAGCAG CAGCTTTGATTTTGATGTATAAGCAGTGTTTTTTACTTTTTAAACTAATC TTTTTATTGTTTATTTTAGGACAATGTGTTATTATAGATGGTGCAGAAGG GGAGCCACAGATAGAGTTTACAGATTACAGAGATCCCTCTCAACAATGTC CTGGCATTACAGTTAGACTAAATGATGACACAGTACCTAATCTCGAGCCG AACGAAAAAATTGTTGCCGATGTAACTCAAGCCTTAAGATTTGGTAAATC GACTAAAGAATATCCTTGTGAGCTTGATGATGGTTATTGGGTTTGTTATG ACGGGAGAGGTTTATCAAATGGAATAAAGATTGATGCTGTAATAAGAAGC TCTACTAACAAATCAAGAGTTTTTGCAGCAAGACCAAGTCATACATATTA TTACACAGGTTTGTCTTTGGGAGAAAAGAGTTGACTTAACTCCCTNGATG GTTATTGGGTTTGTCATGACGGGAGAGGTTTATCAAATGGAATAAAGATT 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GTTGAAAACTGTTGAAGACTTTTCAAAAGAAATCTTTTTTATCTGATCGA ACAGTATTCAAAACATTCAAACGTTCTCTGGAATTTGAAAGTCTTTGGGC ATTCGAAATAGTGAACAAAAAAATACCGTCATTCGAAAAAAAAAACTGCT AGTTTCAGCCGGGCTGTTTTGGACCGGTCTAGATTGGCCTTTGTTTCGAT AAAAAGATCTAAAAACTTGGTTCAGTTAAGATCGACCTACATCGGCAAAG ATCGGTCAACATCGGCCAAATTCAGCCAGAACCGGTCGAAATTGGTCACA ACCTCGGCTTTTTAAGGATCGGCCTATTTTCAATGTGCTCCAAATCGCTT ACAGGGACACATATTGTTAACACCTTTTCAATACATTGTGAGCATTTACT GACATTTACATTGTGTAGTGTCTGTACAGTGTGTAGTGTCTGTACAGTGT GTCCCGAAAAAAGCGGACAAATCTTTAAATAAAGTAAAATCCTCAAAACT TATTACAAAAAAGATTACAATTCGTACTAGTAATCGTCAGTAAATAATCC TCTGACACAGGACTTGCGAGAGAAAAGAATAAGGGGACAAAAGTGTCCCC CCCCCCCCCCGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGCAAAAAGTGGTAATAGTGCAATT AACGATTAATCGCACTCCTCTAAACCAATCAGATTCGAGTAATTTTGCAC GGCTGACGATTATCTTTGTAATCAACTTCAAAGACGATTGAATAGGTTTT TGAGATAGAAATATGAAGTATACAAGTCATAAAATTTGGCGTGAATTATG ACGATTTTACTTTATAAAGAAATTTGTCCATTTTTTTCGGGACACACTGT 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AATTTTCAAAAAACTCTGATCAAAGGTTTTGCTTGACCGGGATTGAGAAA CTCGGTCCAGGGTATATAAAGGTCAGTGTGCTTAGGACTAAAGGCTCAGA CTAGTTCAGTCGATTCTAAATGATTTTGAATTATATATTAATTGTTTTCC TTCCCATCTTTTCAGCGTCTGATGGCCCAGATGATCAGACAGGGATGTAT GTTGGAATACCAGTTGGTGCCATTGCGTTTCTTGTCGTCGTTGCAATTAT TGGTATCTATATTAGGTATGAAACTTTACTCATAAAGTAAACTCTCTTTA ACTCGAACATGTATAATTCGATATAATTCTCAGTTCCCAATCAAGAATAA ACCCTCATAAAATACTTTTCTACAGTTCAAATTATTCTGTAAATTCGAAT GTATCATTATGTCCTTTGTAGTTCGAATTAGCAAGTGTCCACTATACCAT AGGTTTATCCCTTAACGTCTATTGTTTAAGAACAATAAAATGCTATGCAT AATGCGACACTTGCTTATTATAAAAAATATATGCAGCATTCGAGACTACG GTAAGCAAGGTCATGGGTTCAATCACTGACCAGGTCATCCCAAACATTCC AAAGGGGAATACTTGCCCAGTACTTACTCTCTACCGAATGCTCAGCAATT TAGTATACTTTTTTGCTCAGAATTTCATGTTCTATCCGATGATATTAATT ATTTTCGTTTAATTCGACTTTGAAAAAATCGTCAATTTTTGGTGCATTTT AGACGACGTTAGTTTTTTGACAAATAAAAACTTTTTACCAGGCCTAATTC ACGTGCCCCCTCTCAAAAAAGTCTCAAGATCCTATCTACTTTCGAGCCAA TCACATGCGATTGCGTCGCACGAAAAATGCTAAGGATCCTAAGGGTTGCC CCTTACTAGATGACGCAGTCAGTTTTCTCGACGTGGTTTTGATTCGCAAA ACTCGAGGACAATAAAAGTACTGATTAACCATTCATCTCAGTCAATCAGA ATTAGACAATGGAAAAGCGAACCGTACTTGCCGCATAAAAGTTAGTGTAC ATTCTCTTGAAGTTGTTTTGTGTTTTGAAGCCAAAATCCACTGGAAAAGT GCACTTTAAAGTGCAAGGTTTGCAAGGTTTTATTTTTCAAGCAACTTTAT GAAGAAAGCTTGAGTATTGAATAGAGGGAAGATTCTTTTGAGTTTAAAAA AAAATATTATAATGTTGTTTACCGAGTTATGGATTTGTTTATTATGTATG TGACAGTCAACTCAGTAAGCCTCTATTAATTTAATTTTTCTTTAATTTGA ACTAAAATGGTCCAATCAATTTTGAAATATCGTATAAAATACTTTCCGTA ATTCGAATCTTTCTTTAATCCGAAAAATTCTCATGGTTTTCTTTTTCAAC TGTATTCACGATGAATTGCTTTTGATCTTAGTCCACCAATGTAAAGCTTA ACAAAGATATTGGTTCTATTGAGCAATGTCCAGAGTGTCACTCTCAGACA TGCAATATAAGAAGCCCATCGGTTATGGCGTGATTAGCGTTTTTTTTTAA TTCGTGATTTTGTGATTTGAGATTTTAAAACGCGTGATTGCGTGATCGGA GGGACCAACTCAATCAACGTGATCGTGATAGAAAGGAAATTCAACTCGTT ATAATATGATTTGGAAATATTTTTTTTTTGCGTGATTGCATGATTTGAAA GGTGACTGGGAGCCTCGTATTCCGGCGCATCTTTGGCTTTATCGGTTGAC TAGCTAACTCTTACTTCACTTTCGATCAAAATATTTTCAGCAGAAACTCA TAAATTAACGAATCTCCAATATTCATGAATCATTACTAACGAGAGGAAAT ATTTATTATTAAACGGACTTATACAGTCTTCAATTAAAGTTTTTACCAAG 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052822TCONS_00052822Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052821TCONS_00052821Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00052820TCONS_00052820Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00052822-proteinTCONS_00052822-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_220supercontigscaffold_220:12498..24528 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
5.62 6.88 5.92 4.62 36.39 26.34 25.34 25.55 25.07 22.98 33.21 15.38 29.2 28.09 37.28 36.99 21.53 25.21 39.65 44.04 26.55 30.3 27.61 34.18 38.58 36.32 32.34 27.32 88.46 76.9