XLOC_033970 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_033970
Unique NameXLOC_033970
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_234:245682..268280-

Legend: gene
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>XLOC_033970 ID=XLOC_033970|Name=XLOC_033970|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22599bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_234:245682..268280- (Clytia hemisphaerica)
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TCGATTCGACCGTCCAAAGAAATCTCTATATCTTGTTTTACCTTTCAAAA GGTCGTCCAGTTTTTACAACAAAGCTGACTTATGGGTAATCTCAAAAACA ATTGATTTCACACCAGGAGATACTTTCGTTGCAAAAAGTGTATTTTACGG ACCAAATTCCTCATGTGAGTTAGAGATATGTCCTTTAGCTTCGTACAGTA TGTCACAATGGCATGAAAACGAGACTTATTATGCAATCCAAGTCTATAAT GCATCCACTGAACTATCCTGCATTGAAAATCTANCAGACTATCGTTCTTT ATCTACCATGCTTGAATCTCATAATATACAATTCTATGGGCAAACAAAGA TTATGAGAAAGGCTATGAACTTTTTTAACCGAAAACGTAAAGAACCGCAA GCTCGATTCGACCGTCCAAAGAAATCTCTATATCTTGTTTTACCTTTCAA AAGGTCGTCCAGTTTTTACAACAAAGCTGACTTATGGGTAATCTCAAAAA CAATTGATTTCACACCAGGAGATACTTTCGTTGCAAAAAGTGTATTTTAC GGACCAAATTCCTCATGTGAGTTAGAGATATGTCCTTTAGCTTCGTACAG TATGTCACAATGGCATGGAAACGAGGCTTGTTATGCAATCCAAGTCTATA ATGCATTCACTGAACTATCCTGCATTGAAAATCTAGAAGAAAATCTACGA ATCCATGATGTTCCTGTCTTAAAACACGTTCTATTGCCTCATGAAGATTC TACACGAGATCAGAATTTTCACGAACCTAAAGACTTATCTTGTCTCGATG AAAACAGTATAGGAGAGCTGATCGAAAACACTATACAGAATTTCTCCCTC AACGAAGACCAAGCTAAAGCCTTGAGACATATTTCTGGTATGTTCCTCAA ACAGGCCTTGAATTCCGCACATTCTGCACAAGGACACACGTCCTTTTTCG AAGAGCTTCCTCCTAACCAAATCAAAGATATTACGTTAATTCATGGTGTC TTTGGCGCTGGCAAAAGCTTCTTATTATCCGTGGTTGTGATATTCTTACT ACAAGTTTTCGAATTAATCGAGGAACAACAACGTTGGGAATCGAACACTT TGAAACTTATGATATCTTCAACAACGAATGTTGCCGTAGACAGAGTACTA TGCGCCCTTTTGGAACACGGTTATGATGATTTCATTCGGGTTGGTAGTTT ACGGAAGATCTCGAAACGAATTTTACCGAACAGTTTACACGCGGAAGACC ACGAGGACCAAGAACTTAGAGAATTAAACACCATCTTGAAATCGCCTCTC ACTGACACTGAAAAAGGTATAGTATTATTGTCACAGTGAAATAAGATGCA ATCAGCTTTAAGTCAATTAAATTTTGCATTGATTAATTTTCGCGATTTTT GCGAAATTTAGTCCTCGCGAAAAATTTAAAATCAAATATTTGGCCGAACC CCTAGGAAAATGAAAGAAATTAGGTGAAGAAGAGGCTGCTTCACGACCTG AAATACACGCGAAGGTTTTGATTCGTAAATTAATCCACTTAATCTAACCA TAGTCATTATAAAAACACTGATCTGGAAGGTTTTTGTCTCTTTTTATTGT TAAAAGTTAGAGTTCACGTACCAAAATCGATTTATTTTGTAAACTTTTTG ATCATGTGATTAAAAAATAGACCAATCCCAAGAGGAGATTTTGGTAACGT GATCAAAAAGTATACAAATTGCAACTCGTCTTTTGTTTGTAACAAAAGAA AATTGAACAAAAAACTAAAACAATACATTGGGTTTTTTATAATGACCATG ATCTAACCTACAACAGCATTATTACCCAGCCAATTGTCCGAGTTTAAACA TACTGTTAAGGAAAATTTTGATTTTATATTTTGTAATGAAGCCTCAATTT TTAATGCTAACCTCTACTTAAAAACTGTTGTAAAACATTCATTCACACTC GATAATTTCTTTTCACAGATTATGTTAAGAAAGCAATCGAAGCTCACAAA ATGGGTGCCAATCGAACACGTTTGAATCGAGTCCGAGTCGTTGGTGTGAC GTGTGCTGCATGCTCGTTTCCTTTACTGAAGAATCTTACATTCCAAGTAC ATCTTTNAGTCGTTGGTGTGACGTGTGCTGCATGCTCGTTTCCTTTACTG AAGAATCTGACATTCCAAGTACATCTTCTGGATGAATGCAGTCAAATGAT CGAGCCTCTATCCATGGTGCCAATTGCTCGTTTCCATTGTCAAAGGCTAG TGCTGGTTGGTGATCCTAACCAGCTCAGTCCAACTATTCAAGGGTCAGAA AGTGCACATCCAGAAGGTTTGGAAGTGACTTTATTCGAGCGATTGCAGAA AGCTGGCTTAGATCCTATCATTTTGAGATGCCAATACCGATGCCACCCAG CGATCAGTTTGCTATGCAGTAAGATGTTTTATAAAGGAATGCTTACGGAT GGAGTTTCGACTGATGATCGGGGCCANAGTAAGATGTTTTATAAAGGAAT GCTTACGGATGGAGTTTCGACCGATGATCGAGGCCCGTTACTTGATTGGT TAGGTCCAGTATCAATTGCTGATATTTCGGACGGAAAGGAAGCAACAGCC TCCGATGGCAGTTTATTCAACGTTAAGGAAGTACAGTATTGTGTAAAACT GGTTAACGCGATCTTAGCAGAAGGTCTTGAACCGACCCAAGTTGGAATCA TAACCCAGTATAAAGCTCAGGTGAAACGAATTTCCAACCAACTACAAGAA TCAGGAGTTCTATCGGCAATGGAGTTAAAAGGTGTTCAAATTTCAACAGT TGATGCTTTTCAAGGTGCAGAAAAAGACGTTATTATTTTGTCGTGCGTAC GAACCAAATTTATCGGATTTATAAACTGCCCGCGGCGCACCAATGTAGCG CTGTCTCGTGCTAAACATCATTTAATTATCGTTGGTTGTCACCGATTGTT AAGGACTGACCGCCTCTGGGGTGGTGTTTTAGAACTGGCAGAACAGGAGG GCGCAAGTTTTGGGCGTGGATCCGACGCCTTATTACCGCCCGATAAGTAC GTTGAAAATAAGGACTCTATTACGGATGATTTCGAATGTTGATTTTTTCA TTGTTTCTGGTTGGTTCAAACTTGTTGGTAAGAGGTTTTTCTTCATTCTT ACTTTTGTGTTTTAAAGGGGCCTGCAACACTTCTACAGTTGGCTTACGCT AATTCGAATTCACGTGGATGTGCTATTTGTTAAAGATGCAGCGATATGCC AATTTTAAAGAAAGCATTTTATTTATTGATTATTTTACCTTGAATGACAC CTAGAATTAATTCGAATAATAGAATCTCGTAATGGAAAAGTCGATAGTTG AATCACTCTATTTCGAACTTCCGAGGAACATTTTGTTCGAGGGTACAGTC GAGATATTCATCTGCACAACCTTCACACCCCTGTGCCACAGCCTCGCTGA GGCTCAAGCCCCACTGTTCGGCAGTGGACAGTTCGGCAGTGGACAGTTCG GCAGTGGACAGTTCGGCCAAAATTTTGTCCCCGGTGGGAAAACACCCCGG AATTTCAGCCCCACTGGGAAATTGACTTTGAACTAACCCCTTTTGAAATT TAATGGAACAAATTGCACTCCAAAACCATCCCCACTGGATTTTTTGATTT TGCAGGGCTGAAAAACCTTCCACGGTATTCTGAGAAGGGACTATTGATAT AATGATTATCCTTAGTTACATAAATGATAAATTGTCTCAAATTATTTGGT TATATTTCTACTGTTTTTTATTGGTGTATTTTGCTGGTAAAATTTTAATG TTTACTGTACATATGTTTTATAATCTTCTGCATCATGTTGAATTGGGAAC AATACATTTCAAAGGCAGATGAAAGTGTTTTCAAGTTTGTAAAATTTAAT TTCAAGAGCAGTGTATGTTATTTACAGTAAATGGTTTTGAAATAATTGAA GTATAAGGTTACAACAAAAATTATACAATAATATAACATCCTTAAATTTT GAGGGGTTATGAATAAATAGGCTTGATTAAAAGAACCGAGTCAGGTCAGA ATTCCTTGATTTAAAAGGGGCCTTTATAAATTTGTGAACTCGAATAACAC TTATGAGCTCCGAATGCAATTTTAAAGTGAAGTCAATAATTTTGAATTGT TTTTCAAACTTATTGAAATGAAAATTTGTAAGCCTATTATGCTCTAAGAA TTGGAAGGGCGAATAAAAAGATTTCAAAAAGTAGTTCGATTGGCAGTCAC TTAAACACAATTTTATGCAATGCTAGAGTTTTAAACTTTCCATAAAAAAT AAATTCAATAATTCAAGCTCGAATGAGGTAACGAGTCTAGAGGGATTCTA TATAACCTGTCGCACTTTCATAAGAATTCATATATGAAACTGTATGTTTT AAATATCATTTTATCAGCCATTCGTTGAATTTGTATTTGTGGTTGAGCCA TTATTAGACGGCTTGTTGTTTTGTTTTTTGTTTTGTGACTTGGCCATTTC TCGTTGGTAGGCTCTCATACATTCATCCTCGTTCTGATCTTCGTACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053834TCONS_00053834Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00053833TCONS_00053833Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00053834-proteinTCONS_00053834-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_234supercontigscaffold_234:245682..268280 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.15 3.57 2.75 2.37 0.56 0.69 1.13 1.59 0.85 1.18 0.96 0.56 0.73 0.63 0.75 1.33 0.97 0.96 0.32 0.4 0.47 0.4 1.67 1.72 4.52 4.6 0.36 0.23 1.21 1.1