|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold_242:711580..721230+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_034207 ID=XLOC_034207|Name=XLOC_034207|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9651bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:711580..721230+ (Clytia hemisphaerica) CAAACAAGTATGAAATAAGGTCACATGATTTCCAGgagaaagaaaacgaa
agtaaactCAGCTGATTTTATTTCGACTTTTGACTTGACAGAACTCAAAC
AGTCAAACTGCAGTACCAAAATGAAGGCTGCACAAATTATATTTGCTTCA
ATTGCTCTATTTTATCTTCGAAATGTGGAGTCTAAGCATTGGGCTCTCGT
AATTGCTGGCTCAAATGGATGGTATAACTACAGACATCaggtaaaattga
aataaaaaaaaactggtTTGTGGATATGGGGTTGACTCATTCACTGTTTT
CGGGATGCCCCAGAAAATTAAGTGTGCTAAAAGACTCCTTCATCATTGAT
ATGAGCGCTTATTATTTGATAATAGATAAATTTCCATGCACTTATTattg
taagttggtctaatgatTTCGACACCCCTCTTTTTAGACAGTTAGAGATA
ATAGGAATACCCCGTATATATTGGATATATAAATAGAATCGTCGAATCGT
CAAATATCAACATACCTCTTGTTATCTCGGCATAGCtataggctggtctt
cgaaataaaaaatcaaacataaacaaatacatagcAAAGTTACCAATCAA
TCactatatagacctttttttaaagaggcaaccctgttgaataattatgt
agtccagcataaaaacaatgatacagccatgcataattactgtttcatgc
ataatataataattatgcatggctatatcattcttttttttgctggacta
cataattattcaacagggtggcctcattaaaaaaaggtctattgttctct
ccctatcacgtcacagagaTTGTTGatatatgagaaatgtgaagtgttat
tacttatggtttgaaaagaaaattttgattatgtaccatgagagtgggta
acttgcatcagtggacgCTAACATGcaaagccctcaaatgaatgtcCTGG
CTGGTCATttgaaatacaaagttaaataaaaacaaaaatggtagagaaaa
gctgtgagcggagctgaatatagtttattttaatgaccagccaggtcatt
catttgagggctatgcatgttagcctccactgatgcaagttaccaacTCT
CACGGTAGtcatcactaaaaaactaatgagcatgctttcaacgaaaatat
ccaaatcaaaacaacatttcgCACGCAAGGAATTTtatagtagacctttt
tactgtgaaccaaaaataatcaaacaaacccggtttcttttttaatttaa
tgtgaccgccatactaGCCATCACGGCGTGTGGCGTCTTAGCGTCTAGAG
CATGTGTTTGTGATAAaaaaggaaggggaaaccaggcaGACTAAGcacgc
aaattatttttatcacgtaaCTTGAAGCagcttgaagcgtaataaagttg
taaaattttaatgatgggcaTGAGAAAGTTTGCATACGTTTCATGTTTCA
TATGTTGTGTAAaattgcttataatttggctgcttttttaattgaaatag
AATAGATTGATTTGCATATTTGGCTCTATACAAGTGCATACAGGCCAAAC
TAGAAAGTACATATGTCAGTCGGACTAAAACATCATGACATCGCGAATAG
TTGTTTAGGAGATCTTTCCCTTAGCCAGCACAAAcaggataaattatctt
gtccctAGGTCACAgctgtgttgtaaaagacaaatcaattatgTAAAGTT
ATTGCTAAAAAGGTTTCTGCTGGAGTAATTAGTCATTTAAAAGACCATCA
CATTCTTCCAAACAACTATTTGACATTCTCAAACTCTGCAACTTAGTGTT
AATGATTGCAAGGGAACTTTTGGGTTCAGTATGTGTCAAGTGTGGAGATT
CTTTGTATGTATTTTACATCATGGAAATTTATCCTTGGTATCAACTTGGT
GGGatgtcaacatccctcatctaattcgaCACCCTCTTTTAGATctgaaa
ataatagaaaggttgaaactatttttctttacttagtggtcagagatgaa
aaattctttttctaaagaatggtGTCAGAATTTAATCAGGGATGTCAATA
ATAGACAAATTTACTGTATATAGGTAAGCAAtgttttatagatttttatt
ACTCAGCTCCTACCtctattttcaaactttagGCTGATGCTTGCCATGCa
tatcaaattttgaataaacATGGAATTCCTGAAGAAAATATTGTTGTTAT
GATGTATGATGATATTGCTAACAATAGAGAGTAAGTGGTTCAAGCAGTTT
TTTTTGCTGGTTATTTTACGTTTAATTTTTGATACAATCAAAAAATGATG
TATTCTAACTCAACAATTGTATATgcactgatgatgttttttaataaaac
gaaaagcttatgctgaaaaaatatttgttgaaattttttttgaataataa
ttaattttctggctattttattacaactaactcaataaatttgtaatatt
tttgtttaagaATTCAAGTTTTGTTTCAGTACTTTTGATAACACTTTtgt
attttgtccattttctgtGCTTTAGAAATCCAACCCGAGGAAAAATTATC
AACATGGTAAGCATCAATAATTCATCACTGTCtgacattttgtttttatt
gtaatatGATATTATCATAGTTCTGTCACATGAACAATCCAAAGTTTTGA
TTGTATCCAAGAGAAAAAGGAATTTAGCTTAAGAACAATATCAAAAGGTC
ATTTGTTTCACATCCACATTTCACATGACCagtcaaaatttttattgttc
tttgTCTCAAATAAGGCATACAGTAGTCACGTTTTCATGTTATCATGTTT
CTATCAAATGACCCTGAAAAGTCAACACTTTGTAACTTACCTATTACATT
AAGTTTTTAGgttattgttttttatctttctagCCAAATGGTCCAGATGT
TTATGAAGGTGTCCCAAAAGATTATACAAAAGAAGTAAGAAATTCTCCCC
ATGGgccttttcaaacaaaagatcTTACTGTATTTTGCCTAATACTAGTG
TGTGTTTTGGAAACCATGACCAGCTGACAATTTGAAGTGAAATAGTACAC
AAATGATAATCCAAAAAAATCCCCCTCCATAATCTTCATCAGAAAAATGA
CAAGAACAGCTTGATGTTAAAGTATCTATATTTTGTGTATACACTTTCAG
GAGATTTTACTCCTTATCAATCCAAAGAAATTTTGAGATATTGTGTATAT
CCCCCAAGCTAGATCTCCCTATTAATGATAAATAAAGCCAGAAAATGCTT
CGAATTCATTATTATTCACAGTGCTGACTTTaccacatttttttattttt
ctttaggaAGTAACAccagaaaactttttgaatatCTTGCAAGGAAACAA
AGATAAAGTTAAAGGAGGAAGTGGAAAAGTCATCGACAGGTTTGTTTTGT
TTCtaatgaagagaaaaaaaaattgttttcatatCTACCTTACTTCTAAT
CAAACTTTAACGGAAAGATACCTTTCTTTGCTGTGATATACAATATTGAT
TGAAGTCGACTTAATAAAGTTGTTCATTACCCTTCTTCATTCTTATTTGT
AACAAAGATTGAGAAGATTGCTCCTAGCCTagatttttatagatttttat
tgcttttcttctttattttccagTGGACCAGATGACCATATTTTCGTCTT
TTTCACTGATCATGGTGCACCAGGCCTCATTGCATTTCCTGATAGCGAGG
TAAGTCGATTTTTGTCTTTTGACTCGTCCTCACGTTTAAGATCAGTTAAA
TGATGGCAATTTTactgtacactttttttataagaatatccaaaaatttt
caagccttGGGATGTCCttaacctgttcttattttcgccattttttagag
tatttttgtctatttttctaagaaattgggtgatTTAGAGCCCACacagc
cttaaaatgttcttaacttgttcttaacattttggccctcgaagccttat
gttcttatgtagtttgttcttataaaataaaacgtAATCAATAGAGTAAA
ATTACgctaaattgtttttttttcagcttcACGCTAGACAATTGCAAGAG
GCTCTTGTTAGCATGAACCAAAAACAAAGATATAAGCAGGTAAGCTagaa
tcaaggtcataatatttgagaaaaaagggaaattttccaggaagttttga
aaccacaatcgatttgtaagtgctctaaagtaggttcgaagggtagagtt
ttaactctgagttttaagctggacttaggaccttaggatctgaggaccta
aaagttcaaaaatagtccaataaagctcagaatatagcctggaagtctgc
caacccctcccaaagtGAAATATTCGATCAAATTAAAGAGATATcccaaa
atcaactttctcgccggaacttaaaatcttgaaaaacgttaaaataactg
gaattctcaatatatttcgaccataatTGTAGTAGGGCTAAATGGTATGA
AATATAGTTTATTGATGTAAACTTATTAACAGAAACAGTTTTTGACTCGC
AACATCCCAAATCGAGCTAAATTTATATTGGCATTTGTAAAGTCTAAAAA
GTAGAAACCCTGAAATATAAAGATATatcattaaatattttgctcttAAT
TTAGATGGTATTGTACATTGAGGCATGTGAATCAGGATCAATGTTTAACC
GTCACAGACTTCCTACTAATATCAACGGTAAAATTCATTCTTTTGTAAAT
GTCAGTACAGTATACATAATAGTAACAAGTAAATCTTAATAACAAAGATA
TCAATAAGTCCCAGATAAATACGTACAGCACGTCGTTAAACGATATCTAT
TAAAGGTTTTAGTTCTACGTTAGTCGTTAAaagttcccgtttcatatcag
acacatatttcatatcaggatagTGTCTACTATTGCTATATTGTGTTCAA
TTTCGTGCTGAATGATCAAAAGATTGTTTTTCTTTCCTTCTTTCTAACCA
ATAATGCTCCACCCAACTCAATGTGAAAAATGTTGTactttaaaattgat
gagtaagcaaatgatatGAACTTATTTgtaaaacaaaaccttttttacGG
AAAAGGAATTTAAATTAtaaatcattttctttctaGTTTTTGCCACCACT
GCTGCTAATGGAGTCGAATCTTCTTATGCTTGTTATTATGACAAGAAAAG
ACAAACATATCTTGGTGATGTTTACAGTGTCAAATGGATGGAAAACTCTG
ATAAGGTAAAATTTgaatcttttgttttcatgtcaCCGACTCGTCACCTA
CTTATTATTTCATTTTCCCTATATCCAGAAGAAAAGGCTattatttttga
gttttcacATATTAGAAACAGTTGCTAGTTTTAGTCCACAGgcttttcta
taagaacatccgaaatttttaagctttcagatgttcttaactttttgagt
tttaagtctaaaatgttcttagcatgttctcatttgcaccattttgtgag
tatttttgtcctattttcctatgaaagtctaatatgttcttaacttgttc
tgaaTGTTTCGGCCATTAAAAtattatgctcttatatagtttgttcttat
aaaaaaacgtgtattcaataGCAGTTCTGATTTTCCTAAAGCATTTTTCT
CATGCAATAGAGCTTGTTCTTGTGATCTAGGGAATGGATTAAAACCATAT
CGGCTTACttgatttttaataatttgTTTATTAATTCTGATAGGCTAACT
TTTTACAAGAAACATTGGAAAGTCAATTTGATCTTGTCAAGAAAGAGACC
AATACAAGTCACGTCATGCAATTCGGAGATATGGTTTGTCAATTTAATTT
TAACATAGCTACCctttgaatacaccttttcgacagtAGTCGTGCGGTCa
gacgcgtgccactttattatttaattcaccaccctaaactcgatccaatc
ctctttttttacactttttcctattgtctttaggtgtgAAAAAACACTGG
GACAGTTTTAGGGTGGTagaacggacaaaaaatgcccgcgcggcaattgg
cggctacggtggAAAAGCTGTATTAactgtagtctagcaagctagacgac
taattaatacatagtagaaataaagcaaaaagtaatgaatggaacaattt
tagtcgtctagaaacctttgtgcactaactccaaacaaaagaaaagtgtc
aatattgcaattataattttttcctgctcaaaataattcttgagaaaaag
aatatgtgtggatttgtgtattgaaagtttttcatttgagttgatttcgt
tttgagggtttgttgttgcttgataaattgttttctcgctacgcaagttt
ctgcgtagctagcccctgtatctataaggctggaacaccggattcttcca
gtcttttatacaaactaaatcccgtattattgttattattattattagta
ttacatgcattataaacgactcaaGTCTATATTAACTGTTataaattaat
ttcaaattaatCACAAACTATTCACTTTTCAACATTGATTGATCCACAGA
TCATTTCACATTTAAAGTCTGTCcaaatataattggcagtggaaataaga
atgcctgtaacttttgatagtcaaatataattatggaatttttttttgct
tgtttcatagaatcaaaagtgctatatttgaatgtatttttggttgaaaa
attcgcgatttttagcggttaaatttacGGTTGTAGAAATTAAGCTTTtc
ttctacttatgctataacgttcatttttacaccagtggtagttcaacctt
aggttaaaaagtttgttaaatttcaaggcgaacaaaaaactccttcggaa
gatatgggacccgaaatactccttggtagcacttttctgcgaaatatcaa
atctccaacttattactaaaaacgggcgttatgttatttttttttgaaaa
gtgcaattaaaagttggaaaatgttaagtgttggtgcattggtattattg
gtatcattgattatttcgaaacaaagtgaaatcacagtataattgttttt
attgaaaagagcttatattgcctttgttatttttaagttatTAAAggact
ttgctaattcccaaaacactaaacacagtttggctatgaggtcattaaag
agatcgtaaaatgtgttatgatcgaaaaactgttttatcataNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNacccccgtttttag
taataagttggagatttggtatttcacagaaaagtgctaccaaggggtat
ttcgggtcccatatcttccgaaggacttttctattcgccttgaaatttaa
caaacttcttaacctaaggttgaactaccactggtgtaaaaatgaatgtt
ATAGCATaggtagaaaaaaagcttaatttttgtaatcgcaaatttaaccg
ctaaaaatcgcaaatttttcaaccaaaaatacattcaaatatagcacttt
tgattctctgaaacaagcaaaaaaaaattccataattatatttgactatt
aaaagttacaggcattcttgtttccactgccaattatatctggacagact
ttaatactTTTTCTCTACATTCAGAATATCTCCAAAGAACCAATTGGTGA
TTTCCAAGGAAATGCAGAGATTGCTTTTGACAACACAACCAAACACTACA
CACCTGTACCTATTGTAAGTTGTAGTCATAGTTTGTGAACTTTCATAGCC
Gaaaattcatcaccttttttaattatcattatatgtaaattatattttta
ttttacagtgTGACCGGAAAAATTGAActtaccgggtgacccacgaaaag
gTTCGGACGCCTTAAGGCCGAACacatgtcccaaagtgcttggagttttg
atatttaaaaaCTAGATATGCTAACTTAAGATTTAAGCTAACACTTTTTG
AAGTAGACCCACTAGTTCCAAAATTATGAGCTTTTACTCAAAAAAGGggt
agattaaaaaaaaacgacttTTGAGGAATCTAGTTTCGTAAAATTTGTTC
TGCTTTTCCAGATACACtgtaaaacaaaaaatctctaatcattATAATAT
TAATGAATTTTCCAACCCAATCATTAGGTTGACGCCATTCCCTCACCAGA
CGTTCCTTTGAACATCATGTACAACAAATTACGTGAAGTTCGTACGTCAC
AAGAACGAGATCAAGTCCTCACTATGATCAATGATGAACATAAGGTATTT
GTGCTTGATTGTAGGGGAGtcggaataagcagggggggttggtattctga
gagaaaatccataaaatggggTGATGTTTCAGACTGAATGAACAGATAAT
CGTAAAAGAATTGCAAAACCATTTTCTCctgaattttgacaaaatctttc
GTGTACCTGTAGAACGAGCACAATTTTGTAACCCTAATTTTCGACCAAAC
TCGAGATCGTTTCTAAAACTGATGTCCCCTCATTGaacaaatatctttca
tttttgcCAATCTAGATGCGTAAGATCATCAAATCGACAGTACGAGATGT
AGTTGAAAGACTTGTTTCAAATGAACATAAACAACACCGAATTATTAATA
CACCTGCCACTCCAACAAATATGAGATGTTATGAAAATGCTGTCACCAAG
TTTAGAACCAActgtttcaatttcaacaaggtATTGATTTTAAATACTCA
CGGGgatattttcaaggaaaaagtcgaaaaattaacaaacgtGTGGGGGG
GTATTATATAAAGATGACACCATGAGCCTGATCAGTGGAGAAGGGCGATA
TGAGTTTCAAACGTTTTTGGCTCCTACATATTAAAAAATCCGTATAATTT
TAACTTTCCAATACTAATACTTTGAGGATAAGGATAAAGATAACATTACG
GCGATGTCCAAGCCACacgtaaaaaaagacataaaacAGAATTATTGCCG
GCTTAGAGGAAATCGCTGGTCGTGTTTGTCAACATTTCTGTTGGTTTGAT
TGTCTATCATTAACCACGTAATATGTGCACTGCGTACGTTCATCGTAAAA
GGGAGATCAGTAGCGATGGTTTGAttattatttaaaataaatCTTGCTTT
TATGTTTAGTATGAACATGCATTACGTCACGTGTACGTTTTATCCAACCT
CTGCGATGAAGGCTTACACATGATTGAGTAAGTTTCCTttaaattgaatg
tttttttaattgaagtATGTGCctctgagaaaaaaatttcaaaattttgt
tgatcGACTGAAAATATTTAGAGAGTCTCTGATGGTATGTATTCTTGGGT
AACTAATTCTAGGGTaccttaatttttcgaaaaattttccacccaggaca
ttcttattccaacctccctcccccgcttattaaattttggggaaatgttt
ttaaaagttctctcttttgtcctaattctgctgcaTTAACCTTCTTCTCA
AAAATgtcccggctattaggtacctgagggtaataatttttttatttttt
tacattaCAGAGTTGAGAGAGCTATCGAGAAATCCTGTTTTGCTTTACAC
CAACAGTACACTCACTAAATTTTAAAGCAAACATTATCATGATGGTGGGT
T
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
scaffold_242 | supercontig | scaffold_242:711580..721230 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog Name | Description | Organism |
LGMN | legumain preproprotein | Homo Sapiens |
|