XLOC_034243 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034243
Unique NameXLOC_034243
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_242:2277..17000-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034243 ID=XLOC_034243|Name=XLOC_034243|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14724bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:2277..17000- (Clytia hemisphaerica)
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TATATTGTGATAATTCTTATTTCAGCTGGTTTATCATGGCATCGTTTACC GCCTGTTACTCCACAACAAATTCACGTTGCTCGTCAGATCAAAAAGTTTT GCACTGGTGACCTCGAAGCACCAGTAAGTATGGCCACTGATTGCTTTTCC AGGCTCTCAGTCTAGTTGTAACTCAATCACTGCTTTCTTAATATTTTTTC AAAGGAGTTTCCCAGTGCCTTTCATGAGTACTATGGCGCTTTCAGTATTA TAAAAATATGGAGGCAAGGGGACAAGGCTTGAATTTTTTTTTTTATTATT GTTTTTTGTCTTCAATAAGGTTATTCTTATTTCGACCTTTCTCTGGTAAT ACTGTAAGTGTTTCCTGGAATCCTATGCTTAATCCTATTGTTGTCAAGCT TTTTGGTTGGTGGTTCTTATTATCAAAACCTTATCTAATGGGTCTATGTT TTTTAAATTTGGTAATTTTGGTAGTAAGATTTTATTAAAATGTCAAAAGG TTTTAGAGAGCTAAAAGAAATCTCAGTGTTCTATTAGTAAAAGAAAATGA GAATGTAGAAAACACCTCCTGATAAAATAGGCGTAATCTAGATCCCCCAT CTCTAGAAACCTGAGTACGTATAAGGTTAAAAAGTAATGATTGTTTCGTC AAAGAATGATACTCGCTTTAGAATTTTTGTAGGTAATTTCAAATCAAGTG TATTCAGTTGTCTTTCCCACACCTTGTTTTGTGCGAAGTATGACTGCAAA TTATACATGTAAATTATATACCAATTAATATCTACTCCAGATTATCAGCT ATCCACCTTTCCCTGGTACGGAGATCCATTACTTGCGAGCTATGATCGCC AGGATATCAGCTGCAACACACATCAGTCCTCAAGGATATTACATCTTTGA AGAAGATGAAGATGAAGAAATTGATGAAACAGGTATGATACTGCTTTCTG 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TTTAATTATGATTGCTTTTGTTTCGTGTAATTTTTTCTTCACCAATATTT TGCTGAAGAAATTTTTCAGAGACAAACTTTTCTCTACACATTCCTGACTT GGATGTTTGGAAAAGGAAGAAGGAAGTTTTTTTTGAAATATTCAGAAAGA TATTGGATTATGAATGACCTTCTCCCGACCTTCTTATCTAATTCATGAAT GGTGGGATTGTAAATTCAAATGGGGGTTCATAAAATTACAGTGACAATTA TAATTAGGTCTTTTTTTCACGAAGGACGATTTTTCAGTGGATTTTTCTAG TGGGAGGGTTCTACACCGGGTCAATGATACGTCTCCAGTTACTAAGATAT TTTAGGGGCTTTGTAATTGATTTCTATCGGTATTATGTAAAGTAAATATT TTCTATATAAACTTGACATTCACATTAGCTTGTTTATAGAAAGATTAATT TATTGGTTGAATTCTTTCACCTCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054303TCONS_00054303Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054302TCONS_00054302Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054301TCONS_00054301Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054300TCONS_00054300Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054299TCONS_00054299Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054298TCONS_00054298Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054297TCONS_00054297Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054303-proteinTCONS_00054303-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_242supercontigscaffold_242:2277..17000 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
RSPH4APREDICTED: radial spoke head protein 4 homolog A isoform X1 Homo Sapiens
RSPH6Aradial spoke head protein 6 homolog A Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
35.5 36.07 31.05 27.45 252.55 176.61 128.32 130.29 85.8 104.3 76.21 80.14 18.49 15.84 13.54 15.8 15.19 20.09 21.1 23.99 21.43 22.81 22.37 23.13 59.65 51.14 48.46 55.52 14.59 15.28