XLOC_034252 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034252
Unique NameXLOC_034252
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_242:168714..183415-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034252 ID=XLOC_034252|Name=XLOC_034252|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14702bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_242:168714..183415- (Clytia hemisphaerica)
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TGGATATAGCGCACTTGTTTATCAACTTTATGTTAATCATGTTTATATTA CAAAAACTAGAGAGTTTTAAAATCTCCCAAGCTCAATTGAGACGAGATGG AGTTTTTACAAGCTCTTATTTGATTTGGTTGGTCGTTAACCAGTAATAAA ACAATTTTGTTACTTTTCCTAAAGAACGCGTCATTTTTATTATTTTAAAT GACCAATTATTAAAGTATCTTATAAAAACTCCATCTCATCTGGCTCAAAT AGGAAATCCCCACTCATCCTTTTGACCTACAACTTCAAGAAATATAAAAT AAAAACTTTCGCTCTTAGGTATTGCTATTTTCCGGTAGATTTGATACCTT AACCTTTGATTTAAGGTCGGCGTATACTTGAGTTAAATGAGTAAACTTCC TCTTTCACATATTCTTTAGAATACTTCATCCACTTCCAAAAAGGTCATTT CCATTTTGAGAATACATCAGAGCATTTTCCCATGGCCATGACTTTAGGAT CTAAAATAATTTCTCGATTTCCCACTTAAATTTTCTTGAGCACTCAATGA TTTTTATTTATCACATATTTTTTCAGGTATATCAAATTTGGTGGCGTTGA AACTCCCTTCAAATCAACCAATGATCCTGAAAAAGATCAAAAGTCCATCT ACCAATTTTTATGGTCCACTAAAGGGATTGACCCTACAGAAAATCGACAT CGAACAGACGTTTTATGTTCTATGAAGTTCAAAAACTTCAAAGAAATAGA GTTCAGGCTACAAGTCAAATTTTATACTTTACAGAAAATGAAACATGCAA CTTGGGGCGAAAAATTGAACAGTATTTCTATGGATTGTACTGCTGGGCGT GGCACTTATCAATCTTTTGTTGAAAAAATGAAATATATTTAATGCTAATG GGTCCAAGTCGTTCCTTCATTGGATGCCTGAGAAAATTTATTATTTTCTG 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054320TCONS_00054320Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054319TCONS_00054319Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054318TCONS_00054318Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054317TCONS_00054317Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00054316TCONS_00054316Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00054318-proteinTCONS_00054318-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_242supercontigscaffold_242:168714..183415 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CNRIP1PREDICTED: CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.61 1.15 0.72 0.72 1.9 1.44 10.2 13.69 11.18 12.32 5.91 10.42 19.12 19.04 3.72 4.79 16.6 20.26 44.56 61.03 28.22 25.27 7 6.16 17.92 17.9 15.42 18.09 94.87 89.25