XLOC_035250 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_035250
Unique NameXLOC_035250
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_266:399586..410866-

Legend: gene
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>XLOC_035250 ID=XLOC_035250|Name=XLOC_035250|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11281bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_266:399586..410866- (Clytia hemisphaerica)
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AAACTTCTGCTGCAATAGATTCTTCAGATTGCTCGAGGCGGAAAAGAAAC CCTCGAAAACTTTGAACTCCCTTTTGTCTCGATGTTAGGTAATACTTTTC AGCCAGAATTGTAGCAAAATTTGAATAGAGATCTCAAATTTGAACATCAT TCCCGTCTGATAGGTGTTTTGGAAGGAGGGTGACAAAATTATTTGTTTTT GTACGTTAATTTGCTTTTTGGAGGAGTGTATATTTGAGGTATTTGATTGG ATCAGCGATGTGTATTTTGTGTGTTTTAAACAAAGAAATCTCAACGACAG CATCGAGTGAGTAGTGTATTGTCTTCACTTGGTCACTTTTAGCATGGTGT TATAATTCGATGCTTTCAGCATTTCTATGTTTTGGTGGCCCAATTTTTTA TGATGATGTATTCTTTAACGATTCTAGGCCAAATAAACATTTTTGATAAT AGTTCCTGGGATGGGACCCTTTTCATTTAATCTTCAATCAGATAACATAT TTTGCAGAAAATAGGTTTGTTACAGGTTGATATTTTGCGATATTTTTACT TATTCATGGTTTATGGAAATCATAAGACGATCCCGTGATTTCTGTAAATA ATTCAGCGAGCGAACAGTTTGAGTCATTACAGTCAAAGTTGCTATTGCTG TTAAATTCATTTTGGTTTGTTTCGTTGCGGCCTGGGGGGGTAGGCAAATG GAGGTTACGGTATGTGCCGCCCTTAAGGGTACCTTTTTTGGAATTCCAAA GTCCCGCTAAGGGTCGGAAAAATCAGAAAATCAAATTTCAGTCCCACTAA GGGTCGGAAAATAGGAAAATTTCAACTTACCCCTTGAAAAATTTAAATTT GGTCAAAATTGGTCAAATTTGTTCCGCAAAGGGTCGTAAAATTCCCAAAA TTTTCCTTTGTTTTCTCCTTTTTAGTCCCGGTAAGGGTCCAAAGTTCGAA 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CTTTGACTGGGGAGTTATTTTTGCGAGTATAAATTATACAAAAGTTTGTT TTGTTTGCATAAATTACTAGTAAAAATATAACGCTGTAAAAATTTCTGAT GTAATTTTTAGATACGATTTCTAGGGAGCCACTGGTTTCCTATAAATGGA ATTGAAAATGTGGAATAGCTTCAGTTAAAGATTAAGATCTGGAAAAGAAG GACTTTTTCATGTCAAGAAATTCTCGAAAGTGTTTTTAAAATTTAAATTT TATTCAAGTTTTGCTGTAACTTTTCAACGTTTATCAATCAAAAATGGTTT GCTCGTTTTCTTTTGACAATATTATGGAATCTAAAACAAAAGAAAGTAAG TATAAGAAAAAAATATTTCATTTCAATATTGATAAAATTTTCCTCATTTT CGAGGAGGAATGAAAGAGGTGTGTTTCAGTGAGTGTTGTCTCTCTTTTTT TATCCAAAAATTTTAAGAGGTTCAACGTTTTGATTTATCCGCGGTTTTTT TATAGACGCGTTTGTGGAGCAATACGAAAATAAAACTTTTTGCTAAGAGT TAGTGCTTTGGTGTGTTTAAATTGAAAGATACCAGTTTATTTTAAATATT GTTCAGTTAATGAGAGAGTTTCTCTGTAGTTGTTAAATGATGAACTTTTT TTTTAATTCTGATTTTTTCAGCTGCCTTTCTATCTCTTTCCCAGTAAAAT TACACAAGCCTCATTTTTTTATAAAAACACAAAAAATGAAATTCTTTCTG TGTTTTTTTTTGTTTCAAAATGGGTCAAGAGAAGATTAAGATATGGTTTT TGAATAAATCCATGAAAAGGGTTTTTGTTCAACTGCCAACATTAATAGTG AAAATGTCAGATTATTTACCTGACATGAGTTTTTAAAATTTATTTAAAAT CATGCTAGTATGTCATTTTTATTTACACATCATTCTTTTCAATATTTCTA 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TTATAGAGTTGATTAGTTAATCTTTTTGATATTGTTTACTCAGTAACTTT TAGTTATAATCCATTGTTATTTTGTTTTTATAGATCCCAATTTTCGAACA AAGGAATGATGGACGTAGTAATTTCATTGGTGCATTAGTAATAGCTGGAC ACTTTATCATACCTGAAGTTACACTTTTCTTCAACAACAAACTTTTCCGT GGAAACAGAAGTCAAAAAGTTAGTGCTTCAGATCTAGATGCATTTGATTC ACCAAACTTGCCACCCCTTGCAAAACTTGGTACAGACATTGAAGTTGCTT GGGATGCTGTATTTCCTAAAACATCAATGTTACCTTTTCACCTACACGAT AAAATGAGTGAAAATGTTGGTTTACTACAATTATTCCCAGGAATCAATGC TCAAATTGTTCGAGCTTTCCTATCAGCACCAATGGAAGGAATTGTTATTG AATCTTTTGGTAGCGGAAACATCCCATCCAATCGACCTGATCTTGTCAAA GAATTCAAGGAAGCAGCTGAAAGAGGTGTACTGATGTTGAACATTACGCA ATGTGCTCGTGGAACTGTCACTGATGCTTATGCTGCTGGACGTGTTCTGT TTGAGATTGGGGTCATCCCAGGATATGACATGACTCCTGAAGCAGCTTTA GCAAAAATGGCTTATGTATTAAGTAAGAAAGAAATCACACACAGTCAAAG GAGAGAATTTTTAGAGAAAAATATTCGAGGAGAGATGACATTCCCAAAAA CTCACAAACAATTTTCAATGAAGGATGGAGGATTGATCCAAACAGTTGCA AAAACTCTTAGCCTTGGCTCTCAACAGGTAAAATGAAAAGATATTTATAG ATTGATAAAATTTTCCCATATGAAAGTTTATAAATTCTTCTTTGAGCTAT ATCACTTTCACTTCTCACACTCTTGGATGTTTACATCTTATTTAACAATG 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AAGGGAACAAAGAAGCAGTCAAATTTCTTGTTGAAGAAGCACATGTAAAC GTCAATCGAAAAGACATCTTCGGTCGAACGCCTATTGAAAATGCAGTCGA ACTTCAATCCAAAGATGTTCTACAAATTTTGCTACAAGTACTACAAAACA AACGAAGTAACGGTACTATGAATAAATTGAACGGAGTCACTGGTGATGTT AATATGAATAATCTTATAAACTGCAAAATGAACTGTGGGGGAAATTGATG TACTTGTTGTGGACTCAAATTTCCCCCTCACATACAAATGTTTTAGCATA CATTTTTGCTAAAAGTCGAATCGTATATATAATAGTTTTCTACCTGGATT TTGTTGAATTTTGCTTGCTTGCTGGCCGGAGAATACAAATTGGTGAATTG TGTATCATACAGAGCTTGCTGATGTCAACAAAATATTTTTCTTTCCGGTA GAATAACTATATCTTATTTTATCATGTCTTACATTATTTTGTAATGTACA TATTGATTTTCAGATCCTTGATATTTTCTCGCATTCTGAGCTGCAAAAAA TTCTTTGTCACTTCCATCATGGTTCTTTTCAAAAAAAAATCTTCCAATCT TTTAATCTCAGGGATAAGGCTTGTTTTATGTTATTTATATGAAAGTTTTT TTTTGAAAGTATATTTATTTGAGATATCTTTATACTGTACATAATTTGTA AATAGTTCATCAAATTTATTCAAGTCAAAAAAGATGGTTAACAATGAAAT TCAATGTTTAGAGTTTTGTTCTTGTACATGACTAAAAAGAAAGATGATGT AGTATTTTGAAATACAGAAGCATCTGGCGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00056024TCONS_00056024Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056023TCONS_00056023Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00056022TCONS_00056022Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Asparaginase proteinTCONS_00056024-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_266supercontigscaffold_266:399586..410866 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ASPGPREDICTED: 60 kDa lysophospholipase isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

min expression (0.6 tpm) - - (273.7 tpm) max expressionaGrOo_1GrOo_2FGOo_1FGOo_2EG_1EG_2P1_1P1_2P2_1P2_2P3_1P3_2PoPr_1PoPr_2St_1St_2GO_1GO_2PH_1PH_2BMF_1BMF_2MMF_1MMF_2M_1M_2GEC_1GEC_2GEN_1GEN_2
Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.71 4.2 1.36 0.6 12.49 11.59 44.45 44.43 85.32 142.69 81.96 273.7 36.38 9.01 12.59 7.43 19.25 25.82 22.52 33.58 135.95 217.97 16.58 20.31 96.66 68.26 30.94 23.68 50.16 40.44