XLOC_036044 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036044
Unique NameXLOC_036044
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_286:693627..736368+

Legend: gene
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>XLOC_036044 ID=XLOC_036044|Name=XLOC_036044|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=42742bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_286:693627..736368+ (Clytia hemisphaerica)
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CAAGCCGGCCAACAACAAGTCGTGACAGTCACATGTGGAACACATTCACA AGCCACCGTTCAATTGCAAGCCTCGATGGTAAgaaacacttttttctttt cagcttTTCTTCACATGTGGTATTTATTTCGCTGTTTAAAGAACTTACAT AACCTTTGGCAAACGTTTTACTAGCTTGGCCATCAGCTACAGAATACATT AGAAATCTAGAAGTACATCCTTCATCCCCAGAGAGTCTTTCACAAACTAA AGCTTCCTAACTTGCATCTTAGAAACAGTAGAAACTGTACGATCTGAAGC ACTATCTTTAACTGCAAGGAACACTTGGAACGTCTTGTAATTTCATCACT GTTTTTTCTTAGCCGCAACTGCGTACACAGGTTGCACAACAACAAGTCGC CCAATCGCCACAACAAGCTAAAACAGTAGATGCAGTGGCAAGCGCGTCTG CGCTCTTattgcaacaaaaacaacaacaacaacaaaaacaacaacagttA AAACTTCAGCAACAAGCAGCTGCCAACAAGCTTGCTCAACAGAAACAACA GTTTTTACAACAACAATCACAACAACTTGTTCAACAAGCTGCTGCCACAA GAATCTCTCAACAACAACAGCAGGTAAGTCTTCCTTAAGTCATGCAATGT GCCTTTCTAGCaataagattttaaaatttcgtGGGGAAAATGAGCGATAT GGTTTTACTcactaaatctttgttttcaacCAATTCGCAAATCATCacct tgtaaaaaaaattaaaactaaagTAATTGTTTGAAATAGAGGaatctatt tttctttaataTGCTTGGTTTGGGGTGGTCCTGAGTGACTTAATTAATTT GAATAAATGAAATGTTAACTTTAATTCCAGGACTAGACTCTAGAGAGAAA ATGTCTTCTTTGTTTAGATTCAAGCTCAAGTCCAGCAAGCTCAGCAACAA GTTCAACAGCAAACGACGACACCAACTTCATTTACCGTCGACACGTCGTC GGCCAGTCAACAAGTTGTCGTGGACACTCAACAAGTCACTGACGGAAGTC AAATGCAAGTCGCCAATCAAGTAGAAGTTGGCGCAGAAACTGAACTTTCA ACAGCTGATGATACTTCTAGTGAAGCCACAGACGCAACCTTACCGCGTGG CATGCGCACGCGAACTAGAAGTAATACGAAATCATCTTAGATAGGGTTCA CAATTTTTAGAAAGACACTCGAATTTCACCAGGCTAAGATGGCATTGGCA AATACgggcaattttcaattttatagaGGAAACGAACAATCATTTCAAGA TGAGATATACACCAAATCACTCGGTAATTTGGTAGGATGTGATATcttca aaacattttcttaGTAACGATTTTACTTCTTTTTAGgttaaattttaatt tattatttatcaatttttctttcctttaaaatcgtGTTTCGTTTTGAGAC TTTGGCTGACACTATGATCAGAGAATATTTCGGTACATTTAATGAGAACT ATATTCGGTACTCGATTATTCGAACGTTAAATATGAACTTAGCTTTGTTT GAGTGGCATGAGCTACCTGAACTGATCGGGCAATGGATTTAAAGTCACGA TTTTATAATTGTTAAAGTAGTTCCCAATTTTTTCGGGATGACGTTTCTCA ATTAATTAGTTTATTATTAGAAATATATTCAAATAGTGTCATTTTTTAGA ATAACCTTGATTTGTCACATTTGGAAGTAGAAAGTAACGtcaaatttctt gaattttggctaattttgaCAGTTTAGTCACGCAGGCTTCTCATTAtaaa ccatggaggtataaactAAAAAAGAAGTTGTCgttaattggtcgttaaag tcttttgatttctttaatgagaaatatcaaaagaaattctat
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057199TCONS_00057199Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057200TCONS_00057200Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057201TCONS_00057201Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057202TCONS_00057202Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057203TCONS_00057203Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057204TCONS_00057204Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057203-proteinTCONS_00057203-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_286supercontigscaffold_286:693627..736368 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
EP400E1A-binding protein p400 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
22.22 19.29 13.95 11.52 63.04 47.25 31.48 37.13 13.52 19.81 16.15 11.62 13.89 14.51 11.46 16.54 20.08 18.71 8.44 11.4 14.22 14.78 25.77 27.73 30.96 32.76 12.57 10.49 31.55 38.86