XLOC_036139 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036139
Unique NameXLOC_036139
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_288:166574..175805-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036139 ID=XLOC_036139|Name=XLOC_036139|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9232bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_288:166574..175805- (Clytia hemisphaerica)
CGAAAAATATGACGAGGCTATACAGAGCCACAAGCAGTCACGTGAACAAA CTTGCATTGTTTGCGAAGGAAATTTACAGTCATGCATAAATTACGTTCAT TTCTTTGTTAACACAGGAATCTCCCAATTCATGCATGAATTAGTGCCGTC ACCATGACAAACGTATCAAAAGTTTCAATTGACAAAAGAAGAATGCATAA AATAAATTTGACGTCAAATCTTTGTAATGTTGAACAAATTAAACTATTGA CGTTAGCTTTTAAGAAAACCAACACTTCTTGACTTCCAACGCTCCGGAAC AGACGAAGTTTCTCCACTTACACAAATTCTTATTTCATTCATTCAAAATC TCGGTAAGTTATGTATTTTCTTTTATTATACAATGTTAAAACAAGTTTGA GGATGTGCAAAACATATTTTGAAATGATTTGAGGCTTTGAATAGTTTTGC GACTTGTAAACATATTTTAATCTAGTTTGAGCCTTTTTTTGACCTGTTTT TGAGCTTGTTTGACCTTTTGCAACTCTTTTTGAACGGGTTTGACCCTTTG TAAACAGATTGTGAGCTTGTTTGACCTTTTCCAACTCTTTTTGAACTAAT TTGAGCCTTAGCAAACACATTTTAAGCTAGTTTGAGCCTTCACAACTCTT TTTGAGCTTGTTTGAACCTTTGCAAACATGTTTTAAGCTAGTTTAAGCTT TTACAATTCTTTTTGAGCTGGTTTGAGCTTTTGCAACTTATTTTAAGCAT GTTTGAGGATTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTGAGCCTTTGCAACTCT TTTTGAGCCGGTTTGACCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGAAGCC TTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTGACCATTTGCAACTCTTTTTGAGCG GGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTGAGCTTTTGCAACT CTTTTTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGTTTGACCATTTGCA ACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTG ACCATTTGCAACTCTTTTTGAGCCGGTTTGACCATTTGCAACTCTTTTTG AGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTGACCATTTGC AACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCATTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTT GAAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNCTTGTTTGACCATTTGCAACTCTTTTTGAGCGG GTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTGACCATTTGCAACTCT TTTTGAGCCGGTTTGACCATTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCAT TTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCATTTGCAACTCTTTTTGAGCTT GTTTGACCATTTGCAACTCTTTTTGAGCCGGTTTGACCCTTTGCAACTCT TTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTTGTTTGACCA TTTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGATCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCG GGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCATTTGCAACTC TGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAG CCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGA GCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGC AACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTT TGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTG TTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCC TTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGC CGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAA CTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTG AAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTT TGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTT TGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCG GTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACT CTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAA GCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTG AGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTG CAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGT TTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCT GTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGC CTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAG CCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCA ACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTT GAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGT TTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCT TTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCC GGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAAC TCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGA AGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTT GAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTT GCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGG TTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTC TGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAG CCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGA GCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGC AACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTT TGAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTT TTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCCAGT TTGCAACTCTTTTTGAGCCGGTTTCATCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTG GTTTGAGCTTTTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGACCCTTTGCAACTCT TTTTGAGCTGGTTTGAACCTTTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCT TTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCGG GTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCT TTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCT TTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCGG GTTTGAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCTGGTTTGAGCCTTTGCAACTCT GTTTGAGCTGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCCT TTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCG GTTTGAAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCCTTTGCAACTC TTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCGGTTTGAAGC CTTTGCAACTCTTTTTGAGCGGGTTTGTGTCTTTGCAACTCTTTTTGAGC TGGTTTGAGCCTTTGCAACTCTTTTTGAGCTGGTTTGAGCCTTTGCAACT CTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCACCTCTTTTTGAGCGGGTTTGACC CCGTGCAACTCAATTTGAGCTTGTTTAAGCCTTTGCAACTCTGTTTGAGC TGGTTTGACCCTTTGCACCTCAATTTGAGCTTGTTTGAGCCTTTGCAACT CTTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCACCTCTTTTTGAGCGGGTTTGACC CCGTGCAACTGTTTTTGAGCTGGTTTGAGCCTCTTTGAGCCTTCGCAACT GTTTTTGAGCTGGTTTGAGCCTTTGCAACTGTTTTTGAGCTGGTTTGACC CTTTGCAACTCTTGTTGAGCTTGTTTGAGACTTTGCAACTCCTTTTGAGC CTGTTTGAGCCTTTGCAACCTTTTTGATCTGGTTTTACCCTTTGCAACTC TTTTTGAGCGGGTTTGAGCCTTTGCGACTCTTTTTGAGCTGGTTTGACCC TTTGTAACTCTTGTTGAACTTGTTTGAGACTTTGCAACTCCTTTTGAGCC TGTTTGAGTCTTTGCAACTCTGTTTGAGCCTTTACAACTCTGTTTGAGCC CTTACAACTCTTTTTGAGCTAAGTTTAGGCCTTTGTAAACATATTTTGAG CTAATTGAGCTAATGAGAGCCTTCGCAATTCTTTTTTAGCTGGTTTGAGA CTTCGTTAACATTACAATTCAAGAATTCGTTAACATATCTAGAGCTTGTT CGATCCCTTGCAACTGCTTTTCAACTAATTTGAGTCCGTACTTTTTTTGA ACTAGTTTGAGACTTATTCAAGTCATCGCAACTCTTTTTGACTTAATTTG AGATTTTGCAAACATATTTCCAGATAGCTTGACCCTTTGAAAAATATTTG AACTGATTTGAGCCTTAGTAACTCATTTGAGCTAATTTGAACCTCTTTGT AAGTCTATTTAAGTAAGTTTAGGTTTTTGTGAACAAGTTTGAGACTGTAT AGTCCTGATTTAAGAAGAAACGCCGAGTTTTATTAAGTTTGCCTTTTTGA GTACTTATATCCAGAAACTTTGAACGACAAACGCTTTCTTTCTTTCTTTA GATTTAATTCTATCAACGATGGCTGCTATGTTACGTGCTCTTTCAAAACC ATTGAATATGGCTGCTGGTGTTGGCGCCGCCGCATTGGGTTTAGCCGCCG GTGCTATGGGATTCCCTGAGGCTGCTAACGATTGCAAGTCTCAGGTGAAA AAAGCGTACAGACAATTCATGCCGTGCATGGATTATCCTGATTTATCCAA ACACAATAACTGCTTGAGTAAAGTATTGACTCCGCAAATGTATACGAAGC TTCGTGATTTGGTAANATTTATCCAAACACAATAACTGCTTGAGTAAAGT ATTGACTCCGCAAATGTATACGAAACTTCGTGATTTGGTAAGTTCATAAG CATGGATTTTTTCTTTTTTCAATGATCAGTCCTTAGAAGGGTCGGATTGT TTCATCTTGATTTTTGAATATTGCGCTGTTTGCATTTGATCATTTGACAC TAGCAGATTTTCTTATCTTAAAGGTAAACAGGTAAAATGTGAACCAAAAC GCAGACAAAACAAAGATAAGTTTTCTATAGTAAACATCATAGGAGGCAGA TACCTTCGAAAGATACGGGATTTACAACTTTCCCATTCTAAAAGTCCTTT TGAATACTTTTCAAACTTCAATTCGGATATCCATTCATTAGAATAGAAAG TGCTAGACCGCATATATGTCAATAGCGCAAGAAAGTTAAATTCAAACGAT CAAGTGAAAACATTCGTCTTTTATTTAACTTTCAATCATAAAATTTCTTC TTTTTACAGCAAACACCAACAGGTTATACACTTGACATGGCCATCCAAAC AGGTGTCGACAATCCCGGACATCCGTTCATTTCAACGGTCGGTGTTGTTG CCGGTGATGAAGAATCTTATGAAGTCTTCAAAGAATTGATGGATCCCATT ATCCAAGACAGACATAATGGTTTCGGACCTAACGATCAACATAAGACCGA CCTCGATGCCTCCAAAATTAAAGGTATTTCATACTTTGTTTATCAACATG TAGACATTGTTAAAATATTTTTGATAGAGATTAAATATTTGGTTTTGGTT TCTCAGACAAGGCGGACCAGCCTTAGAAGGTCGAAATTATACAAAAAATC TAAATACTAAAAAAAGTAAAGATAACGTAGGTTCTGGCAAGGATAAGGTC TGGCAACAATATGAAAATCAAATTCATCGAAATCATTTTTTTCTAATTTG CAGGTGGCAAATTTGATGAGAAGTATGTTTTGAGTTCACGCGTGCGCACA GGACGTTCTATCAAGGGACATTCCCTGCCACCGCACTGCACTCGTGCTGA ACGTCGCAGTGTTGAACACATTGTCACATCTGCTTTGAACTCGTTACAAG GTGATCTGGCTGGTACTTATTATCCGTTATCTGGAATGACAGACGATGAA CAACAACTATTGATCGATGATCATTTCCTGTTTGATAAACCAGTGTCTCC ATTGTTGACCTGCGCTGGTATGGCACGTGACTGGCCTGATGCACGTGGTA TCTGGCACAACAAAAATAAGAATTTCCTGATCTGGATCAACGAGGAAGAT CACACTCGTGTCATCTCTATGGAGAAGGGCGGAAACATGAAAGGTGTCTT TGAACGTTTCTGCCGTGGATTGAAAGAAGTTGAGAAACATATTGAGGAAC ATGGCCATGGATTTATGTGGTCCCAACGTCTTGGGTATATCTTAACTTGT CCATCCAACCTTGGAACTGGCCTTCGAGCTGGTAAGTATGACAATAATCA GCAATGTATGTCTTTTCAAAAAGATTTTTCGTTGAAACGTAGTATTTAAC CAAATTTCAAACTTTGGGGCCGAAAGAAACCGAAAGGTAATATTAACTTA AACAACTAACAACTTCTTATATCAAAATCTCGTGGATCAAGCTAAGTCCG AATAACATTACATGCTATATCTTAAACTTTCAGGTGTTCACGTGAAATTA CCAAAGCTGTCTCAAGACAAACGTTTCGATAACATTCTTCAAGCATATCG TTTACAAAAACGGGGAACAGGAGGTGTCGACACTGCTGCTGTTGGTGGTA CCTTCGATATTTCAAACTTGGATCGTCTTGGACATTCTGAAGTTGAACTG GTTCAACAAGTCATCAATGGTGTCAACAATCTGGTTGACATGGAAAAATC CTTAGAAAAGGGTAAGAAGATTGACAGCCTTTTGCCCAAAAACATGAAGT CTCAATAAACTTCACATCCAATGAAACCGTAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057348TCONS_00057348Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00057347TCONS_00057347Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00057348-proteinTCONS_00057348-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_288supercontigscaffold_288:166574..175805 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CKMT1BPREDICTED: creatine kinase U-type, mitochondrial isoform X2 Homo Sapiens
CKMT1APREDICTED: creatine kinase U-type, mitochondrial isoform X1 Homo Sapiens
CKMT2creatine kinase S-type, mitochondrial precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.18 0.24 0.49 0.39 0.88 0 0.39 0 0.33 0.59 0.31 0.33 0.26 0.12 0 0.02 0.03 0.12 0.19 0.47 0 0.12 0 0.21 1.6 2.35 0 0 0 0