XLOC_036581 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036581
Unique NameXLOC_036581
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_304:198205..235820-

Legend: gene
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>XLOC_036581 ID=XLOC_036581|Name=XLOC_036581|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=37616bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_304:198205..235820- (Clytia hemisphaerica)
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GGGATAAAAATTCCTATTGAAATCTTAATGGGGGTAGACATTCTTTTGTT TTAAGGTTAAAAAGTCCAGTCGGGATGGTTTTGGAGTGCAATTTTTAAAC ATGGAATTTTGAATGGGGAGGAAATCAAAGTCGATTTCCCAGTAGGGCTG AAATTCAAGGGTATTTTTCCACCGGGGACGAATTTTTTGCTTAATTTTCC AGTATGACTGGGGTCCACATAGTGATGTGGTAATCCTATAATTTCACAAA AATTTTGGCAAAGTAGCAGCATATTGATAATATCAATTTTATTGACTTTT ATTTTAGACCAAGGAGGAATGAACGTTGCACAAAGCATTCTTCAAAAGGA TGTCAGTGAAGCATACAAAACTGCAAATGACATTCTGAAGGTTGAAGATG CTCTTGATAAAAACAGCAAAAGTAAACTCAACGCCAAACGGAAGAAGAAA CATAAAATAGGTATAATTTCTACTCTGATAACCTTCCCAGCCGGCACACA ACGTTGTTTTAACGTCCATCAGGCGTACGTAACGTCCATTTAACGTTAGA TGAACGTTCAAATGACGGTGTGTGTCAACTGGGTTTAGCCCGAAACATAA TAAAAGAAGTTGCAGACGAAAATTTAATTTAGAGTCTCCAACAAACATTT TTATTTTCACCTTGGTAACACAGACCTTGACTTGAAGATTATTCCAGAAA CTTCTTAAAGAAATGATAAAAGAACCTCTTGGACCAGTTAACTATTCACA GATTTTTCTTTTAAGGCTTGGGAACACGAGAAGATTTTTCGCGTTGGCGC AAAAAAACACTTTTTCGTGTCTCCACCACATTTTTCTTACCGAGTTTCTT ACTACCAACAAAAGTGAAATCTCACTTTTGTCCCTGGGACAATGGAGCAA AATCAATGAAACAAAATTGAATCGAATTAAATCGAATCAATCTTGCCCCA TTGTCCCAGGGACAAAATCAGCGTGTCTTTTGGGTATTTCCCTCACTTTT GAAACAAAAAAAGAAACCATGGGACACACGCACTTTTTTCTTGTGTTGGT GGGATAGAGCATGCTGCATCGCACCAACGCAAAAAAAAAACTTCTCGTGT CCCCAAGCCTTTATCAAAGATTAATTTTTTAAAATTCTATCACAGATCGA CATGCAGCGAAAAAACGTGTCTTCAAGAAGAAAACGAAACCGAAAGCGAC TGTCACCGAAGATTACGACACCTCATTGGATGATTTGTTGGATGCAACGT CTTTTGATTGGTAGATTCAATAATGAAAATATAAGAAAAGCTTGATTGTA TTCATGATATGCACCTTTGCAATGTCTTCCACGGACCCAACAGCTGATTG GTTGTAAGTGACGTATTGACTAATTTCACGTCAATTAATAACCATTCAGC TGTTGGGTCTGTGATGTAATGTCAGAAGACATTGCAATGGTGCATATCGT GAATTCTTGAGCAAATCAATTAAGAAACACGAAGACTTGAATATACAGTG TGTTCCAAAGAAAGCGGACAAATTTTTAGATGAAGTAAAATCCTCATAAT TTGTACGAAATTATTTGACGATTTTTATACAGTCTACGCAATCATTTTGC CTTGGGAATTGAATATTTTTTGATTGAGCACTGAATTTTAATCTTATTTC AATTCTTTAAAACCTAGTTTAAATAATGAGATTTTGCTTTATATTAAAAT TGATCTGCTTTTTTTGGGACGCACTCAAATGAGACAGGGTATGTTTGATG AGACTTGAATTCCATTCAGCTCGTAGGGTCGAAACTACGACCATCTTTAC AGAAACGACGAAAGCTTTTTAAATTTGTTACGTCGAATGAGGAACTTTAA GCGATTTTATAGCGATTTTACCGACGAAGGGGTTTTTTTTGTGAAAATCT GGTACGGTGGCCACCATACCTGCCGTACCCGGTGCGTCGTGTCTGCTTTA ACGTTTATTACATCTCACGTTGAAGCCCGATTAGATCTTATCCAATAGAC CTACTTGAAAAATGAACTGTCTCGATTTTTACCGACCTTTTTACAAACTA ATCGAAACAGAACCTGTGGCACGAGACACCCTTGTGTCACATTTCACAGA CCCACTGGGACCCCAACCCCACTGGAAAATATGGCCAAAATTTCTTTTTA ATTAAGTAACAGCAAATTAAAATATTTCATAAATATTTTGAAAATGAGCA AATGTCAATTTTCCTACAATTTTAAAGTTATTTATTTCATAAATACATCC AGATACTTCATTTATTTTTGAGAATATTTTATAATAGCAAAATTTGTAAT ATAATATGATAAAATTATTTTTCTTTGTTTTTTTAATGTCATGAATAATA ATTATTTACTTTTGTTTAGAATCATATTTTGCTGATGTTTGTCCCCTTTT GTCCCAGGAAATGTCGCCTGGAAATATGCCCGAAATACACGCTTTTTTAT AAGAGTATCCAAAATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00058047TCONS_00058047Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00058036TCONS_00058036Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058035TCONS_00058035Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00058033TCONS_00058033Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058032TCONS_00058032Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058031TCONS_00058031Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058030TCONS_00058030Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00058029TCONS_00058029Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058042-proteinTCONS_00058042-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_304supercontigscaffold_304:198205..235820 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ZFHX2PREDICTED: zinc finger homeobox protein 2 isoform X3 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.07 0.19 0.12 0.16 0.73 0.37 7.29 9.28 1.72 3.85 2.9 2.99 20.26 18.73 6.7 29.15 10.74 9.29 0.14 0.13 12.03 12.54 6.92 11.2 23.14 31.87 2.75 0.92 0.28 0.15