XLOC_036773 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_036773
Unique NameXLOC_036773
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_31:7087..16662-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_036773 ID=XLOC_036773|Name=XLOC_036773|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9576bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_31:7087..16662- (Clytia hemisphaerica)
ATGATGGTCAACTAACAAAACGGAAAGAAGGGAAAACAAGGAAAGAAAAC GATGTCAAAAAGTCAAAATGGTAAATAAATAACTGTCATCGTGGATTTGC ACCCTTATTTTGATTCTAACTTGGTAAAAATACAATTAAGTTATGTAGTT TTTCTTTATTTGAATGATCCCATTTCAAAAGTACCATTTGAACAATTAAA TTATGCTTTTTTTGGCTTAATTTATAATAAATCTAAAAATAAATCTTTTC TGAAGTTACTAGAAAAAGTGTCCTGTTATTTTAAACTTTACATTAGATCC ACAACTCAACATCAGGTTGCCACCTTTTAATGAACTTGTTTTAATAATAA TACACCTAACTAAATAAATAAATAGCAGGCTCTTTGCGATGAGTTTCTTT TGATACATGGTGTGGAAATTGTGGTTTGTGTTGTTTAACCATAGTTTTGT TTTGGGTCTATGTTTAGGTTCTAAAGATCGTGATGATATAAGTCAACTTG TACAAAATGCCAACAACATTGCAAATGAAATAAGTCGAAAGGAGCAAACA AAGAGTATGTTTTCTTAACACTTTGTAGAGTTCATGTTCAAGGATTTTCA TTATTTCTTAATTTCAAGGAATGTCCTGCATTGCCTCGTGAAATTGACTT AATAAGTGATGTATGTTTTTAAGGTGATGATCTAATTCAAATTATACAAA ATGCCAACACCATTGCAAATCAAATAAGTCGAAAGAAACCGGTGAAAAAA AAGAGTAAGTTTTCTATCATATATACTTTGGACGGATTCATTTATTATAT ATGTATATACTTTGGACGGATTATTAGGTTTTACCACAGATTTTCTGTTA TCTTTTTTGTCAGAAATTTTATCAAATGTCCGGAGGACCTATATTGCTAG AGATGAGAATGGAAGGCGATCCTACCCACGACCAAGAAAAACACTCAAGA 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TGATATTGTACAAATCTCTGCCCTCCAACTCCAAACATAAAGATGGTTTA TCGCCAATGCTCAAACAAAGACTGGATGAAATTGATTGGCCAGATTTGTC TCTGCTCGATATAAAGGTTTTAAAGAAGAGGAAATGTACGCAGGATAAAC TTCTTGAAAAGATTACTGACGAATTAAAGCCAGAAATGATAGCAGAACTT GAGAAAACAACTTCAAACAAAATCATAATTCCAGCTCTACGAACAGCCAT CGATCGCTCCCGTTTCGAATTGATTAGCTGGAAAGCTAAAGTGAAAAAGA AAGCTAGTAATTCAATTATATCTACCTACATTAAAGATTTTTCATTTTCA TCACATTTTTAAATGGTTTGAATTTTTAGTTTTCAATTCATATATATATC TCGTGTATCTGTAATCTCATTTTATTCTTTCTTAGCAACATGCAAGCAAC GCTTTATCTTCCGCAGAAAGCAATCCCAATGCACAAAAAAACTTGAAAGT CTGCTTCAAAAATTAACAAAGTATGTAGTACATAGTACTTGATGATATTA GGATGATTTTTCAATTCAAATTCATATCCTTAGATTTTTTAGAGTTTTAC GTTGTTTATTTATTTCCTAAACGGATTGTTTTTTTGCGGACATACTGAAA CTCGTGTGATTCAAACCCGAACTAACCCGATATATAAATGACTGCAGAAT TACTGCTGAATGTTTTCGTTTGAAAAATTCTGCGTGTGGAATATATGTCT AATTGCGTGCTCTTTTTAATTATATGGTATATATAATATTCAATTTATCT CTTTCAGATTTAGCAATGATGTCATCTCTTTGGAAAGTCCTTTCCCGTGG GATTGTCAATTTAAGTTGCTACCCAACATTTCTTGTGAGAATCTTTTTTT TAACTTTACCTTTACCTATTCAATTGTCCTTAAGACATGTCGTCAATGAT AAGAAACATATGATTGGTATCCTTAGTTAATCTAATGATAAACCAAGAGG TCATTGTTTTCTTTAAAAACTTTTCATGTGGAAAGGAAGAAAATTCGCCC TGAGAAGAAAAATGTAACTCTTGAAGGATTTCCAATGTCACCATTTTATA ATCAAATTTTTTTTTCAAAAATTCAGGTACAGATCGACGTACATTAGCTG AAATCTGCTTAAAAATTCGTAGGAGTGAGGAAGAATTGATTTTATTAAGG AGAGATGCTGCATCCTTTGTTACTTATCAAAAGTCAAAGCTGGAAGAACT ATCTCAAAAATGCTTAGTTCTTGAAACAGCCTCTGACGTATGTGCCATAT ATTTTATGAACCCTATTTCGAAGATTTCTTCAATGCTAAGATTTTGCTCT TATCTATGTTATCTATCGTTCGAATCAATTATTTTTAAAATTCAAAGAAA TTATGATTTGCGTTTGAACCGGCTGGCTGACCCCTGTTAATGGTTTTTAG TATAAGTTGATTACTTTTATATATTATGTTATTGGATTCAAAACTCACAA AGTCACTGCTTTGATTATAATGTTTATTTCAGAGTTACAGTAAAGGATTA TTGATGATGATCAGGGAAACCATCATCGTCAAAAAGCAAAAGCTGGAAGA TGGAATCAAGCTGTTCAACGAAACTTTTTCACTCAATCTGCATTTTGACC CTCACCCAGATTCTGAACAAGCTGCTCCCATGGAAGCTGAAATCGACGAA GTTGATGGCGATGGCGAAGAAAATGAAGATGATGATGAAGATGATGATGA AGATGAACGAGAATTCGAAACTGAGAACCCAGATCAATCAGACGATTTTG ATCTTTCCCTGATTATGGAGCTGGGCCGTGAGCTGAGCGGACCATCGCCC ATCTCACAGATCCAAATAATTAATGGAACTGAGATTTTTTTGCTTAACGA TGACTTGGCACAGGGAACGATCAACGGGCGAAATGGAAGTATTGCTTGCT CTCTCATCTCGCTAATTGCGGCATACTCAAATTTAGCTCGGTTGGATGTT TCTGATGTTAGTCAGCTGGTATCAGGCTATATTGGTGCAATGGAGCTTGG CAATAACGTTTTTACTAACACCTTCTCGGAAATGCCTGAGCTACCTGAAG CTGTCGAATCACTTTCTGAATTTACCGATATAGTTTTAAAGGAAGAAAAC ACAATTTTTTTTCCAAACGACAGCAATGTAATCCTGGATTTTGTCAACAA TTTACAAAGCAACGAGGCGATCATTTTAATTTATAGCGGCAAAATGGTTC ATTTGACGAGGAGGGGGGACAAGTTTTATTTTTTTGACTCACATTGTCAC GGAAATTTTGGGGCAGTCATTCTTATTGGAAGTGATGCGCAGACCATTTT TCCATATCTATCTGATGATGAATCTATATATATGAACATTGGTGTTGTTA GTTTTTTATTTTAATTTTCAAAATATTTGTATTTTGAAAAGATGTTTGTT TATAAACTTCGACTTTTTTCTCCAAGCAGCTTATTCGTTCGTTGACTGAT TGCGGCACGTGCGATCGTTATATTTTCCCCTTCCAGGTCACTGTTGATCT TTTCCAATAGTTTTTGGTATAGTTTATTTTTATTTTTACACATTTAACAC ATTGGAAGCTTCTGCCTCCTATTCGCACAGTTGTGGGTTCAGCATACATA TATTATAACTTAGCCTGGTACCAAACCCGCACATCGGGTCGATTTTCAAA CAAATCTTGCCTTGTTTGGGTTTGGAACATTTAACACGTTAGGTACAGGC TAAGTAGTAATGTATGGTTTAGGGAATTTTACGTACAGATTTTGCAACCA AGAGCAGAGTTTTTTTTTGCTGTTGTTTATGTTGCTGTAAATACATCACG AATTCAAAATTAACATTAATGTGTTACGTCATGTTCCTTCTTCCCTTTTT AACAAAAATATTTTTTAAGAGTCTAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058383TCONS_00058383Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00058383-proteinTCONS_00058383-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_31supercontigscaffold_31:7087..16662 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.52 0.46 0.19 0.19 0.77 0.63 0.79 0.84 0.61 0.98 1.12 0.66 0.67 0.55 1 1.23 1.52 1.55 0.74 0.72 1 1.25 0.49 0.56 0.61 0.48 1.38 0.97 0.51 0.23