XLOC_036878 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_036878
Unique Name	XLOC_036878
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_311:711792..720771-

gene from alignment at scaffold_311:711792..720771-

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_036878 ID=XLOC_036878|Name=XLOC_036878|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8980bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_311:711792..720771- (Clytia hemisphaerica)
TAGATTTCGACCATGATTAAAGATATAGCTTATAGGAAATAAAATCGCAT
AAATTCTTTGTTTTTAAGGTCAACGTGCGTCACCCTTTGGATGCTAAAAA
TTGAGAACAGTTCAAGAAATGACCTGACTAGAGTTGGGGACCAACCCGGG
GGTACTAGGGTTACGAGTTGACAGGGGATACCGCCCGACTTGGACCCTTG
GATATACCCTTACCGGGACTAAAAAGGAGAAAACAAAGGAAAACTTTGTG
AATTTTACGACACTTATTGCCCTTATTGAGACAAATTTGACCGAATTCCG
ATCTTTCCGGGGGTAAAAAGATGAAATTTTTTTATTTCTCCGACCCTTAA
AGGGACTGAAATTTGATCTTCTGATTTTTTCCGACCCTTAGCCGGACTTT
GGAAATCCGCAAAAAAGGTACCCTTAAAGGGCGGCACATACCGTACCCTC
CATTTGCCTAAGTACCCCCCTCCTAGGGGGACCAATAGTTGGCGATGAAT
AATAAACCTTAAACAACCTTGCACCATCCTTACAAAGGGTCATGATGTTT
CAATATTATTTTGCTGACGCAATTGTTTCCCTATGTTCATGGTTTCCCAT
ACGTCATAATGGTTTTTAGTAAACTGTGAAATTTTCCTTCACCGTCTATA
TTTAACAAGCCTGCTCGAGCTAAAACAGATACTTTACAAATGGAAAATTA
ACAGAGTGGTCTATCTTAAAAGTGTCGAACAGAACTACGGGGTAGTCAAA
TTGTTAATCGCAATATTTGGACAAAAGTTTCATTTTACAAAAGAAATCTT
GGCTTGTTTCGAACGATTAAAGGAACAATCAATTCAGGGAAAAGAACAAA
ATGGTTTTATCAAAGACAACGATGTTCATTTTTACTTTATTTTTCTGTAG
TATTATACAGCTCCAAGGTTGGTAGGTTTCTTTCTCGTGCGTATTATAAT
ATCCCTTTACTTTAAAGTGAATTTCTATATATTTCGTATGACTTGGAAAA
ATGATGCTATTTTTATGACAAATATAATAGGTCAAAAACTACTCGAAATG
GGGAAAGCGTTCCAAATAGGGTGAAGAAATTTCACTAAAATATTTATTCA
ATATAAAGTTATGATACAAAGTTGATAAGTGATTGACCCCAAAAAACAGG
AGAAAACAGCTTATAACTTTGTTTGATATCTTTTGACTGAATAATTATTT
TTGAGAAATTTTTTCACAGTGATGACGTTCTACAATGAAAAGGAGTCACT
TCAGTGAAAATGATAGTTATAGCACCTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTT
CTTCTTCATTTTCATCTTCATTTTTAGAATTTTTTTATAAATTTTTTTAT
TCCAAATTGTTCCACTCACTAATATCTTTCCAACGATACCAAATTTATAA
AGATTGAGGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTCAATGAAAAAAGAGTGAAC
ACTTATCGTGAATAGACTTTAGTCTTTCTTTTAGGCTTTCTTTTGTTTGA
TATTGATAGTATCTTATCTGCCATATTTTGAACTAAACAGGACGAAGAAT
CGATGTACAGCCAGCGAAACCGAAACTTCAGTTGGAAAAAATCCTGAAGC
CAATAATATGCCCTCAAGATGTGGGATGTCGGTATAATCCAAAAACCGGA
AAAACTGAAATTTTCTCGAGTAAGTCTAACATNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNGGGACCAATAGTTGGCGATGAATAATAAACCTTA
AACAACCTTGCACCATCCTTACAAAGGGTCATGATGTTTCAATATTATTT
TGCTGACGCAATTGTTTCCCTATGTTCATGGTTTCCCATACGTCATAATG
GTTTTTAGTAAACTGTGAAATTTTCCTTCACCCTCTATATTTAACAAGCC
TGCTCGAGCTAAAACAGATACTTTACAAATGGAAAATTAACAGAGTGGTC
TATCTTAAAAGTGTCGAACAGAACTACGGGGTAGTCAAATTGTTAATCGC
AATATTTGGACAAAAGTTTCATTTTACAAAAGAAATCTTGGCTTGTTTCG
AACGATTAAAGGAACAATCAATTCAGGGAAAAGAACAAAATGGTTTTATC
AAAGACAACAATGTTCATTTTTACTTTATTTTTCTGTAGTATTATACAGC
TACAAGGTTGGTAGGTTTCTTTCTCGTGCTTATTATAATATCCCTTTACT
TTAAAGTTAATTTCTATATATTTCGTATGACTTGGAAAAATGATGCTATT
TTTATGACAAATATGATAGGTCAAAAACTACTCGAAATGGGGAAAGCGTT
CCAAATAGGATGAAGAAATTTCACTAAAATATTTATTCAATATAAAGTTA
TGATACAAAGTTGATAAGTGATTGACCCCAAAAAACAGCAGAAAACAGCG
TTATTAGACGTCAATCAGCTTAAAACTTTGTTTGATATCTTGACTGAATA
ATTATTTTTGAGAAATTTTTTCACAGTGATGACGTTCTACAATGAAAAGG
AGTCACTTCAGTGAAAATGATAGTTATAGCACCTTTCTACAAGATCTTCA
TTTTTTTCTTCTTCATTTTCATCTTCATTTTTAGAATTTTTTTATAAATT
TTTTTATTCCAAATTGTTCCACTCACTAATATCTTTCCAACGATACCAAA
TTTATAAAGATTGAGGAATTCCTTCAAAAGTTATAGGTCAATGAAAAAAG
AGTGAACACTTATCGTGAATAGACTTTAGTCTTTCTTTTAGGCTTTCTTT
TGTTTGATATTGATAGTATCTTATCTGCCATATTTTGAACTAAACAGGAC
GAAGAATCGATGTACAGCCAGCGAAACCGAAACTTCAGTTGGAAAAAATC
CTGAAGCCAATAATATGCCCTCAAGATGTGGGATGTCGGTATAATCCAAA
AACCGGAAAAACTGAAATTTTCTCGAGTAAGTCTAACATCGCAGCTCTTT
ATTTCCAAAATTAAGGTATGTGTACACCTTTTTTCCGATTTTTTGTCAAA
AATTTTTTTTTCAGTCAAAGTGGAAGAAAAGTTACTGGATTTCATTTTGG
TAAAATCGCGATTATAAATTTTTTTTTGATCCAGAGTTATAACCATTTAA
ATTTCAAAACAAAGTTCGTCTTATGATGGATTATTTACTCAAATAATTGT
CTCTTTCGGAAACAACAAAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTGCGCCAAACTAACAAAAATCATGTAATTG
GCTTGCGCAAAGTCCATTTTGACTCTTTATTCACCAAATCTTGGGCATAT
TTCATTTCAGTTCACTCAATTAAATATTATCATGCATTTTCAATCAAATG
GAGTCAGTTTCTGACTATCAATTAAGGGTTTTTTTATGTTGTCATGTCGG
TCAAGGTGCGAGGTCTGCGCGACCGGACCGGGCAACCGGACCGGTTGCTC
ATACCAGATTTCAACCCTCGCGAAGCCATACAAGTACACCATTTATTGTA
ATGTGGACGTCTAATTGATGGTTCAATGGAATTTTCTGGTTACTCTAATT
AATCATATCAGTAGTATATCACAAAATAGTTTGAATGTCAAGAGGAGCTG
CAGAAATCCTTCCAGAAAATCACATAACGACAAATGGTTTTGTACCGGAT
AGCCAACCTCTTCAGGATATTAACAACACAAAAGCTTGTCCAAATACATC
CAAGAACTCTTCAACAACAAATTACAATAAGAATAATCCATNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTGAGCGATTAAGGCCATAGCAACCGATTG
AAATTTGGTTGCTAGGGGTTTTTTTGGACTACCATGGTACACAAAAATGC
TTCCTGCGACCCAAATACTTGAGATACGGGTTTTAAATTTTCAAGGCACT
CTCTGGAATGGTTGCAGATTCGAAAACGCCCAAAAAACAAAAATTTATAA
TTTTTTCGGTAACTTTTCAAATCTCAGGTAACTACCACCTTAAAAAAAGA
GAATGTGTCAAGAAAGGTGAACACATACCTTAAAGTTTGTCTCGTAATAG
TTTGCAGGGGAAACAAAAAGAATAGATACTTATTTTTACACCGACTTTAA
GAACGACTCAAAACAGCGAATTTCTTAGGAAATAAAGCACAAAATGATTA
AATTAAGAACATTTTAAGAACATTTTTAGGTTCAAAACTCAAAAAGTAAA
GAACATTAATAAGCTTTAAAAAATATTTTGATGTTCTTATAAAAGACGTG
CAGAACCTTTGTATAATTCGAATGTCTCTTCACTCGAACGATCACCTTAC
TCGTTAGAGGTAACATTTCTTAATAAACACACCTAATAAATAAACCCCTG
CCAATCTAACCTGCTCCATAACTCATATGTTACTCTAAAAGTTCCCTAAC
AGTTTTTCTGTCCCTTGGAGTAATATTATAACACTCTTTCTCCACAGACC
CGGTATAATTTTTCCAGCCAGTAGGGGTGAAAATAACGGACTGAAACTCA
GTGGGAATTGATATTCCCATATCTTTTATGGCTGGGGATTTGAATTCTTT
TGTTTTCAAGTCAGAAAATCCAGTGGGGATAGGAAAAACAGTGAGGATTG
GTTTAATTGATTCTTTTCAGTGGGGACAAAAATTGAAGGGTAATATTCCA
CCGGGGACGATATTTTGGCCAATTTTTCAAGCGGGAAGGGGTCCCAGTGA
ATCCGTGAGAAGGGGGTGTATTAAGCTAAGTTTTGTCTTCTCTCTGACCA
TTCGAGACGAAGACTCTTTCATTGAATACCTGAGACACATCATTCCAAAT
ATCTCTCGTTTATGGTTTCAGTATGTCGAAAGGATCTTTGCACCAAACAT
AAATGTCCAAAGCAAAAGAAGTGTGTGGTTATGCTACTTGGTTGTGTTCC
AGTCTGTATTCGTGATCAAAAACGTCAGTAATATACACCCGATCGTCCTT
ACGTATCGTTGTTTTAACCCTATTCAACCTAGGCTTTTAGGGGCGGTGCA
GAACTAGGGGGGGGGGCTTTTCCTGTACCACCCCTTAACTTTTGATCTAG
TGGGTCTTTTTGGATGAAATTTGGCACACAAGATCCTTGTCACGTAAGGT
AACTTTCGACAAGAAATTTTTTTGAAGACGTCCTTCATCATGCCCAAAGT
GAGCAAAAACCGGAAATTTCCTTTGTTCTTATAAATAACTATTGTATTCT
AACAAAAGCTTTAGAAAAAAGTTGCCTGAG

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00058545	TCONS_00058545	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00058544	TCONS_00058544	Clytia hemisphaerica	transcript
TCONS_00058543	TCONS_00058543	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00058544-protein	TCONS_00058544-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_311	supercontig	scaffold_311:711792..720771 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.71	0.84	3.31	3.63	2.78	2.65	10.3	13.05	13.3	16.07	23.51	13.44	9.53	7.84	2.95	2.87	12.03	21.19	8.49	24.35	107.87	112.2	20.6	26.68	59.79	49.85	3.93	3.16	2.98	3.01

You are here

XLOC_036878 (gene) - C. hemisphaerica