XLOC_037453 (gene) - C. hemisphaerica

Overview


Name	XLOC_037453
Unique Name	XLOC_037453
Type	gene
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence

The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_329:14154..24179+

gene from alignment at scaffold_329:14154..24179+

Legend: gene

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>XLOC_037453 ID=XLOC_037453|Name=XLOC_037453|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10026bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_329:14154..24179+ (Clytia hemisphaerica)
CTTTCAGAATAAAATGTTACCGAGTCCCTATAATACCCATTGTGGTACCA
AAACATTCAACTTTCTTGATCCGACACTGAAATACAGCAAAGGTCTTTGT
ATTATTGATTGTATTATTGGTCACATTTACAAGAATATGGCTTGTGTTGG
AGAAGAATTTCGCTCTCTCATAGATGATGGTTAGTATTTTTATCGGAATA
CCTTAAcgccttttttttctttattgataaTCATAAACACAgggtacact
acgaacatatactGCAAAATACTACTAAACattaatatagtccctccccc
tccgctagaaacttaagttatatcgccagaggtaatAGACTATGAAGAAA
GGGGTAAGGGGTAAGGGTAAAGCCTTTTGACGATTTTATATATTAACGAA
CTTCAACCTACCACTGCCCAATTTTCTAGATTAGGACCTCACTGGCTTTT
CATAGCAGTAAATATTGACTTACATCGGTATTAAATGTAGTACTTTAGtt
gattcatgatattcatgatgtaatcttttatacggaagcacacaaaataa
tcTGGAACTAGTGTTTgccactagtcttttgttattttgccactagttcc
gggttttctcgggtgcttccgtataaaagattacgtcatgaatatcatga
atagataagttgtttaaaaaaaatgctttttgcaaaattttggatgtaag
aaaaactacactttttttttataagaaccagtaaatttttgctgaggctc
ggctgttcttattttttggcactttgagccttcaattgttcttattttat
tcttattttttctaaggttaaaaacaagttttggctatttgctttactat
ttagaggattttagaaaccagtgattctttttgctataactctctaactt
cagcctctccactgttcttaaattgttcttattttggcatttttgagcct
cattgttcttattaaattgttcttatagaaaaaagttTATGATAAAACTT
CCATGCTTATATGTTTTAGGTTATGACTTTTGTTTGCTTAAAGATCTTCC
AACCTACTATCAAGTTCTGAGTAAGTACACGTTTCCTTTataaatccaaa
aattttgaagccttcggatgttcttaactttttgaggttTAAGCCTAAAT
ATGTTTGTAATATGTTTTTACtgtattttcgccatttttatagtattttt
gtcaatgaagccttaaaatgttcctaacttattcttaacattttcgccat
cgaagccttatgttcttataaagtttgttcttattaaaaaaaacgtgtat
tcttagTATTTCTAGATCATTCAAGGTTTGATTCGACATCTATTATTTgc
tatacgttttttataagaacaaaaaacacaaaaacataagccttcgatgg
ctaaaatattaagaatgtaAGAACTATTCGAGACTTTGAATTTAAGAACT
CTAAAAAAaacgatttcttaggaaattgtacAAAATACTCTAAAACAGAT
ATTTGAGAAtaatttcaagaacattttacgGCGCTTAAAactaagaataa
gttaagaatatcagaaggcttcaaaattttttgatgttattacacgtttt
tttttataaggaaccttaactttgctctgagcctggagttccttattttt
acagagaatttcagcctcaaagttccttatcgagttccttaNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNTGTTATGTACTTGAACAAAAACCCTAATCTATTATTCTAG
TCAGATTTAATCTTTCCTGACTAAATTAGCTGCTACATCCTGTAGCGTGT
GATACTACTCCTGTAGCATGTGACAGTACTCTCTGGTAAAGAGTtgttaa
ttcttttttattctttttctaGTGATAATATCTTGAAAATCCATGTTTCG
TTTTTCGACAACACGGTTGAGACAGAGGAAATGCAACCAGCCGTCTCTTG
GAATTCTCTCATAGGTAAatttataccttatcggccaaaacttagtcggc
cttaattttagttggcccaaatttttagctggccctaattttagtcacca
agccaaaatttagtcacttttgGCCGATAATGTAATCAATTTTCTTCGCT
ACGAATATTGTGTAGTTTACCTTTCAACAAATCAAATGATTATTTCAAAG
AGACCTCTGTGTTACAGACCCAGTGGGACCCCAACATCACTGAAAATTCt
agccaaaatttcgtccccatcCCCATTGAGGAAAATACCCCACAGTTTCA
GACCCACTGGGAAGTTGACTTTGTTTTTACGCCCATTTGAGATTCAATGA
AAAAACTGCACTGAAAACCATCCCCAGTAGACTTTTTGACCTGGAATCAA
TAGGATTTCTTTCTCTATTGAGATATAacaatacacccccttctcacagg
ccCACTAAGAAcctcttcccactggaaaaattgcccAAAATGTGTTCGTT
CTCACCTTTTATTGCGTCACACCCTGGTAAGGAAATATTTTAGTACCCTT
AGACTTCTTTCGGGTAATATTATGGTGCGAATAGTGGTTTACTTAATTGT
ATATTGGTCATTCGCATTTAGgaacacctccttctcacagacccggcaGG
ATTGTTTCAGCCCAAACTCGATTGGGATTGATATTAGCCAGAagattcag
tggggatagataaaatagcacaatattttgcagtgaggattcgctttcta
attattttcagcagggacaaaaattggggttcaattttccactggggaca
atattttggccaatttttccagtgggtctgtgagaagtgggtgtggtttt
gagttttgtttaagagggttttaggtttaaaactaaTAAAGATATTGAAA
TGAATATAAAACAttcatgaaaattatttaaacgattttaaaatgtcaaa
atgtaGACAAGCTTAGCTACTATAATGGGCCATTTCTCTAATGTTCCctt
atggaatttttttccaaaatctttctttcagcGACCATGGGTGGAGCTAT
CGGGCTTGGTCTCGGATTCAGTTTCATCACCGGATTCGAATTTCTATTCT
TCTTTNATATTTTCAGCCAAAACTCGATTGGGATTGATattagccagaaa
attcagcggGATGGataaaatagcacaatattttgcagtgaggatttgct
ttataattattttcagcGAGGACAAAAATTGGGGTtcaattttccactgg
ggacaatattttggccaatttttccagtgggtctgtgagaagtgggTGTA
GTTTTGGGTTTTGTTTAAGAAggttttaggtttaaaactagTAAAGATAT
TGAAATggatataaataaataaaaacattcgtAAATTATTTAAACGATTC
TGAAATGTCAAAATGAAGACATGTTTAGTTACTATCATGGGTCATTTCTA
TAATGTTCCTttatggaattttttcaaaatctttcttttcagCGACCATG
GGTGGAGCAATCGGGCTTGGTCTCGGATTCAGTTTCATCACCGGATTCGA
ATTtctattcttcttttttgacgtcattAAATTGGCATGGCAACGACGTA
AACAAAAACAAGTTCTTGGTATGTAAATTGACAAAGTATGCACAAAACGC
AACACAGGTGTTTATTTGGGTTTTGCAAGTCAATATATGTAGGTTATAAA
ACACGAAAAAGCTAAGGATTGGCAATCGACAGGGACTGGAACTTGAAAGT
GTTACCATCTTAAAAAAGCCCATCAGGATAAAGGGATTTCTCATCCATCA
TTGACATTTTTCTATATTGCAGTTATGTCATTTTTNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNaaaaagagggagagctta
aaatacaattttgtgaatacacacttaaaactttctactcaatcgcatgt
tcaaactcgatacttttattagggacaccctgtatactAATGGACCTTGA
ATTATTATGGAAAGAACCTATTACAACGACCTGGGGAACACATTCATAGA
TCATTTTCTAattcaattttgtattttttcaatgGATTTAGTTCTATCAC
TGAAATGCTACAAATGTATACATGGAGTGAATTGCTATAACAATATGACC
TTGGAGTGTTCCACGAAAGAGAACGCGTGTTTTACGCATTATGAAACAAG
GGAAGTTTATTCGTCACCAGACTACCAAGATCATATTGAGGTATATGTTC
ATCAAGACTGTGGTACTGAAAGCGAACAATTTTGCAGCGACGCCGAGATG
TGTGGACGTCGTGCAATCTCAGTTGGATTTGTCTCATGTAAGGTAAGGTT
GTTTCAGTGTATCACTATAAAATATGGTATATAAAATACACCCTGTATGG
TCGGACGCCTATTTCTGCAGGGTATGACACTTTGATTTTAGAAATCACAC
TGACCGCTTATTGGAATAcccacttctcacagacccgttgttttcaagtc
aggaaattcagtggggatgggaaaaatagcatattattttgcagtgagga
ttggcttGTTATTGGATTATTTTCGGTGGAGATaaaaattttcccaccgg
ggacgatatttcggccaatttttccagtgggaaggagtCCCACTCGacag
ggtctgtgagaaaggggtgttttgNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGAGGCTTCAAAAAAGTTTAATGTT
ATTAAAAGGAGCGTATATAGACGACCTTGTAAAAATATACACTGTCAAGT
CCTGTCAAAGCGAATTGCAAAAAATAGTGATTTTACACATTTGATATCCA
TGTAGAAATGCAAGTTCTTCATAGAGAATATNTTTGATATCCATGTAGAA
ATGCAAGTTCTTCATAGAGAATACAGAATATGCACgccttttcttttaaa
agaataacttccataagaatatcagggtgagatttcagagttagaacaat
aggcctattgtttagaacaatagaaaaataagaataatgctcaccctcag
ccaaaaattactattcttataaaaagaaaagcgtgtattctatactgact
gaagactgcctgaaacggcacgaaactccgagtatcggaaaaaaaatttg
tctttATTCTTGGCTGATATACCACTCTACCGATGGTATAGAACACTTTC
TTGAATATATTCTATACATTCTTTGAACCCAAAAGTTCCCCTATTACTCT
CACTCATCACCTTCATAGATGAATTGTATGAAGAAGGCGATGTTCTCGAA
AACACTTGCTACCATACATGTCCGAATGAATGCGTCCGAAAGTCGTACAC
CGTCCGAAAATCTACATACCGAATCGGAAGTCAATCTGTATatgaagaaa
tgaagaaaacaatACCAAAGTTCAATAACAGAAGTATCAACGagattgaa
aaatatatcaggTCAGGTAGATAATAATCAtgtcggcgatccaaaaaata
tcagcaatctgattggttaaaaagagtataATATATCtcgtattttacat
gtacaaaatataaattgacgagaAGATGTTGTTGCATGTAGAGATATAGT
AGCAATCTAACGCCattttgctacaaaagtgccctgcgcttttttataac
acaaaaagtgcatttttgggtcaccg

Gene-mRNA-Prot

The following transcript feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00059491	TCONS_00059491	Clytia hemisphaerica	transcript

The following polypeptide feature(s) derives from this gene:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
Ion channel protein	TCONS_00059491-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_329	supercontig	scaffold_329:14154..24179 +

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
33.59	39.04	24.11	18.68	0.78	0.62	0.44	0.7	0.07	0.26	0.66	0.11	0.22	0.11	0.05	0.2	1.06	1.37	0.09	0.09	6.15	5.86	6.98	7.6	2.13	2.73	0.46	1.03	1.82	2.03

You are here

XLOC_037453 (gene) - C. hemisphaerica