XLOC_038667 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038667
Unique NameXLOC_038667
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_36:546649..567949-

Legend: gene
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>XLOC_038667 ID=XLOC_038667|Name=XLOC_038667|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21301bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_36:546649..567949- (Clytia hemisphaerica)
GTATTTATTGAATATCTTTCATGGACGATGTGATTATTTTTCAACAGGTC AAGCGCGTCTTTAACGAGGTAAAGGCCATGTCAAAAAGCGATCTCTACGA TGCCTTAAAATCCGGTCACACCAATCCCAAGATGTTAGCTTTACATTTCA CTGCAATACAAGAAAAGGGCCTAGTTTATTTAGACGATATCTACAACCTC GAAGTCTCAACACCGCTTACAGTTATCATTCACGCCATTTACCCCGGACT CTGTCTTTCGAAGAAGAAACTCGACGCACTCAACGCAGAAAGATTGCTCG TTGCTGAACATTGGTCAACCGAATCCGACACCGCGGCATACGCCTGTGAA AATGCCCTTAAAAACCAACTGCATACGCATGNTCAACGCAGAAAGATTGC TCGTTGCTGAACATTGGTCAACCGAATCCGACACCGCGGCATACGCCTGT GAAAATGCCCTTAAAAACCAACTGCATACGTATGATGTCCTTCTTATCCG CGCGACCCAACACAAGGGGACTGGGCGTGAGAAGTCGGATAGGAGAACAA TTCGTCAATACGTCTGGCAGCACCTCCAGGACATGTTCTCCAAGGCTGTC GATAGAGGATGTGTCACCTATTCCACACAGCAGCAGGCGAAGGGATTCTG CTGTAACGGAAAACCAGACGTCACCGGAGAATTACAAGAGAACGTCCCTG CTGTCCACCCCATTTTCAACCTTTCCCTGTTCCTCAAGACTGGCACGTCC GCGATTACGAATTGTTTCAACTACGTCCTCCGAAGAAGAGTTCATGGTAA GGAGCAATTCAAGCGTCTCGCCGTCATGTCCGTCAACCGCCAGAATGTCA TCCGTGAGAGAGTTGGCTTCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCTTCGTACACGCTTTTTTTTATAAGAACC AGTAAATTTTGGCTCAGGCTGGGCTGTTCTTAATTTTTTGAAATTTTCAG GCTTAAATGTTCTTACGATGTTCTTATTATACTTAGTTTCTTTACTTAAG AACTTAAAATAGTTTAAAATCTGTTAAAATCCTGTTAAAATCAGTACTTT TTTAGTAATTTCTGAAATCTGAGGCTCAGGTTGTTCTTAATTTGTTCTTA GGTTTTGGCCAAATTTCAGCCTCATGTTCTTATGAAATTGTTCTTATAAA AAAAGCGTGTATCTCGTGTCATGTGATTGAAATTTTTCTTTTTTCTGCTA GACAATTAAATTTTGTTGCTTCACAGTCGGATTAAATTGGTAAAAAAATT TCCAAGAGTTAGTCTGCAGATTGGATTATTTCTCTGAGACCAGATCTAGA TTTAAGATAAAATAGCTTGATATAATGACAAGGGCAAATATTCTTATTTT CAGCTTTTTCTTTTATAAATAAGAATTCTGATTTTTACAGTGTACTCCAC 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ACACCGCTTACAGTTATCATTCACGCCATTTACCCCGGACTCTGTCTTTC GAAGAAGAAACTCGACGCACTCAACGCAGAAAGATTCCTCGTTGCTGAAC ATTGGTCAACCGAATCCGGCACCGCGGCATACGCCTGTGAAAATGCCCTT AAAAACCAACTGCATACGCATAATGTCCTTCTTATCCGCACAACCCAACA CAAGGGGACTTGGCGTGAGAAGACGGATAGGAGAACAATTCGTCAATACG TCTTGCAGCACCTCCAGGACATGTTCTCCAAGGCTGTCGATAGAGGATGT GTCACCTATTCCACACAGCAGCAGGCGAAGGGATTCTGCTGTAACGGAAA ACCAGACGTCACCGGAGAATTACAAGAGAACGTCCCTGCTGTCCACCCCA CTTTCAACCTATCCCTGTTCCTCAAGACTGGCACGTCCGCGATTACGAAT TGTTTCAACTACGTCCTCAGAAGAAGAGTTCATGGTAAGGGGCAATTCAA GCGTCTCGCCGTCATGTCCGTTAACCGCCAGAATGTCATCCGTGAGAGAG TTGGCTTCCCTGACCGAGTTAAGCTCGATTTCTTCAAGCCCATTGAGACG AAACGTAAACGAGGTTCTGACGAATGGTTATCCAAGGAGAACTTACGAGA GGGATCAGAGGGAGCTGTTCAATCAAAAAAAACCCGTCCGACGCCAGATC TTGGAACTCCTGAAAGCGAAGTGCATCAGAAACAGTAAGCATTACAATGT TGAACTTTTAACTAATTAACATTTACAATTTTTAGAAGGTTGTATTATGC CGTCTGCTCTTTACAATGTAAAAAGAATTGCTTTTAATCAGAATTGTTAT CGTCCAATTGTACCTTATTTTGAGAGAACTGTGTATGGAAAAGATTATAC CCAGCAACACAGCCATCGCACGCTTTAAAGTCACATGATATGTAATTATT GTTTAAATGTATTTATATTGAATATCTTTCATGACTTTTTAGATCAAAAG TCGAGTGAGACTCCATTAGATGAAAAGAATACCCAGCAACACAGCCATCG CACGCTTTAAAGTCACATGGTATGTAATTATTATTTAAATGTATTTATTG AATATCTTTCATGATTTTCTAGATCAAAAGTCGAGTGAGACTCCATTAGA TGAAAAGAATATCCAGCAACACAGCCATCGCACGCTTTAAAGTCACATGA TATGTAATTATTGTTTAAATGTATTTATATTGAATATCTTTCATGACTTT TTAGATCAAAAGTCGAGTGAGACTCCATTAGATGAAAAGAATACCCAGCA ACACAGCCATCGCACGCTTTAAAGTCACATGATATGTAATTATTGTTTAA A
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061665TCONS_00061665Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061664TCONS_00061664Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061663TCONS_00061663Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00061662TCONS_00061662Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00061662-proteinTCONS_00061662-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_36supercontigscaffold_36:546649..567949 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.37 0.33 0.77 1.12 4.32 2.26 1.57 2.22 0.55 0.75 1.09 0.7 0.62 0.76 0.64 0.77 1.02 0.34 0.52 0.79 1.32 1.41 0.54 0.62 1.37 1.17 2.12 0.77 0.48 0.13