XLOC_038876 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038876
Unique NameXLOC_038876
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_361:880866..896054-

Legend: gene
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>XLOC_038876 ID=XLOC_038876|Name=XLOC_038876|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=15189bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_361:880866..896054- (Clytia hemisphaerica)
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CAAAAAAGCATGACTGTCAATAAAAACTGTACGGTCCCATTTTTTTCAAT TTTGCATTGGATCGTTTAACGATTCTTAAAAATCCATATTCATTTAAAAA GAAACTCCCTGTCCTACATTAAAACATGATTCTTATTTCTCTACCGCAAT ATCATCCAAAGTCTATTCACGATAAGTGTGCACTCTTTTTTCTTTTACCT ATAACTTTTGAAGGAATTCTTCAATCTTCATAAATTTGGTATCATTTGAA AGATATTAGTGAGTGGAACAATTTGAAATAAAAAAATCTTCAAAAAATTC TGAAAATGAAGATGAAAATGAAGAAGTCATCACTGTGAAGAAATTTCATT AAAATATTTATTCAATATAAAGTTATGATACAAAGTTAATAAGTGATTGA CCCCAAAAAACAGCAAAAAACTGCAAAAACAGCGTTTTTAGACGTCAATC AGCTTATAACTTTGTTTGATATCGTTTGACTGAATGATTATTTTTGAGAA ATTTTTTCACAGTGATGACGTTCGATGATCAAGGATTCACTTCAGTGAAA ATGATAGTTATACTGTAGCACTTTTCTACAAGATCTTCATTTTTTTCTTC TTCATTTTCATCTTCATGTTCAGAATTCTTTTAAAGATTTTTTTATTTCA AATTGTTCCACTCACTAATATCTTTCCAATGATACCAAATTTGTAAAGAT TAAAGAATTCCTTCGAAAGTTATAGGTAAAAGAAAAAAGAGTGCACACTT ATCGTGAATAGACTTTAGCATCCCATTCAGTATTTGAAAGCATATAAATA GCCCAGAGTTTGACCATTCAGTGATAGGCTCAAATTACTGTAGCCTTTAA ACATGCCATAGTTACCATTGTTATTACTATTAGCACCAAAAAGACACATA TTTGGCCACATCGGTACTTCATAGTCCCTCATAGTAATAATCATCAAGTT 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TACACATCAATTTTAATTTACAAGCTTTTTCACATTGGATTGACACGGAT GTGGAGCAAGATTGGTCAGAACAAGGAAAAGAAAAACGCTTTTTTGCTAA TATCAGCAAAATATAATAAAAGGCAGACACTGTCCTGATATGAAATATGT GTCTGACATGAAACGGAGACACTTTGATATGTGAAAAGAAAACTTTTAAG ATCGCATTAACTCCGAACTTCATTACTTCATTTATATGAAGTTGTTCTTT CAGTTAAGTTCAGTAAAATGATTCTCTTCTCTTTATAGTCGCATCCTTCG GATAGTGGATTTTCTTAATCCTTTATTGTTCCGGTTGAAAATTGTATGCT ATGCCTGTGAAAAACATACTTGCGTAGAAAAAGCTACAATACTATTGACA ATAATGTGTCATTTCAGTGGTTTTGTTTTATTGCTTTTTTATTCCCTTAT CGGACTAAAATTCGCATTCCTTCAAATTCAACCAAATTTAATTTTTATAA TGCAACAGGAATCATACAAGCCAAAACGAATGTTCAAGAAGCCCTCCAAG TTTGCCAAAGCTGATGAAGACACACAAGTTCAAAGCACGCTCTTAGAATA CGGTCAACGCTTTGGTTTCAGTGGGAGTAAAGCAAACAAGGAAGAAACAG AAGCCAAACAAAAAGCCATTGCTGCAGGTTTGTGAGGGGAATTTTAGCTG GCGATCATATCAAAACTATTTTCATCCAAAGTAGGTCAAATAATTCCTAA CGCTTGATTTGTAATTGTGTCAAACTTTATATCTCAAATCACATCAGTAA GCGAATGAAGGTGGGTTAGTATCACCAAAGAAATAATCAAATTGATCTTG AATCACAGCTCTAACATATTGAAGGATCGGTCTTTTCTCCATTTTTTGCA GGCCTGGTAAAAGTAAAAGGTGATGAGTCAGCAGAAAATCAAGAAGAAGA 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TGAATCGGACACTTTTACCAGACGTTAAACCAAGCAAAAGAAGAAACAAT CAACTTTAAATCTTTCAATAAAGAGTTTTGACAATTTTGATAAAAATTCA CCTGACGGTGACGAGAGAAAATGAAACATTGACAATGTGTAAAACTTTTA ACATCGTAAATTCAATAACTCTAATCTTTCGCTTTAACAGGTTGAATTGA AAGAAATTGAGGAGAAAATGTCGAAATTGGAAGCAATCGTCAACGAAGGA GATAATACGGAAGCGGTACCTTATTTTGTTTCCTCGGATCGGCTGATATC TTCACTAAGAATGATAAGTGGCGCAGCCTAACACTGGGAGAACCTGGGAT TGTCCAAAGCATTTTTCTGAATTGTTCCGTTCATTTCGTATCTTTAACTT TTCATATCGAATCTAATAAAATCTTAAAAGAAATTTTATGTTCAAAAGGT CGTGATTGTATTTTAGTACCTATTTCAGTTTCAAGATAGCTTCGCCATTT TTTTTTTTGATAAAAAATTCAAATTTCTCTGATTTCTGCATTAGGAACGG ATGAGAGTCATCAACGAACAATTTGATAACGACACTGAAAAATTACGCAA AATGAGACTGGCACTGGTAAGTAGTAGAAATAACATAATCTCTATTTCCA AATAAAGTCCTGGAATTCGTACAAGTAGTTAATGCGTTCAAATTATGAAT TAAAGATCCTTTTAAAATATCAAAAAAGATTAATCTGCTAGAATCTGCCG TTTGTGTTCATGATGATGTGGCGTAAATTTTCTGATCTTCGGTCTCATTT TTGAAAATTGGACTATTTTACAAGATGTTTTCTGCACTGATCCGAATTTC GAGATTAATTAATTCGTTTCCTTTTGCTTGTTCTTTAGGCTAAAAGAAAC CGAGAGATCGCATCTTTGCAATGGAAAATCGATGATGTACCGACCAGAGC 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062025TCONS_00062025Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062024TCONS_00062024Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062023TCONS_00062023Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062022TCONS_00062022Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062022-proteinTCONS_00062022-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_361supercontigscaffold_361:880866..896054 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
25.36 25.33 9.72 9.06 26.02 21.49 25.58 28.82 24.32 25.51 24.11 20.58 30.13 31.04 28.87 35.83 22.1 25.48 23.38 24.64 19.64 17.37 29.12 27.86 28.08 31.14 11.41 10.36 23.53 24.97