XLOC_039653 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039653
Unique NameXLOC_039653
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_385:183441..206275-

Legend: gene
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TATGAAGAACTGATATTAGGAACCTGGGGTCGAGCTTATTATTGACATTT TCATGCATTCATCGTGGGGTAGAACTCAATGAATAAACTACCGTAGCTGA TGTACAGTATATAATGCTCATCGACACAAAAATTTACGTCAAGGGACCAA TATATTTCCTCGAAGTTAGAAAAGATTCGAATAACAGAGAGTGTTCACAC TACTTCCCTGCTGAGGGGACCAACCAATGCTTTAGTTCAAATTACCAAAA GATTCCAAATCCTAGATGCTCGATATAGCGAGATTATGAATTCCAATAAA GAAATGGCAAAACAACGAACAGCTTATTGGATGAATGAAGAACACGCTGT CTACTTAAAACTGACTTTGAAATTAATTCTTTTTGCAACTAAGTTTCTCA TTAGTTTTGTTATTGTTCTTTCAGATCCAATCAAAGGCCTTGAGAGGCGC ATGATGTCTATGTCCGATGATGATGCTGATCTAGATTCAACTCTTCTCCT TGACTGTTTACGTAATGATTCCGAAGAAATCTATCATGTTCGTATCAATA ATATTACGCTGGAGAAAGCGATTCTGTTGGCAATTTTTGATACATTGAAA ACAACGAAAACAATGAGGCATTTATCGCTAGCAGGAATACATTTCAAAGA TGAAGAAGGATTGGTATGTGAAAAAATTTTGTACAATAATTAACCCCCAC CTAGCTGGCACATAACGTTGTTTCAACGTTCACCTAACGTTATATGGACG TGGACGTTAGATAAACGTCGAAACAACGTTGTGTGCCAGCTGGGCAGGGT TACTGGGTTTCTTTTGGAATCATTTTCTTCCAAACTTTGCTTGATTTCAA AAAATGTTGGTCCAAATTTTTTCAAAAAACGATAATACTTAGAGGAAGGA AACTTTTTTATTTCAAGACCTTGGAACCCTTTTAGCTGGTAGGTTTTTGT ATTCCTAAAAGAGAAGTAAGAACTTTCAATACTCTATATGCTTTTGCTAT TCGAAGATATATTTTGATGACTTGAAAAATTGGAAGATAAATCAGTTTTT TCAATACTAGGATTCTTTTGTCATTATTTTCAGCTCTTTAATGAAGCAAT GAAGGAAAATACCACCATTGAAACATTGAATCTGGAATCAAATGAATTAA CCAACATTTGTATTGAGGTAAGCATATAATCTAGCTAAATGCTCTTTAGG ATTCGTTTAAAATTCTCCACCCTCTGTCTCACAGACCCGATGGGAACTTT TCCCCACTGGCAAGATAAAGGTTTCTAACATCCCCTTCTCACAGACCTGG TAGGATTTTTTTGCAGCCAGTGGGAATAGAAATAACTGACTAAAACTCAA TGGGGATTGATATTCCCATATTTTCTATGGCTGGGGGATTTCACTTCTTT TGTTTTCAAGTCAGAAAATTCAGTGGGAATGGGAAAAATAGCAAAGTAAT TTCCTACCAGAGACGACATTTCTAGTGGGAAGAGGTCCCAGTGGGTCTGT GCGAAGGGGGTGCTTTCTATCCAAATCCCAATTATTTGGATAGAAACTAT ATCATTTCCAGTTCTAAAAATTAAGTGATGATGGCTCTGTAGTGCATTTA TTTACATTAATGAGGTTGATCCAACTGGGGCTGAAATTGCAGGGTTATTT TTCCTAGCGGGGACGAAATTTTAGTCAAATTTTCCAGTTGGACCGAGTCT GTGATATAAGGGGTGTAATTTTTCACATCAATGCAATGTGTAGAGGAATT CGGTCATTTTTTTGCCTTTCCTCCATAGTATCAAAGGACACATATTATAT TATCACAAAATGTCTCACATGGTTTCATCTGTACCCTCATGAAAAATATA GTTGATAAAAACCTTAGAGAACGATAAACCAATATCATACTGAGCCATTT ATCAATGCTAGTTTAATATATATTAATCAATTAAATCTTTGAAATGTCAA GCTTTTATTGTCCTTTAGCTATCTAATCATTAAATCAAACTTTTGAAGCC AAACTTCCTTAAATGTAGATGCCAATTGTTTATGTCTGTTTACTTAACAG TTCCTTATGCTGTGATAATCTCGTATCTAGTCTCTGCATGAGCTCTTTGA GGTATTTCTCTCTGATCGAGATTAATTATTGAGTTGTGCACATGCATATC ACGAAAGTTTTAAATTCGTCTCTCATGCTCATATGTGATGACATCATGTT TTAAAAATGCTTTAACTCATCCTTTTCCCTTTAGCTTGACAGCTGAGCGA ATCCTTTAAGAAAGAAAAAAGGTCTTGAATTAACAGCTTCTGGATTCTGA TGTGTCAGAACGTTCCATTCTCCAAGTAACTTTTTTGTAACAGTATTACA AATTGAGAAATCTTTGAATTCGAGACAATTTCTTTTTTTGTATTTCAGCC GCTATGTGAGATTTTGGAAACACATCCTGCAATCAGAGAATTCAAATGTT CACACCAGGTATAAAATATTACACTCCTGTCTCGTCAATGCGAGATATCA ATGTTATCCACTGTCTTGCAACGTTGCCTATCTCAATTAACCAGTTTACA ACCTTGTCTCAGTGGCCCATTTACTCCCCTCTAAGCAACAATTTTTCATT ATTTCCAAACAAAACCTTTTAATGGCTGTTGGTAATCCTACACATCTAAG ATCTTGTCTCATTGACACTTCTCCACCCCTGTCTCAGACTCACACATCCA ACAAATTGTCTCAATAAACTACATCCCTGTCTCTATAACATATTTATACA TCACACTCTCACAGTAAAACGATTAGCTCAATGAGGGGGAGGGCACTGGG TTTACCAACTGACGGTATGTATCGCAAAAACAAAAAAAATGGTGAAACTC GTACCCTTAGAGTGCATATCAAATTTTTAACCCCTTTAGAGAAGATTTTC TGGGAAGATTTCTTGATTTTCTCGCAGATTTACTAAAATTTTCCTTACAA TGCGTTTATCAAAAAGTTGACCTTTACAGTCTATTTATGCTATCTTGAAA AACCGCCGCACTGTAATGCTTTTCAGTGAATTTGCCTGACTATACCCTGA CCGACCGACCGATGAACTCTCAATAATAAACAACACTACATCTTCCTTCA GAAACATGGTCTTGGATCACGTGGCGAAGAAGCCATGGCCAGAGCATTGA ACAAAAATGAACGACTCTTGAAAATCAGTTATCCTTTCAAAGTTCCTTCA GCAAGAAGTGTGGCAGATAGGTGTCAAATCAGGAATGGAGAAATATGTAA ATCACTACTTAATTTTTTTCAAATATTTTCGACTTTTTACCCTTATTTCA CCCCTCTAAACGGTATATATAAGACTTTTTAAATTAAAAAAAATTACTTT GCGAAATATTGGAGGCGCCATGGCCCCCCTGCCACCCGGGTGACGGGGGC CATGGTATTGCTCTTATTTTGTTCTTCATTTCAGGCAAATTTTACTTATT TCACGCTCAAATATCCTTAAACGTGCAGAGGTTTCTAATGTGAATGACCC AACTCTGTCACATGTACTCTGTGTGTTAGATCCACCCGCATGTGAATATT TTGGGATTAAATATTTATCTCCAACCCCAATGGCACGCTTAAACAAAAGG TATGAAATGTTTTTCAAATTACTTTTCAGTGCGTCAAAAACGAACGAAGG GTGAAGATTTTTATAATTACAAAGAAGAGATAAAACAACGCGACGCGCAT GTCCAACCATGGATCAAAGTACAAACCGTAGATAAGAACGAACAAATGAA ATCCGATCTAGCTGACCAACGAGGAAGGATGAAATCAGTGGGATCAGTAT CGCAAATGCGAGCAGAATCAAAATTACGAGCTCGCGAAAACGCGAAACCA ACTATGGACAATGAGTTAGCTAGTAAACTGAGCGCAGCTCGGAAATCTAG AGGCCGCTCTATCAAAGCCTCATAAAATAGTAGGCATGGTGGGAAGGTAA GATGAGAAGGAAAAATATTAGTAGAAAAATAACAAGTAATCAATGTAAAT AGTTATGGTTTATCAAATTAATCTTGAGATCTAAATTTTAACAAAAAAGT GTCACTTGAACTTAAAGTCCATCGGTTTAACCATCCACTCTTTTAGCTAC TGTGCCGAAACCACCATCAGGAGTCTAAGCATGTTGCCTTAGTTTTTCAG GCTAGCAAAAATACACCCCCTTCTCGCAGACTCACTGGAAACCCTTCCCA CTGGAAAAATTGGCCAAAATATCGTCCCCAGTGGAAAGTTCTCCTTGCTT CTCAACTTTTGTCCCCGTTGAAAATAATCAAATACGGTAATCCTCACTGT GAGATATTTATTATTGTTATTGTTCCATCCCCACTAAGAATTGAAATCCC CAGCCATAAAGAATATCGAAATATGAAATCTTATCAATTTTGGTCAGATA TCTTTATCCTCACTGCTCGAAAAGTTCTCACCGGGTCTATGAGAAGGGGT GTAAAAGTAGTGGTCACTCAAAGCGAATGGACTTTAGATTATCATTATTG ACACCGTCTGAAAAAACTTCCTTTGAAAATTATATCCCTAATATTTTGAT TTTTATAAAAAAAGTCAGTTAGATTATTAGTCGTACTAATATGAAAAAAT GCTGTAAATATTTTGTAAGTATGCTAATATCATTATTTTTCAATAAAACA GTAATTATCTCTAATTTAGCCCTTTAAAGATCATATTCTGGACTTAAACG TTTATTAAACCCAAGATTCCCTTTTGTTTAGTACTGAAACTTTTTCTAAA TCACAGTATTATCCTAAAATATGGGGAAATTAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063275TCONS_00063275Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063274TCONS_00063274Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063273TCONS_00063273Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063272TCONS_00063272Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063275-proteinTCONS_00063275-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_385supercontigscaffold_385:183441..206275 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.13 0.12 0.26 0.13 14.46 9.86 33.66 42.76 133.8 102.66 57.54 98.67 19.54 13.18 2.83 1.81 70.98 69.96 26.25 27.82 125.99 118.68 20.09 28.71 28.08 33.98 1.24 0.34 0.15 0.12