XLOC_040058 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040058
Unique NameXLOC_040058
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_404:738775..785926+

Legend: gene
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GGATACAAGGTCAAATCGACGATATAAAAACGGACGGTATGTACTCCTAC ATGTAAGATCTAAATTTTAACACATTTCGATCGAGATGACCATGGTAACT TTGGTGCTAAAAAAACTTCTTTTCAACGGCAACGTATCTTGGGAGCCCCT TTAATAGTGCAGTCTAAATGTGCCAAAAGTCATTAACATTGTGCACAAAG GCGTACAAGCACGAGACTTTGCACAAttgtagtttaggggtcaaaaatgg atttaaatctcaaacccaaaaaattggcacctgtttgtgtattctACAAA CCATAAACGTCTTTGGGTGGTCCTGgagtttttgctgacgtcagcaatca CGTCATTTTTCTGCATTGTTCAAAAAGCCTTCCgcaataactttttttag cttcattttcagatatgggttgtaatgtttttctaaacgagcatgaaaaa tgctttccaacggtatgtaaTATGAcatatttttggagaaaaaaaaaatt cattttagcctgggaacCTGTTCTGGTTCTGAGATTTAAATCtatttttg acccctaaactacaaTTGCGCAAAGTCTCATGCTTGTACGCCTTTGTGCA CAATTTTTACACAATTAGACCGTACTATAAGGGCAATCCATAACCATAgt gtccccccccccttttttaaagtGGGGGGtagttttttcagaaaatgggg AAAGGGTGggcaaaattgttttcaaaattctagGGGAAGCAATCAAAAGG AGGGGGagaaaaaatctgaggaaaaaatGTCTGTTCTCTGGTGTCaaaca taaaacataaaatatatttGTTTAGCTTCAAGCTAAAAACATGTAATAGT GTTTTATATTCGAGGTGGTGacaatttacattttttctttgtatatgGGG ATGAGATAACATGAATAGAAGCAGTATTATGTTATGAGCAAAAAATCACA 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TTCTGAATAAATTCGATTCGACATCAAGTTTTTGACaagaaaatattctt catgcaGAAATTAAAGAAGTCTCTTTCGGTGACCTTTTTTACCCTTGAGG CTTTGGAGTGACTATTCTCTCTCACTTTCCGACGGTTCGAAACTCTCTTA TAGTAAAGAACTGGGGTGTCTCGAAGATTTTTTCTCCGCATTCGGGAGTT TATCGGGAAACAGGATAAGTAGTGAAAATGCTCTTCTGGTTGTTGTTCTA TTCTCCTTCTGGCGATAACAACTTTTATCGTGTCTCTTCGACATGAAAGT GTTCCGACCATTTCTTTAATGTTAAGACCTATTTTATGGACATTGTGAAA TAGAATTCAATTTTCCCTCTATAAGACGCCCTTAAAAGAACTTCCAGATA AACTGTTTGCGCTACTATCGAAAACTATTAAAAGAGATCTCTAGTCGCGG TGAGTCTCTAATAGGAAgcaattgaaaagaaaaagtagaGATCAAATAGA GAAGAAGATGTTGTAAAGAGTAGCTGTAAAATCGATTAAGACTTTACAAC TAACTTCCTTCAGAAAAAGTTGAATCCCAAAGTTAGTTAGCCTCGTAACA ATATTTTTGGTGATTTTCGAGAAGAAAATGCAATCTTTTCGCTCCAAGAT TTCTTTTTATCATCTCGTTTTCCGATTGGTCCATTTTTGTAGGTCGTGGA TGGAGCGCACGTCGAAACGCACGCAAGCGTACATGAACGATGTCACGGAG ACGGTGTCACGTAAGCACGTCCACGATGAGTTATCAAGCGAAATTGAATC ACGCCGTCAATACGTGACGGAGCTGCAGCTTAAAAAACAAAAcgattttc attgttttaccAAAGACAATTTAGACGTGTTAACCAACTGTTGGTGTAGT TTTGAACGTAAGTGGCATGCTTTACAGTCACAGGTCAGAATGTTGGGTGA TTTAGTGGAAAACACGGATGGGTTGAACCACATTCTGAATGATTTTGATG CCATTGAAAGCTGGCTGGACgaacaagaaaagaaaatatatttggaacCT TCGAATAAATTGAATGATTCTTTGGACGAGTCGGGTTTtgaaaatggttt tcttgagaATGCACTTTCAAATCAAAACGAACTTGAAGAATTTTTGAAGA TACAAGACGAGAAAGTTCGATCAACTTGCGATAAAATAGATTCTTTTAAA ATGGTGAAAACTGGTGACAATGATTCTACTGATATGACTTGTTCTAGTGA GGTACAGATCATTGAAAAAGCTTTGCAGTTAGAAAACCAAGTTGAAGACA CACCTTCAAATGGGGGATTGGATGATTCAGAACCAAGTAACCATAGTAAC GAAATAAACAATAACGAAACAACCGGTACCGATTCACTTCGAGATATTCC ACAGACTTCTCCTTCGAAACCAGATAAAGTTCTTATcggacttttgaaaa aatcgaGAACTCCGAGTAACTCAAAGAAACGTGTTGTGTTTAGTACAACT CATGAATTCTCAGATTGTGTAACCATTCAACAATTCTCTAAACTCAATGA CGAGTATGAACAAGAACAACATTATTTCTATgaagatgacgatgatgatt ATGATAATTATGCAGATGGTAATTATGCTAATTATGTAGACGATGACCAT TGGGAGGACGATGGTATTGTTTTCAGTGAAGAGGCGTTGTCTCCGTCATA TTATCCCGAACCGCCCGAAGAATTCCTTCATTTATCCGATTCGGATGAGG ATGAGGACGATGGTGAGTCATTCTACGGTGGTAGCTCTCCTACAAAACTT AACTGTTTTTTATCACTAGGATGCAATCGAAGCTATAGAATAGATTTTAC TTAATCCAGCGTTTCATTTTTCACCCAAAAGATTCCTCCTCAACCCTTTA AATATTTCCATGTGATACTTTaattgtagaaattttagcgagactaattt tagcgtatattagcgagtcaggaaaatcttgattttttttggatttattt tagcgaatcacgattgcaaaaaaattcgtgtagataaattttagcgaata ctcgtgttacattattgactgaattcaTTTTCTAGCatatttctttgcac tgaaaccctttctattgataaaaatgtatcaaagtaatataaccagaaat tttagcggtctgtcgattcggcgtgttttagcgaaaatagggaaagctcg ctaaaacgctaaaattagtctcgctaaaatttctacgattaaagtaatag TAATTTTGATGCGTTCATAAATTTTCTTCACTCTCCTTACCTTACCTATG TGTCTGGACACTGGTAAAAGGTTAAGTGCCAGTATTATCTTAAATATTCC AGGATGAAAAAATCTTCCAAAAGTTAGCTTAGGGAGCAGAGTAATTTATT GACCGACACTGACAGATTTTGACACTAAattgctagattttctttttctt ttccataGATTGTTGGGATAAGGATTATTTCATTGCAAGCACAACAACAT CG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063901TCONS_00063901Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063902TCONS_00063902Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063903TCONS_00063903Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063904TCONS_00063904Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063905TCONS_00063905Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063906TCONS_00063906Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063907TCONS_00063907Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063908TCONS_00063908Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063909TCONS_00063909Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Spectrin domain containing proteinTCONS_00063903-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_404supercontigscaffold_404:738775..785926 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.45 2.87 3.59 3.62 40.89 28.37 13.12 14.96 9.04 15.96 14.9 10.62 5.42 5.14 2.34 3.55 4.39 4.47 8.37 9.46 7.89 6.55 5.41 6.67 8.39 10.28 23.12 26.17 3.38 2.84